RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589494.1

PLIN3-206, Transcript of perilipin 3, humanhuman

TSL 5

Gene PLIN3, Length 629 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLIN3-206ENST00000589494 NISCHQ9Y2I1 1504 aa44.76■■■■■ 4.76
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PLIN3-206ENST00000589494 DCAF8L2P0C7V8 631 aa37.19■■■■□ 3.54
PLIN3-206ENST00000589494 NACADO15069 1562 aa37.14■■■■□ 3.54
PLIN3-206ENST00000589494 MYO15BQ96JP2 1530 aa37.13■■■■□ 3.53
PLIN3-206ENST00000589494 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa37.1■■■■□ 3.53
PLIN3-206ENST00000589494 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa37.04■■■■□ 3.52
PLIN3-206ENST00000589494 UNC13AQ9UPW8 1703 aa36.15■■■■□ 3.38
PLIN3-206ENST00000589494 SCRIBQ14160 1630 aa36.06■■■■□ 3.36
PLIN3-206ENST00000589494 BICRAQ9NZM4 1560 aa35.94■■■■□ 3.34
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PLIN3-206ENST00000589494 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP34.92■■■■□ 3.18
PLIN3-206ENST00000589494 DNAJC5BQ9UF47 199 aa34.9■■■■□ 3.18
PLIN3-206ENST00000589494 CECR2Q9BXF3 1484 aa34.82■■■■□ 3.16
PLIN3-206ENST00000589494 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa34.67■■■■□ 3.14
PLIN3-206ENST00000589494 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP34.63■■■■□ 3.13
PLIN3-206ENST00000589494 SMARCA4P51532 1647 aa34.59■■■■□ 3.13
PLIN3-206ENST00000589494 MROH2BQ7Z745 1585 aa34.49■■■■□ 3.11
PLIN3-206ENST00000589494 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa34.36■■■■□ 3.09
PLIN3-206ENST00000589494 NCAPD3P42695 1498 aa34.33■■■■□ 3.09
PLIN3-206ENST00000589494 PEG3Q9GZU2 1588 aa34.31■■■■□ 3.08
PLIN3-206ENST00000589494 SMARCA2P51531 1590 aa34.3■■■■□ 3.08
PLIN3-206ENST00000589494 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP34.29■■■■□ 3.08
PLIN3-206ENST00000589494 HMGXB3Q12766 1538 aa34.11■■■■□ 3.05
PLIN3-206ENST00000589494 WIZO95785 1651 aa34.09■■■■□ 3.05
PLIN3-206ENST00000589494 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP34.04■■■■□ 3.04
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PLIN3-206ENST00000589494 CCDC88BA6NC98 1476 aa33.42■■■□□ 2.94
PLIN3-206ENST00000589494 CADPSQ9ULU8 1353 aa33.34■■■□□ 2.93
PLIN3-206ENST00000589494 NESP48681 1621 aa33.28■■■□□ 2.92
PLIN3-206ENST00000589494 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa33.28■■■□□ 2.92
PLIN3-206ENST00000589494 CFTRP13569 1480 aa33.21■■■□□ 2.91
PLIN3-206ENST00000589494 PDS5BQ9NTI5 1447 aa33.08■■■□□ 2.89
PLIN3-206ENST00000589494 ERCC6Q03468 1493 aa32.95■■■□□ 2.87
PLIN3-206ENST00000589494 FANCD2Q9BXW9 1451 aa32.88■■■□□ 2.85
PLIN3-206ENST00000589494 PRDM2Q13029 1718 aa32.85■■■□□ 2.85
PLIN3-206ENST00000589494 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa32.83■■■□□ 2.85
PLIN3-206ENST00000589494 CEP164Q9UPV0 1460 aa32.78■■■□□ 2.84
PLIN3-206ENST00000589494 MRC2Q9UBG0 1479 aa32.67■■■□□ 2.82
PLIN3-206ENST00000589494 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP32.66■■■□□ 2.82
PLIN3-206ENST00000589494 WDR62O43379 1518 aa32.55■■■□□ 2.8
PLIN3-206ENST00000589494 CUX2O14529 1486 aa32.54■■■□□ 2.8
PLIN3-206ENST00000589494 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP32.53■■■□□ 2.8
PLIN3-206ENST00000589494 ABCC8Q09428 1581 aa32.48■■■□□ 2.79
PLIN3-206ENST00000589494 TOPBP1Q92547 1522 aa32.41■■■□□ 2.78
PLIN3-206ENST00000589494 DNMBPQ6XZF7 1577 aa32.39■■■□□ 2.78
PLIN3-206ENST00000589494 CUX1P39880 1505 aa32.31■■■□□ 2.76
PLIN3-206ENST00000589494 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP32.27■■■□□ 2.76
PLIN3-206ENST00000589494 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP32.16■■■□□ 2.74
PLIN3-206ENST00000589494 TOP2BQ02880 1626 aa32.15■■■□□ 2.74
PLIN3-206ENST00000589494 SYNJ1O43426 1573 aa32.12■■■□□ 2.73
PLIN3-206ENST00000589494 FGD5Q6ZNL6 1462 aa32.12■■■□□ 2.73
PLIN3-206ENST00000589494 IFT140Q96RY7 1462 aa32.12■■■□□ 2.73
PLIN3-206ENST00000589494 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa32.11■■■□□ 2.73
PLIN3-206ENST00000589494 SOGA1O94964 1423 aa32.08■■■□□ 2.73
PLIN3-206ENST00000589494 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP32.02■■■□□ 2.72
PLIN3-206ENST00000589494 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa32.02■■■□□ 2.72
PLIN3-206ENST00000589494 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP31.91■■■□□ 2.7
PLIN3-206ENST00000589494 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa31.88■■■□□ 2.69
PLIN3-206ENST00000589494 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP31.82■■■□□ 2.69
PLIN3-206ENST00000589494 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP31.81■■■□□ 2.686e-8■■■■□ 26.4
PLIN3-206ENST00000589494 TRIM41Q8WV44 630 aa31.81■■■□□ 2.68
PLIN3-206ENST00000589494 WDR97A6NE52 1622 aa31.81■■■□□ 2.68
PLIN3-206ENST00000589494 CHIC1Q5VXU3 224 aa31.75■■■□□ 2.67
PLIN3-206ENST00000589494 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP31.74■■■□□ 2.67
PLIN3-206ENST00000589494 GAPVD1Q14C86 1478 aa31.69■■■□□ 2.66
PLIN3-206ENST00000589494 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa31.66■■■□□ 2.66
PLIN3-206ENST00000589494 GRIN2BQ13224 1484 aa31.63■■■□□ 2.65
PLIN3-206ENST00000589494 KIF27Q86VH2 1401 aa31.58■■■□□ 2.65
PLIN3-206ENST00000589494 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP31.5■■■□□ 2.63
PLIN3-206ENST00000589494 ERICH3Q5RHP9 1530 aa31.49■■■□□ 2.63
PLIN3-206ENST00000589494 PBRM1Q86U86 1689 aa31.49■■■□□ 2.63
PLIN3-206ENST00000589494 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa31.48■■■□□ 2.63
PLIN3-206ENST00000589494 IGF1RP08069 1367 aa31.47■■■□□ 2.63
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PLIN3-206ENST00000589494 SYNJ2O15056 1496 aa31.37■■■□□ 2.61
PLIN3-206ENST00000589494 FHAD1B1AJZ9 1412 aa31.36■■■□□ 2.61
PLIN3-206ENST00000589494 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP31.35■■■□□ 2.61
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PLIN3-206ENST00000589494 EEA1Q15075 1411 aa31.27■■■□□ 2.6
PLIN3-206ENST00000589494 CHD1O14646 1710 aa31.25■■■□□ 2.59
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PLIN3-206ENST00000589494 PRXQ9BXM0 1461 aa31.11■■■□□ 2.57
PLIN3-206ENST00000589494 NUP160Q12769 1436 aa31.09■■■□□ 2.57
PLIN3-206ENST00000589494 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa31.08■■■□□ 2.57
PLIN3-206ENST00000589494 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP31.08■■■□□ 2.57
PLIN3-206ENST00000589494 CEP170Q5SW79 1584 aa31■■■□□ 2.55
PLIN3-206ENST00000589494 CLASP1Q7Z460 1538 aa31■■■□□ 2.55
PLIN3-206ENST00000589494 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa30.9■■■□□ 2.54
PLIN3-206ENST00000589494 KIF21BO75037 1637 aa30.85■■■□□ 2.53
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