RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531958.5

CARNS1-207, Transcript of carnosine synthase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CARNS1, Length 2,369 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARNS1-207ENST00000531958 NISCHQ9Y2I1 1504 aa39■■■■□ 3.83
CARNS1-207ENST00000531958 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa33.92■■■■□ 3.02
CARNS1-207ENST00000531958 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP32.75■■■□□ 2.83
CARNS1-207ENST00000531958 DCAF8L2P0C7V8 631 aa32.43■■■□□ 2.78
CARNS1-207ENST00000531958 ABCC9O60706 1549 aa32.25■■■□□ 2.75
CARNS1-207ENST00000531958 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa32.16■■■□□ 2.74
CARNS1-207ENST00000531958 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa32.01■■■□□ 2.71
CARNS1-207ENST00000531958 MYO15BQ96JP2 1530 aa31.76■■■□□ 2.67
CARNS1-207ENST00000531958 NACADO15069 1562 aa31.62■■■□□ 2.65
CARNS1-207ENST00000531958 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa31.37■■■□□ 2.61
CARNS1-207ENST00000531958 SCRIBQ14160 1630 aa31.33■■■□□ 2.61
CARNS1-207ENST00000531958 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP30.8■■■□□ 2.52
CARNS1-207ENST00000531958 UNC13AQ9UPW8 1703 aa30.76■■■□□ 2.52
CARNS1-207ENST00000531958 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP30.48■■■□□ 2.47
CARNS1-207ENST00000531958 BICRAQ9NZM4 1560 aa30.45■■■□□ 2.47
CARNS1-207ENST00000531958 CECR2Q9BXF3 1484 aa30.38■■■□□ 2.45
CARNS1-207ENST00000531958 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP30.3■■■□□ 2.44
CARNS1-207ENST00000531958 MROH2BQ7Z745 1585 aa30.18■■■□□ 2.42
CARNS1-207ENST00000531958 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP30.1■■■□□ 2.41
CARNS1-207ENST00000531958 SMARCA4P51532 1647 aa29.97■■■□□ 2.39
CARNS1-207ENST00000531958 WIZO95785 1651 aa29.94■■■□□ 2.38
CARNS1-207ENST00000531958 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP29.56■■■□□ 2.32
CARNS1-207ENST00000531958 PEG3Q9GZU2 1588 aa29.55■■■□□ 2.32
CARNS1-207ENST00000531958 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP29.55■■■□□ 2.32
CARNS1-207ENST00000531958 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa29.5■■■□□ 2.31
CARNS1-207ENST00000531958 SMARCA2P51531 1590 aa29.44■■■□□ 2.3
CARNS1-207ENST00000531958 CHIC1Q5VXU3 224 aa29.41■■■□□ 2.3
CARNS1-207ENST00000531958 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP29.35■■■□□ 2.29
CARNS1-207ENST00000531958 CCDC88BA6NC98 1476 aa29.32■■■□□ 2.28
CARNS1-207ENST00000531958 NCAPD3P42695 1498 aa29.22■■■□□ 2.27
CARNS1-207ENST00000531958 HMGXB3Q12766 1538 aa29.15■■■□□ 2.26
CARNS1-207ENST00000531958 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa29.13■■■□□ 2.25
CARNS1-207ENST00000531958 TRIM41Q8WV44 630 aa28.9■■■□□ 2.22
CARNS1-207ENST00000531958 ABCC8Q09428 1581 aa28.75■■■□□ 2.19
CARNS1-207ENST00000531958 CFTRP13569 1480 aa28.59■■■□□ 2.17
CARNS1-207ENST00000531958 DNAJC5BQ9UF47 199 aa28.53■■■□□ 2.16
CARNS1-207ENST00000531958 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP28.52■■■□□ 2.16
CARNS1-207ENST00000531958 CADPSQ9ULU8 1353 aa28.51■■■□□ 2.15
CARNS1-207ENST00000531958 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP28.46■■■□□ 2.15
CARNS1-207ENST00000531958 SYNJ1O43426 1573 aa28.4■■■□□ 2.14
CARNS1-207ENST00000531958 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa28.37■■■□□ 2.13
CARNS1-207ENST00000531958 PRDM2Q13029 1718 aa28.37■■■□□ 2.13
CARNS1-207ENST00000531958 NESP48681 1621 aa28.32■■■□□ 2.12
CARNS1-207ENST00000531958 TOP2BQ02880 1626 aa28.24■■■□□ 2.11
CARNS1-207ENST00000531958 SOGA1O94964 1423 aa28.22■■■□□ 2.11
CARNS1-207ENST00000531958 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa28.21■■■□□ 2.11
CARNS1-207ENST00000531958 FANCD2Q9BXW9 1451 aa28.21■■■□□ 2.11
CARNS1-207ENST00000531958 CUX1P39880 1505 aa28.2■■■□□ 2.11
CARNS1-207ENST00000531958 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa28.19■■■□□ 2.1
CARNS1-207ENST00000531958 EHMT2Q96KQ7 1210 aa28.14■■■□□ 2.1
CARNS1-207ENST00000531958 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa28.12■■■□□ 2.09
CARNS1-207ENST00000531958 EEA1Q15075 1411 aa28.05■■■□□ 2.08
CARNS1-207ENST00000531958 PDS5BQ9NTI5 1447 aa28.03■■■□□ 2.08
CARNS1-207ENST00000531958 CEP164Q9UPV0 1460 aa28.01■■■□□ 2.07
CARNS1-207ENST00000531958 CSRNP3Q8WYN3 585 aa28■■■□□ 2.07
CARNS1-207ENST00000531958 PCGF6Q9BYE7 350 aa27.95■■■□□ 2.07
CARNS1-207ENST00000531958 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa27.91■■■□□ 2.06
CARNS1-207ENST00000531958 DNMBPQ6XZF7 1577 aa27.9■■■□□ 2.06
CARNS1-207ENST00000531958 FGD5Q6ZNL6 1462 aa27.9■■■□□ 2.06
CARNS1-207ENST00000531958 TOPBP1Q92547 1522 aa27.89■■■□□ 2.06
CARNS1-207ENST00000531958 HRCP23327 699 aa27.88■■■□□ 2.05
CARNS1-207ENST00000531958 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP27.85■■■□□ 2.05
CARNS1-207ENST00000531958 KIF27Q86VH2 1401 aa27.79■■■□□ 2.04
CARNS1-207ENST00000531958 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP27.76■■■□□ 2.04
CARNS1-207ENST00000531958 CUX2O14529 1486 aa27.75■■■□□ 2.03
CARNS1-207ENST00000531958 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa27.72■■■□□ 2.03
CARNS1-207ENST00000531958 GOLGA3Q08378 1498 aa27.71■■■□□ 2.03
CARNS1-207ENST00000531958 UBTFP17480 764 aaKnown RBP27.7■■■□□ 2.03
CARNS1-207ENST00000531958 KIF21BO75037 1637 aa27.69■■■□□ 2.02
CARNS1-207ENST00000531958 MRC2Q9UBG0 1479 aa27.66■■■□□ 2.02
CARNS1-207ENST00000531958 ERCC6Q03468 1493 aa27.63■■■□□ 2.01
CARNS1-207ENST00000531958 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa27.62■■■□□ 2.01
CARNS1-207ENST00000531958 TNIKQ9UKE5 1360 aa27.62■■■□□ 2.01
CARNS1-207ENST00000531958 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa27.62■■■□□ 2.01
CARNS1-207ENST00000531958 PRXQ9BXM0 1461 aa27.59■■■□□ 2.01
CARNS1-207ENST00000531958 IGF1RP08069 1367 aa27.56■■■□□ 2
CARNS1-207ENST00000531958 CEP162Q5TB80 1403 aa27.51■■□□□ 1.99
CARNS1-207ENST00000531958 ERICH3Q5RHP9 1530 aa27.5■■□□□ 1.99
CARNS1-207ENST00000531958 WDR62O43379 1518 aa27.5■■□□□ 1.99
CARNS1-207ENST00000531958 WDR97A6NE52 1622 aa27.49■■□□□ 1.99
CARNS1-207ENST00000531958 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP27.47■■□□□ 1.99
CARNS1-207ENST00000531958 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP27.45■■□□□ 1.99
CARNS1-207ENST00000531958 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP27.44■■□□□ 1.98
CARNS1-207ENST00000531958 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa27.43■■□□□ 1.98
CARNS1-207ENST00000531958 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP27.42■■□□□ 1.98
CARNS1-207ENST00000531958 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa27.38■■□□□ 1.97
CARNS1-207ENST00000531958 GAPVD1Q14C86 1478 aa27.37■■□□□ 1.97
CARNS1-207ENST00000531958 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP27.35■■□□□ 1.97
CARNS1-207ENST00000531958 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP27.34■■□□□ 1.97
CARNS1-207ENST00000531958 IFT140Q96RY7 1462 aa27.31■■□□□ 1.96
CARNS1-207ENST00000531958 CLIP1P30622 1438 aa27.3■■□□□ 1.96
CARNS1-207ENST00000531958 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP27.29■■□□□ 1.96
CARNS1-207ENST00000531958 CUL7Q14999 1698 aa27.27■■□□□ 1.96
CARNS1-207ENST00000531958 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP27.24■■□□□ 1.95
CARNS1-207ENST00000531958 PBRM1Q86U86 1689 aa27.18■■□□□ 1.94
CARNS1-207ENST00000531958 GRIN2BQ13224 1484 aa27.13■■□□□ 1.93
CARNS1-207ENST00000531958 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP27.1■■□□□ 1.93
CARNS1-207ENST00000531958 FHAD1B1AJZ9 1412 aa27.05■■□□□ 1.92
CARNS1-207ENST00000531958 VPS8Q8N3P4 1428 aa27.04■■□□□ 1.92
CARNS1-207ENST00000531958 ADAMTS12P58397 1594 aa27.03■■□□□ 1.92
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