RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000526020.5

ZBED5-204, Transcript of zinc finger BED-type containing 5, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ZBED5, Length 1,512 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED5-204ENST00000526020 NISCHQ9Y2I1 1504 aa38.12■■■■□ 3.69
ZBED5-204ENST00000526020 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa33.79■■■■□ 3
ZBED5-204ENST00000526020 ABCC9O60706 1549 aa32.81■■■□□ 2.84
ZBED5-204ENST00000526020 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP31.8■■■□□ 2.68
ZBED5-204ENST00000526020 NACADO15069 1562 aa31.69■■■□□ 2.66
ZBED5-204ENST00000526020 DCAF8L2P0C7V8 631 aa31.67■■■□□ 2.66
ZBED5-204ENST00000526020 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa31.65■■■□□ 2.66
ZBED5-204ENST00000526020 MYO15BQ96JP2 1530 aa31.6■■■□□ 2.65
ZBED5-204ENST00000526020 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa31.55■■■□□ 2.64
ZBED5-204ENST00000526020 UNC13AQ9UPW8 1703 aa31.05■■■□□ 2.56
ZBED5-204ENST00000526020 SCRIBQ14160 1630 aa30.83■■■□□ 2.53
ZBED5-204ENST00000526020 BICRAQ9NZM4 1560 aa30.77■■■□□ 2.52
ZBED5-204ENST00000526020 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP30.69■■■□□ 2.5
ZBED5-204ENST00000526020 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa30.38■■■□□ 2.45
ZBED5-204ENST00000526020 DNAJC5BQ9UF47 199 aa29.97■■■□□ 2.39
ZBED5-204ENST00000526020 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP29.89■■■□□ 2.38
ZBED5-204ENST00000526020 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa29.72■■■□□ 2.35
ZBED5-204ENST00000526020 CECR2Q9BXF3 1484 aa29.69■■■□□ 2.34
ZBED5-204ENST00000526020 SMARCA4P51532 1647 aa29.53■■■□□ 2.32
ZBED5-204ENST00000526020 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP29.5■■■□□ 2.31
ZBED5-204ENST00000526020 MROH2BQ7Z745 1585 aa29.4■■■□□ 2.3
ZBED5-204ENST00000526020 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa29.3■■■□□ 2.28
ZBED5-204ENST00000526020 SMARCA2P51531 1590 aa29.25■■■□□ 2.27
ZBED5-204ENST00000526020 PEG3Q9GZU2 1588 aa29.25■■■□□ 2.27
ZBED5-204ENST00000526020 NCAPD3P42695 1498 aa29.25■■■□□ 2.27
ZBED5-204ENST00000526020 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP29.13■■■□□ 2.25
ZBED5-204ENST00000526020 HMGXB3Q12766 1538 aa29.12■■■□□ 2.25
ZBED5-204ENST00000526020 WIZO95785 1651 aa29.1■■■□□ 2.25
ZBED5-204ENST00000526020 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP29.04■■■□□ 2.24
ZBED5-204ENST00000526020 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP28.76■■■□□ 2.2
ZBED5-204ENST00000526020 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP28.51■■■□□ 2.15
ZBED5-204ENST00000526020 NESP48681 1621 aa28.5■■■□□ 2.15
ZBED5-204ENST00000526020 CCDC88BA6NC98 1476 aa28.44■■■□□ 2.14
ZBED5-204ENST00000526020 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa28.43■■■□□ 2.14
ZBED5-204ENST00000526020 CADPSQ9ULU8 1353 aa28.39■■■□□ 2.14
ZBED5-204ENST00000526020 CFTRP13569 1480 aa28.29■■■□□ 2.12
ZBED5-204ENST00000526020 ERCC6Q03468 1493 aa28.21■■■□□ 2.11
ZBED5-204ENST00000526020 PDS5BQ9NTI5 1447 aa28.19■■■□□ 2.1
ZBED5-204ENST00000526020 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa28.18■■■□□ 2.1
ZBED5-204ENST00000526020 PRDM2Q13029 1718 aa28.14■■■□□ 2.09
ZBED5-204ENST00000526020 FANCD2Q9BXW9 1451 aa28.06■■■□□ 2.08
ZBED5-204ENST00000526020 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP28.01■■■□□ 2.08
ZBED5-204ENST00000526020 CEP164Q9UPV0 1460 aa27.99■■■□□ 2.07
ZBED5-204ENST00000526020 MRC2Q9UBG0 1479 aa27.91■■■□□ 2.06
ZBED5-204ENST00000526020 CUX2O14529 1486 aa27.86■■■□□ 2.05
ZBED5-204ENST00000526020 WDR62O43379 1518 aa27.84■■■□□ 2.05
ZBED5-204ENST00000526020 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP27.81■■■□□ 2.04
ZBED5-204ENST00000526020 TOPBP1Q92547 1522 aa27.66■■■□□ 2.02
ZBED5-204ENST00000526020 DNMBPQ6XZF7 1577 aa27.64■■■□□ 2.02
ZBED5-204ENST00000526020 ABCC8Q09428 1581 aa27.63■■■□□ 2.01
ZBED5-204ENST00000526020 CUX1P39880 1505 aa27.55■■■□□ 2
ZBED5-204ENST00000526020 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP27.44■■□□□ 1.98
ZBED5-204ENST00000526020 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP27.42■■□□□ 1.98
ZBED5-204ENST00000526020 FGD5Q6ZNL6 1462 aa27.4■■□□□ 1.98
ZBED5-204ENST00000526020 IFT140Q96RY7 1462 aa27.4■■□□□ 1.98
ZBED5-204ENST00000526020 SYNJ1O43426 1573 aa27.39■■□□□ 1.98
ZBED5-204ENST00000526020 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa27.39■■□□□ 1.97
ZBED5-204ENST00000526020 TOP2BQ02880 1626 aa27.37■■□□□ 1.97
ZBED5-204ENST00000526020 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP27.37■■□□□ 1.97
ZBED5-204ENST00000526020 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa27.33■■□□□ 1.96
ZBED5-204ENST00000526020 SOGA1O94964 1423 aa27.3■■□□□ 1.96
ZBED5-204ENST00000526020 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP27.3■■□□□ 1.96
ZBED5-204ENST00000526020 WDR97A6NE52 1622 aa27.22■■□□□ 1.95
ZBED5-204ENST00000526020 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP27.19■■□□□ 1.94
ZBED5-204ENST00000526020 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP27.16■■□□□ 1.94
ZBED5-204ENST00000526020 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa27.16■■□□□ 1.94
ZBED5-204ENST00000526020 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP27.14■■□□□ 1.94
ZBED5-204ENST00000526020 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa27.05■■□□□ 1.92
ZBED5-204ENST00000526020 GAPVD1Q14C86 1478 aa27■■□□□ 1.91
ZBED5-204ENST00000526020 PBRM1Q86U86 1689 aa26.97■■□□□ 1.91
ZBED5-204ENST00000526020 GRIN2BQ13224 1484 aa26.96■■□□□ 1.91
ZBED5-204ENST00000526020 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa26.9■■□□□ 1.9
ZBED5-204ENST00000526020 TRIM41Q8WV44 630 aa26.9■■□□□ 1.9
ZBED5-204ENST00000526020 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP26.86■■□□□ 1.89
ZBED5-204ENST00000526020 CHD1O14646 1710 aa26.84■■□□□ 1.89
ZBED5-204ENST00000526020 ERICH3Q5RHP9 1530 aa26.82■■□□□ 1.88
ZBED5-204ENST00000526020 KIF27Q86VH2 1401 aa26.81■■□□□ 1.88
ZBED5-204ENST00000526020 CHIC1Q5VXU3 224 aa26.79■■□□□ 1.88
ZBED5-204ENST00000526020 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa26.76■■□□□ 1.87
ZBED5-204ENST00000526020 SYNJ2O15056 1496 aa26.76■■□□□ 1.87
ZBED5-204ENST00000526020 ADAMTS12P58397 1594 aa26.75■■□□□ 1.87
ZBED5-204ENST00000526020 OSCARQ8IYS5 282 aa26.75■■□□□ 1.87
ZBED5-204ENST00000526020 IGF1RP08069 1367 aa26.72■■□□□ 1.87
ZBED5-204ENST00000526020 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa26.72■■□□□ 1.87
ZBED5-204ENST00000526020 FBLN2P98095 1184 aa26.72■■□□□ 1.87
ZBED5-204ENST00000526020 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP26.7■■□□□ 1.86
ZBED5-204ENST00000526020 FHAD1B1AJZ9 1412 aa26.69■■□□□ 1.86
ZBED5-204ENST00000526020 GRIN2AQ12879 1464 aa26.62■■□□□ 1.85
ZBED5-204ENST00000526020 CUL7Q14999 1698 aa26.62■■□□□ 1.85
ZBED5-204ENST00000526020 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa26.54■■□□□ 1.84
ZBED5-204ENST00000526020 CLASP1Q7Z460 1538 aa26.53■■□□□ 1.84
ZBED5-204ENST00000526020 NUP160Q12769 1436 aa26.51■■□□□ 1.83
ZBED5-204ENST00000526020 CEP170Q5SW79 1584 aa26.51■■□□□ 1.83
ZBED5-204ENST00000526020 EEA1Q15075 1411 aa26.44■■□□□ 1.82
ZBED5-204ENST00000526020 PRXQ9BXM0 1461 aa26.41■■□□□ 1.82
ZBED5-204ENST00000526020 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa26.41■■□□□ 1.82
ZBED5-204ENST00000526020 CSRNP3Q8WYN3 585 aa26.4■■□□□ 1.82
ZBED5-204ENST00000526020 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP26.35■■□□□ 1.81
ZBED5-204ENST00000526020 ARHGEF11O15085 1522 aa26.34■■□□□ 1.81
ZBED5-204ENST00000526020 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa26.34■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.4 ms