RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524626.5

APBB1-204, Transcript of amyloid beta precursor protein binding family B member 1, human

TSL 2

Gene APBB1, Length 1,458 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
APBB1-204	ENST00000524626	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		45.36	■■■■■ 4.85
APBB1-204	ENST00000524626	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		40.22	■■■■■ 4.03
APBB1-204	ENST00000524626	ABCC9	O60706	1549 aa		39.14	■■■■□ 3.86
APBB1-204	ENST00000524626	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		37.9	■■■■□ 3.66
APBB1-204	ENST00000524626	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	37.82	■■■■□ 3.64
APBB1-204	ENST00000524626	NACAD	O15069	1562 aa		37.77	■■■■□ 3.64
APBB1-204	ENST00000524626	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		37.76	■■■■□ 3.64
APBB1-204	ENST00000524626	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		37.59	■■■■□ 3.61
APBB1-204	ENST00000524626	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		37.53	■■■■□ 3.6
APBB1-204	ENST00000524626	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		36.92	■■■■□ 3.5
APBB1-204	ENST00000524626	SCRIB	Q14160	1630 aa		36.73	■■■■□ 3.47
APBB1-204	ENST00000524626	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	36.65	■■■■□ 3.46
APBB1-204	ENST00000524626	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		36.58	■■■■□ 3.45
APBB1-204	ENST00000524626	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		36.2	■■■■□ 3.39
APBB1-204	ENST00000524626	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		35.72	■■■■□ 3.31
APBB1-204	ENST00000524626	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	35.61	■■■■□ 3.29
APBB1-204	ENST00000524626	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		35.42	■■■■□ 3.26
APBB1-204	ENST00000524626	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		35.31	■■■■□ 3.24
APBB1-204	ENST00000524626	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	35.15	■■■■□ 3.22
APBB1-204	ENST00000524626	SMARCA4	P51532	1647 aa		35.15	■■■■□ 3.22
APBB1-204	ENST00000524626	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		34.97	■■■■□ 3.19
APBB1-204	ENST00000524626	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		34.89	■■■■□ 3.18
APBB1-204	ENST00000524626	SMARCA2	P51531	1590 aa		34.87	■■■■□ 3.17
APBB1-204	ENST00000524626	NCAPD3	P42695	1498 aa		34.84	■■■■□ 3.17
APBB1-204	ENST00000524626	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		34.79	■■■■□ 3.16
APBB1-204	ENST00000524626	HMGXB3	Q12766	1538 aa		34.68	■■■■□ 3.14
APBB1-204	ENST00000524626	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	34.66	■■■■□ 3.14
APBB1-204	ENST00000524626	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	34.63	■■■■□ 3.13
APBB1-204	ENST00000524626	WIZ	O95785	1651 aa		34.62	■■■■□ 3.13
APBB1-204	ENST00000524626	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	34.24	■■■■□ 3.07
APBB1-204	ENST00000524626	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	34.03	■■■■□ 3.04
APBB1-204	ENST00000524626	NES	P48681	1621 aa		33.94	■■■■□ 3.02
APBB1-204	ENST00000524626	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		33.9	■■■■□ 3.02
APBB1-204	ENST00000524626	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		33.86	■■■■□ 3.01
APBB1-204	ENST00000524626	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		33.85	■■■■□ 3.01
APBB1-204	ENST00000524626	ERCC6	Q03468	1493 aa		33.74	■■■□□ 2.99
APBB1-204	ENST00000524626	CFTR	P13569	1480 aa		33.68	■■■□□ 2.98
APBB1-204	ENST00000524626	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		33.67	■■■□□ 2.98
APBB1-204	ENST00000524626	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		33.56	■■■□□ 2.96
APBB1-204	ENST00000524626	PRDM2	Q13029	1718 aa		33.47	■■■□□ 2.95
APBB1-204	ENST00000524626	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		33.46	■■■□□ 2.95
APBB1-204	ENST00000524626	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		33.4	■■■□□ 2.94
APBB1-204	ENST00000524626	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	33.34	■■■□□ 2.93
APBB1-204	ENST00000524626	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		33.29	■■■□□ 2.92
APBB1-204	ENST00000524626	CUX2	O14529	1486 aa		33.26	■■■□□ 2.91
APBB1-204	ENST00000524626	WDR62	O43379	1518 aa		33.16	■■■□□ 2.9
APBB1-204	ENST00000524626	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	33.1	■■■□□ 2.89
APBB1-204	ENST00000524626	ABCC8	Q09428	1581 aa		32.98	■■■□□ 2.87
APBB1-204	ENST00000524626	TOPBP1	Q92547	1522 aa		32.95	■■■□□ 2.86
APBB1-204	ENST00000524626	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		32.93	■■■□□ 2.86
APBB1-204	ENST00000524626	CUX1	P39880	1505 aa		32.78	■■■□□ 2.84
APBB1-204	ENST00000524626	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	32.68	■■■□□ 2.82
APBB1-204	ENST00000524626	IFT140	Q96RY7	1462 aa		32.68	■■■□□ 2.82
APBB1-204	ENST00000524626	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	32.68	■■■□□ 2.82
APBB1-204	ENST00000524626	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		32.65	■■■□□ 2.82
APBB1-204	ENST00000524626	SOGA1	O94964	1423 aa		32.58	■■■□□ 2.81
APBB1-204	ENST00000524626	TOP2B	Q02880	1626 aa		32.58	■■■□□ 2.81
APBB1-204	ENST00000524626	SYNJ1	O43426	1573 aa		32.57	■■■□□ 2.81
APBB1-204	ENST00000524626	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	32.57	■■■□□ 2.8
APBB1-204	ENST00000524626	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		32.57	■■■□□ 2.8
APBB1-204	ENST00000524626	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		32.55	■■■□□ 2.8
APBB1-204	ENST00000524626	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	32.51	■■■□□ 2.8
APBB1-204	ENST00000524626	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	32.39	■■■□□ 2.78
APBB1-204	ENST00000524626	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	32.38	■■■□□ 2.77
APBB1-204	ENST00000524626	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	32.37	■■■□□ 2.77
APBB1-204	ENST00000524626	WDR97	A6NE52	1622 aa		32.34	■■■□□ 2.77
APBB1-204	ENST00000524626	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		32.33	■■■□□ 2.77
APBB1-204	ENST00000524626	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		32.2	■■■□□ 2.74
APBB1-204	ENST00000524626	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		32.18	■■■□□ 2.74
APBB1-204	ENST00000524626	GRIN2B	Q13224	1484 aa		32.15	■■■□□ 2.74
APBB1-204	ENST00000524626	TRIM41	Q8WV44	630 aa		32.13	■■■□□ 2.73
APBB1-204	ENST00000524626	PBRM1	Q86U86	1689 aa		32.12	■■■□□ 2.73
APBB1-204	ENST00000524626	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		32.07	■■■□□ 2.72
APBB1-204	ENST00000524626	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	32.04	■■■□□ 2.72
APBB1-204	ENST00000524626	FBLN2	P98095	1184 aa		32	■■■□□ 2.71
APBB1-204	ENST00000524626	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		31.99	■■■□□ 2.71
APBB1-204	ENST00000524626	KIF27	Q86VH2	1401 aa		31.99	■■■□□ 2.71
APBB1-204	ENST00000524626	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		31.98	■■■□□ 2.71
APBB1-204	ENST00000524626	CHD1	O14646	1710 aa		31.96	■■■□□ 2.71
APBB1-204	ENST00000524626	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		31.96	■■■□□ 2.71
APBB1-204	ENST00000524626	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	31.93	■■■□□ 2.7
APBB1-204	ENST00000524626	SYNJ2	O15056	1496 aa		31.91	■■■□□ 2.7
APBB1-204	ENST00000524626	CHIC1	Q5VXU3	224 aa		31.87	■■■□□ 2.69
APBB1-204	ENST00000524626	ADAMTS12	P58397	1594 aa		31.85	■■■□□ 2.69
APBB1-204	ENST00000524626	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		31.83	■■■□□ 2.69
APBB1-204	ENST00000524626	IGF1R	P08069	1367 aa		31.83	■■■□□ 2.69
APBB1-204	ENST00000524626	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		31.77	■■■□□ 2.68
APBB1-204	ENST00000524626	GRIN2A	Q12879	1464 aa		31.73	■■■□□ 2.67
APBB1-204	ENST00000524626	CUL7	Q14999	1698 aa		31.72	■■■□□ 2.67
APBB1-204	ENST00000524626	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		31.65	■■■□□ 2.66
APBB1-204	ENST00000524626	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		31.58	■■■□□ 2.65
APBB1-204	ENST00000524626	NUP160	Q12769	1436 aa		31.57	■■■□□ 2.64
APBB1-204	ENST00000524626	CEP170	Q5SW79	1584 aa		31.56	■■■□□ 2.64
APBB1-204	ENST00000524626	EEA1	Q15075	1411 aa		31.53	■■■□□ 2.64
APBB1-204	ENST00000524626	CSRNP3	Q8WYN3	585 aa		31.5	■■■□□ 2.63
APBB1-204	ENST00000524626	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		31.49	■■■□□ 2.63
APBB1-204	ENST00000524626	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	31.46	■■■□□ 2.63
APBB1-204	ENST00000524626	PRX	Q9BXM0	1461 aa		31.41	■■■□□ 2.62
APBB1-204	ENST00000524626	ARHGEF11	O15085	1522 aa		31.41	■■■□□ 2.62
APBB1-204	ENST00000524626	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		31.4	■■■□□ 2.62

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