RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000625215.2

PCBP1-AS1-272, PCBP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5

Gene PCBP1-AS1, Length 844 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1-AS1-272ENST00000625215 CHIC1Q5VXU3 224 aa22.44■■□□□ 1.18
PCBP1-AS1-272ENST00000625215 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
PCBP1-AS1-272ENST00000625215 NISCHQ9Y2I1 1504 aa21.15■□□□□ 0.98
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PCBP1-AS1-272ENST00000625215 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP18.89■□□□□ 0.61
PCBP1-AS1-272ENST00000625215 PLPPR3Q6T4P5 718 aa18.62■□□□□ 0.57
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PCBP1-AS1-272ENST00000625215 ADRA2BP18089 450 aa17.24■□□□□ 0.35
PCBP1-AS1-272ENST00000625215 SCRIBQ14160 1630 aa17.18■□□□□ 0.34
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PCBP1-AS1-272ENST00000625215 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa16.57■□□□□ 0.24
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PCBP1-AS1-272ENST00000625215 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa16.44■□□□□ 0.22
PCBP1-AS1-272ENST00000625215 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP16.43■□□□□ 0.22
PCBP1-AS1-272ENST00000625215 CECR2Q9BXF3 1484 aa16.41■□□□□ 0.22
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PCBP1-AS1-272ENST00000625215 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
PCBP1-AS1-272ENST00000625215 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
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PCBP1-AS1-272ENST00000625215 MSH5O43196 834 aa15.86■□□□□ 0.13
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PCBP1-AS1-272ENST00000625215 ABCC8Q09428 1581 aa15.4■□□□□ 0.06
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PCBP1-AS1-272ENST00000625215 ZBTB22O15209 634 aa15.36■□□□□ 0.05
PCBP1-AS1-272ENST00000625215 FOXD4L1Q9NU39 408 aa15.33■□□□□ 0.04
PCBP1-AS1-272ENST00000625215 CUX1P39880 1505 aa15.29■□□□□ 0.04
PCBP1-AS1-272ENST00000625215 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa15.28■□□□□ 0.04
PCBP1-AS1-272ENST00000625215 IFT140Q96RY7 1462 aa15.26■□□□□ 0.03
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PCBP1-AS1-272ENST00000625215 TOP2BQ02880 1626 aa15.24■□□□□ 0.03
PCBP1-AS1-272ENST00000625215 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP15.24■□□□□ 0.03
PCBP1-AS1-272ENST00000625215 FGD5Q6ZNL6 1462 aa15.23■□□□□ 0.03
PCBP1-AS1-272ENST00000625215 WDR97A6NE52 1622 aa15.22■□□□□ 0.03
PCBP1-AS1-272ENST00000625215 SYNJ1O43426 1573 aa15.22■□□□□ 0.03
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PCBP1-AS1-272ENST00000625215 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP15.2■□□□□ 0.02
PCBP1-AS1-272ENST00000625215 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP15.14■□□□□ 0.01
PCBP1-AS1-272ENST00000625215 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa15.14■□□□□ 0.01
PCBP1-AS1-272ENST00000625215 SOGA1O94964 1423 aa15.13■□□□□ 0.01
PCBP1-AS1-272ENST00000625215 DMRT2Q9Y5R5 561 aa15.13■□□□□ 0.01
PCBP1-AS1-272ENST00000625215 PBRM1Q86U86 1689 aa15.12■□□□□ 0.01
PCBP1-AS1-272ENST00000625215 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP15.09■□□□□ 0.01
PCBP1-AS1-272ENST00000625215 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa15.08■□□□□ 0.01
PCBP1-AS1-272ENST00000625215 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa15.08■□□□□ 0
PCBP1-AS1-272ENST00000625215 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP15.04■□□□□ -0
PCBP1-AS1-272ENST00000625215 CHD1O14646 1710 aa15.03■□□□□ -0
PCBP1-AS1-272ENST00000625215 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP15.01□□□□□ -0.01
PCBP1-AS1-272ENST00000625215 GAPVD1Q14C86 1478 aa15□□□□□ -0.01
PCBP1-AS1-272ENST00000625215 GRIN2BQ13224 1484 aa14.99□□□□□ -0.01
PCBP1-AS1-272ENST00000625215 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa14.97□□□□□ -0.01
PCBP1-AS1-272ENST00000625215 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
PCBP1-AS1-272ENST00000625215 ADAMTS12P58397 1594 aa14.94□□□□□ -0.02
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