RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546614.1

COQ10A-204, Transcript of coenzyme Q10A, humanhuman

TSL 3

Gene COQ10A, Length 707 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COQ10A-204ENST00000546614 NISCHQ9Y2I1 1504 aa34.07■■■■□ 3.04
COQ10A-204ENST00000546614 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa30.13■■■□□ 2.41
COQ10A-204ENST00000546614 ABCC9O60706 1549 aa29.27■■■□□ 2.28
COQ10A-204ENST00000546614 DCAF8L2P0C7V8 631 aa28.49■■■□□ 2.15
COQ10A-204ENST00000546614 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP28.4■■■□□ 2.14
COQ10A-204ENST00000546614 NACADO15069 1562 aa28.32■■■□□ 2.12
COQ10A-204ENST00000546614 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa28.28■■■□□ 2.12
COQ10A-204ENST00000546614 MYO15BQ96JP2 1530 aa28.23■■■□□ 2.11
COQ10A-204ENST00000546614 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa28.2■■■□□ 2.1
COQ10A-204ENST00000546614 UNC13AQ9UPW8 1703 aa27.55■■■□□ 2
COQ10A-204ENST00000546614 SCRIBQ14160 1630 aa27.52■■■□□ 2
COQ10A-204ENST00000546614 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP27.45■■□□□ 1.98
COQ10A-204ENST00000546614 BICRAQ9NZM4 1560 aa27.35■■□□□ 1.97
COQ10A-204ENST00000546614 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa27.14■■□□□ 1.94
COQ10A-204ENST00000546614 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP26.64■■□□□ 1.86
COQ10A-204ENST00000546614 DNAJC5BQ9UF47 199 aa26.64■■□□□ 1.86
COQ10A-204ENST00000546614 CECR2Q9BXF3 1484 aa26.49■■□□□ 1.83
COQ10A-204ENST00000546614 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa26.47■■□□□ 1.83
COQ10A-204ENST00000546614 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP26.39■■□□□ 1.82
COQ10A-204ENST00000546614 SMARCA4P51532 1647 aa26.35■■□□□ 1.81
COQ10A-204ENST00000546614 MROH2BQ7Z745 1585 aa26.24■■□□□ 1.79
COQ10A-204ENST00000546614 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa26.17■■□□□ 1.78
COQ10A-204ENST00000546614 SMARCA2P51531 1590 aa26.17■■□□□ 1.78
COQ10A-204ENST00000546614 NCAPD3P42695 1498 aa26.14■■□□□ 1.78
COQ10A-204ENST00000546614 PEG3Q9GZU2 1588 aa26.09■■□□□ 1.77
COQ10A-204ENST00000546614 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP26.07■■□□□ 1.76
COQ10A-204ENST00000546614 HMGXB3Q12766 1538 aa25.99■■□□□ 1.75
COQ10A-204ENST00000546614 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
COQ10A-204ENST00000546614 WIZO95785 1651 aa25.96■■□□□ 1.75
COQ10A-204ENST00000546614 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP25.71■■□□□ 1.71
COQ10A-204ENST00000546614 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP25.69■■□□□ 1.7
COQ10A-204ENST00000546614 CCDC88BA6NC98 1476 aa25.45■■□□□ 1.66
COQ10A-204ENST00000546614 CADPSQ9ULU8 1353 aa25.42■■□□□ 1.66
COQ10A-204ENST00000546614 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa25.39■■□□□ 1.65
COQ10A-204ENST00000546614 NESP48681 1621 aa25.38■■□□□ 1.65
COQ10A-204ENST00000546614 CFTRP13569 1480 aa25.29■■□□□ 1.64
COQ10A-204ENST00000546614 PDS5BQ9NTI5 1447 aa25.27■■□□□ 1.64
COQ10A-204ENST00000546614 ERCC6Q03468 1493 aa25.24■■□□□ 1.63
COQ10A-204ENST00000546614 FANCD2Q9BXW9 1451 aa25.09■■□□□ 1.61
COQ10A-204ENST00000546614 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa25.06■■□□□ 1.6
COQ10A-204ENST00000546614 PRDM2Q13029 1718 aa25.05■■□□□ 1.6
COQ10A-204ENST00000546614 CEP164Q9UPV0 1460 aa25.03■■□□□ 1.6
COQ10A-204ENST00000546614 MRC2Q9UBG0 1479 aa24.93■■□□□ 1.58
COQ10A-204ENST00000546614 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
COQ10A-204ENST00000546614 CUX2O14529 1486 aa24.86■■□□□ 1.57
COQ10A-204ENST00000546614 WDR62O43379 1518 aa24.81■■□□□ 1.56
COQ10A-204ENST00000546614 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
COQ10A-204ENST00000546614 ABCC8Q09428 1581 aa24.78■■□□□ 1.56
COQ10A-204ENST00000546614 TOPBP1Q92547 1522 aa24.71■■□□□ 1.55
COQ10A-204ENST00000546614 DNMBPQ6XZF7 1577 aa24.69■■□□□ 1.54
COQ10A-204ENST00000546614 CUX1P39880 1505 aa24.61■■□□□ 1.53
COQ10A-204ENST00000546614 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP24.6■■□□□ 1.53
COQ10A-204ENST00000546614 IFT140Q96RY7 1462 aa24.51■■□□□ 1.51
COQ10A-204ENST00000546614 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP24.51■■□□□ 1.51
COQ10A-204ENST00000546614 FGD5Q6ZNL6 1462 aa24.49■■□□□ 1.51
COQ10A-204ENST00000546614 SOGA1O94964 1423 aa24.47■■□□□ 1.51
COQ10A-204ENST00000546614 TOP2BQ02880 1626 aa24.46■■□□□ 1.51
COQ10A-204ENST00000546614 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa24.44■■□□□ 1.5
COQ10A-204ENST00000546614 SYNJ1O43426 1573 aa24.44■■□□□ 1.5
COQ10A-204ENST00000546614 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa24.41■■□□□ 1.5
COQ10A-204ENST00000546614 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.49
COQ10A-204ENST00000546614 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP24.34■■□□□ 1.49
COQ10A-204ENST00000546614 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa24.29■■□□□ 1.48
COQ10A-204ENST00000546614 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
COQ10A-204ENST00000546614 TRIM41Q8WV44 630 aa24.28■■□□□ 1.48
COQ10A-204ENST00000546614 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP24.27■■□□□ 1.481e-6■■■■■ 28.8
COQ10A-204ENST00000546614 WDR97A6NE52 1622 aa24.24■■□□□ 1.47
COQ10A-204ENST00000546614 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
COQ10A-204ENST00000546614 GAPVD1Q14C86 1478 aa24.18■■□□□ 1.46
COQ10A-204ENST00000546614 GRIN2BQ13224 1484 aa24.13■■□□□ 1.45
COQ10A-204ENST00000546614 CHIC1Q5VXU3 224 aa24.12■■□□□ 1.45
COQ10A-204ENST00000546614 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa24.1■■□□□ 1.45
COQ10A-204ENST00000546614 KIF27Q86VH2 1401 aa24.09■■□□□ 1.45
COQ10A-204ENST00000546614 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
COQ10A-204ENST00000546614 PBRM1Q86U86 1689 aa24.02■■□□□ 1.44
COQ10A-204ENST00000546614 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa24.02■■□□□ 1.44
COQ10A-204ENST00000546614 FBLN2P98095 1184 aa24.01■■□□□ 1.43
COQ10A-204ENST00000546614 ERICH3Q5RHP9 1530 aa24■■□□□ 1.43
COQ10A-204ENST00000546614 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP23.98■■□□□ 1.43
COQ10A-204ENST00000546614 OSCARQ8IYS5 282 aa23.97■■□□□ 1.43
COQ10A-204ENST00000546614 IGF1RP08069 1367 aa23.95■■□□□ 1.42
COQ10A-204ENST00000546614 SYNJ2O15056 1496 aa23.93■■□□□ 1.42
COQ10A-204ENST00000546614 FHAD1B1AJZ9 1412 aa23.91■■□□□ 1.42
COQ10A-204ENST00000546614 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa23.89■■□□□ 1.41
COQ10A-204ENST00000546614 CHD1O14646 1710 aa23.87■■□□□ 1.41
COQ10A-204ENST00000546614 ADAMTS12P58397 1594 aa23.86■■□□□ 1.41
COQ10A-204ENST00000546614 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa23.84■■□□□ 1.41
COQ10A-204ENST00000546614 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa23.82■■□□□ 1.4
COQ10A-204ENST00000546614 CUL7Q14999 1698 aa23.8■■□□□ 1.4
COQ10A-204ENST00000546614 EEA1Q15075 1411 aa23.8■■□□□ 1.4
COQ10A-204ENST00000546614 GRIN2AQ12879 1464 aa23.8■■□□□ 1.4
COQ10A-204ENST00000546614 CSRNP3Q8WYN3 585 aa23.77■■□□□ 1.4
COQ10A-204ENST00000546614 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP23.73■■□□□ 1.39
COQ10A-204ENST00000546614 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa23.69■■□□□ 1.38
COQ10A-204ENST00000546614 NUP160Q12769 1436 aa23.67■■□□□ 1.38
COQ10A-204ENST00000546614 PRXQ9BXM0 1461 aa23.64■■□□□ 1.38
COQ10A-204ENST00000546614 CEP170Q5SW79 1584 aa23.63■■□□□ 1.37
COQ10A-204ENST00000546614 CLASP1Q7Z460 1538 aa23.62■■□□□ 1.37
COQ10A-204ENST00000546614 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa23.55■■□□□ 1.36
COQ10A-204ENST00000546614 JPH4Q96JJ6 628 aa23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 74.8 ms