RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534406.1

SIPA1-210, Transcript of signal-induced proliferation-associated 1, humanhuman

TSL 3

Gene SIPA1, Length 351 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIPA1-210ENST00000534406 NISCHQ9Y2I1 1504 aa58.19■■■■■ 6.91
SIPA1-210ENST00000534406 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa51.66■■■■■ 5.86
SIPA1-210ENST00000534406 ABCC9O60706 1549 aa50.11■■■■■ 5.61
SIPA1-210ENST00000534406 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP48.6■■■■■ 5.37
SIPA1-210ENST00000534406 NACADO15069 1562 aa48.43■■■■■ 5.34
SIPA1-210ENST00000534406 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa48.42■■■■■ 5.34
SIPA1-210ENST00000534406 DCAF8L2P0C7V8 631 aa48.35■■■■■ 5.33
SIPA1-210ENST00000534406 MYO15BQ96JP2 1530 aa48.26■■■■■ 5.32
SIPA1-210ENST00000534406 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa48.2■■■■■ 5.31
SIPA1-210ENST00000534406 UNC13AQ9UPW8 1703 aa47.33■■■■■ 5.17
SIPA1-210ENST00000534406 SCRIBQ14160 1630 aa47.14■■■■■ 5.14
SIPA1-210ENST00000534406 BICRAQ9NZM4 1560 aa46.9■■■■■ 5.1
SIPA1-210ENST00000534406 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP46.8■■■■■ 5.08
SIPA1-210ENST00000534406 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa46.51■■■■■ 5.04
SIPA1-210ENST00000534406 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP45.65■■■■■ 4.9
SIPA1-210ENST00000534406 DNAJC5BQ9UF47 199 aa45.52■■■■■ 4.88
SIPA1-210ENST00000534406 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa45.37■■■■■ 4.85
SIPA1-210ENST00000534406 CECR2Q9BXF3 1484 aa45.25■■■■■ 4.83
SIPA1-210ENST00000534406 SMARCA4P51532 1647 aa45.12■■■■■ 4.81
SIPA1-210ENST00000534406 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP45.11■■■■■ 4.81
SIPA1-210ENST00000534406 MROH2BQ7Z745 1585 aa44.84■■■■■ 4.77
SIPA1-210ENST00000534406 SMARCA2P51531 1590 aa44.74■■■■■ 4.75
SIPA1-210ENST00000534406 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa44.73■■■■■ 4.75
SIPA1-210ENST00000534406 PEG3Q9GZU2 1588 aa44.66■■■■■ 4.74
SIPA1-210ENST00000534406 NCAPD3P42695 1498 aa44.63■■■■■ 4.73
SIPA1-210ENST00000534406 HMGXB3Q12766 1538 aa44.53■■■■■ 4.72
SIPA1-210ENST00000534406 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP44.44■■■■■ 4.7
SIPA1-210ENST00000534406 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP44.42■■■■■ 4.7
SIPA1-210ENST00000534406 WIZO95785 1651 aa44.4■■■■■ 4.7
SIPA1-210ENST00000534406 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP43.99■■■■■ 4.63
SIPA1-210ENST00000534406 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP43.54■■■■■ 4.56
SIPA1-210ENST00000534406 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa43.46■■■■■ 4.55
SIPA1-210ENST00000534406 NESP48681 1621 aa43.45■■■■■ 4.55
SIPA1-210ENST00000534406 CCDC88BA6NC98 1476 aa43.39■■■■■ 4.54
SIPA1-210ENST00000534406 CADPSQ9ULU8 1353 aa43.34■■■■■ 4.53
SIPA1-210ENST00000534406 ERCC6Q03468 1493 aa43.19■■■■■ 4.51
SIPA1-210ENST00000534406 CFTRP13569 1480 aa43.19■■■■■ 4.5
SIPA1-210ENST00000534406 PDS5BQ9NTI5 1447 aa43.12■■■■■ 4.49
SIPA1-210ENST00000534406 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa43.02■■■■■ 4.48
SIPA1-210ENST00000534406 PRDM2Q13029 1718 aa43.02■■■■■ 4.48
SIPA1-210ENST00000534406 FANCD2Q9BXW9 1451 aa42.89■■■■■ 4.46
SIPA1-210ENST00000534406 CEP164Q9UPV0 1460 aa42.83■■■■■ 4.45
SIPA1-210ENST00000534406 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP42.8■■■■■ 4.44
SIPA1-210ENST00000534406 MRC2Q9UBG0 1479 aa42.68■■■■■ 4.42
SIPA1-210ENST00000534406 CUX2O14529 1486 aa42.61■■■■■ 4.41
SIPA1-210ENST00000534406 WDR62O43379 1518 aa42.54■■■■■ 4.4
SIPA1-210ENST00000534406 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP42.44■■■■■ 4.38
SIPA1-210ENST00000534406 ABCC8Q09428 1581 aa42.27■■■■■ 4.36
SIPA1-210ENST00000534406 DNMBPQ6XZF7 1577 aa42.27■■■■■ 4.36
SIPA1-210ENST00000534406 TOPBP1Q92547 1522 aa42.25■■■■■ 4.35
SIPA1-210ENST00000534406 CUX1P39880 1505 aa42.07■■■■■ 4.33
SIPA1-210ENST00000534406 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP41.93■■■■■ 4.3
SIPA1-210ENST00000534406 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP41.92■■■■■ 4.3
SIPA1-210ENST00000534406 IFT140Q96RY7 1462 aa41.9■■■■■ 4.3
SIPA1-210ENST00000534406 FGD5Q6ZNL6 1462 aa41.87■■■■■ 4.29
SIPA1-210ENST00000534406 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41.84■■■■■ 4.29
SIPA1-210ENST00000534406 SYNJ1O43426 1573 aa41.83■■■■■ 4.29
SIPA1-210ENST00000534406 TOP2BQ02880 1626 aa41.83■■■■■ 4.29
SIPA1-210ENST00000534406 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP41.77■■■■■ 4.28
SIPA1-210ENST00000534406 SOGA1O94964 1423 aa41.7■■■■■ 4.27
SIPA1-210ENST00000534406 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41.69■■■■■ 4.26
SIPA1-210ENST00000534406 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP41.64■■■■■ 4.26
SIPA1-210ENST00000534406 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP41.58■■■■■ 4.25
SIPA1-210ENST00000534406 WDR97A6NE52 1622 aa41.57■■■■■ 4.25
SIPA1-210ENST00000534406 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa41.49■■■■■ 4.23
SIPA1-210ENST00000534406 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP41.43■■■■■ 4.22
SIPA1-210ENST00000534406 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP41.4■■■■■ 4.22
SIPA1-210ENST00000534406 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa41.33■■■■■ 4.21
SIPA1-210ENST00000534406 GAPVD1Q14C86 1478 aa41.27■■■■■ 4.2
SIPA1-210ENST00000534406 PBRM1Q86U86 1689 aa41.23■■■■■ 4.19
SIPA1-210ENST00000534406 GRIN2BQ13224 1484 aa41.21■■■■■ 4.19
SIPA1-210ENST00000534406 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa41.13■■■■■ 4.17
SIPA1-210ENST00000534406 TRIM41Q8WV44 630 aa41.11■■■■■ 4.17
SIPA1-210ENST00000534406 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP41.09■■■■■ 4.17
SIPA1-210ENST00000534406 KIF27Q86VH2 1401 aa41.02■■■■■ 4.16
SIPA1-210ENST00000534406 ERICH3Q5RHP9 1530 aa41.02■■■■■ 4.16
SIPA1-210ENST00000534406 CHD1O14646 1710 aa40.98■■■■■ 4.15
SIPA1-210ENST00000534406 ADAMTS12P58397 1594 aa40.93■■■■■ 4.14
SIPA1-210ENST00000534406 SYNJ2O15056 1496 aa40.91■■■■■ 4.14
SIPA1-210ENST00000534406 FBLN2P98095 1184 aa40.84■■■■■ 4.13
SIPA1-210ENST00000534406 CHIC1Q5VXU3 224 aa40.84■■■■■ 4.13
SIPA1-210ENST00000534406 FHAD1B1AJZ9 1412 aa40.8■■■■■ 4.12
SIPA1-210ENST00000534406 OSCARQ8IYS5 282 aa40.79■■■■■ 4.12
SIPA1-210ENST00000534406 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP40.79■■■■■ 4.12
SIPA1-210ENST00000534406 CUL7Q14999 1698 aa40.75■■■■■ 4.11
SIPA1-210ENST00000534406 IGF1RP08069 1367 aa40.74■■■■■ 4.11
SIPA1-210ENST00000534406 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa40.74■■■■■ 4.11
SIPA1-210ENST00000534406 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa40.71■■■■■ 4.11
SIPA1-210ENST00000534406 GRIN2AQ12879 1464 aa40.7■■■■■ 4.11
SIPA1-210ENST00000534406 CLASP1Q7Z460 1538 aa40.53■■■■■ 4.08
SIPA1-210ENST00000534406 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa40.53■■■■■ 4.08
SIPA1-210ENST00000534406 EEA1Q15075 1411 aa40.5■■■■■ 4.07
SIPA1-210ENST00000534406 NUP160Q12769 1436 aa40.5■■■■■ 4.07
SIPA1-210ENST00000534406 CEP170Q5SW79 1584 aa40.49■■■■■ 4.07
SIPA1-210ENST00000534406 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa40.38■■■■■ 4.05
SIPA1-210ENST00000534406 PRXQ9BXM0 1461 aa40.32■■■■■ 4.04
SIPA1-210ENST00000534406 CSRNP3Q8WYN3 585 aa40.29■■■■■ 4.04
SIPA1-210ENST00000534406 ARHGEF11O15085 1522 aa40.24■■■■■ 4.03
SIPA1-210ENST00000534406 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP40.23■■■■■ 4.03
SIPA1-210ENST00000534406 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa40.21■■■■■ 4.03
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