RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566833.1

CCNDBP1-209, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene CCNDBP1, Length 577 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-209ENST00000566833 NISCHQ9Y2I1 1504 aa32.01■■■□□ 2.72
CCNDBP1-209ENST00000566833 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa28.35■■■□□ 2.13
CCNDBP1-209ENST00000566833 ABCC9O60706 1549 aa27.45■■□□□ 1.98
CCNDBP1-209ENST00000566833 DCAF8L2P0C7V8 631 aa26.73■■□□□ 1.87
CCNDBP1-209ENST00000566833 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP26.73■■□□□ 1.87
CCNDBP1-209ENST00000566833 NACADO15069 1562 aa26.58■■□□□ 1.85
CCNDBP1-209ENST00000566833 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa26.54■■□□□ 1.84
CCNDBP1-209ENST00000566833 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa26.49■■□□□ 1.83
CCNDBP1-209ENST00000566833 MYO15BQ96JP2 1530 aa26.47■■□□□ 1.83
CCNDBP1-209ENST00000566833 SCRIBQ14160 1630 aa25.92■■□□□ 1.74
CCNDBP1-209ENST00000566833 UNC13AQ9UPW8 1703 aa25.91■■□□□ 1.74
CCNDBP1-209ENST00000566833 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP25.7■■□□□ 1.7
CCNDBP1-209ENST00000566833 BICRAQ9NZM4 1560 aa25.66■■□□□ 1.7
CCNDBP1-209ENST00000566833 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa25.56■■□□□ 1.68
CCNDBP1-209ENST00000566833 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
CCNDBP1-209ENST00000566833 CECR2Q9BXF3 1484 aa24.89■■□□□ 1.58
CCNDBP1-209ENST00000566833 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP24.83■■□□□ 1.57
CCNDBP1-209ENST00000566833 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
CCNDBP1-209ENST00000566833 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa24.82■■□□□ 1.56
CCNDBP1-209ENST00000566833 DNAJC5BQ9UF47 199 aa24.81■■□□□ 1.56
CCNDBP1-209ENST00000566833 SMARCA4P51532 1647 aa24.79■■□□□ 1.56
CCNDBP1-209ENST00000566833 MROH2BQ7Z745 1585 aa24.67■■□□□ 1.54
CCNDBP1-209ENST00000566833 SMARCA2P51531 1590 aa24.58■■□□□ 1.52
CCNDBP1-209ENST00000566833 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa24.56■■□□□ 1.52
CCNDBP1-209ENST00000566833 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP24.51■■□□□ 1.51
CCNDBP1-209ENST00000566833 PEG3Q9GZU2 1588 aa24.5■■□□□ 1.51
CCNDBP1-209ENST00000566833 NCAPD3P42695 1498 aa24.48■■□□□ 1.51
CCNDBP1-209ENST00000566833 WIZO95785 1651 aa24.45■■□□□ 1.5
CCNDBP1-209ENST00000566833 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP24.42■■□□□ 1.5
CCNDBP1-209ENST00000566833 HMGXB3Q12766 1538 aa24.41■■□□□ 1.5
CCNDBP1-209ENST00000566833 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
CCNDBP1-209ENST00000566833 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
CCNDBP1-209ENST00000566833 CCDC88BA6NC98 1476 aa23.91■■□□□ 1.42
CCNDBP1-209ENST00000566833 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa23.82■■□□□ 1.4
CCNDBP1-209ENST00000566833 NESP48681 1621 aa23.81■■□□□ 1.4
CCNDBP1-209ENST00000566833 CADPSQ9ULU8 1353 aa23.81■■□□□ 1.4
CCNDBP1-209ENST00000566833 CFTRP13569 1480 aa23.72■■□□□ 1.39
CCNDBP1-209ENST00000566833 ERCC6Q03468 1493 aa23.68■■□□□ 1.38
CCNDBP1-209ENST00000566833 PDS5BQ9NTI5 1447 aa23.67■■□□□ 1.38
CCNDBP1-209ENST00000566833 PRDM2Q13029 1718 aa23.62■■□□□ 1.37
CCNDBP1-209ENST00000566833 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa23.57■■□□□ 1.36
CCNDBP1-209ENST00000566833 FANCD2Q9BXW9 1451 aa23.56■■□□□ 1.36
CCNDBP1-209ENST00000566833 CEP164Q9UPV0 1460 aa23.51■■□□□ 1.35
CCNDBP1-209ENST00000566833 CHIC1Q5VXU3 224 aa23.47■■□□□ 1.35
CCNDBP1-209ENST00000566833 MRC2Q9UBG0 1479 aa23.4■■□□□ 1.34
CCNDBP1-209ENST00000566833 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
CCNDBP1-209ENST00000566833 WDR62O43379 1518 aa23.28■■□□□ 1.32
CCNDBP1-209ENST00000566833 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
CCNDBP1-209ENST00000566833 CUX2O14529 1486 aa23.25■■□□□ 1.31
CCNDBP1-209ENST00000566833 ABCC8Q09428 1581 aa23.25■■□□□ 1.31
CCNDBP1-209ENST00000566833 DNMBPQ6XZF7 1577 aa23.22■■□□□ 1.31
CCNDBP1-209ENST00000566833 TOPBP1Q92547 1522 aa23.21■■□□□ 1.31
CCNDBP1-209ENST00000566833 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP23.15■■□□□ 1.3
CCNDBP1-209ENST00000566833 CUX1P39880 1505 aa23.13■■□□□ 1.29
CCNDBP1-209ENST00000566833 SYNJ1O43426 1573 aa23.05■■□□□ 1.28
CCNDBP1-209ENST00000566833 FGD5Q6ZNL6 1462 aa23.04■■□□□ 1.28
CCNDBP1-209ENST00000566833 TOP2BQ02880 1626 aa23.04■■□□□ 1.28
CCNDBP1-209ENST00000566833 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa23.04■■□□□ 1.28
CCNDBP1-209ENST00000566833 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
CCNDBP1-209ENST00000566833 IFT140Q96RY7 1462 aa22.99■■□□□ 1.27
CCNDBP1-209ENST00000566833 SOGA1O94964 1423 aa22.96■■□□□ 1.27
CCNDBP1-209ENST00000566833 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa22.93■■□□□ 1.26
CCNDBP1-209ENST00000566833 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
CCNDBP1-209ENST00000566833 TRIM41Q8WV44 630 aa22.87■■□□□ 1.25
CCNDBP1-209ENST00000566833 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
CCNDBP1-209ENST00000566833 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa22.81■■□□□ 1.24
CCNDBP1-209ENST00000566833 WDR97A6NE52 1622 aa22.8■■□□□ 1.24
CCNDBP1-209ENST00000566833 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
CCNDBP1-209ENST00000566833 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
CCNDBP1-209ENST00000566833 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP22.76■■□□□ 1.23
CCNDBP1-209ENST00000566833 GAPVD1Q14C86 1478 aa22.7■■□□□ 1.22
CCNDBP1-209ENST00000566833 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa22.69■■□□□ 1.22
CCNDBP1-209ENST00000566833 GRIN2BQ13224 1484 aa22.66■■□□□ 1.22
CCNDBP1-209ENST00000566833 KIF27Q86VH2 1401 aa22.65■■□□□ 1.22
CCNDBP1-209ENST00000566833 PBRM1Q86U86 1689 aa22.65■■□□□ 1.22
CCNDBP1-209ENST00000566833 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa22.58■■□□□ 1.2
CCNDBP1-209ENST00000566833 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
CCNDBP1-209ENST00000566833 ERICH3Q5RHP9 1530 aa22.55■■□□□ 1.2
CCNDBP1-209ENST00000566833 FBLN2P98095 1184 aa22.51■■□□□ 1.19
CCNDBP1-209ENST00000566833 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa22.49■■□□□ 1.19
CCNDBP1-209ENST00000566833 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
CCNDBP1-209ENST00000566833 SYNJ2O15056 1496 aa22.47■■□□□ 1.19
CCNDBP1-209ENST00000566833 ADAMTS12P58397 1594 aa22.46■■□□□ 1.19
CCNDBP1-209ENST00000566833 IGF1RP08069 1367 aa22.46■■□□□ 1.19
CCNDBP1-209ENST00000566833 FHAD1B1AJZ9 1412 aa22.45■■□□□ 1.18
CCNDBP1-209ENST00000566833 CHD1O14646 1710 aa22.45■■□□□ 1.18
CCNDBP1-209ENST00000566833 CUL7Q14999 1698 aa22.44■■□□□ 1.18
CCNDBP1-209ENST00000566833 EEA1Q15075 1411 aa22.43■■□□□ 1.18
CCNDBP1-209ENST00000566833 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
CCNDBP1-209ENST00000566833 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa22.38■■□□□ 1.17
CCNDBP1-209ENST00000566833 OSCARQ8IYS5 282 aa22.37■■□□□ 1.17
CCNDBP1-209ENST00000566833 GRIN2AQ12879 1464 aa22.35■■□□□ 1.17
CCNDBP1-209ENST00000566833 CSRNP3Q8WYN3 585 aa22.35■■□□□ 1.17
CCNDBP1-209ENST00000566833 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa22.28■■□□□ 1.16
CCNDBP1-209ENST00000566833 PRXQ9BXM0 1461 aa22.24■■□□□ 1.15
CCNDBP1-209ENST00000566833 CEP170Q5SW79 1584 aa22.21■■□□□ 1.15
CCNDBP1-209ENST00000566833 NUP160Q12769 1436 aa22.21■■□□□ 1.15
CCNDBP1-209ENST00000566833 CLASP1Q7Z460 1538 aa22.17■■□□□ 1.14
CCNDBP1-209ENST00000566833 KIF21BO75037 1637 aa22.16■■□□□ 1.14
CCNDBP1-209ENST00000566833 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa22.14■■□□□ 1.13
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