RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000569223.1

EHD4-202, Transcript of EH domain containing 4, humanhuman

TSL 2

Gene EHD4, Length 2,032 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD4-202ENST00000569223 NISCHQ9Y2I1 1504 aa49.68■■■■■ 5.54
EHD4-202ENST00000569223 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa42.69■■■■■ 4.42
EHD4-202ENST00000569223 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP41.97■■■■■ 4.31
EHD4-202ENST00000569223 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa41.62■■■■■ 4.25
EHD4-202ENST00000569223 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa40.94■■■■■ 4.14
EHD4-202ENST00000569223 DCAF8L2P0C7V8 631 aa40.86■■■■■ 4.13
EHD4-202ENST00000569223 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP40.57■■■■■ 4.09
EHD4-202ENST00000569223 MYO15BQ96JP2 1530 aa39.97■■■■□ 3.99
EHD4-202ENST00000569223 SCRIBQ14160 1630 aa39.64■■■■□ 3.94
EHD4-202ENST00000569223 ABCC9O60706 1549 aa39.55■■■■□ 3.92
EHD4-202ENST00000569223 NACADO15069 1562 aa39.48■■■■□ 3.91
EHD4-202ENST00000569223 CHIC1Q5VXU3 224 aa39.38■■■■□ 3.89
EHD4-202ENST00000569223 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP39.04■■■■□ 3.84
EHD4-202ENST00000569223 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa38.9■■■■□ 3.82
EHD4-202ENST00000569223 CECR2Q9BXF3 1484 aa38.64■■■■□ 3.78
EHD4-202ENST00000569223 MROH2BQ7Z745 1585 aa38.52■■■■□ 3.76
EHD4-202ENST00000569223 UNC13AQ9UPW8 1703 aa38.34■■■■□ 3.73
EHD4-202ENST00000569223 WIZO95785 1651 aa38.32■■■■□ 3.72
EHD4-202ENST00000569223 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP38.23■■■■□ 3.71
EHD4-202ENST00000569223 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa38.03■■■■□ 3.68
EHD4-202ENST00000569223 SMARCA4P51532 1647 aa37.98■■■■□ 3.67
EHD4-202ENST00000569223 TRIM41Q8WV44 630 aa37.95■■■■□ 3.67
EHD4-202ENST00000569223 BICRAQ9NZM4 1560 aa37.83■■■■□ 3.65
EHD4-202ENST00000569223 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP37.82■■■■□ 3.64
EHD4-202ENST00000569223 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP37.73■■■■□ 3.63
EHD4-202ENST00000569223 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP37.6■■■■□ 3.61
EHD4-202ENST00000569223 SMARCA2P51531 1590 aa37.55■■■■□ 3.6
EHD4-202ENST00000569223 CCDC88BA6NC98 1476 aa37.52■■■■□ 3.6
EHD4-202ENST00000569223 PCGF6Q9BYE7 350 aa37.5■■■■□ 3.59
EHD4-202ENST00000569223 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP37.45■■■■□ 3.59
EHD4-202ENST00000569223 PEG3Q9GZU2 1588 aa37.37■■■■□ 3.57
EHD4-202ENST00000569223 HRCP23327 699 aa37.31■■■■□ 3.56
EHD4-202ENST00000569223 ABCC8Q09428 1581 aa37.2■■■■□ 3.55
EHD4-202ENST00000569223 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP37.07■■■■□ 3.53
EHD4-202ENST00000569223 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa37.05■■■■□ 3.52
EHD4-202ENST00000569223 EHMT2Q96KQ7 1210 aa37.01■■■■□ 3.52
EHD4-202ENST00000569223 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP36.91■■■■□ 3.5
EHD4-202ENST00000569223 SOGA1O94964 1423 aa36.72■■■■□ 3.47
EHD4-202ENST00000569223 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP36.69■■■■□ 3.46
EHD4-202ENST00000569223 EEA1Q15075 1411 aa36.66■■■■□ 3.46
EHD4-202ENST00000569223 SYNJ1O43426 1573 aa36.58■■■■□ 3.45
EHD4-202ENST00000569223 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa36.55■■■■□ 3.44
EHD4-202ENST00000569223 HMGXB3Q12766 1538 aa36.51■■■■□ 3.43
EHD4-202ENST00000569223 CSRNP3Q8WYN3 585 aa36.47■■■■□ 3.43
EHD4-202ENST00000569223 NCAPD3P42695 1498 aa36.46■■■■□ 3.43
EHD4-202ENST00000569223 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP36.43■■■■□ 3.42
EHD4-202ENST00000569223 TNIKQ9UKE5 1360 aa36.41■■■■□ 3.42
EHD4-202ENST00000569223 CEP162Q5TB80 1403 aa36.38■■■■□ 3.41
EHD4-202ENST00000569223 GOLGA3Q08378 1498 aa36.32■■■■□ 3.4
EHD4-202ENST00000569223 TOP2BQ02880 1626 aa36.25■■■■□ 3.39
EHD4-202ENST00000569223 KIF21BO75037 1637 aa36.22■■■■□ 3.39
EHD4-202ENST00000569223 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa36.19■■■■□ 3.38
EHD4-202ENST00000569223 UBTFP17480 764 aaKnown RBP36.18■■■■□ 3.38
EHD4-202ENST00000569223 CEP164Q9UPV0 1460 aa36.18■■■■□ 3.38
EHD4-202ENST00000569223 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP36.11■■■■□ 3.37
EHD4-202ENST00000569223 CFTRP13569 1480 aa36.01■■■■□ 3.36
EHD4-202ENST00000569223 CUX1P39880 1505 aa35.93■■■■□ 3.34
EHD4-202ENST00000569223 PRDM2Q13029 1718 aa35.92■■■■□ 3.34
EHD4-202ENST00000569223 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa35.89■■■■□ 3.34
EHD4-202ENST00000569223 CLIP1P30622 1438 aa35.81■■■■□ 3.32
EHD4-202ENST00000569223 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa35.77■■■■□ 3.32
EHD4-202ENST00000569223 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP35.73■■■■□ 3.31
EHD4-202ENST00000569223 ERICH3Q5RHP9 1530 aa35.73■■■■□ 3.31
EHD4-202ENST00000569223 PRXQ9BXM0 1461 aa35.7■■■■□ 3.31
EHD4-202ENST00000569223 CADPSQ9ULU8 1353 aa35.65■■■■□ 3.3
EHD4-202ENST00000569223 VPS8Q8N3P4 1428 aa35.64■■■■□ 3.3
EHD4-202ENST00000569223 KIF27Q86VH2 1401 aa35.62■■■■□ 3.29
EHD4-202ENST00000569223 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP35.56■■■■□ 3.28
EHD4-202ENST00000569223 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP35.47■■■■□ 3.27
EHD4-202ENST00000569223 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP35.41■■■■□ 3.26
EHD4-202ENST00000569223 ARAP1Q96P48 1450 aa35.35■■■■□ 3.25
EHD4-202ENST00000569223 CUX2O14529 1486 aa35.34■■■■□ 3.25
EHD4-202ENST00000569223 FGD5Q6ZNL6 1462 aa35.34■■■■□ 3.25
EHD4-202ENST00000569223 FANCD2Q9BXW9 1451 aa35.31■■■■□ 3.24
EHD4-202ENST00000569223 APLP2Q06481 763 aa35.3■■■■□ 3.24
EHD4-202ENST00000569223 IGF1RP08069 1367 aa35.23■■■■□ 3.23
EHD4-202ENST00000569223 DNMBPQ6XZF7 1577 aa35.17■■■■□ 3.22
EHD4-202ENST00000569223 NESP48681 1621 aa35.13■■■■□ 3.21
EHD4-202ENST00000569223 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa35.11■■■■□ 3.21
EHD4-202ENST00000569223 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa35.07■■■■□ 3.2
EHD4-202ENST00000569223 TOPBP1Q92547 1522 aa35.06■■■■□ 3.2
EHD4-202ENST00000569223 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP35.04■■■■□ 3.2
EHD4-202ENST00000569223 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa35.03■■■■□ 3.2
EHD4-202ENST00000569223 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP34.99■■■■□ 3.19
EHD4-202ENST00000569223 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa34.99■■■■□ 3.19
EHD4-202ENST00000569223 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa34.97■■■■□ 3.19
EHD4-202ENST00000569223 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP34.91■■■■□ 3.18
EHD4-202ENST00000569223 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP34.84■■■■□ 3.17
EHD4-202ENST00000569223 WDR97A6NE52 1622 aa34.82■■■■□ 3.16
EHD4-202ENST00000569223 CUL7Q14999 1698 aa34.8■■■■□ 3.16
EHD4-202ENST00000569223 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP34.76■■■■□ 3.15
EHD4-202ENST00000569223 PDS5BQ9NTI5 1447 aa34.73■■■■□ 3.15
EHD4-202ENST00000569223 MAP3K1Q13233 1512 aa34.72■■■■□ 3.15
EHD4-202ENST00000569223 TIAM1Q13009 1591 aa34.71■■■■□ 3.15
EHD4-202ENST00000569223 DNAJC5BQ9UF47 199 aa34.69■■■■□ 3.14
EHD4-202ENST00000569223 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa34.68■■■■□ 3.14
EHD4-202ENST00000569223 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa34.66■■■■□ 3.14
EHD4-202ENST00000569223 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa34.65■■■■□ 3.14
EHD4-202ENST00000569223 FHAD1B1AJZ9 1412 aa34.61■■■■□ 3.13
EHD4-202ENST00000569223 EFCAB5A4FU69 1503 aa34.59■■■■□ 3.13
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