RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000626236.2

SGMS1-211, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SGMS1, Length 1,013 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SGMS1-211ENST00000626236 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa15.53■□□□□ 0.08
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SGMS1-211ENST00000626236 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa14.91□□□□□ -0.02
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SGMS1-211ENST00000626236 PDS5BQ9NTI5 1447 aa14.77□□□□□ -0.04
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SGMS1-211ENST00000626236 FANCD2Q9BXW9 1451 aa14.75□□□□□ -0.05
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SGMS1-211ENST00000626236 SYNJ1O43426 1573 aa14.56□□□□□ -0.08
SGMS1-211ENST00000626236 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa14.55□□□□□ -0.08
SGMS1-211ENST00000626236 TOP2BQ02880 1626 aa14.53□□□□□ -0.08
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SGMS1-211ENST00000626236 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP14.39□□□□□ -0.11
SGMS1-211ENST00000626236 WDR97A6NE52 1622 aa14.38□□□□□ -0.11
SGMS1-211ENST00000626236 SOGA1O94964 1423 aa14.38□□□□□ -0.11
SGMS1-211ENST00000626236 IFT140Q96RY7 1462 aa14.38□□□□□ -0.11
SGMS1-211ENST00000626236 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa14.32□□□□□ -0.12
SGMS1-211ENST00000626236 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP14.31□□□□□ -0.12
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SGMS1-211ENST00000626236 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa14.28□□□□□ -0.12
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SGMS1-211ENST00000626236 KIF27Q86VH2 1401 aa14.23□□□□□ -0.13
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SGMS1-211ENST00000626236 GRIN2BQ13224 1484 aa14.18□□□□□ -0.14
SGMS1-211ENST00000626236 ERICH3Q5RHP9 1530 aa14.16□□□□□ -0.14
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SGMS1-211ENST00000626236 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa14.14□□□□□ -0.15
SGMS1-211ENST00000626236 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP14.14□□□□□ -0.15
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SGMS1-211ENST00000626236 ADAMTS12P58397 1594 aa14.13□□□□□ -0.15
SGMS1-211ENST00000626236 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP14.12□□□□□ -0.15
SGMS1-211ENST00000626236 IGF1RP08069 1367 aa14.11□□□□□ -0.15
SGMS1-211ENST00000626236 CHD1O14646 1710 aa14.1□□□□□ -0.15
SGMS1-211ENST00000626236 CSRNP3Q8WYN3 585 aa14.07□□□□□ -0.16
SGMS1-211ENST00000626236 FHAD1B1AJZ9 1412 aa14.07□□□□□ -0.16
SGMS1-211ENST00000626236 SYNJ2O15056 1496 aa14.06□□□□□ -0.16
SGMS1-211ENST00000626236 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa14.05□□□□□ -0.16
SGMS1-211ENST00000626236 FBLN2P98095 1184 aa14.03□□□□□ -0.16
SGMS1-211ENST00000626236 KIF21BO75037 1637 aa14.03□□□□□ -0.16
SGMS1-211ENST00000626236 PRXQ9BXM0 1461 aa14.02□□□□□ -0.16
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