RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000603043.1

CDCA3-211, Transcript of cell division cycle associated 3, humanhuman

TSL 2

Gene CDCA3, Length 1,995 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA3-211ENST00000603043 NISCHQ9Y2I1 1504 aa37.36■■■■□ 3.57
CDCA3-211ENST00000603043 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa33.13■■■□□ 2.89
CDCA3-211ENST00000603043 ABCC9O60706 1549 aa32.13■■■□□ 2.73
CDCA3-211ENST00000603043 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP31.18■■■□□ 2.58
CDCA3-211ENST00000603043 DCAF8L2P0C7V8 631 aa31.09■■■□□ 2.57
CDCA3-211ENST00000603043 NACADO15069 1562 aa31.06■■■□□ 2.56
CDCA3-211ENST00000603043 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa31.04■■■□□ 2.56
CDCA3-211ENST00000603043 MYO15BQ96JP2 1530 aa30.94■■■□□ 2.54
CDCA3-211ENST00000603043 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa30.92■■■□□ 2.54
CDCA3-211ENST00000603043 UNC13AQ9UPW8 1703 aa30.4■■■□□ 2.46
CDCA3-211ENST00000603043 SCRIBQ14160 1630 aa30.25■■■□□ 2.43
CDCA3-211ENST00000603043 BICRAQ9NZM4 1560 aa30.08■■■□□ 2.41
CDCA3-211ENST00000603043 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP30.04■■■□□ 2.4
CDCA3-211ENST00000603043 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa29.78■■■□□ 2.36
CDCA3-211ENST00000603043 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP29.27■■■□□ 2.28
CDCA3-211ENST00000603043 DNAJC5BQ9UF47 199 aa29.19■■■□□ 2.26
CDCA3-211ENST00000603043 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa29.09■■■□□ 2.25
CDCA3-211ENST00000603043 CECR2Q9BXF3 1484 aa29.06■■■□□ 2.24
CDCA3-211ENST00000603043 SMARCA4P51532 1647 aa28.95■■■□□ 2.23
CDCA3-211ENST00000603043 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP28.95■■■□□ 2.23
CDCA3-211ENST00000603043 MROH2BQ7Z745 1585 aa28.8■■■□□ 2.2
CDCA3-211ENST00000603043 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa28.69■■■□□ 2.18
CDCA3-211ENST00000603043 SMARCA2P51531 1590 aa28.69■■■□□ 2.18
CDCA3-211ENST00000603043 PEG3Q9GZU2 1588 aa28.65■■■□□ 2.18
CDCA3-211ENST00000603043 NCAPD3P42695 1498 aa28.63■■■□□ 2.17
CDCA3-211ENST00000603043 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP28.55■■■□□ 2.16
CDCA3-211ENST00000603043 HMGXB3Q12766 1538 aa28.54■■■□□ 2.16
CDCA3-211ENST00000603043 WIZO95785 1651 aa28.53■■■□□ 2.16
CDCA3-211ENST00000603043 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP28.49■■■□□ 2.15
CDCA3-211ENST00000603043 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP28.22■■■□□ 2.11
CDCA3-211ENST00000603043 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP28.04■■■□□ 2.08
CDCA3-211ENST00000603043 NESP48681 1621 aa27.88■■■□□ 2.05
CDCA3-211ENST00000603043 CCDC88BA6NC98 1476 aa27.87■■■□□ 2.05
CDCA3-211ENST00000603043 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa27.87■■■□□ 2.05
CDCA3-211ENST00000603043 CADPSQ9ULU8 1353 aa27.81■■■□□ 2.04
CDCA3-211ENST00000603043 CFTRP13569 1480 aa27.71■■■□□ 2.03
CDCA3-211ENST00000603043 ERCC6Q03468 1493 aa27.68■■■□□ 2.02
CDCA3-211ENST00000603043 PDS5BQ9NTI5 1447 aa27.64■■■□□ 2.02
CDCA3-211ENST00000603043 PRDM2Q13029 1718 aa27.61■■■□□ 2.01
CDCA3-211ENST00000603043 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa27.61■■■□□ 2.01
CDCA3-211ENST00000603043 FANCD2Q9BXW9 1451 aa27.51■■□□□ 1.99
CDCA3-211ENST00000603043 CEP164Q9UPV0 1460 aa27.46■■□□□ 1.99
CDCA3-211ENST00000603043 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP27.42■■□□□ 1.98
CDCA3-211ENST00000603043 MRC2Q9UBG0 1479 aa27.35■■□□□ 1.97
CDCA3-211ENST00000603043 CUX2O14529 1486 aa27.27■■□□□ 1.96
CDCA3-211ENST00000603043 WDR62O43379 1518 aa27.27■■□□□ 1.96
CDCA3-211ENST00000603043 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP27.22■■□□□ 1.95
CDCA3-211ENST00000603043 ABCC8Q09428 1581 aa27.11■■□□□ 1.93
CDCA3-211ENST00000603043 DNMBPQ6XZF7 1577 aa27.11■■□□□ 1.93
CDCA3-211ENST00000603043 TOPBP1Q92547 1522 aa27.11■■□□□ 1.93
CDCA3-211ENST00000603043 CUX1P39880 1505 aa27■■□□□ 1.91
CDCA3-211ENST00000603043 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP26.93■■□□□ 1.9
CDCA3-211ENST00000603043 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP26.89■■□□□ 1.9
CDCA3-211ENST00000603043 FGD5Q6ZNL6 1462 aa26.88■■□□□ 1.89
CDCA3-211ENST00000603043 SYNJ1O43426 1573 aa26.87■■□□□ 1.89
CDCA3-211ENST00000603043 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa26.86■■□□□ 1.89
CDCA3-211ENST00000603043 IFT140Q96RY7 1462 aa26.86■■□□□ 1.89
CDCA3-211ENST00000603043 TOP2BQ02880 1626 aa26.86■■□□□ 1.89
CDCA3-211ENST00000603043 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP26.8■■□□□ 1.88
CDCA3-211ENST00000603043 SOGA1O94964 1423 aa26.77■■□□□ 1.88
CDCA3-211ENST00000603043 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa26.76■■□□□ 1.87
CDCA3-211ENST00000603043 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP26.72■■□□□ 1.87
CDCA3-211ENST00000603043 WDR97A6NE52 1622 aa26.67■■□□□ 1.86
CDCA3-211ENST00000603043 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP26.66■■□□□ 1.86
CDCA3-211ENST00000603043 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa26.61■■□□□ 1.85
CDCA3-211ENST00000603043 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP26.6■■□□□ 1.858e-7■□□□□ 11.3
CDCA3-211ENST00000603043 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP26.58■■□□□ 1.85
CDCA3-211ENST00000603043 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa26.51■■□□□ 1.83
CDCA3-211ENST00000603043 GAPVD1Q14C86 1478 aa26.48■■□□□ 1.83
CDCA3-211ENST00000603043 PBRM1Q86U86 1689 aa26.46■■□□□ 1.83
CDCA3-211ENST00000603043 TRIM41Q8WV44 630 aa26.46■■□□□ 1.83
CDCA3-211ENST00000603043 GRIN2BQ13224 1484 aa26.43■■□□□ 1.82
CDCA3-211ENST00000603043 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa26.37■■□□□ 1.81
CDCA3-211ENST00000603043 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP26.34■■□□□ 1.81
CDCA3-211ENST00000603043 KIF27Q86VH2 1401 aa26.34■■□□□ 1.81
CDCA3-211ENST00000603043 ERICH3Q5RHP9 1530 aa26.31■■□□□ 1.8
CDCA3-211ENST00000603043 CHIC1Q5VXU3 224 aa26.3■■□□□ 1.8
CDCA3-211ENST00000603043 CHD1O14646 1710 aa26.3■■□□□ 1.8
CDCA3-211ENST00000603043 ADAMTS12P58397 1594 aa26.24■■□□□ 1.79
CDCA3-211ENST00000603043 SYNJ2O15056 1496 aa26.23■■□□□ 1.79
CDCA3-211ENST00000603043 FBLN2P98095 1184 aa26.23■■□□□ 1.79
CDCA3-211ENST00000603043 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP26.19■■□□□ 1.78
CDCA3-211ENST00000603043 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa26.18■■□□□ 1.78
CDCA3-211ENST00000603043 OSCARQ8IYS5 282 aa26.18■■□□□ 1.78
CDCA3-211ENST00000603043 FHAD1B1AJZ9 1412 aa26.18■■□□□ 1.78
CDCA3-211ENST00000603043 IGF1RP08069 1367 aa26.17■■□□□ 1.78
CDCA3-211ENST00000603043 CUL7Q14999 1698 aa26.15■■□□□ 1.78
CDCA3-211ENST00000603043 GRIN2AQ12879 1464 aa26.11■■□□□ 1.77
CDCA3-211ENST00000603043 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa26.08■■□□□ 1.77
CDCA3-211ENST00000603043 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa26.03■■□□□ 1.76
CDCA3-211ENST00000603043 EEA1Q15075 1411 aa26.01■■□□□ 1.75
CDCA3-211ENST00000603043 CEP170Q5SW79 1584 aa25.97■■□□□ 1.75
CDCA3-211ENST00000603043 CLASP1Q7Z460 1538 aa25.97■■□□□ 1.75
CDCA3-211ENST00000603043 NUP160Q12769 1436 aa25.96■■□□□ 1.75
CDCA3-211ENST00000603043 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa25.93■■□□□ 1.74
CDCA3-211ENST00000603043 CSRNP3Q8WYN3 585 aa25.92■■□□□ 1.74
CDCA3-211ENST00000603043 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP25.91■■□□□ 1.74
CDCA3-211ENST00000603043 PRXQ9BXM0 1461 aa25.89■■□□□ 1.74
CDCA3-211ENST00000603043 ARHGEF11O15085 1522 aa25.79■■□□□ 1.72
CDCA3-211ENST00000603043 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa25.78■■□□□ 1.72
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