RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000626236.2

SGMS1-211, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SGMS1, Length 1,013 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-211ENST00000626236 NISCHQ9Y2I1 1504 aa20.14■□□□□ 0.81
SGMS1-211ENST00000626236 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
SGMS1-211ENST00000626236 CHIC1Q5VXU3 224 aa19.49■□□□□ 0.71
SGMS1-211ENST00000626236 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa17.82■□□□□ 0.44
SGMS1-211ENST00000626236 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP17.22■□□□□ 0.35
SGMS1-211ENST00000626236 ABCC9O60706 1549 aa17.12■□□□□ 0.33
SGMS1-211ENST00000626236 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP16.92■□□□□ 0.3
SGMS1-211ENST00000626236 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP16.84■□□□□ 0.29
SGMS1-211ENST00000626236 DCAF8L2P0C7V8 631 aa16.71■□□□□ 0.27
SGMS1-211ENST00000626236 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa16.65■□□□□ 0.26
SGMS1-211ENST00000626236 NACADO15069 1562 aa16.64■□□□□ 0.25
SGMS1-211ENST00000626236 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa16.61■□□□□ 0.25
SGMS1-211ENST00000626236 MYO15BQ96JP2 1530 aa16.6■□□□□ 0.25
SGMS1-211ENST00000626236 UNC13AQ9UPW8 1703 aa16.31■□□□□ 0.2
SGMS1-211ENST00000626236 SCRIBQ14160 1630 aa16.3■□□□□ 0.2
SGMS1-211ENST00000626236 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa16.12■□□□□ 0.17
SGMS1-211ENST00000626236 BICRAQ9NZM4 1560 aa16.09■□□□□ 0.17
SGMS1-211ENST00000626236 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP16.03■□□□□ 0.16
SGMS1-211ENST00000626236 FOXD1Q16676 465 aa15.81■□□□□ 0.12
SGMS1-211ENST00000626236 PLPPR3Q6T4P5 718 aa15.78■□□□□ 0.12
SGMS1-211ENST00000626236 CECR2Q9BXF3 1484 aa15.65■□□□□ 0.1
SGMS1-211ENST00000626236 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP15.65■□□□□ 0.1
SGMS1-211ENST00000626236 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
SGMS1-211ENST00000626236 SMARCA4P51532 1647 aa15.6■□□□□ 0.09
SGMS1-211ENST00000626236 MROH2BQ7Z745 1585 aa15.53■□□□□ 0.08
SGMS1-211ENST00000626236 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa15.53■□□□□ 0.08
SGMS1-211ENST00000626236 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP15.44■□□□□ 0.06
SGMS1-211ENST00000626236 WIZO95785 1651 aa15.43■□□□□ 0.06
SGMS1-211ENST00000626236 SMARCA2P51531 1590 aa15.41■□□□□ 0.06
SGMS1-211ENST00000626236 PEG3Q9GZU2 1588 aa15.41■□□□□ 0.06
SGMS1-211ENST00000626236 DNAJC5BQ9UF47 199 aa15.4■□□□□ 0.06
SGMS1-211ENST00000626236 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa15.39■□□□□ 0.05
SGMS1-211ENST00000626236 NCAPD3P42695 1498 aa15.32■□□□□ 0.04
SGMS1-211ENST00000626236 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP15.31■□□□□ 0.04
SGMS1-211ENST00000626236 HMGXB3Q12766 1538 aa15.31■□□□□ 0.04
SGMS1-211ENST00000626236 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP15.3■□□□□ 0.04
SGMS1-211ENST00000626236 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP15.25■□□□□ 0.03
SGMS1-211ENST00000626236 PPP6R1Q9UPN7 881 aa15.24■□□□□ 0.03
SGMS1-211ENST00000626236 ADRA2BP18089 450 aa15.22■□□□□ 0.03
SGMS1-211ENST00000626236 CCDC88BA6NC98 1476 aa15.05■□□□□ -0
SGMS1-211ENST00000626236 NESP48681 1621 aa14.92□□□□□ -0.02
SGMS1-211ENST00000626236 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa14.91□□□□□ -0.02
SGMS1-211ENST00000626236 PRDM2Q13029 1718 aa14.9□□□□□ -0.02
SGMS1-211ENST00000626236 CADPSQ9ULU8 1353 aa14.89□□□□□ -0.03
SGMS1-211ENST00000626236 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
SGMS1-211ENST00000626236 CFTRP13569 1480 aa14.88□□□□□ -0.03
SGMS1-211ENST00000626236 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa14.81□□□□□ -0.04
SGMS1-211ENST00000626236 PDS5BQ9NTI5 1447 aa14.77□□□□□ -0.04
SGMS1-211ENST00000626236 ERCC6Q03468 1493 aa14.75□□□□□ -0.05
SGMS1-211ENST00000626236 FANCD2Q9BXW9 1451 aa14.75□□□□□ -0.05
SGMS1-211ENST00000626236 CEP164Q9UPV0 1460 aa14.71□□□□□ -0.05
SGMS1-211ENST00000626236 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
SGMS1-211ENST00000626236 ABCC8Q09428 1581 aa14.64□□□□□ -0.07
SGMS1-211ENST00000626236 MRC2Q9UBG0 1479 aa14.63□□□□□ -0.07
SGMS1-211ENST00000626236 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
SGMS1-211ENST00000626236 DNMBPQ6XZF7 1577 aa14.58□□□□□ -0.08
SGMS1-211ENST00000626236 WDR62O43379 1518 aa14.57□□□□□ -0.08
SGMS1-211ENST00000626236 CUX1P39880 1505 aa14.56□□□□□ -0.08
SGMS1-211ENST00000626236 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP14.56□□□□□ -0.08
SGMS1-211ENST00000626236 TOPBP1Q92547 1522 aa14.56□□□□□ -0.08
SGMS1-211ENST00000626236 SYNJ1O43426 1573 aa14.56□□□□□ -0.08
SGMS1-211ENST00000626236 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa14.55□□□□□ -0.08
SGMS1-211ENST00000626236 TOP2BQ02880 1626 aa14.53□□□□□ -0.08
SGMS1-211ENST00000626236 MSH5O43196 834 aa14.48□□□□□ -0.09
SGMS1-211ENST00000626236 FGD5Q6ZNL6 1462 aa14.47□□□□□ -0.09
SGMS1-211ENST00000626236 CUX2O14529 1486 aa14.45□□□□□ -0.1
SGMS1-211ENST00000626236 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP14.44□□□□□ -0.1
SGMS1-211ENST00000626236 TRIM41Q8WV44 630 aa14.42□□□□□ -0.1
SGMS1-211ENST00000626236 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa14.39□□□□□ -0.11
SGMS1-211ENST00000626236 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP14.39□□□□□ -0.11
SGMS1-211ENST00000626236 WDR97A6NE52 1622 aa14.38□□□□□ -0.11
SGMS1-211ENST00000626236 SOGA1O94964 1423 aa14.38□□□□□ -0.11
SGMS1-211ENST00000626236 IFT140Q96RY7 1462 aa14.38□□□□□ -0.11
SGMS1-211ENST00000626236 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa14.32□□□□□ -0.12
SGMS1-211ENST00000626236 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP14.31□□□□□ -0.12
SGMS1-211ENST00000626236 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP14.3□□□□□ -0.12
SGMS1-211ENST00000626236 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa14.28□□□□□ -0.12
SGMS1-211ENST00000626236 PBRM1Q86U86 1689 aa14.26□□□□□ -0.13
SGMS1-211ENST00000626236 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP14.26□□□□□ -0.13
SGMS1-211ENST00000626236 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP14.25□□□□□ -0.13
SGMS1-211ENST00000626236 GAPVD1Q14C86 1478 aa14.23□□□□□ -0.13
SGMS1-211ENST00000626236 KIF27Q86VH2 1401 aa14.23□□□□□ -0.13
SGMS1-211ENST00000626236 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa14.21□□□□□ -0.13
SGMS1-211ENST00000626236 GRIN2BQ13224 1484 aa14.18□□□□□ -0.14
SGMS1-211ENST00000626236 ERICH3Q5RHP9 1530 aa14.16□□□□□ -0.14
SGMS1-211ENST00000626236 EEA1Q15075 1411 aa14.15□□□□□ -0.14
SGMS1-211ENST00000626236 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa14.14□□□□□ -0.15
SGMS1-211ENST00000626236 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP14.14□□□□□ -0.15
SGMS1-211ENST00000626236 CUL7Q14999 1698 aa14.14□□□□□ -0.15
SGMS1-211ENST00000626236 ADAMTS12P58397 1594 aa14.13□□□□□ -0.15
SGMS1-211ENST00000626236 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP14.12□□□□□ -0.15
SGMS1-211ENST00000626236 IGF1RP08069 1367 aa14.11□□□□□ -0.15
SGMS1-211ENST00000626236 CHD1O14646 1710 aa14.1□□□□□ -0.15
SGMS1-211ENST00000626236 CSRNP3Q8WYN3 585 aa14.07□□□□□ -0.16
SGMS1-211ENST00000626236 FHAD1B1AJZ9 1412 aa14.07□□□□□ -0.16
SGMS1-211ENST00000626236 SYNJ2O15056 1496 aa14.06□□□□□ -0.16
SGMS1-211ENST00000626236 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa14.05□□□□□ -0.16
SGMS1-211ENST00000626236 FBLN2P98095 1184 aa14.03□□□□□ -0.16
SGMS1-211ENST00000626236 KIF21BO75037 1637 aa14.03□□□□□ -0.16
SGMS1-211ENST00000626236 PRXQ9BXM0 1461 aa14.02□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.7 ms