RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557916.5

SMAD6-202, Transcript of SMAD family member 6, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SMAD6, Length 1,401 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD6-202ENST00000557916 NISCHQ9Y2I1 1504 aa61.26■■■■■ 7.4
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SMAD6-202ENST00000557916 SMARCA2P51531 1590 aa47.05■■■■■ 5.12
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SMAD6-202ENST00000557916 ERCC6Q03468 1493 aa45.47■■■■■ 4.87
SMAD6-202ENST00000557916 PDS5BQ9NTI5 1447 aa45.41■■■■■ 4.86
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SMAD6-202ENST00000557916 FANCD2Q9BXW9 1451 aa45.15■■■■■ 4.82
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SMAD6-202ENST00000557916 MRC2Q9UBG0 1479 aa44.9■■■■■ 4.78
SMAD6-202ENST00000557916 CUX2O14529 1486 aa44.8■■■■■ 4.76
SMAD6-202ENST00000557916 WDR62O43379 1518 aa44.72■■■■■ 4.75
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SMAD6-202ENST00000557916 TOPBP1Q92547 1522 aa44.47■■■■■ 4.71
SMAD6-202ENST00000557916 DNMBPQ6XZF7 1577 aa44.44■■■■■ 4.7
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SMAD6-202ENST00000557916 FGD5Q6ZNL6 1462 aa44.08■■■■■ 4.65
SMAD6-202ENST00000557916 SYNJ1O43426 1573 aa44■■■■■ 4.63
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SMAD6-202ENST00000557916 WDR97A6NE52 1622 aa43.63■■■■■ 4.58
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SMAD6-202ENST00000557916 TRIM41Q8WV44 630 aa43.45■■■■■ 4.55
SMAD6-202ENST00000557916 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa43.42■■■■■ 4.54
SMAD6-202ENST00000557916 GRIN2BQ13224 1484 aa43.4■■■■■ 4.54
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SMAD6-202ENST00000557916 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP43.23■■■■■ 4.51
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SMAD6-202ENST00000557916 CHIC1Q5VXU3 224 aa43.17■■■■■ 4.5
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SMAD6-202ENST00000557916 ARHGEF11O15085 1522 aa42.33■■■■■ 4.37
SMAD6-202ENST00000557916 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa42.33■■■■■ 4.37
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