RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524681.1

CTSW-202, Transcript of cathepsin W, humanhuman

TSL 2

Gene CTSW, Length 521 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSW-202ENST00000524681 NISCHQ9Y2I1 1504 aa17.83■□□□□ 0.45
CTSW-202ENST00000524681 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa15.68■□□□□ 0.1
CTSW-202ENST00000524681 ABCC9O60706 1549 aa15.09■□□□□ 0.01
CTSW-202ENST00000524681 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
CTSW-202ENST00000524681 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa14.78□□□□□ -0.04
CTSW-202ENST00000524681 MYO15BQ96JP2 1530 aa14.76□□□□□ -0.05
CTSW-202ENST00000524681 NACADO15069 1562 aa14.69□□□□□ -0.06
CTSW-202ENST00000524681 DCAF8L2P0C7V8 631 aa14.65□□□□□ -0.06
CTSW-202ENST00000524681 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa14.6□□□□□ -0.07
CTSW-202ENST00000524681 UNC13AQ9UPW8 1703 aa14.32□□□□□ -0.12
CTSW-202ENST00000524681 SCRIBQ14160 1630 aa14.3□□□□□ -0.12
CTSW-202ENST00000524681 BICRAQ9NZM4 1560 aa14.28□□□□□ -0.12
CTSW-202ENST00000524681 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP14.17□□□□□ -0.14
CTSW-202ENST00000524681 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa14.16□□□□□ -0.14
CTSW-202ENST00000524681 CECR2Q9BXF3 1484 aa13.9□□□□□ -0.18
CTSW-202ENST00000524681 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP13.81□□□□□ -0.2
CTSW-202ENST00000524681 MROH2BQ7Z745 1585 aa13.76□□□□□ -0.21
CTSW-202ENST00000524681 DNAJC5BQ9UF47 199 aa13.76□□□□□ -0.21
CTSW-202ENST00000524681 SMARCA4P51532 1647 aa13.75□□□□□ -0.21
CTSW-202ENST00000524681 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP13.75□□□□□ -0.21
CTSW-202ENST00000524681 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP13.72□□□□□ -0.21
CTSW-202ENST00000524681 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa13.68□□□□□ -0.22
CTSW-202ENST00000524681 PEG3Q9GZU2 1588 aa13.66□□□□□ -0.22
CTSW-202ENST00000524681 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa13.64□□□□□ -0.23
CTSW-202ENST00000524681 NCAPD3P42695 1498 aa13.62□□□□□ -0.23
CTSW-202ENST00000524681 WIZO95785 1651 aa13.59□□□□□ -0.23
CTSW-202ENST00000524681 SMARCA2P51531 1590 aa13.57□□□□□ -0.24
CTSW-202ENST00000524681 HMGXB3Q12766 1538 aa13.52□□□□□ -0.25
CTSW-202ENST00000524681 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP13.47□□□□□ -0.25
CTSW-202ENST00000524681 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP13.45□□□□□ -0.26
CTSW-202ENST00000524681 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
CTSW-202ENST00000524681 CCDC88BA6NC98 1476 aa13.33□□□□□ -0.28
CTSW-202ENST00000524681 CFTRP13569 1480 aa13.2□□□□□ -0.3
CTSW-202ENST00000524681 CADPSQ9ULU8 1353 aa13.2□□□□□ -0.3
CTSW-202ENST00000524681 NESP48681 1621 aa13.18□□□□□ -0.3
CTSW-202ENST00000524681 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa13.13□□□□□ -0.31
CTSW-202ENST00000524681 PDS5BQ9NTI5 1447 aa13.02□□□□□ -0.33
CTSW-202ENST00000524681 FANCD2Q9BXW9 1451 aa13.02□□□□□ -0.33
CTSW-202ENST00000524681 PRDM2Q13029 1718 aa13.02□□□□□ -0.33
CTSW-202ENST00000524681 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa12.98□□□□□ -0.33
CTSW-202ENST00000524681 CEP164Q9UPV0 1460 aa12.93□□□□□ -0.34
CTSW-202ENST00000524681 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP12.92□□□□□ -0.34
CTSW-202ENST00000524681 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP12.91□□□□□ -0.34
CTSW-202ENST00000524681 ERCC6Q03468 1493 aa12.91□□□□□ -0.34
CTSW-202ENST00000524681 MRC2Q9UBG0 1479 aa12.9□□□□□ -0.34
CTSW-202ENST00000524681 CUX1P39880 1505 aa12.88□□□□□ -0.35
CTSW-202ENST00000524681 ABCC8Q09428 1581 aa12.88□□□□□ -0.35
CTSW-202ENST00000524681 WDR62O43379 1518 aa12.88□□□□□ -0.35
CTSW-202ENST00000524681 TOPBP1Q92547 1522 aa12.86□□□□□ -0.35
CTSW-202ENST00000524681 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP12.85□□□□□ -0.35
CTSW-202ENST00000524681 SYNJ1O43426 1573 aa12.84□□□□□ -0.35
CTSW-202ENST00000524681 DNMBPQ6XZF7 1577 aa12.84□□□□□ -0.35
CTSW-202ENST00000524681 TOP2BQ02880 1626 aa12.81□□□□□ -0.36
CTSW-202ENST00000524681 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa12.8□□□□□ -0.36
CTSW-202ENST00000524681 CUX2O14529 1486 aa12.8□□□□□ -0.36
CTSW-202ENST00000524681 CHIC1Q5VXU3 224 aa12.79□□□□□ -0.36
CTSW-202ENST00000524681 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP12.77□□□□□ -0.37
CTSW-202ENST00000524681 FGD5Q6ZNL6 1462 aa12.76□□□□□ -0.37
CTSW-202ENST00000524681 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP12.73□□□□□ -0.37
CTSW-202ENST00000524681 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa12.72□□□□□ -0.37
CTSW-202ENST00000524681 SOGA1O94964 1423 aa12.7□□□□□ -0.38
CTSW-202ENST00000524681 IFT140Q96RY7 1462 aa12.69□□□□□ -0.38
CTSW-202ENST00000524681 TRIM41Q8WV44 630 aa12.68□□□□□ -0.38
CTSW-202ENST00000524681 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa12.67□□□□□ -0.38
CTSW-202ENST00000524681 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP12.66□□□□□ -0.38
CTSW-202ENST00000524681 WDR97A6NE52 1622 aa12.66□□□□□ -0.38
CTSW-202ENST00000524681 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP12.61□□□□□ -0.39
CTSW-202ENST00000524681 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa12.61□□□□□ -0.39
CTSW-202ENST00000524681 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP12.6□□□□□ -0.39
CTSW-202ENST00000524681 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa12.59□□□□□ -0.39
CTSW-202ENST00000524681 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP12.56□□□□□ -0.4
CTSW-202ENST00000524681 IGF1RP08069 1367 aa12.56□□□□□ -0.4
CTSW-202ENST00000524681 GAPVD1Q14C86 1478 aa12.54□□□□□ -0.4
CTSW-202ENST00000524681 KIF27Q86VH2 1401 aa12.54□□□□□ -0.4
CTSW-202ENST00000524681 GRIN2BQ13224 1484 aa12.51□□□□□ -0.41
CTSW-202ENST00000524681 ERICH3Q5RHP9 1530 aa12.5□□□□□ -0.41
CTSW-202ENST00000524681 PBRM1Q86U86 1689 aa12.47□□□□□ -0.41
CTSW-202ENST00000524681 EEA1Q15075 1411 aa12.46□□□□□ -0.41
CTSW-202ENST00000524681 PRXQ9BXM0 1461 aa12.46□□□□□ -0.42
CTSW-202ENST00000524681 CSRNP3Q8WYN3 585 aa12.45□□□□□ -0.42
CTSW-202ENST00000524681 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa12.45□□□□□ -0.42
CTSW-202ENST00000524681 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP12.45□□□□□ -0.42
CTSW-202ENST00000524681 ADAMTS12P58397 1594 aa12.43□□□□□ -0.42
CTSW-202ENST00000524681 FHAD1B1AJZ9 1412 aa12.42□□□□□ -0.42
CTSW-202ENST00000524681 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa12.41□□□□□ -0.42
CTSW-202ENST00000524681 SYNJ2O15056 1496 aa12.4□□□□□ -0.42
CTSW-202ENST00000524681 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP12.4□□□□□ -0.42
CTSW-202ENST00000524681 CUL7Q14999 1698 aa12.38□□□□□ -0.43
CTSW-202ENST00000524681 GRIN2AQ12879 1464 aa12.36□□□□□ -0.43
CTSW-202ENST00000524681 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP12.36□□□□□ -0.43
CTSW-202ENST00000524681 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa12.35□□□□□ -0.43
CTSW-202ENST00000524681 KIF21BO75037 1637 aa12.34□□□□□ -0.43
CTSW-202ENST00000524681 NUP160Q12769 1436 aa12.34□□□□□ -0.43
CTSW-202ENST00000524681 CHD1O14646 1710 aa12.33□□□□□ -0.44
CTSW-202ENST00000524681 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP12.32□□□□□ -0.44
CTSW-202ENST00000524681 CEP170Q5SW79 1584 aa12.31□□□□□ -0.44
CTSW-202ENST00000524681 CLASP1Q7Z460 1538 aa12.28□□□□□ -0.44
CTSW-202ENST00000524681 FBLN2P98095 1184 aa12.28□□□□□ -0.44
CTSW-202ENST00000524681 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa12.26□□□□□ -0.45
CTSW-202ENST00000524681 OSCARQ8IYS5 282 aa12.26□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.1 ms