RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000614051.1

CCL3-206, Transcript of C-C motif chemokine ligand 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CCL3, Length 1,494 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3-206ENST00000614051 NISCHQ9Y2I1 1504 aa36.5■■■■□ 3.43
CCL3-206ENST00000614051 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP32.26■■■□□ 2.75
CCL3-206ENST00000614051 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa32.12■■■□□ 2.73
CCL3-206ENST00000614051 CHIC1Q5VXU3 224 aa31.32■■■□□ 2.6
CCL3-206ENST00000614051 ABCC9O60706 1549 aa30.89■■■□□ 2.54
CCL3-206ENST00000614051 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP30.54■■■□□ 2.48
CCL3-206ENST00000614051 DCAF8L2P0C7V8 631 aa30.32■■■□□ 2.44
CCL3-206ENST00000614051 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa30.14■■■□□ 2.42
CCL3-206ENST00000614051 NACADO15069 1562 aa30.01■■■□□ 2.4
CCL3-206ENST00000614051 MYO15BQ96JP2 1530 aa29.98■■■□□ 2.39
CCL3-206ENST00000614051 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa29.91■■■□□ 2.38
CCL3-206ENST00000614051 SCRIBQ14160 1630 aa29.48■■■□□ 2.31
CCL3-206ENST00000614051 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa29.39■■■□□ 2.3
CCL3-206ENST00000614051 UNC13AQ9UPW8 1703 aa29.38■■■□□ 2.29
CCL3-206ENST00000614051 BICRAQ9NZM4 1560 aa29.05■■■□□ 2.24
CCL3-206ENST00000614051 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP29■■■□□ 2.23
CCL3-206ENST00000614051 DNAJC5BQ9UF47 199 aa28.98■■■□□ 2.23
CCL3-206ENST00000614051 CECR2Q9BXF3 1484 aa28.43■■■□□ 2.14
CCL3-206ENST00000614051 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP28.21■■■□□ 2.11
CCL3-206ENST00000614051 SMARCA4P51532 1647 aa28.2■■■□□ 2.11
CCL3-206ENST00000614051 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP28.2■■■□□ 2.1
CCL3-206ENST00000614051 MROH2BQ7Z745 1585 aa28.2■■■□□ 2.1
CCL3-206ENST00000614051 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP28.08■■■□□ 2.09
CCL3-206ENST00000614051 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP27.97■■■□□ 2.07
CCL3-206ENST00000614051 WIZO95785 1651 aa27.96■■■□□ 2.07
CCL3-206ENST00000614051 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa27.95■■■□□ 2.06
CCL3-206ENST00000614051 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa27.86■■■□□ 2.05
CCL3-206ENST00000614051 PEG3Q9GZU2 1588 aa27.85■■■□□ 2.05
CCL3-206ENST00000614051 SMARCA2P51531 1590 aa27.82■■■□□ 2.04
CCL3-206ENST00000614051 NCAPD3P42695 1498 aa27.69■■■□□ 2.02
CCL3-206ENST00000614051 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP27.66■■■□□ 2.02
CCL3-206ENST00000614051 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP27.62■■■□□ 2.01
CCL3-206ENST00000614051 HMGXB3Q12766 1538 aa27.62■■■□□ 2.01
CCL3-206ENST00000614051 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP27.52■■■□□ 2
CCL3-206ENST00000614051 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP27.39■■□□□ 1.98
CCL3-206ENST00000614051 CCDC88BA6NC98 1476 aa27.33■■□□□ 1.97
CCL3-206ENST00000614051 NESP48681 1621 aa26.95■■□□□ 1.9
CCL3-206ENST00000614051 CADPSQ9ULU8 1353 aa26.94■■□□□ 1.9
CCL3-206ENST00000614051 CFTRP13569 1480 aa26.92■■□□□ 1.9
CCL3-206ENST00000614051 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa26.86■■□□□ 1.89
CCL3-206ENST00000614051 PRDM2Q13029 1718 aa26.83■■□□□ 1.89
CCL3-206ENST00000614051 ERCC6Q03468 1493 aa26.73■■□□□ 1.87
CCL3-206ENST00000614051 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa26.72■■□□□ 1.87
CCL3-206ENST00000614051 CUX2O14529 1486 aa26.7■■□□□ 1.86
CCL3-206ENST00000614051 FANCD2Q9BXW9 1451 aa26.67■■□□□ 1.86
CCL3-206ENST00000614051 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa26.65■■□□□ 1.86
CCL3-206ENST00000614051 PDS5BQ9NTI5 1447 aa26.64■■□□□ 1.85
CCL3-206ENST00000614051 ABCC8Q09428 1581 aa26.6■■□□□ 1.85
CCL3-206ENST00000614051 CEP164Q9UPV0 1460 aa26.55■■□□□ 1.84
CCL3-206ENST00000614051 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP26.44■■□□□ 1.82
CCL3-206ENST00000614051 SYNJ1O43426 1573 aa26.41■■□□□ 1.82
CCL3-206ENST00000614051 CUX1P39880 1505 aa26.41■■□□□ 1.82
CCL3-206ENST00000614051 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP26.39■■□□□ 1.81
CCL3-206ENST00000614051 MRC2Q9UBG0 1479 aa26.36■■□□□ 1.81
CCL3-206ENST00000614051 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP26.34■■□□□ 1.81
CCL3-206ENST00000614051 DNMBPQ6XZF7 1577 aa26.33■■□□□ 1.81
CCL3-206ENST00000614051 TOP2BQ02880 1626 aa26.32■■□□□ 1.8
CCL3-206ENST00000614051 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa26.32■■□□□ 1.8
CCL3-206ENST00000614051 TRIM41Q8WV44 630 aa26.32■■□□□ 1.8
CCL3-206ENST00000614051 TOPBP1Q92547 1522 aa26.32■■□□□ 1.8
CCL3-206ENST00000614051 WDR62O43379 1518 aa26.26■■□□□ 1.79
CCL3-206ENST00000614051 FGD5Q6ZNL6 1462 aa26.19■■□□□ 1.78
CCL3-206ENST00000614051 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP26.14■■□□□ 1.78
CCL3-206ENST00000614051 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa26.08■■□□□ 1.77
CCL3-206ENST00000614051 SOGA1O94964 1423 aa26.04■■□□□ 1.76
CCL3-206ENST00000614051 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
CCL3-206ENST00000614051 WDR97A6NE52 1622 aa25.96■■□□□ 1.75
CCL3-206ENST00000614051 IFT140Q96RY7 1462 aa25.94■■□□□ 1.74
CCL3-206ENST00000614051 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa25.92■■□□□ 1.74
CCL3-206ENST00000614051 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa25.92■■□□□ 1.74
CCL3-206ENST00000614051 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP25.86■■□□□ 1.73
CCL3-206ENST00000614051 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP25.86■■□□□ 1.73
CCL3-206ENST00000614051 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP25.86■■□□□ 1.73
CCL3-206ENST00000614051 KIF27Q86VH2 1401 aa25.81■■□□□ 1.72
CCL3-206ENST00000614051 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa25.8■■□□□ 1.72
CCL3-206ENST00000614051 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP25.79■■□□□ 1.72
CCL3-206ENST00000614051 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP25.77■■□□□ 1.72
CCL3-206ENST00000614051 GAPVD1Q14C86 1478 aa25.75■■□□□ 1.71
CCL3-206ENST00000614051 EEA1Q15075 1411 aa25.72■■□□□ 1.71
CCL3-206ENST00000614051 PBRM1Q86U86 1689 aa25.71■■□□□ 1.71
CCL3-206ENST00000614051 CSRNP3Q8WYN3 585 aa25.66■■□□□ 1.7
CCL3-206ENST00000614051 IGF1RP08069 1367 aa25.66■■□□□ 1.7
CCL3-206ENST00000614051 GRIN2BQ13224 1484 aa25.63■■□□□ 1.69
CCL3-206ENST00000614051 ERICH3Q5RHP9 1530 aa25.62■■□□□ 1.69
CCL3-206ENST00000614051 OSCARQ8IYS5 282 aa25.59■■□□□ 1.69
CCL3-206ENST00000614051 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa25.55■■□□□ 1.68
CCL3-206ENST00000614051 EHMT2Q96KQ7 1210 aa25.54■■□□□ 1.68
CCL3-206ENST00000614051 CUL7Q14999 1698 aa25.53■■□□□ 1.68
CCL3-206ENST00000614051 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa25.51■■□□□ 1.67
CCL3-206ENST00000614051 PRXQ9BXM0 1461 aa25.51■■□□□ 1.67
CCL3-206ENST00000614051 ADAMTS12P58397 1594 aa25.5■■□□□ 1.67
CCL3-206ENST00000614051 KIF21BO75037 1637 aa25.48■■□□□ 1.67
CCL3-206ENST00000614051 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP25.47■■□□□ 1.67
CCL3-206ENST00000614051 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa25.47■■□□□ 1.67
CCL3-206ENST00000614051 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa25.45■■□□□ 1.66
CCL3-206ENST00000614051 FOXD1Q16676 465 aa25.45■■□□□ 1.66
CCL3-206ENST00000614051 FHAD1B1AJZ9 1412 aa25.45■■□□□ 1.66
CCL3-206ENST00000614051 SYNJ2O15056 1496 aa25.38■■□□□ 1.65
CCL3-206ENST00000614051 GOLGA3Q08378 1498 aa25.37■■□□□ 1.65
CCL3-206ENST00000614051 FBLN2P98095 1184 aa25.37■■□□□ 1.65
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