RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000604081.1

HOXC-AS2-202, HOXC cluster antisense RNA 2, humanhuman

Gene HOXC-AS2, Length 2,090 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS2-202ENST00000604081 NISCHQ9Y2I1 1504 aa40.12■■■■■ 4.01
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa34.52■■■■□ 3.12
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP33.84■■■■□ 3.01
HOXC-AS2-202ENST00000604081 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa33.42■■■□□ 2.94
HOXC-AS2-202ENST00000604081 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa33.13■■■□□ 2.89
HOXC-AS2-202ENST00000604081 DCAF8L2P0C7V8 631 aa33.09■■■□□ 2.89
HOXC-AS2-202ENST00000604081 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP32.58■■■□□ 2.81
HOXC-AS2-202ENST00000604081 MYO15BQ96JP2 1530 aa32.44■■■□□ 2.78
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ABCC9O60706 1549 aa32.1■■■□□ 2.73
HOXC-AS2-202ENST00000604081 NACADO15069 1562 aa32.04■■■□□ 2.72
HOXC-AS2-202ENST00000604081 SCRIBQ14160 1630 aa31.96■■■□□ 2.71
HOXC-AS2-202ENST00000604081 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa31.59■■■□□ 2.65
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CHIC1Q5VXU3 224 aa31.55■■■□□ 2.64
HOXC-AS2-202ENST00000604081 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP31.47■■■□□ 2.63
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CECR2Q9BXF3 1484 aa31.15■■■□□ 2.58
HOXC-AS2-202ENST00000604081 MROH2BQ7Z745 1585 aa31.04■■■□□ 2.56
HOXC-AS2-202ENST00000604081 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP30.91■■■□□ 2.54
HOXC-AS2-202ENST00000604081 UNC13AQ9UPW8 1703 aa30.89■■■□□ 2.54
HOXC-AS2-202ENST00000604081 WIZO95785 1651 aa30.81■■■□□ 2.52
HOXC-AS2-202ENST00000604081 SMARCA4P51532 1647 aa30.65■■■□□ 2.5
HOXC-AS2-202ENST00000604081 BICRAQ9NZM4 1560 aa30.6■■■□□ 2.49
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TRIM41Q8WV44 630 aa30.56■■■□□ 2.48
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP30.51■■■□□ 2.47
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP30.5■■■□□ 2.47
HOXC-AS2-202ENST00000604081 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa30.42■■■□□ 2.46
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CCDC88BA6NC98 1476 aa30.26■■■□□ 2.43
HOXC-AS2-202ENST00000604081 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP30.26■■■□□ 2.43
HOXC-AS2-202ENST00000604081 SMARCA2P51531 1590 aa30.24■■■□□ 2.43
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PEG3Q9GZU2 1588 aa30.22■■■□□ 2.43
HOXC-AS2-202ENST00000604081 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP30.05■■■□□ 2.4
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa30■■■□□ 2.39
HOXC-AS2-202ENST00000604081 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP29.89■■■□□ 2.38
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PCGF6Q9BYE7 350 aa29.88■■■□□ 2.37
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ABCC8Q09428 1581 aa29.87■■■□□ 2.37
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP29.66■■■□□ 2.34
HOXC-AS2-202ENST00000604081 HRCP23327 699 aa29.64■■■□□ 2.33
HOXC-AS2-202ENST00000604081 EHMT2Q96KQ7 1210 aa29.64■■■□□ 2.33
HOXC-AS2-202ENST00000604081 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP29.61■■■□□ 2.33
HOXC-AS2-202ENST00000604081 NCAPD3P42695 1498 aa29.6■■■□□ 2.33
HOXC-AS2-202ENST00000604081 EEA1Q15075 1411 aa29.59■■■□□ 2.33
HOXC-AS2-202ENST00000604081 HMGXB3Q12766 1538 aa29.58■■■□□ 2.33
HOXC-AS2-202ENST00000604081 SOGA1O94964 1423 aa29.51■■■□□ 2.31
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CSRNP3Q8WYN3 585 aa29.42■■■□□ 2.3
HOXC-AS2-202ENST00000604081 SYNJ1O43426 1573 aa29.4■■■□□ 2.3
HOXC-AS2-202ENST00000604081 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa29.33■■■□□ 2.29
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TNIKQ9UKE5 1360 aa29.3■■■□□ 2.28
HOXC-AS2-202ENST00000604081 GOLGA3Q08378 1498 aa29.22■■■□□ 2.27
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TOP2BQ02880 1626 aa29.21■■■□□ 2.27
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CEP162Q5TB80 1403 aa29.2■■■□□ 2.27
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CFTRP13569 1480 aa29.17■■■□□ 2.26
HOXC-AS2-202ENST00000604081 UBTFP17480 764 aaKnown RBP29.16■■■□□ 2.26
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CEP164Q9UPV0 1460 aa29.14■■■□□ 2.26
HOXC-AS2-202ENST00000604081 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa29.13■■■□□ 2.25
HOXC-AS2-202ENST00000604081 KIF21BO75037 1637 aa29.11■■■□□ 2.25
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa29■■■□□ 2.23
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CUX1P39880 1505 aa28.97■■■□□ 2.23
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP28.95■■■□□ 2.22
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CADPSQ9ULU8 1353 aa28.94■■■□□ 2.22
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PRDM2Q13029 1718 aa28.92■■■□□ 2.22
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP28.9■■■□□ 2.22
HOXC-AS2-202ENST00000604081 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa28.86■■■□□ 2.21
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CLIP1P30622 1438 aa28.81■■■□□ 2.2
HOXC-AS2-202ENST00000604081 KIF27Q86VH2 1401 aa28.8■■■□□ 2.2
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ERICH3Q5RHP9 1530 aa28.78■■■□□ 2.2
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PRXQ9BXM0 1461 aa28.77■■■□□ 2.2
HOXC-AS2-202ENST00000604081 VPS8Q8N3P4 1428 aa28.65■■■□□ 2.18
HOXC-AS2-202ENST00000604081 FANCD2Q9BXW9 1451 aa28.61■■■□□ 2.17
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP28.57■■■□□ 2.16
HOXC-AS2-202ENST00000604081 FGD5Q6ZNL6 1462 aa28.55■■■□□ 2.16
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CUX2O14529 1486 aa28.54■■■□□ 2.16
HOXC-AS2-202ENST00000604081 APLP2Q06481 763 aa28.5■■■□□ 2.15
HOXC-AS2-202ENST00000604081 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP28.48■■■□□ 2.15
HOXC-AS2-202ENST00000604081 IGF1RP08069 1367 aa28.47■■■□□ 2.15
HOXC-AS2-202ENST00000604081 DNMBPQ6XZF7 1577 aa28.45■■■□□ 2.14
HOXC-AS2-202ENST00000604081 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa28.43■■■□□ 2.14
HOXC-AS2-202ENST00000604081 NESP48681 1621 aa28.41■■■□□ 2.14
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP28.39■■■□□ 2.14
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ARAP1Q96P48 1450 aa28.38■■■□□ 2.13
HOXC-AS2-202ENST00000604081 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP28.38■■■□□ 2.13
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TOPBP1Q92547 1522 aa28.37■■■□□ 2.13
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa28.36■■■□□ 2.13
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa28.3■■■□□ 2.12
HOXC-AS2-202ENST00000604081 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP28.29■■■□□ 2.12
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PDS5BQ9NTI5 1447 aa28.26■■■□□ 2.12
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa28.24■■■□□ 2.11
HOXC-AS2-202ENST00000604081 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa28.24■■■□□ 2.11
HOXC-AS2-202ENST00000604081 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP28.18■■■□□ 2.1
HOXC-AS2-202ENST00000604081 DNAJC5BQ9UF47 199 aa28.12■■■□□ 2.09
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CUL7Q14999 1698 aa28.09■■■□□ 2.09
HOXC-AS2-202ENST00000604081 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP28.08■■■□□ 2.09
HOXC-AS2-202ENST00000604081 WDR97A6NE52 1622 aa28.04■■■□□ 2.08
HOXC-AS2-202ENST00000604081 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP28.04■■■□□ 2.08
HOXC-AS2-202ENST00000604081 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa27.99■■■□□ 2.07
HOXC-AS2-202ENST00000604081 MAP3K1Q13233 1512 aa27.98■■■□□ 2.07
HOXC-AS2-202ENST00000604081 FHAD1B1AJZ9 1412 aa27.96■■■□□ 2.07
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa27.96■■■□□ 2.07
HOXC-AS2-202ENST00000604081 GAPVD1Q14C86 1478 aa27.94■■■□□ 2.06
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP27.93■■■□□ 2.06
HOXC-AS2-202ENST00000604081 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP27.91■■■□□ 2.06
HOXC-AS2-202ENST00000604081 EFCAB5A4FU69 1503 aa27.91■■■□□ 2.06
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