RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547311.5

TSPAN31-204, Transcript of tetraspanin 31, humanhuman

TSL 3

Gene TSPAN31, Length 438 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN31-204ENST00000547311 NISCHQ9Y2I1 1504 aa32.4■■■□□ 2.78
TSPAN31-204ENST00000547311 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa28.71■■■□□ 2.19
TSPAN31-204ENST00000547311 ABCC9O60706 1549 aa27.66■■■□□ 2.02
TSPAN31-204ENST00000547311 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP27.09■■□□□ 1.93
TSPAN31-204ENST00000547311 MYO15BQ96JP2 1530 aa26.91■■□□□ 1.9
TSPAN31-204ENST00000547311 NACADO15069 1562 aa26.9■■□□□ 1.9
TSPAN31-204ENST00000547311 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa26.9■■□□□ 1.9
TSPAN31-204ENST00000547311 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa26.83■■□□□ 1.89
TSPAN31-204ENST00000547311 DCAF8L2P0C7V8 631 aa26.74■■□□□ 1.87
TSPAN31-204ENST00000547311 UNC13AQ9UPW8 1703 aa26.17■■□□□ 1.78
TSPAN31-204ENST00000547311 SCRIBQ14160 1630 aa26.12■■□□□ 1.77
TSPAN31-204ENST00000547311 BICRAQ9NZM4 1560 aa25.99■■□□□ 1.75
TSPAN31-204ENST00000547311 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa25.87■■□□□ 1.73
TSPAN31-204ENST00000547311 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP25.84■■□□□ 1.73
TSPAN31-204ENST00000547311 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
TSPAN31-204ENST00000547311 CECR2Q9BXF3 1484 aa25.15■■□□□ 1.62
TSPAN31-204ENST00000547311 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
TSPAN31-204ENST00000547311 SMARCA4P51532 1647 aa25.07■■□□□ 1.6
TSPAN31-204ENST00000547311 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa25.07■■□□□ 1.6
TSPAN31-204ENST00000547311 DNAJC5BQ9UF47 199 aa25.05■■□□□ 1.6
TSPAN31-204ENST00000547311 MROH2BQ7Z745 1585 aa24.94■■□□□ 1.58
TSPAN31-204ENST00000547311 PEG3Q9GZU2 1588 aa24.88■■□□□ 1.57
TSPAN31-204ENST00000547311 SMARCA2P51531 1590 aa24.86■■□□□ 1.57
TSPAN31-204ENST00000547311 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa24.84■■□□□ 1.57
TSPAN31-204ENST00000547311 NCAPD3P42695 1498 aa24.81■■□□□ 1.56
TSPAN31-204ENST00000547311 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
TSPAN31-204ENST00000547311 HMGXB3Q12766 1538 aa24.75■■□□□ 1.55
TSPAN31-204ENST00000547311 WIZO95785 1651 aa24.66■■□□□ 1.54
TSPAN31-204ENST00000547311 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP24.65■■□□□ 1.54
TSPAN31-204ENST00000547311 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
TSPAN31-204ENST00000547311 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
TSPAN31-204ENST00000547311 CCDC88BA6NC98 1476 aa24.15■■□□□ 1.46
TSPAN31-204ENST00000547311 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa24.1■■□□□ 1.45
TSPAN31-204ENST00000547311 CADPSQ9ULU8 1353 aa24.07■■□□□ 1.44
TSPAN31-204ENST00000547311 NESP48681 1621 aa24.02■■□□□ 1.44
TSPAN31-204ENST00000547311 CFTRP13569 1480 aa24.02■■□□□ 1.44
TSPAN31-204ENST00000547311 PDS5BQ9NTI5 1447 aa23.91■■□□□ 1.42
TSPAN31-204ENST00000547311 PRDM2Q13029 1718 aa23.87■■□□□ 1.41
TSPAN31-204ENST00000547311 ERCC6Q03468 1493 aa23.83■■□□□ 1.41
TSPAN31-204ENST00000547311 FANCD2Q9BXW9 1451 aa23.79■■□□□ 1.4
TSPAN31-204ENST00000547311 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa23.77■■□□□ 1.4
TSPAN31-204ENST00000547311 CEP164Q9UPV0 1460 aa23.75■■□□□ 1.39
TSPAN31-204ENST00000547311 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP23.67■■□□□ 1.38
TSPAN31-204ENST00000547311 MRC2Q9UBG0 1479 aa23.65■■□□□ 1.38
TSPAN31-204ENST00000547311 WDR62O43379 1518 aa23.58■■□□□ 1.36
TSPAN31-204ENST00000547311 CUX2O14529 1486 aa23.54■■□□□ 1.36
TSPAN31-204ENST00000547311 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
TSPAN31-204ENST00000547311 ABCC8Q09428 1581 aa23.51■■□□□ 1.35
TSPAN31-204ENST00000547311 DNMBPQ6XZF7 1577 aa23.48■■□□□ 1.35
TSPAN31-204ENST00000547311 TOPBP1Q92547 1522 aa23.46■■□□□ 1.35
TSPAN31-204ENST00000547311 CUX1P39880 1505 aa23.39■■□□□ 1.34
TSPAN31-204ENST00000547311 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP23.36■■□□□ 1.33
TSPAN31-204ENST00000547311 TOP2BQ02880 1626 aa23.3■■□□□ 1.32
TSPAN31-204ENST00000547311 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa23.3■■□□□ 1.32
TSPAN31-204ENST00000547311 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
TSPAN31-204ENST00000547311 SYNJ1O43426 1573 aa23.27■■□□□ 1.32
TSPAN31-204ENST00000547311 FGD5Q6ZNL6 1462 aa23.26■■□□□ 1.31
TSPAN31-204ENST00000547311 IFT140Q96RY7 1462 aa23.24■■□□□ 1.31
TSPAN31-204ENST00000547311 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP23.18■■□□□ 1.3
TSPAN31-204ENST00000547311 SOGA1O94964 1423 aa23.16■■□□□ 1.3
TSPAN31-204ENST00000547311 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa23.12■■□□□ 1.29
TSPAN31-204ENST00000547311 WDR97A6NE52 1622 aa23.1■■□□□ 1.29
TSPAN31-204ENST00000547311 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa23.09■■□□□ 1.29
TSPAN31-204ENST00000547311 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
TSPAN31-204ENST00000547311 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
TSPAN31-204ENST00000547311 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa22.97■■□□□ 1.27
TSPAN31-204ENST00000547311 TRIM41Q8WV44 630 aa22.96■■□□□ 1.27
TSPAN31-204ENST00000547311 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
TSPAN31-204ENST00000547311 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP22.95■■□□□ 1.26
TSPAN31-204ENST00000547311 GAPVD1Q14C86 1478 aa22.92■■□□□ 1.26
TSPAN31-204ENST00000547311 CHIC1Q5VXU3 224 aa22.91■■□□□ 1.26
TSPAN31-204ENST00000547311 GRIN2BQ13224 1484 aa22.89■■□□□ 1.25
TSPAN31-204ENST00000547311 KIF27Q86VH2 1401 aa22.86■■□□□ 1.25
TSPAN31-204ENST00000547311 PBRM1Q86U86 1689 aa22.84■■□□□ 1.25
TSPAN31-204ENST00000547311 ERICH3Q5RHP9 1530 aa22.82■■□□□ 1.24
TSPAN31-204ENST00000547311 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
TSPAN31-204ENST00000547311 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa22.79■■□□□ 1.24
TSPAN31-204ENST00000547311 ADAMTS12P58397 1594 aa22.72■■□□□ 1.23
TSPAN31-204ENST00000547311 IGF1RP08069 1367 aa22.7■■□□□ 1.22
TSPAN31-204ENST00000547311 SYNJ2O15056 1496 aa22.7■■□□□ 1.22
TSPAN31-204ENST00000547311 FHAD1B1AJZ9 1412 aa22.69■■□□□ 1.22
TSPAN31-204ENST00000547311 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa22.68■■□□□ 1.22
TSPAN31-204ENST00000547311 EEA1Q15075 1411 aa22.68■■□□□ 1.22
TSPAN31-204ENST00000547311 CUL7Q14999 1698 aa22.68■■□□□ 1.22
TSPAN31-204ENST00000547311 CHD1O14646 1710 aa22.63■■□□□ 1.21
TSPAN31-204ENST00000547311 GRIN2AQ12879 1464 aa22.6■■□□□ 1.21
TSPAN31-204ENST00000547311 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
TSPAN31-204ENST00000547311 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa22.57■■□□□ 1.2
TSPAN31-204ENST00000547311 FBLN2P98095 1184 aa22.55■■□□□ 1.2
TSPAN31-204ENST00000547311 OSCARQ8IYS5 282 aa22.53■■□□□ 1.2
TSPAN31-204ENST00000547311 PRXQ9BXM0 1461 aa22.52■■□□□ 1.2
TSPAN31-204ENST00000547311 CSRNP3Q8WYN3 585 aa22.51■■□□□ 1.19
TSPAN31-204ENST00000547311 NUP160Q12769 1436 aa22.5■■□□□ 1.19
TSPAN31-204ENST00000547311 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa22.5■■□□□ 1.19
TSPAN31-204ENST00000547311 CLASP1Q7Z460 1538 aa22.46■■□□□ 1.19
TSPAN31-204ENST00000547311 CEP170Q5SW79 1584 aa22.46■■□□□ 1.19
TSPAN31-204ENST00000547311 KIF21BO75037 1637 aa22.4■■□□□ 1.18
TSPAN31-204ENST00000547311 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
TSPAN31-204ENST00000547311 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa22.35■■□□□ 1.17
TSPAN31-204ENST00000547311 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.9 ms