RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613947.1

CCL4-201, Transcript of C-C motif chemokine ligand 4, humanhuman

Gene CCL4, Length 1,774 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL4-201ENST00000613947 NISCHQ9Y2I1 1504 aa30.74■■■□□ 2.51
CCL4-201ENST00000613947 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa27.17■■□□□ 1.94
CCL4-201ENST00000613947 ABCC9O60706 1549 aa26.51■■□□□ 1.83
CCL4-201ENST00000613947 DCAF8L2P0C7V8 631 aa25.7■■□□□ 1.7
CCL4-201ENST00000613947 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP25.63■■□□□ 1.69
CCL4-201ENST00000613947 NACADO15069 1562 aa25.54■■□□□ 1.68
CCL4-201ENST00000613947 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa25.52■■□□□ 1.68
CCL4-201ENST00000613947 MYO15BQ96JP2 1530 aa25.43■■□□□ 1.66
CCL4-201ENST00000613947 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa25.4■■□□□ 1.66
CCL4-201ENST00000613947 UNC13AQ9UPW8 1703 aa24.94■■□□□ 1.58
CCL4-201ENST00000613947 SCRIBQ14160 1630 aa24.87■■□□□ 1.57
CCL4-201ENST00000613947 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP24.85■■□□□ 1.57
CCL4-201ENST00000613947 BICRAQ9NZM4 1560 aa24.77■■□□□ 1.56
CCL4-201ENST00000613947 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa24.46■■□□□ 1.51
CCL4-201ENST00000613947 DNAJC5BQ9UF47 199 aa24.23■■□□□ 1.47
CCL4-201ENST00000613947 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
CCL4-201ENST00000613947 CECR2Q9BXF3 1484 aa23.96■■□□□ 1.43
CCL4-201ENST00000613947 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa23.95■■□□□ 1.43
CCL4-201ENST00000613947 SMARCA4P51532 1647 aa23.79■■□□□ 1.4
CCL4-201ENST00000613947 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP23.79■■□□□ 1.4
CCL4-201ENST00000613947 MROH2BQ7Z745 1585 aa23.71■■□□□ 1.39
CCL4-201ENST00000613947 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa23.64■■□□□ 1.38
CCL4-201ENST00000613947 NCAPD3P42695 1498 aa23.59■■□□□ 1.37
CCL4-201ENST00000613947 SMARCA2P51531 1590 aa23.59■■□□□ 1.37
CCL4-201ENST00000613947 PEG3Q9GZU2 1588 aa23.54■■□□□ 1.36
CCL4-201ENST00000613947 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
CCL4-201ENST00000613947 HMGXB3Q12766 1538 aa23.46■■□□□ 1.35
CCL4-201ENST00000613947 WIZO95785 1651 aa23.45■■□□□ 1.34
CCL4-201ENST00000613947 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
CCL4-201ENST00000613947 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP23.19■■□□□ 1.3
CCL4-201ENST00000613947 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
CCL4-201ENST00000613947 NESP48681 1621 aa23■■□□□ 1.27
CCL4-201ENST00000613947 CCDC88BA6NC98 1476 aa22.96■■□□□ 1.27
CCL4-201ENST00000613947 CADPSQ9ULU8 1353 aa22.93■■□□□ 1.26
CCL4-201ENST00000613947 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa22.9■■□□□ 1.26
CCL4-201ENST00000613947 CFTRP13569 1480 aa22.82■■□□□ 1.24
CCL4-201ENST00000613947 ERCC6Q03468 1493 aa22.82■■□□□ 1.24
CCL4-201ENST00000613947 PDS5BQ9NTI5 1447 aa22.78■■□□□ 1.24
CCL4-201ENST00000613947 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa22.69■■□□□ 1.22
CCL4-201ENST00000613947 FANCD2Q9BXW9 1451 aa22.66■■□□□ 1.22
CCL4-201ENST00000613947 CEP164Q9UPV0 1460 aa22.6■■□□□ 1.21
CCL4-201ENST00000613947 PRDM2Q13029 1718 aa22.59■■□□□ 1.21
CCL4-201ENST00000613947 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
CCL4-201ENST00000613947 MRC2Q9UBG0 1479 aa22.52■■□□□ 1.2
CCL4-201ENST00000613947 CUX2O14529 1486 aa22.47■■□□□ 1.19
CCL4-201ENST00000613947 WDR62O43379 1518 aa22.44■■□□□ 1.18
CCL4-201ENST00000613947 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
CCL4-201ENST00000613947 TOPBP1Q92547 1522 aa22.31■■□□□ 1.16
CCL4-201ENST00000613947 ABCC8Q09428 1581 aa22.29■■□□□ 1.16
CCL4-201ENST00000613947 DNMBPQ6XZF7 1577 aa22.28■■□□□ 1.16
CCL4-201ENST00000613947 CUX1P39880 1505 aa22.22■■□□□ 1.15
CCL4-201ENST00000613947 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP22.15■■□□□ 1.14
CCL4-201ENST00000613947 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
CCL4-201ENST00000613947 IFT140Q96RY7 1462 aa22.12■■□□□ 1.13
CCL4-201ENST00000613947 FGD5Q6ZNL6 1462 aa22.11■■□□□ 1.13
CCL4-201ENST00000613947 SYNJ1O43426 1573 aa22.08■■□□□ 1.13
CCL4-201ENST00000613947 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa22.07■■□□□ 1.12
CCL4-201ENST00000613947 SOGA1O94964 1423 aa22.07■■□□□ 1.12
CCL4-201ENST00000613947 TOP2BQ02880 1626 aa22.06■■□□□ 1.12
CCL4-201ENST00000613947 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
CCL4-201ENST00000613947 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
CCL4-201ENST00000613947 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa22.03■■□□□ 1.12
CCL4-201ENST00000613947 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
CCL4-201ENST00000613947 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP21.95■■□□□ 1.1
CCL4-201ENST00000613947 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
CCL4-201ENST00000613947 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa21.9■■□□□ 1.1
CCL4-201ENST00000613947 WDR97A6NE52 1622 aa21.87■■□□□ 1.09
CCL4-201ENST00000613947 GAPVD1Q14C86 1478 aa21.81■■□□□ 1.08
CCL4-201ENST00000613947 TRIM41Q8WV44 630 aa21.8■■□□□ 1.08
CCL4-201ENST00000613947 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa21.77■■□□□ 1.08
CCL4-201ENST00000613947 GRIN2BQ13224 1484 aa21.76■■□□□ 1.07
CCL4-201ENST00000613947 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa21.71■■□□□ 1.07
CCL4-201ENST00000613947 PBRM1Q86U86 1689 aa21.7■■□□□ 1.06
CCL4-201ENST00000613947 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP21.68■■□□□ 1.06
CCL4-201ENST00000613947 KIF27Q86VH2 1401 aa21.67■■□□□ 1.06
CCL4-201ENST00000613947 FBLN2P98095 1184 aa21.67■■□□□ 1.06
CCL4-201ENST00000613947 CHIC1Q5VXU3 224 aa21.67■■□□□ 1.06
CCL4-201ENST00000613947 OSCARQ8IYS5 282 aa21.64■■□□□ 1.06
CCL4-201ENST00000613947 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa21.64■■□□□ 1.06
CCL4-201ENST00000613947 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP21.63■■□□□ 1.05
CCL4-201ENST00000613947 ERICH3Q5RHP9 1530 aa21.63■■□□□ 1.05
CCL4-201ENST00000613947 SYNJ2O15056 1496 aa21.6■■□□□ 1.05
CCL4-201ENST00000613947 IGF1RP08069 1367 aa21.59■■□□□ 1.05
CCL4-201ENST00000613947 CHD1O14646 1710 aa21.59■■□□□ 1.05
CCL4-201ENST00000613947 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa21.58■■□□□ 1.04
CCL4-201ENST00000613947 ADAMTS12P58397 1594 aa21.55■■□□□ 1.04
CCL4-201ENST00000613947 FHAD1B1AJZ9 1412 aa21.55■■□□□ 1.04
CCL4-201ENST00000613947 GRIN2AQ12879 1464 aa21.49■■□□□ 1.03
CCL4-201ENST00000613947 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa21.46■■□□□ 1.03
CCL4-201ENST00000613947 CUL7Q14999 1698 aa21.44■■□□□ 1.02
CCL4-201ENST00000613947 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
CCL4-201ENST00000613947 NUP160Q12769 1436 aa21.38■■□□□ 1.01
CCL4-201ENST00000613947 CEP170Q5SW79 1584 aa21.37■■□□□ 1.01
CCL4-201ENST00000613947 CSRNP3Q8WYN3 585 aa21.37■■□□□ 1.01
CCL4-201ENST00000613947 CLASP1Q7Z460 1538 aa21.37■■□□□ 1.01
CCL4-201ENST00000613947 EEA1Q15075 1411 aa21.35■■□□□ 1.01
CCL4-201ENST00000613947 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa21.33■■□□□ 1
CCL4-201ENST00000613947 PRXQ9BXM0 1461 aa21.31■■□□□ 1
CCL4-201ENST00000613947 ARHGEF11O15085 1522 aa21.26■□□□□ 0.99
CCL4-201ENST00000613947 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa21.23■□□□□ 0.99
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