RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000569441.5

JMJD8-214, Transcript of jumonji domain containing 8, humanhuman

TSL 5

Gene JMJD8, Length 1,428 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JMJD8-214ENST00000569441 NISCHQ9Y2I1 1504 aa73.38■■■■■ 9.34
JMJD8-214ENST00000569441 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa64.92■■■■■ 7.98
JMJD8-214ENST00000569441 ABCC9O60706 1549 aa63.17■■■■■ 7.7
JMJD8-214ENST00000569441 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP61.2■■■■■ 7.39
JMJD8-214ENST00000569441 DCAF8L2P0C7V8 631 aa61.15■■■■■ 7.38
JMJD8-214ENST00000569441 NACADO15069 1562 aa60.96■■■■■ 7.35
JMJD8-214ENST00000569441 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa60.89■■■■■ 7.34
JMJD8-214ENST00000569441 MYO15BQ96JP2 1530 aa60.75■■■■■ 7.32
JMJD8-214ENST00000569441 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa60.68■■■■■ 7.3
JMJD8-214ENST00000569441 UNC13AQ9UPW8 1703 aa59.61■■■■■ 7.13
JMJD8-214ENST00000569441 SCRIBQ14160 1630 aa59.35■■■■■ 7.09
JMJD8-214ENST00000569441 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP59.18■■■■■ 7.062e-6■■■■□ 24.9
JMJD8-214ENST00000569441 BICRAQ9NZM4 1560 aa59.14■■■■■ 7.06
JMJD8-214ENST00000569441 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa58.39■■■■■ 6.94
JMJD8-214ENST00000569441 DNAJC5BQ9UF47 199 aa57.68■■■■■ 6.82
JMJD8-214ENST00000569441 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP57.49■■■■■ 6.79
JMJD8-214ENST00000569441 CECR2Q9BXF3 1484 aa57.18■■■■■ 6.74
JMJD8-214ENST00000569441 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa57.14■■■■■ 6.74
JMJD8-214ENST00000569441 SMARCA4P51532 1647 aa56.81■■■■■ 6.68
JMJD8-214ENST00000569441 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP56.78■■■■■ 6.68
JMJD8-214ENST00000569441 MROH2BQ7Z745 1585 aa56.6■■■■■ 6.65
JMJD8-214ENST00000569441 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa56.41■■■■■ 6.62
JMJD8-214ENST00000569441 NCAPD3P42695 1498 aa56.3■■■■■ 6.6
JMJD8-214ENST00000569441 SMARCA2P51531 1590 aa56.28■■■■■ 6.6
JMJD8-214ENST00000569441 PEG3Q9GZU2 1588 aa56.24■■■■■ 6.59
JMJD8-214ENST00000569441 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP56.13■■■■■ 6.58
JMJD8-214ENST00000569441 WIZO95785 1651 aa56■■■■■ 6.56
JMJD8-214ENST00000569441 HMGXB3Q12766 1538 aa56■■■■■ 6.56
JMJD8-214ENST00000569441 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP55.92■■■■■ 6.54
JMJD8-214ENST00000569441 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP55.37■■■■■ 6.45
JMJD8-214ENST00000569441 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP55.08■■■■■ 6.41
JMJD8-214ENST00000569441 NESP48681 1621 aa54.85■■■■■ 6.37
JMJD8-214ENST00000569441 CCDC88BA6NC98 1476 aa54.79■■■■■ 6.36
JMJD8-214ENST00000569441 CADPSQ9ULU8 1353 aa54.68■■■■■ 6.34
JMJD8-214ENST00000569441 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa54.67■■■■■ 6.34
JMJD8-214ENST00000569441 CFTRP13569 1480 aa54.46■■■■■ 6.31
JMJD8-214ENST00000569441 ERCC6Q03468 1493 aa54.32■■■■■ 6.29
JMJD8-214ENST00000569441 PDS5BQ9NTI5 1447 aa54.29■■■■■ 6.28
JMJD8-214ENST00000569441 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa54.15■■■■■ 6.26
JMJD8-214ENST00000569441 FANCD2Q9BXW9 1451 aa54.04■■■■■ 6.24
JMJD8-214ENST00000569441 PRDM2Q13029 1718 aa54.01■■■■■ 6.24
JMJD8-214ENST00000569441 CEP164Q9UPV0 1460 aa53.88■■■■■ 6.22
JMJD8-214ENST00000569441 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP53.84■■■■■ 6.21
JMJD8-214ENST00000569441 MRC2Q9UBG0 1479 aa53.72■■■■■ 6.19
JMJD8-214ENST00000569441 CUX2O14529 1486 aa53.57■■■■■ 6.17
JMJD8-214ENST00000569441 WDR62O43379 1518 aa53.53■■■■■ 6.16
JMJD8-214ENST00000569441 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP53.51■■■■■ 6.16
JMJD8-214ENST00000569441 TOPBP1Q92547 1522 aa53.24■■■■■ 6.11
JMJD8-214ENST00000569441 ABCC8Q09428 1581 aa53.19■■■■■ 6.11
JMJD8-214ENST00000569441 DNMBPQ6XZF7 1577 aa53.18■■■■■ 6.1
JMJD8-214ENST00000569441 CUX1P39880 1505 aa53.05■■■■■ 6.08
JMJD8-214ENST00000569441 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP52.85■■■■■ 6.05
JMJD8-214ENST00000569441 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP52.82■■■■■ 6.05
JMJD8-214ENST00000569441 FGD5Q6ZNL6 1462 aa52.76■■■■■ 6.04
JMJD8-214ENST00000569441 IFT140Q96RY7 1462 aa52.75■■■■■ 6.03
JMJD8-214ENST00000569441 SYNJ1O43426 1573 aa52.73■■■■■ 6.03
JMJD8-214ENST00000569441 TOP2BQ02880 1626 aa52.67■■■■■ 6.02
JMJD8-214ENST00000569441 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa52.66■■■■■ 6.02
JMJD8-214ENST00000569441 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa52.64■■■■■ 6.02
JMJD8-214ENST00000569441 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP52.63■■■■■ 6.02
JMJD8-214ENST00000569441 SOGA1O94964 1423 aa52.63■■■■■ 6.02
JMJD8-214ENST00000569441 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP52.55■■■■■ 6
JMJD8-214ENST00000569441 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP52.32■■■■■ 5.973e-9■■■■■ 43.8
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JMJD8-214ENST00000569441 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP52.29■■■■■ 5.96
JMJD8-214ENST00000569441 WDR97A6NE52 1622 aa52.28■■■■■ 5.96
JMJD8-214ENST00000569441 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa52.27■■■■■ 5.96
JMJD8-214ENST00000569441 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa52.01■■■■■ 5.92
JMJD8-214ENST00000569441 GAPVD1Q14C86 1478 aa52■■■■■ 5.92
JMJD8-214ENST00000569441 TRIM41Q8WV44 630 aa51.97■■■■■ 5.91
JMJD8-214ENST00000569441 GRIN2BQ13224 1484 aa51.91■■■■■ 5.9
JMJD8-214ENST00000569441 PBRM1Q86U86 1689 aa51.83■■■■■ 5.89
JMJD8-214ENST00000569441 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa51.8■■■■■ 5.88
JMJD8-214ENST00000569441 CHIC1Q5VXU3 224 aa51.73■■■■■ 5.87
JMJD8-214ENST00000569441 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP51.7■■■■■ 5.87
JMJD8-214ENST00000569441 KIF27Q86VH2 1401 aa51.68■■■■■ 5.86
JMJD8-214ENST00000569441 ERICH3Q5RHP9 1530 aa51.62■■■■■ 5.85
JMJD8-214ENST00000569441 CHD1O14646 1710 aa51.56■■■■■ 5.84
JMJD8-214ENST00000569441 FBLN2P98095 1184 aa51.55■■■■■ 5.84
JMJD8-214ENST00000569441 OSCARQ8IYS5 282 aa51.52■■■■■ 5.84
JMJD8-214ENST00000569441 SYNJ2O15056 1496 aa51.52■■■■■ 5.84
JMJD8-214ENST00000569441 IGF1RP08069 1367 aa51.51■■■■■ 5.84
JMJD8-214ENST00000569441 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa51.5■■■■■ 5.84
JMJD8-214ENST00000569441 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP51.48■■■■■ 5.83
JMJD8-214ENST00000569441 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa51.47■■■■■ 5.83
JMJD8-214ENST00000569441 ADAMTS12P58397 1594 aa51.46■■■■■ 5.83
JMJD8-214ENST00000569441 FHAD1B1AJZ9 1412 aa51.41■■■■■ 5.82
JMJD8-214ENST00000569441 GRIN2AQ12879 1464 aa51.25■■■■■ 5.8
JMJD8-214ENST00000569441 CUL7Q14999 1698 aa51.22■■■■■ 5.79
JMJD8-214ENST00000569441 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa51.17■■■■■ 5.78
JMJD8-214ENST00000569441 NUP160Q12769 1436 aa51.03■■■■■ 5.76
JMJD8-214ENST00000569441 CLASP1Q7Z460 1538 aa51.02■■■■■ 5.76
JMJD8-214ENST00000569441 CEP170Q5SW79 1584 aa51.01■■■■■ 5.76
JMJD8-214ENST00000569441 EEA1Q15075 1411 aa50.98■■■■■ 5.75
JMJD8-214ENST00000569441 CSRNP3Q8WYN3 585 aa50.96■■■■■ 5.75
JMJD8-214ENST00000569441 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP50.93■■■■■ 5.74
JMJD8-214ENST00000569441 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa50.89■■■■■ 5.74
JMJD8-214ENST00000569441 PRXQ9BXM0 1461 aa50.88■■■■■ 5.73
JMJD8-214ENST00000569441 ARHGEF11O15085 1522 aa50.66■■■■■ 5.7
JMJD8-214ENST00000569441 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa50.64■■■■■ 5.7
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