RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000607330.1

MEIS3-213, Transcript of Meis homeobox 3, humanhuman

TSL 4

Gene MEIS3, Length 515 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3-213ENST00000607330 NISCHQ9Y2I1 1504 aa43.71■■■■■ 4.59
MEIS3-213ENST00000607330 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa38.71■■■■□ 3.79
MEIS3-213ENST00000607330 ABCC9O60706 1549 aa37.4■■■■□ 3.58
MEIS3-213ENST00000607330 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP36.51■■■■□ 3.44
MEIS3-213ENST00000607330 MYO15BQ96JP2 1530 aa36.31■■■■□ 3.4
MEIS3-213ENST00000607330 NACADO15069 1562 aa36.31■■■■□ 3.4
MEIS3-213ENST00000607330 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa36.27■■■■□ 3.4
MEIS3-213ENST00000607330 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa36.23■■■■□ 3.39
MEIS3-213ENST00000607330 DCAF8L2P0C7V8 631 aa36.17■■■■□ 3.38
MEIS3-213ENST00000607330 UNC13AQ9UPW8 1703 aa35.31■■■■□ 3.24
MEIS3-213ENST00000607330 SCRIBQ14160 1630 aa35.24■■■■□ 3.23
MEIS3-213ENST00000607330 BICRAQ9NZM4 1560 aa35.12■■■■□ 3.21
MEIS3-213ENST00000607330 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP34.98■■■■□ 3.19
MEIS3-213ENST00000607330 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa34.91■■■■□ 3.18
MEIS3-213ENST00000607330 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP34.15■■■■□ 3.06
MEIS3-213ENST00000607330 DNAJC5BQ9UF47 199 aa33.99■■■■□ 3.03
MEIS3-213ENST00000607330 CECR2Q9BXF3 1484 aa33.95■■■■□ 3.03
MEIS3-213ENST00000607330 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa33.88■■■■□ 3.01
MEIS3-213ENST00000607330 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP33.85■■■■□ 3.01
MEIS3-213ENST00000607330 SMARCA4P51532 1647 aa33.81■■■■□ 3
MEIS3-213ENST00000607330 MROH2BQ7Z745 1585 aa33.65■■■□□ 2.98
MEIS3-213ENST00000607330 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa33.56■■■□□ 2.96
MEIS3-213ENST00000607330 PEG3Q9GZU2 1588 aa33.55■■■□□ 2.96
MEIS3-213ENST00000607330 SMARCA2P51531 1590 aa33.54■■■□□ 2.96
MEIS3-213ENST00000607330 NCAPD3P42695 1498 aa33.52■■■□□ 2.96
MEIS3-213ENST00000607330 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP33.44■■■□□ 2.94
MEIS3-213ENST00000607330 HMGXB3Q12766 1538 aa33.38■■■□□ 2.93
MEIS3-213ENST00000607330 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP33.27■■■□□ 2.92
MEIS3-213ENST00000607330 WIZO95785 1651 aa33.26■■■□□ 2.92
MEIS3-213ENST00000607330 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP33.02■■■□□ 2.88
MEIS3-213ENST00000607330 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP32.72■■■□□ 2.83
MEIS3-213ENST00000607330 CCDC88BA6NC98 1476 aa32.6■■■□□ 2.81
MEIS3-213ENST00000607330 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa32.53■■■□□ 2.8
MEIS3-213ENST00000607330 CADPSQ9ULU8 1353 aa32.53■■■□□ 2.8
MEIS3-213ENST00000607330 NESP48681 1621 aa32.48■■■□□ 2.79
MEIS3-213ENST00000607330 CFTRP13569 1480 aa32.43■■■□□ 2.78
MEIS3-213ENST00000607330 PDS5BQ9NTI5 1447 aa32.3■■■□□ 2.76
MEIS3-213ENST00000607330 ERCC6Q03468 1493 aa32.22■■■□□ 2.75
MEIS3-213ENST00000607330 PRDM2Q13029 1718 aa32.14■■■□□ 2.74
MEIS3-213ENST00000607330 FANCD2Q9BXW9 1451 aa32.12■■■□□ 2.73
MEIS3-213ENST00000607330 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa32.09■■■□□ 2.73
MEIS3-213ENST00000607330 CEP164Q9UPV0 1460 aa32.05■■■□□ 2.72
MEIS3-213ENST00000607330 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP31.97■■■□□ 2.71
MEIS3-213ENST00000607330 MRC2Q9UBG0 1479 aa31.94■■■□□ 2.7
MEIS3-213ENST00000607330 WDR62O43379 1518 aa31.85■■■□□ 2.69
MEIS3-213ENST00000607330 CUX2O14529 1486 aa31.84■■■□□ 2.69
MEIS3-213ENST00000607330 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP31.78■■■□□ 2.68
MEIS3-213ENST00000607330 ABCC8Q09428 1581 aa31.73■■■□□ 2.67
MEIS3-213ENST00000607330 DNMBPQ6XZF7 1577 aa31.67■■■□□ 2.66
MEIS3-213ENST00000607330 TOPBP1Q92547 1522 aa31.66■■■□□ 2.66
MEIS3-213ENST00000607330 CUX1P39880 1505 aa31.55■■■□□ 2.64
MEIS3-213ENST00000607330 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP31.5■■■□□ 2.63
MEIS3-213ENST00000607330 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP31.42■■■□□ 2.62
MEIS3-213ENST00000607330 TOP2BQ02880 1626 aa31.41■■■□□ 2.62
MEIS3-213ENST00000607330 IFT140Q96RY7 1462 aa31.4■■■□□ 2.62
MEIS3-213ENST00000607330 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa31.39■■■□□ 2.62
MEIS3-213ENST00000607330 FGD5Q6ZNL6 1462 aa31.39■■■□□ 2.62
MEIS3-213ENST00000607330 SYNJ1O43426 1573 aa31.38■■■□□ 2.61
MEIS3-213ENST00000607330 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP31.29■■■□□ 2.6
MEIS3-213ENST00000607330 SOGA1O94964 1423 aa31.28■■■□□ 2.6
MEIS3-213ENST00000607330 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa31.23■■■□□ 2.59
MEIS3-213ENST00000607330 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP31.16■■■□□ 2.58
MEIS3-213ENST00000607330 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa31.14■■■□□ 2.58
MEIS3-213ENST00000607330 WDR97A6NE52 1622 aa31.14■■■□□ 2.58
MEIS3-213ENST00000607330 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP31.07■■■□□ 2.56
MEIS3-213ENST00000607330 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP31.03■■■□□ 2.56
MEIS3-213ENST00000607330 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP31.02■■■□□ 2.56
MEIS3-213ENST00000607330 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa30.97■■■□□ 2.55
MEIS3-213ENST00000607330 TRIM41Q8WV44 630 aa30.96■■■□□ 2.55
MEIS3-213ENST00000607330 GAPVD1Q14C86 1478 aa30.93■■■□□ 2.54
MEIS3-213ENST00000607330 GRIN2BQ13224 1484 aa30.89■■■□□ 2.54
MEIS3-213ENST00000607330 CHIC1Q5VXU3 224 aa30.85■■■□□ 2.53
MEIS3-213ENST00000607330 KIF27Q86VH2 1401 aa30.83■■■□□ 2.53
MEIS3-213ENST00000607330 PBRM1Q86U86 1689 aa30.8■■■□□ 2.52
MEIS3-213ENST00000607330 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP30.79■■■□□ 2.52
MEIS3-213ENST00000607330 ERICH3Q5RHP9 1530 aa30.78■■■□□ 2.52
MEIS3-213ENST00000607330 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa30.77■■■□□ 2.52
MEIS3-213ENST00000607330 SYNJ2O15056 1496 aa30.66■■■□□ 2.5
MEIS3-213ENST00000607330 IGF1RP08069 1367 aa30.66■■■□□ 2.5
MEIS3-213ENST00000607330 ADAMTS12P58397 1594 aa30.64■■■□□ 2.5
MEIS3-213ENST00000607330 FHAD1B1AJZ9 1412 aa30.62■■■□□ 2.49
MEIS3-213ENST00000607330 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa30.59■■■□□ 2.49
MEIS3-213ENST00000607330 CUL7Q14999 1698 aa30.55■■■□□ 2.48
MEIS3-213ENST00000607330 CHD1O14646 1710 aa30.54■■■□□ 2.48
MEIS3-213ENST00000607330 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP30.54■■■□□ 2.48
MEIS3-213ENST00000607330 EEA1Q15075 1411 aa30.54■■■□□ 2.48
MEIS3-213ENST00000607330 OSCARQ8IYS5 282 aa30.52■■■□□ 2.48
MEIS3-213ENST00000607330 FBLN2P98095 1184 aa30.5■■■□□ 2.47
MEIS3-213ENST00000607330 GRIN2AQ12879 1464 aa30.5■■■□□ 2.47
MEIS3-213ENST00000607330 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa30.46■■■□□ 2.47
MEIS3-213ENST00000607330 NUP160Q12769 1436 aa30.39■■■□□ 2.45
MEIS3-213ENST00000607330 CSRNP3Q8WYN3 585 aa30.37■■■□□ 2.45
MEIS3-213ENST00000607330 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa30.37■■■□□ 2.45
MEIS3-213ENST00000607330 PRXQ9BXM0 1461 aa30.37■■■□□ 2.45
MEIS3-213ENST00000607330 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa30.34■■■□□ 2.45
MEIS3-213ENST00000607330 CLASP1Q7Z460 1538 aa30.32■■■□□ 2.44
MEIS3-213ENST00000607330 CEP170Q5SW79 1584 aa30.3■■■□□ 2.44
MEIS3-213ENST00000607330 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP30.2■■■□□ 2.43
MEIS3-213ENST00000607330 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa30.17■■■□□ 2.42
MEIS3-213ENST00000607330 KIF21BO75037 1637 aa30.14■■■□□ 2.42
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