RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000571855.1

ABCC3-218, Transcript of ATP binding cassette subfamily C member 3, humanhuman

Gene ABCC3, Length 1,562 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC3-218ENST00000571855 NISCHQ9Y2I1 1504 aa39.93■■■■□ 3.98
ABCC3-218ENST00000571855 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa35.38■■■■□ 3.25
ABCC3-218ENST00000571855 ABCC9O60706 1549 aa34.42■■■■□ 3.1
ABCC3-218ENST00000571855 DCAF8L2P0C7V8 631 aa33.3■■■□□ 2.92
ABCC3-218ENST00000571855 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP33.29■■■□□ 2.92
ABCC3-218ENST00000571855 NACADO15069 1562 aa33.22■■■□□ 2.91
ABCC3-218ENST00000571855 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa33.19■■■□□ 2.9
ABCC3-218ENST00000571855 MYO15BQ96JP2 1530 aa33.09■■■□□ 2.89
ABCC3-218ENST00000571855 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa33.03■■■□□ 2.88
ABCC3-218ENST00000571855 UNC13AQ9UPW8 1703 aa32.5■■■□□ 2.79
ABCC3-218ENST00000571855 SCRIBQ14160 1630 aa32.31■■■□□ 2.76
ABCC3-218ENST00000571855 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP32.22■■■□□ 2.75
ABCC3-218ENST00000571855 BICRAQ9NZM4 1560 aa32.2■■■□□ 2.75
ABCC3-218ENST00000571855 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa31.84■■■□□ 2.69
ABCC3-218ENST00000571855 DNAJC5BQ9UF47 199 aa31.43■■■□□ 2.62
ABCC3-218ENST00000571855 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP31.32■■■□□ 2.61
ABCC3-218ENST00000571855 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa31.15■■■□□ 2.58
ABCC3-218ENST00000571855 CECR2Q9BXF3 1484 aa31.09■■■□□ 2.57
ABCC3-218ENST00000571855 SMARCA4P51532 1647 aa30.93■■■□□ 2.54
ABCC3-218ENST00000571855 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP30.92■■■□□ 2.54
ABCC3-218ENST00000571855 MROH2BQ7Z745 1585 aa30.78■■■□□ 2.52
ABCC3-218ENST00000571855 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa30.71■■■□□ 2.51
ABCC3-218ENST00000571855 SMARCA2P51531 1590 aa30.67■■■□□ 2.5
ABCC3-218ENST00000571855 NCAPD3P42695 1498 aa30.66■■■□□ 2.5
ABCC3-218ENST00000571855 PEG3Q9GZU2 1588 aa30.62■■■□□ 2.49
ABCC3-218ENST00000571855 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP30.52■■■□□ 2.48
ABCC3-218ENST00000571855 HMGXB3Q12766 1538 aa30.51■■■□□ 2.47
ABCC3-218ENST00000571855 WIZO95785 1651 aa30.47■■■□□ 2.47
ABCC3-218ENST00000571855 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP30.46■■■□□ 2.47
ABCC3-218ENST00000571855 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP30.13■■■□□ 2.41
ABCC3-218ENST00000571855 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP29.93■■■□□ 2.38
ABCC3-218ENST00000571855 NESP48681 1621 aa29.86■■■□□ 2.37
ABCC3-218ENST00000571855 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa29.8■■■□□ 2.36
ABCC3-218ENST00000571855 CCDC88BA6NC98 1476 aa29.8■■■□□ 2.36
ABCC3-218ENST00000571855 CADPSQ9ULU8 1353 aa29.78■■■□□ 2.36
ABCC3-218ENST00000571855 CFTRP13569 1480 aa29.64■■■□□ 2.34
ABCC3-218ENST00000571855 ERCC6Q03468 1493 aa29.64■■■□□ 2.34
ABCC3-218ENST00000571855 PDS5BQ9NTI5 1447 aa29.6■■■□□ 2.33
ABCC3-218ENST00000571855 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa29.52■■■□□ 2.32
ABCC3-218ENST00000571855 PRDM2Q13029 1718 aa29.46■■■□□ 2.31
ABCC3-218ENST00000571855 FANCD2Q9BXW9 1451 aa29.43■■■□□ 2.3
ABCC3-218ENST00000571855 CEP164Q9UPV0 1460 aa29.36■■■□□ 2.29
ABCC3-218ENST00000571855 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP29.34■■■□□ 2.29
ABCC3-218ENST00000571855 MRC2Q9UBG0 1479 aa29.27■■■□□ 2.28
ABCC3-218ENST00000571855 CUX2O14529 1486 aa29.24■■■□□ 2.27
ABCC3-218ENST00000571855 WDR62O43379 1518 aa29.17■■■□□ 2.26
ABCC3-218ENST00000571855 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP29.12■■■□□ 2.25
ABCC3-218ENST00000571855 ABCC8Q09428 1581 aa28.99■■■□□ 2.23
ABCC3-218ENST00000571855 TOPBP1Q92547 1522 aa28.99■■■□□ 2.23
ABCC3-218ENST00000571855 DNMBPQ6XZF7 1577 aa28.97■■■□□ 2.23
ABCC3-218ENST00000571855 CUX1P39880 1505 aa28.86■■■□□ 2.21
ABCC3-218ENST00000571855 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP28.76■■■□□ 2.19
ABCC3-218ENST00000571855 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP28.75■■■□□ 2.19
ABCC3-218ENST00000571855 IFT140Q96RY7 1462 aa28.74■■■□□ 2.19
ABCC3-218ENST00000571855 FGD5Q6ZNL6 1462 aa28.72■■■□□ 2.19
ABCC3-218ENST00000571855 SYNJ1O43426 1573 aa28.67■■■□□ 2.18
ABCC3-218ENST00000571855 TOP2BQ02880 1626 aa28.67■■■□□ 2.18
ABCC3-218ENST00000571855 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP28.66■■■□□ 2.18
ABCC3-218ENST00000571855 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa28.66■■■□□ 2.18
ABCC3-218ENST00000571855 SOGA1O94964 1423 aa28.65■■■□□ 2.18
ABCC3-218ENST00000571855 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa28.64■■■□□ 2.18
ABCC3-218ENST00000571855 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP28.61■■■□□ 2.17
ABCC3-218ENST00000571855 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP28.49■■■□□ 2.15
ABCC3-218ENST00000571855 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP28.48■■■□□ 2.15
ABCC3-218ENST00000571855 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP28.47■■■□□ 2.15
ABCC3-218ENST00000571855 WDR97A6NE52 1622 aa28.47■■■□□ 2.15
ABCC3-218ENST00000571855 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa28.45■■■□□ 2.15
ABCC3-218ENST00000571855 GAPVD1Q14C86 1478 aa28.32■■■□□ 2.12
ABCC3-218ENST00000571855 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa28.32■■■□□ 2.12
ABCC3-218ENST00000571855 GRIN2BQ13224 1484 aa28.27■■■□□ 2.12
ABCC3-218ENST00000571855 TRIM41Q8WV44 630 aa28.25■■■□□ 2.11
ABCC3-218ENST00000571855 PBRM1Q86U86 1689 aa28.25■■■□□ 2.11
ABCC3-218ENST00000571855 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa28.2■■■□□ 2.1
ABCC3-218ENST00000571855 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP28.18■■■□□ 2.1
ABCC3-218ENST00000571855 KIF27Q86VH2 1401 aa28.13■■■□□ 2.09
ABCC3-218ENST00000571855 ERICH3Q5RHP9 1530 aa28.11■■■□□ 2.09
ABCC3-218ENST00000571855 CHD1O14646 1710 aa28.11■■■□□ 2.09
ABCC3-218ENST00000571855 FBLN2P98095 1184 aa28.11■■■□□ 2.09
ABCC3-218ENST00000571855 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa28.11■■■□□ 2.09
ABCC3-218ENST00000571855 OSCARQ8IYS5 282 aa28.1■■■□□ 2.09
ABCC3-218ENST00000571855 SYNJ2O15056 1496 aa28.07■■■□□ 2.08
ABCC3-218ENST00000571855 CHIC1Q5VXU3 224 aa28.07■■■□□ 2.08
ABCC3-218ENST00000571855 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP28.06■■■□□ 2.08
ABCC3-218ENST00000571855 ADAMTS12P58397 1594 aa28.02■■■□□ 2.08
ABCC3-218ENST00000571855 IGF1RP08069 1367 aa28.01■■■□□ 2.08
ABCC3-218ENST00000571855 FHAD1B1AJZ9 1412 aa27.99■■■□□ 2.07
ABCC3-218ENST00000571855 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa27.97■■■□□ 2.07
ABCC3-218ENST00000571855 GRIN2AQ12879 1464 aa27.91■■■□□ 2.06
ABCC3-218ENST00000571855 CUL7Q14999 1698 aa27.9■■■□□ 2.06
ABCC3-218ENST00000571855 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa27.84■■■□□ 2.05
ABCC3-218ENST00000571855 CLASP1Q7Z460 1538 aa27.79■■■□□ 2.04
ABCC3-218ENST00000571855 NUP160Q12769 1436 aa27.78■■■□□ 2.04
ABCC3-218ENST00000571855 CEP170Q5SW79 1584 aa27.77■■■□□ 2.04
ABCC3-218ENST00000571855 EEA1Q15075 1411 aa27.73■■■□□ 2.03
ABCC3-218ENST00000571855 CSRNP3Q8WYN3 585 aa27.7■■■□□ 2.03
ABCC3-218ENST00000571855 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa27.69■■■□□ 2.02
ABCC3-218ENST00000571855 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP27.67■■■□□ 2.02
ABCC3-218ENST00000571855 PRXQ9BXM0 1461 aa27.65■■■□□ 2.02
ABCC3-218ENST00000571855 ARHGEF11O15085 1522 aa27.62■■■□□ 2.01
ABCC3-218ENST00000571855 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa27.6■■■□□ 2.01
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