RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577545.1

PRR29-AS1-201, PRR29 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3

Gene PRR29-AS1, Length 889 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRR29-AS1-201ENST00000577545 NISCHQ9Y2I1 1504 aa34.98■■■■□ 3.19
PRR29-AS1-201ENST00000577545 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa30.97■■■□□ 2.55
PRR29-AS1-201ENST00000577545 ABCC9O60706 1549 aa30.02■■■□□ 2.4
PRR29-AS1-201ENST00000577545 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP29.19■■■□□ 2.26
PRR29-AS1-201ENST00000577545 DCAF8L2P0C7V8 631 aa29.14■■■□□ 2.26
PRR29-AS1-201ENST00000577545 NACADO15069 1562 aa29.08■■■□□ 2.25
PRR29-AS1-201ENST00000577545 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa29.04■■■□□ 2.24
PRR29-AS1-201ENST00000577545 MYO15BQ96JP2 1530 aa29.02■■■□□ 2.24
PRR29-AS1-201ENST00000577545 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa28.99■■■□□ 2.23
PRR29-AS1-201ENST00000577545 SCRIBQ14160 1630 aa28.26■■■□□ 2.11
PRR29-AS1-201ENST00000577545 UNC13AQ9UPW8 1703 aa28.24■■■□□ 2.11
PRR29-AS1-201ENST00000577545 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP28.11■■■□□ 2.09
PRR29-AS1-201ENST00000577545 BICRAQ9NZM4 1560 aa28.08■■■□□ 2.09
PRR29-AS1-201ENST00000577545 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa27.94■■■□□ 2.06
PRR29-AS1-201ENST00000577545 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP27.36■■□□□ 1.97
PRR29-AS1-201ENST00000577545 DNAJC5BQ9UF47 199 aa27.26■■□□□ 1.95
PRR29-AS1-201ENST00000577545 CECR2Q9BXF3 1484 aa27.18■■□□□ 1.94
PRR29-AS1-201ENST00000577545 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa27.16■■□□□ 1.94
PRR29-AS1-201ENST00000577545 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP27.12■■□□□ 1.93
PRR29-AS1-201ENST00000577545 SMARCA4P51532 1647 aa27.06■■□□□ 1.92
PRR29-AS1-201ENST00000577545 MROH2BQ7Z745 1585 aa26.93■■□□□ 1.9
PRR29-AS1-201ENST00000577545 SMARCA2P51531 1590 aa26.88■■□□□ 1.89
PRR29-AS1-201ENST00000577545 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa26.87■■□□□ 1.89
PRR29-AS1-201ENST00000577545 NCAPD3P42695 1498 aa26.83■■□□□ 1.89
PRR29-AS1-201ENST00000577545 PEG3Q9GZU2 1588 aa26.81■■□□□ 1.88
PRR29-AS1-201ENST00000577545 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP26.76■■□□□ 1.87
PRR29-AS1-201ENST00000577545 HMGXB3Q12766 1538 aa26.72■■□□□ 1.87
PRR29-AS1-201ENST00000577545 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP26.69■■□□□ 1.86
PRR29-AS1-201ENST00000577545 WIZO95785 1651 aa26.63■■□□□ 1.85
PRR29-AS1-201ENST00000577545 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP26.43■■□□□ 1.82
PRR29-AS1-201ENST00000577545 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP26.3■■□□□ 1.8
PRR29-AS1-201ENST00000577545 CCDC88BA6NC98 1476 aa26.1■■□□□ 1.77
PRR29-AS1-201ENST00000577545 CADPSQ9ULU8 1353 aa26.07■■□□□ 1.76
PRR29-AS1-201ENST00000577545 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa26.07■■□□□ 1.76
PRR29-AS1-201ENST00000577545 NESP48681 1621 aa26.03■■□□□ 1.76
PRR29-AS1-201ENST00000577545 CFTRP13569 1480 aa25.97■■□□□ 1.75
PRR29-AS1-201ENST00000577545 PDS5BQ9NTI5 1447 aa25.93■■□□□ 1.74
PRR29-AS1-201ENST00000577545 ERCC6Q03468 1493 aa25.91■■□□□ 1.74
PRR29-AS1-201ENST00000577545 FANCD2Q9BXW9 1451 aa25.76■■□□□ 1.71
PRR29-AS1-201ENST00000577545 CEP164Q9UPV0 1460 aa25.72■■□□□ 1.71
PRR29-AS1-201ENST00000577545 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa25.71■■□□□ 1.71
PRR29-AS1-201ENST00000577545 PRDM2Q13029 1718 aa25.71■■□□□ 1.71
PRR29-AS1-201ENST00000577545 MRC2Q9UBG0 1479 aa25.62■■□□□ 1.69
PRR29-AS1-201ENST00000577545 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP25.59■■□□□ 1.69
PRR29-AS1-201ENST00000577545 CUX2O14529 1486 aa25.53■■□□□ 1.68
PRR29-AS1-201ENST00000577545 WDR62O43379 1518 aa25.5■■□□□ 1.67
PRR29-AS1-201ENST00000577545 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP25.45■■□□□ 1.66
PRR29-AS1-201ENST00000577545 ABCC8Q09428 1581 aa25.44■■□□□ 1.66
PRR29-AS1-201ENST00000577545 DNMBPQ6XZF7 1577 aa25.37■■□□□ 1.65
PRR29-AS1-201ENST00000577545 TOPBP1Q92547 1522 aa25.36■■□□□ 1.65
PRR29-AS1-201ENST00000577545 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa25.28■■□□□ 1.64
PRR29-AS1-201ENST00000577545 CUX1P39880 1505 aa25.26■■□□□ 1.63
PRR29-AS1-201ENST00000577545 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP25.25■■□□□ 1.63
PRR29-AS1-201ENST00000577545 IFT140Q96RY7 1462 aa25.17■■□□□ 1.62
PRR29-AS1-201ENST00000577545 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
PRR29-AS1-201ENST00000577545 FGD5Q6ZNL6 1462 aa25.15■■□□□ 1.62
PRR29-AS1-201ENST00000577545 TOP2BQ02880 1626 aa25.13■■□□□ 1.61
PRR29-AS1-201ENST00000577545 SYNJ1O43426 1573 aa25.11■■□□□ 1.61
PRR29-AS1-201ENST00000577545 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa25.1■■□□□ 1.61
PRR29-AS1-201ENST00000577545 SOGA1O94964 1423 aa25.1■■□□□ 1.61
PRR29-AS1-201ENST00000577545 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
PRR29-AS1-201ENST00000577545 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa25.03■■□□□ 1.6
PRR29-AS1-201ENST00000577545 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP24.97■■□□□ 1.59
PRR29-AS1-201ENST00000577545 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa24.93■■□□□ 1.58
PRR29-AS1-201ENST00000577545 WDR97A6NE52 1622 aa24.93■■□□□ 1.58
PRR29-AS1-201ENST00000577545 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
PRR29-AS1-201ENST00000577545 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.58
PRR29-AS1-201ENST00000577545 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP24.89■■□□□ 1.57
PRR29-AS1-201ENST00000577545 TRIM41Q8WV44 630 aa24.87■■□□□ 1.57
PRR29-AS1-201ENST00000577545 GAPVD1Q14C86 1478 aa24.81■■□□□ 1.56
PRR29-AS1-201ENST00000577545 GRIN2BQ13224 1484 aa24.78■■□□□ 1.56
PRR29-AS1-201ENST00000577545 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa24.77■■□□□ 1.56
PRR29-AS1-201ENST00000577545 KIF27Q86VH2 1401 aa24.72■■□□□ 1.55
PRR29-AS1-201ENST00000577545 CHIC1Q5VXU3 224 aa24.7■■□□□ 1.54
PRR29-AS1-201ENST00000577545 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP24.69■■□□□ 1.54
PRR29-AS1-201ENST00000577545 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa24.68■■□□□ 1.54
PRR29-AS1-201ENST00000577545 PBRM1Q86U86 1689 aa24.66■■□□□ 1.54
PRR29-AS1-201ENST00000577545 ERICH3Q5RHP9 1530 aa24.65■■□□□ 1.54
PRR29-AS1-201ENST00000577545 SYNJ2O15056 1496 aa24.58■■□□□ 1.53
PRR29-AS1-201ENST00000577545 FBLN2P98095 1184 aa24.58■■□□□ 1.53
PRR29-AS1-201ENST00000577545 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP24.58■■□□□ 1.53
PRR29-AS1-201ENST00000577545 FHAD1B1AJZ9 1412 aa24.55■■□□□ 1.52
PRR29-AS1-201ENST00000577545 IGF1RP08069 1367 aa24.54■■□□□ 1.52
PRR29-AS1-201ENST00000577545 OSCARQ8IYS5 282 aa24.54■■□□□ 1.52
PRR29-AS1-201ENST00000577545 ADAMTS12P58397 1594 aa24.54■■□□□ 1.52
PRR29-AS1-201ENST00000577545 CHD1O14646 1710 aa24.48■■□□□ 1.51
PRR29-AS1-201ENST00000577545 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa24.47■■□□□ 1.51
PRR29-AS1-201ENST00000577545 CUL7Q14999 1698 aa24.46■■□□□ 1.51
PRR29-AS1-201ENST00000577545 EEA1Q15075 1411 aa24.46■■□□□ 1.51
PRR29-AS1-201ENST00000577545 GRIN2AQ12879 1464 aa24.44■■□□□ 1.5
PRR29-AS1-201ENST00000577545 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa24.42■■□□□ 1.5
PRR29-AS1-201ENST00000577545 CSRNP3Q8WYN3 585 aa24.35■■□□□ 1.49
PRR29-AS1-201ENST00000577545 NUP160Q12769 1436 aa24.32■■□□□ 1.48
PRR29-AS1-201ENST00000577545 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa24.32■■□□□ 1.48
PRR29-AS1-201ENST00000577545 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP24.3■■□□□ 1.48
PRR29-AS1-201ENST00000577545 PRXQ9BXM0 1461 aa24.28■■□□□ 1.48
PRR29-AS1-201ENST00000577545 CLASP1Q7Z460 1538 aa24.27■■□□□ 1.48
PRR29-AS1-201ENST00000577545 CEP170Q5SW79 1584 aa24.26■■□□□ 1.47
PRR29-AS1-201ENST00000577545 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa24.17■■□□□ 1.46
PRR29-AS1-201ENST00000577545 KIF21BO75037 1637 aa24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 66.5 ms