RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529895.1

BBS1-216, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 1, humanhuman

TSL 2

Gene BBS1, Length 560 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS1-216ENST00000529895 NISCHQ9Y2I1 1504 aa36.24■■■■□ 3.39
BBS1-216ENST00000529895 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa31.93■■■□□ 2.7
BBS1-216ENST00000529895 ABCC9O60706 1549 aa30.97■■■□□ 2.55
BBS1-216ENST00000529895 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP30.25■■■□□ 2.43
BBS1-216ENST00000529895 DCAF8L2P0C7V8 631 aa30.23■■■□□ 2.43
BBS1-216ENST00000529895 NACADO15069 1562 aa29.97■■■□□ 2.39
BBS1-216ENST00000529895 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa29.95■■■□□ 2.38
BBS1-216ENST00000529895 MYO15BQ96JP2 1530 aa29.91■■■□□ 2.38
BBS1-216ENST00000529895 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa29.9■■■□□ 2.38
BBS1-216ENST00000529895 SCRIBQ14160 1630 aa29.26■■■□□ 2.27
BBS1-216ENST00000529895 UNC13AQ9UPW8 1703 aa29.22■■■□□ 2.27
BBS1-216ENST00000529895 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP29.09■■■□□ 2.25
BBS1-216ENST00000529895 BICRAQ9NZM4 1560 aa29.02■■■□□ 2.24
BBS1-216ENST00000529895 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa28.97■■■□□ 2.23
BBS1-216ENST00000529895 CECR2Q9BXF3 1484 aa28.23■■■□□ 2.11
BBS1-216ENST00000529895 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP28.2■■■□□ 2.11
BBS1-216ENST00000529895 DNAJC5BQ9UF47 199 aa28.14■■■□□ 2.1
BBS1-216ENST00000529895 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP28.02■■■□□ 2.08
BBS1-216ENST00000529895 SMARCA4P51532 1647 aa28■■■□□ 2.07
BBS1-216ENST00000529895 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa28■■■□□ 2.07
BBS1-216ENST00000529895 MROH2BQ7Z745 1585 aa27.96■■■□□ 2.07
BBS1-216ENST00000529895 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP27.8■■■□□ 2.04
BBS1-216ENST00000529895 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa27.77■■■□□ 2.04
BBS1-216ENST00000529895 SMARCA2P51531 1590 aa27.71■■■□□ 2.03
BBS1-216ENST00000529895 PEG3Q9GZU2 1588 aa27.69■■■□□ 2.02
BBS1-216ENST00000529895 NCAPD3P42695 1498 aa27.69■■■□□ 2.02
BBS1-216ENST00000529895 WIZO95785 1651 aa27.67■■■□□ 2.02
BBS1-216ENST00000529895 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP27.55■■■□□ 2
BBS1-216ENST00000529895 HMGXB3Q12766 1538 aa27.53■■■□□ 2
BBS1-216ENST00000529895 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP27.49■■□□□ 1.99
BBS1-216ENST00000529895 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP27.36■■□□□ 1.97
BBS1-216ENST00000529895 CCDC88BA6NC98 1476 aa27.1■■□□□ 1.93
BBS1-216ENST00000529895 NESP48681 1621 aa26.94■■□□□ 1.9
BBS1-216ENST00000529895 CADPSQ9ULU8 1353 aa26.93■■□□□ 1.9
BBS1-216ENST00000529895 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa26.84■■□□□ 1.89
BBS1-216ENST00000529895 CFTRP13569 1480 aa26.83■■□□□ 1.89
BBS1-216ENST00000529895 PDS5BQ9NTI5 1447 aa26.7■■□□□ 1.86
BBS1-216ENST00000529895 ERCC6Q03468 1493 aa26.62■■□□□ 1.85
BBS1-216ENST00000529895 FANCD2Q9BXW9 1451 aa26.6■■□□□ 1.85
BBS1-216ENST00000529895 PRDM2Q13029 1718 aa26.56■■□□□ 1.84
BBS1-216ENST00000529895 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa26.56■■□□□ 1.84
BBS1-216ENST00000529895 CEP164Q9UPV0 1460 aa26.5■■□□□ 1.83
BBS1-216ENST00000529895 MRC2Q9UBG0 1479 aa26.38■■□□□ 1.81
BBS1-216ENST00000529895 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP26.35■■□□□ 1.81
BBS1-216ENST00000529895 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP26.32■■□□□ 1.8
BBS1-216ENST00000529895 WDR62O43379 1518 aa26.26■■□□□ 1.79
BBS1-216ENST00000529895 ABCC8Q09428 1581 aa26.23■■□□□ 1.79
BBS1-216ENST00000529895 TOPBP1Q92547 1522 aa26.22■■□□□ 1.79
BBS1-216ENST00000529895 DNMBPQ6XZF7 1577 aa26.2■■□□□ 1.78
BBS1-216ENST00000529895 CUX1P39880 1505 aa26.19■■□□□ 1.78
BBS1-216ENST00000529895 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP26.17■■□□□ 1.78
BBS1-216ENST00000529895 CUX2O14529 1486 aa26.16■■□□□ 1.78
BBS1-216ENST00000529895 SYNJ1O43426 1573 aa26.08■■□□□ 1.77
BBS1-216ENST00000529895 TOP2BQ02880 1626 aa26.04■■□□□ 1.76
BBS1-216ENST00000529895 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP26.03■■□□□ 1.76
BBS1-216ENST00000529895 FGD5Q6ZNL6 1462 aa26.03■■□□□ 1.76
BBS1-216ENST00000529895 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa26.02■■□□□ 1.76
BBS1-216ENST00000529895 SOGA1O94964 1423 aa25.97■■□□□ 1.75
BBS1-216ENST00000529895 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa25.95■■□□□ 1.74
BBS1-216ENST00000529895 IFT140Q96RY7 1462 aa25.94■■□□□ 1.74
BBS1-216ENST00000529895 TRIM41Q8WV44 630 aa25.92■■□□□ 1.74
BBS1-216ENST00000529895 CHIC1Q5VXU3 224 aa25.9■■□□□ 1.74
BBS1-216ENST00000529895 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP25.88■■□□□ 1.73
BBS1-216ENST00000529895 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP25.83■■□□□ 1.72
BBS1-216ENST00000529895 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP25.79■■□□□ 1.72
BBS1-216ENST00000529895 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa25.78■■□□□ 1.72
BBS1-216ENST00000529895 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP25.76■■□□□ 1.71
BBS1-216ENST00000529895 WDR97A6NE52 1622 aa25.73■■□□□ 1.71
BBS1-216ENST00000529895 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP25.68■■□□□ 1.7
BBS1-216ENST00000529895 GAPVD1Q14C86 1478 aa25.64■■□□□ 1.69
BBS1-216ENST00000529895 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa25.62■■□□□ 1.69
BBS1-216ENST00000529895 KIF27Q86VH2 1401 aa25.59■■□□□ 1.69
BBS1-216ENST00000529895 GRIN2BQ13224 1484 aa25.57■■□□□ 1.68
BBS1-216ENST00000529895 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa25.57■■□□□ 1.68
BBS1-216ENST00000529895 PBRM1Q86U86 1689 aa25.5■■□□□ 1.67
BBS1-216ENST00000529895 IGF1RP08069 1367 aa25.49■■□□□ 1.67
BBS1-216ENST00000529895 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa25.48■■□□□ 1.67
BBS1-216ENST00000529895 ERICH3Q5RHP9 1530 aa25.46■■□□□ 1.67
BBS1-216ENST00000529895 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP25.43■■□□□ 1.66
BBS1-216ENST00000529895 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP25.42■■□□□ 1.66
BBS1-216ENST00000529895 FBLN2P98095 1184 aa25.39■■□□□ 1.66
BBS1-216ENST00000529895 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP25.37■■□□□ 1.65
BBS1-216ENST00000529895 CSRNP3Q8WYN3 585 aa25.36■■□□□ 1.65
BBS1-216ENST00000529895 FHAD1B1AJZ9 1412 aa25.36■■□□□ 1.65
BBS1-216ENST00000529895 EEA1Q15075 1411 aa25.36■■□□□ 1.65
BBS1-216ENST00000529895 SYNJ2O15056 1496 aa25.34■■□□□ 1.65
BBS1-216ENST00000529895 ADAMTS12P58397 1594 aa25.34■■□□□ 1.65
BBS1-216ENST00000529895 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa25.33■■□□□ 1.65
BBS1-216ENST00000529895 CUL7Q14999 1698 aa25.29■■□□□ 1.64
BBS1-216ENST00000529895 CHD1O14646 1710 aa25.28■■□□□ 1.64
BBS1-216ENST00000529895 GRIN2AQ12879 1464 aa25.24■■□□□ 1.63
BBS1-216ENST00000529895 OSCARQ8IYS5 282 aa25.24■■□□□ 1.63
BBS1-216ENST00000529895 PRXQ9BXM0 1461 aa25.21■■□□□ 1.63
BBS1-216ENST00000529895 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa25.2■■□□□ 1.62
BBS1-216ENST00000529895 NUP160Q12769 1436 aa25.11■■□□□ 1.61
BBS1-216ENST00000529895 CEP170Q5SW79 1584 aa25.1■■□□□ 1.61
BBS1-216ENST00000529895 EHMT2Q96KQ7 1210 aa25.09■■□□□ 1.61
BBS1-216ENST00000529895 KIF21BO75037 1637 aa25.04■■□□□ 1.6
BBS1-216ENST00000529895 CLASP1Q7Z460 1538 aa25.02■■□□□ 1.6
BBS1-216ENST00000529895 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa24.98■■□□□ 1.59
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