RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577870.2

SARM1-202, Transcript of sterile alpha and TIR motif containing 1, humanhuman

TSL 4

Gene SARM1, Length 566 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SARM1-202ENST00000577870 NISCHQ9Y2I1 1504 aa55.55■■■■■ 6.48
SARM1-202ENST00000577870 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa49.15■■■■■ 5.46
SARM1-202ENST00000577870 ABCC9O60706 1549 aa47.61■■■■■ 5.21
SARM1-202ENST00000577870 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP46.37■■■■■ 5.01
SARM1-202ENST00000577870 NACADO15069 1562 aa46.1■■■■■ 4.97
SARM1-202ENST00000577870 DCAF8L2P0C7V8 631 aa46.1■■■■■ 4.97
SARM1-202ENST00000577870 MYO15BQ96JP2 1530 aa46.03■■■■■ 4.96
SARM1-202ENST00000577870 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa46.01■■■■■ 4.96
SARM1-202ENST00000577870 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa46■■■■■ 4.95
SARM1-202ENST00000577870 UNC13AQ9UPW8 1703 aa45.03■■■■■ 4.8
SARM1-202ENST00000577870 SCRIBQ14160 1630 aa44.85■■■■■ 4.77
SARM1-202ENST00000577870 BICRAQ9NZM4 1560 aa44.69■■■■■ 4.75
SARM1-202ENST00000577870 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP44.59■■■■■ 4.73
SARM1-202ENST00000577870 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa44.2■■■■■ 4.67
SARM1-202ENST00000577870 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP43.41■■■■■ 4.54
SARM1-202ENST00000577870 DNAJC5BQ9UF47 199 aa43.38■■■■■ 4.53
SARM1-202ENST00000577870 CECR2Q9BXF3 1484 aa43.24■■■■■ 4.51
SARM1-202ENST00000577870 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa43.12■■■■■ 4.49
SARM1-202ENST00000577870 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP42.99■■■■■ 4.47
SARM1-202ENST00000577870 SMARCA4P51532 1647 aa42.98■■■■■ 4.47
SARM1-202ENST00000577870 MROH2BQ7Z745 1585 aa42.83■■■■■ 4.45
SARM1-202ENST00000577870 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa42.65■■■■■ 4.42
SARM1-202ENST00000577870 PEG3Q9GZU2 1588 aa42.6■■■■■ 4.41
SARM1-202ENST00000577870 SMARCA2P51531 1590 aa42.58■■■■■ 4.41
SARM1-202ENST00000577870 NCAPD3P42695 1498 aa42.57■■■■■ 4.41
SARM1-202ENST00000577870 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP42.52■■■■■ 4.4
SARM1-202ENST00000577870 WIZO95785 1651 aa42.38■■■■■ 4.37
SARM1-202ENST00000577870 HMGXB3Q12766 1538 aa42.37■■■■■ 4.37
SARM1-202ENST00000577870 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP42.27■■■■■ 4.36
SARM1-202ENST00000577870 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP41.94■■■■■ 4.3
SARM1-202ENST00000577870 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP41.71■■■■■ 4.27
SARM1-202ENST00000577870 CCDC88BA6NC98 1476 aa41.47■■■■■ 4.23
SARM1-202ENST00000577870 NESP48681 1621 aa41.38■■■■■ 4.21
SARM1-202ENST00000577870 CADPSQ9ULU8 1353 aa41.33■■■■■ 4.21
SARM1-202ENST00000577870 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa41.33■■■■■ 4.21
SARM1-202ENST00000577870 CFTRP13569 1480 aa41.2■■■■■ 4.19
SARM1-202ENST00000577870 PDS5BQ9NTI5 1447 aa41.01■■■■■ 4.16
SARM1-202ENST00000577870 ERCC6Q03468 1493 aa40.94■■■■■ 4.14
SARM1-202ENST00000577870 PRDM2Q13029 1718 aa40.89■■■■■ 4.14
SARM1-202ENST00000577870 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa40.88■■■■■ 4.14
SARM1-202ENST00000577870 FANCD2Q9BXW9 1451 aa40.83■■■■■ 4.13
SARM1-202ENST00000577870 CEP164Q9UPV0 1460 aa40.7■■■■■ 4.11
SARM1-202ENST00000577870 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP40.65■■■■■ 4.1
SARM1-202ENST00000577870 MRC2Q9UBG0 1479 aa40.58■■■■■ 4.09
SARM1-202ENST00000577870 WDR62O43379 1518 aa40.45■■■■■ 4.07
SARM1-202ENST00000577870 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP40.43■■■■■ 4.06
SARM1-202ENST00000577870 CUX2O14529 1486 aa40.4■■■■■ 4.06
SARM1-202ENST00000577870 TOPBP1Q92547 1522 aa40.26■■■■■ 4.03
SARM1-202ENST00000577870 ABCC8Q09428 1581 aa40.25■■■■■ 4.03
SARM1-202ENST00000577870 DNMBPQ6XZF7 1577 aa40.23■■■■■ 4.03
SARM1-202ENST00000577870 CUX1P39880 1505 aa40.15■■■■■ 4.02
SARM1-202ENST00000577870 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.02■■■■■ 4
SARM1-202ENST00000577870 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP39.94■■■■□ 3.98
SARM1-202ENST00000577870 SYNJ1O43426 1573 aa39.93■■■■□ 3.98
SARM1-202ENST00000577870 TOP2BQ02880 1626 aa39.91■■■■□ 3.98
SARM1-202ENST00000577870 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa39.91■■■■□ 3.98
SARM1-202ENST00000577870 FGD5Q6ZNL6 1462 aa39.9■■■■□ 3.98
SARM1-202ENST00000577870 IFT140Q96RY7 1462 aa39.86■■■■□ 3.97
SARM1-202ENST00000577870 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP39.8■■■■□ 3.96
SARM1-202ENST00000577870 SOGA1O94964 1423 aa39.78■■■■□ 3.96
SARM1-202ENST00000577870 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa39.77■■■■□ 3.96
SARM1-202ENST00000577870 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP39.67■■■■□ 3.94
SARM1-202ENST00000577870 WDR97A6NE52 1622 aa39.58■■■■□ 3.93
SARM1-202ENST00000577870 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa39.56■■■■□ 3.92
SARM1-202ENST00000577870 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP39.5■■■■□ 3.91
SARM1-202ENST00000577870 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP39.5■■■■□ 3.91
SARM1-202ENST00000577870 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP39.49■■■■□ 3.91
SARM1-202ENST00000577870 TRIM41Q8WV44 630 aa39.37■■■■□ 3.89
SARM1-202ENST00000577870 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa39.36■■■■□ 3.89
SARM1-202ENST00000577870 GAPVD1Q14C86 1478 aa39.32■■■■□ 3.89
SARM1-202ENST00000577870 CHIC1Q5VXU3 224 aa39.28■■■■□ 3.88
SARM1-202ENST00000577870 GRIN2BQ13224 1484 aa39.24■■■■□ 3.87
SARM1-202ENST00000577870 PBRM1Q86U86 1689 aa39.19■■■■□ 3.86
SARM1-202ENST00000577870 KIF27Q86VH2 1401 aa39.14■■■■□ 3.86
SARM1-202ENST00000577870 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa39.12■■■■□ 3.85
SARM1-202ENST00000577870 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP39.09■■■■□ 3.85
SARM1-202ENST00000577870 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.08■■■■□ 3.85
SARM1-202ENST00000577870 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa39■■■■□ 3.83
SARM1-202ENST00000577870 IGF1RP08069 1367 aa38.99■■■■□ 3.83
SARM1-202ENST00000577870 SYNJ2O15056 1496 aa38.93■■■■□ 3.82
SARM1-202ENST00000577870 ADAMTS12P58397 1594 aa38.93■■■■□ 3.82
SARM1-202ENST00000577870 CHD1O14646 1710 aa38.92■■■■□ 3.82
SARM1-202ENST00000577870 FHAD1B1AJZ9 1412 aa38.89■■■■□ 3.82
SARM1-202ENST00000577870 FBLN2P98095 1184 aa38.85■■■■□ 3.81
SARM1-202ENST00000577870 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP38.85■■■■□ 3.81
SARM1-202ENST00000577870 OSCARQ8IYS5 282 aa38.81■■■■□ 3.8
SARM1-202ENST00000577870 CUL7Q14999 1698 aa38.79■■■■□ 3.8
SARM1-202ENST00000577870 GRIN2AQ12879 1464 aa38.74■■■■□ 3.79
SARM1-202ENST00000577870 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa38.72■■■■□ 3.79
SARM1-202ENST00000577870 EEA1Q15075 1411 aa38.71■■■■□ 3.79
SARM1-202ENST00000577870 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa38.65■■■■□ 3.78
SARM1-202ENST00000577870 CSRNP3Q8WYN3 585 aa38.61■■■■□ 3.77
SARM1-202ENST00000577870 NUP160Q12769 1436 aa38.59■■■■□ 3.77
SARM1-202ENST00000577870 PRXQ9BXM0 1461 aa38.57■■■■□ 3.76
SARM1-202ENST00000577870 CEP170Q5SW79 1584 aa38.55■■■■□ 3.76
SARM1-202ENST00000577870 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa38.54■■■■□ 3.76
SARM1-202ENST00000577870 CLASP1Q7Z460 1538 aa38.54■■■■□ 3.76
SARM1-202ENST00000577870 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP38.53■■■■□ 3.76
SARM1-202ENST00000577870 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa38.32■■■■□ 3.72
SARM1-202ENST00000577870 KIF21BO75037 1637 aa38.29■■■■□ 3.72
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.4 ms