RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553190.5

MYBPC1-223, Transcript of myosin binding protein C, slow type, human

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene MYBPC1, Length 3,777 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MYBPC1-223	ENST00000553190	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		14.51	□□□□□ -0.09
MYBPC1-223	ENST00000553190	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		12.56	□□□□□ -0.4
MYBPC1-223	ENST00000553190	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		12.27	□□□□□ -0.45
MYBPC1-223	ENST00000553190	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	12.16	□□□□□ -0.46
MYBPC1-223	ENST00000553190	ABCC9	O60706	1549 aa		12.02	□□□□□ -0.49
MYBPC1-223	ENST00000553190	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		11.97	□□□□□ -0.49
MYBPC1-223	ENST00000553190	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		11.97	□□□□□ -0.49
MYBPC1-223	ENST00000553190	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		11.84	□□□□□ -0.51
MYBPC1-223	ENST00000553190	NACAD	O15069	1562 aa		11.8	□□□□□ -0.52
MYBPC1-223	ENST00000553190	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		11.7	□□□□□ -0.54
MYBPC1-223	ENST00000553190	SCRIB	Q14160	1630 aa		11.62	□□□□□ -0.55
MYBPC1-223	ENST00000553190	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
MYBPC1-223	ENST00000553190	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	11.41	□□□□□ -0.58
MYBPC1-223	ENST00000553190	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	11.29	□□□□□ -0.6
MYBPC1-223	ENST00000553190	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		11.26	□□□□□ -0.61
MYBPC1-223	ENST00000553190	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	11.23	□□□□□ -0.61
MYBPC1-223	ENST00000553190	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		11.21	□□□□□ -0.61
MYBPC1-223	ENST00000553190	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		11.21	□□□□□ -0.61
MYBPC1-223	ENST00000553190	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		11.19	□□□□□ -0.62
MYBPC1-223	ENST00000553190	SMARCA4	P51532	1647 aa		11.11	□□□□□ -0.63
MYBPC1-223	ENST00000553190	WIZ	O95785	1651 aa		11.05	□□□□□ -0.64
MYBPC1-223	ENST00000553190	CHIC1	Q5VXU3	224 aa		11.03	□□□□□ -0.64
MYBPC1-223	ENST00000553190	SMARCA2	P51531	1590 aa		11.01	□□□□□ -0.65
MYBPC1-223	ENST00000553190	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	11	□□□□□ -0.65
MYBPC1-223	ENST00000553190	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		10.99	□□□□□ -0.65
MYBPC1-223	ENST00000553190	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	10.98	□□□□□ -0.65
MYBPC1-223	ENST00000553190	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	10.96	□□□□□ -0.66
MYBPC1-223	ENST00000553190	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		10.94	□□□□□ -0.66
MYBPC1-223	ENST00000553190	TRIM41	Q8WV44	630 aa		10.94	□□□□□ -0.66
MYBPC1-223	ENST00000553190	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		10.91	□□□□□ -0.66
MYBPC1-223	ENST00000553190	NCAPD3	P42695	1498 aa		10.9	□□□□□ -0.66
MYBPC1-223	ENST00000553190	HMGXB3	Q12766	1538 aa		10.84	□□□□□ -0.67
MYBPC1-223	ENST00000553190	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		10.78	□□□□□ -0.68
MYBPC1-223	ENST00000553190	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	10.73	□□□□□ -0.69
MYBPC1-223	ENST00000553190	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	10.69	□□□□□ -0.7
MYBPC1-223	ENST00000553190	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		10.69	□□□□□ -0.7
MYBPC1-223	ENST00000553190	CFTR	P13569	1480 aa		10.65	□□□□□ -0.7
MYBPC1-223	ENST00000553190	ABCC8	Q09428	1581 aa		10.64	□□□□□ -0.71
MYBPC1-223	ENST00000553190	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		10.62	□□□□□ -0.71
MYBPC1-223	ENST00000553190	EHMT2	Q96KQ7	1210 aa		10.59	□□□□□ -0.71
MYBPC1-223	ENST00000553190	EEA1	Q15075	1411 aa		10.58	□□□□□ -0.72
MYBPC1-223	ENST00000553190	CSRNP3	Q8WYN3	585 aa		10.56	□□□□□ -0.72
MYBPC1-223	ENST00000553190	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		10.55	□□□□□ -0.72
MYBPC1-223	ENST00000553190	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		10.55	□□□□□ -0.72
MYBPC1-223	ENST00000553190	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		10.53	□□□□□ -0.72
MYBPC1-223	ENST00000553190	UBTF	P17480	764 aa	Known RBP	10.51	□□□□□ -0.73
MYBPC1-223	ENST00000553190	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		10.5	□□□□□ -0.73
MYBPC1-223	ENST00000553190	SOGA1	O94964	1423 aa		10.5	□□□□□ -0.73
MYBPC1-223	ENST00000553190	SYNJ1	O43426	1573 aa		10.5	□□□□□ -0.73
MYBPC1-223	ENST00000553190	NES	P48681	1621 aa		10.49	□□□□□ -0.73
MYBPC1-223	ENST00000553190	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		10.48	□□□□□ -0.73
MYBPC1-223	ENST00000553190	TOP2B	Q02880	1626 aa		10.48	□□□□□ -0.73
MYBPC1-223	ENST00000553190	KIF27	Q86VH2	1401 aa		10.46	□□□□□ -0.74
MYBPC1-223	ENST00000553190	CUX1	P39880	1505 aa		10.46	□□□□□ -0.74
MYBPC1-223	ENST00000553190	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		10.42	□□□□□ -0.74
MYBPC1-223	ENST00000553190	PRDM2	Q13029	1718 aa		10.41	□□□□□ -0.74
MYBPC1-223	ENST00000553190	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		10.41	□□□□□ -0.74
MYBPC1-223	ENST00000553190	GOLGA3	Q08378	1498 aa		10.41	□□□□□ -0.74
MYBPC1-223	ENST00000553190	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		10.4	□□□□□ -0.75
MYBPC1-223	ENST00000553190	CUX2	O14529	1486 aa		10.39	□□□□□ -0.75
MYBPC1-223	ENST00000553190	ERCC6	Q03468	1493 aa		10.39	□□□□□ -0.75
MYBPC1-223	ENST00000553190	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		10.39	□□□□□ -0.75
MYBPC1-223	ENST00000553190	TOPBP1	Q92547	1522 aa		10.38	□□□□□ -0.75
MYBPC1-223	ENST00000553190	TNIK	Q9UKE5	1360 aa		10.38	□□□□□ -0.75
MYBPC1-223	ENST00000553190	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		10.34	□□□□□ -0.75
MYBPC1-223	ENST00000553190	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	10.33	□□□□□ -0.76
MYBPC1-223	ENST00000553190	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	10.33	□□□□□ -0.76
MYBPC1-223	ENST00000553190	RANGAP1	P46060	587 aa	Predicted RBP	10.32	□□□□□ -0.76
MYBPC1-223	ENST00000553190	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		10.31	□□□□□ -0.76
MYBPC1-223	ENST00000553190	IGF1R	P08069	1367 aa		10.31	□□□□□ -0.76
MYBPC1-223	ENST00000553190	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		10.31	□□□□□ -0.76
MYBPC1-223	ENST00000553190	CEP162	Q5TB80	1403 aa		10.3	□□□□□ -0.76
MYBPC1-223	ENST00000553190	KIF21B	O75037	1637 aa		10.3	□□□□□ -0.76
MYBPC1-223	ENST00000553190	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		10.3	□□□□□ -0.76
MYBPC1-223	ENST00000553190	APLP2	Q06481	763 aa		10.29	□□□□□ -0.76
MYBPC1-223	ENST00000553190	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	10.29	□□□□□ -0.76
MYBPC1-223	ENST00000553190	PRX	Q9BXM0	1461 aa		10.28	□□□□□ -0.76
MYBPC1-223	ENST00000553190	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		10.28	□□□□□ -0.76
MYBPC1-223	ENST00000553190	CLIP1	P30622	1438 aa		10.26	□□□□□ -0.77
MYBPC1-223	ENST00000553190	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		10.26	□□□□□ -0.77
MYBPC1-223	ENST00000553190	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		10.26	□□□□□ -0.77
MYBPC1-223	ENST00000553190	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		10.24	□□□□□ -0.77
MYBPC1-223	ENST00000553190	IFT140	Q96RY7	1462 aa		10.24	□□□□□ -0.77
MYBPC1-223	ENST00000553190	TRIM26	Q12899	539 aa	Predicted RBP	10.23	□□□□□ -0.77
MYBPC1-223	ENST00000553190	PCGF6	Q9BYE7	350 aa		10.22	□□□□□ -0.77
MYBPC1-223	ENST00000553190	WDR62	O43379	1518 aa		10.2	□□□□□ -0.78
MYBPC1-223	ENST00000553190	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	10.17	□□□□□ -0.78
MYBPC1-223	ENST00000553190	GRIN2B	Q13224	1484 aa		10.17	□□□□□ -0.78
MYBPC1-223	ENST00000553190	PPARGC1B	Q86YN6	1023 aa	Known RBP	10.17	□□□□□ -0.78
MYBPC1-223	ENST00000553190	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		10.15	□□□□□ -0.78
MYBPC1-223	ENST00000553190	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	10.15	□□□□□ -0.78
MYBPC1-223	ENST00000553190	CUL7	Q14999	1698 aa		10.15	□□□□□ -0.79
MYBPC1-223	ENST00000553190	FBLN2	P98095	1184 aa		10.15	□□□□□ -0.79
MYBPC1-223	ENST00000553190	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		10.14	□□□□□ -0.79
MYBPC1-223	ENST00000553190	TTBK1	Q5TCY1	1321 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
MYBPC1-223	ENST00000553190	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
MYBPC1-223	ENST00000553190	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
MYBPC1-223	ENST00000553190	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		10.12	□□□□□ -0.79
MYBPC1-223	ENST00000553190	P3H3	Q8IVL6	736 aa		10.12	□□□□□ -0.79
MYBPC1-223	ENST00000553190	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79

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