RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520912.1

TBC1D9B-211, Transcript of TBC1 domain family member 9B, humanhuman

TSL 2

Gene TBC1D9B, Length 1,931 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBC1D9B-211ENST00000520912 NISCHQ9Y2I1 1504 aa35.51■■■■□ 3.27
TBC1D9B-211ENST00000520912 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa31.08■■■□□ 2.57
TBC1D9B-211ENST00000520912 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP29.8■■■□□ 2.36
TBC1D9B-211ENST00000520912 ABCC9O60706 1549 aa29.54■■■□□ 2.32
TBC1D9B-211ENST00000520912 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa29.35■■■□□ 2.29
TBC1D9B-211ENST00000520912 DCAF8L2P0C7V8 631 aa29.35■■■□□ 2.29
TBC1D9B-211ENST00000520912 MYO15BQ96JP2 1530 aa29.08■■■□□ 2.25
TBC1D9B-211ENST00000520912 NACADO15069 1562 aa28.96■■■□□ 2.23
TBC1D9B-211ENST00000520912 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa28.82■■■□□ 2.2
TBC1D9B-211ENST00000520912 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa28.77■■■□□ 2.2
TBC1D9B-211ENST00000520912 SCRIBQ14160 1630 aa28.54■■■□□ 2.16
TBC1D9B-211ENST00000520912 UNC13AQ9UPW8 1703 aa28.24■■■□□ 2.11
TBC1D9B-211ENST00000520912 BICRAQ9NZM4 1560 aa27.93■■■□□ 2.06
TBC1D9B-211ENST00000520912 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP27.8■■■□□ 2.04
TBC1D9B-211ENST00000520912 CECR2Q9BXF3 1484 aa27.62■■■□□ 2.01
TBC1D9B-211ENST00000520912 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP27.61■■■□□ 2.01
TBC1D9B-211ENST00000520912 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP27.47■■□□□ 1.99
TBC1D9B-211ENST00000520912 MROH2BQ7Z745 1585 aa27.44■■□□□ 1.98
TBC1D9B-211ENST00000520912 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP27.44■■□□□ 1.98
TBC1D9B-211ENST00000520912 SMARCA4P51532 1647 aa27.36■■□□□ 1.97
TBC1D9B-211ENST00000520912 WIZO95785 1651 aa27.22■■□□□ 1.95
TBC1D9B-211ENST00000520912 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP27.09■■□□□ 1.93
TBC1D9B-211ENST00000520912 PEG3Q9GZU2 1588 aa27.03■■□□□ 1.92
TBC1D9B-211ENST00000520912 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa26.93■■□□□ 1.9
TBC1D9B-211ENST00000520912 SMARCA2P51531 1590 aa26.91■■□□□ 1.9
TBC1D9B-211ENST00000520912 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP26.91■■□□□ 1.9
TBC1D9B-211ENST00000520912 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP26.77■■□□□ 1.88
TBC1D9B-211ENST00000520912 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa26.74■■□□□ 1.87
TBC1D9B-211ENST00000520912 NCAPD3P42695 1498 aa26.73■■□□□ 1.87
TBC1D9B-211ENST00000520912 HMGXB3Q12766 1538 aa26.69■■□□□ 1.86
TBC1D9B-211ENST00000520912 CCDC88BA6NC98 1476 aa26.62■■□□□ 1.85
TBC1D9B-211ENST00000520912 CHIC1Q5VXU3 224 aa26.51■■□□□ 1.83
TBC1D9B-211ENST00000520912 DNAJC5BQ9UF47 199 aa26.23■■□□□ 1.79
TBC1D9B-211ENST00000520912 HRCP23327 699 aa26.2■■□□□ 1.78
TBC1D9B-211ENST00000520912 CFTRP13569 1480 aa26.1■■□□□ 1.77
TBC1D9B-211ENST00000520912 CADPSQ9ULU8 1353 aa26.03■■□□□ 1.76
TBC1D9B-211ENST00000520912 ABCC8Q09428 1581 aa26.02■■□□□ 1.76
TBC1D9B-211ENST00000520912 PRDM2Q13029 1718 aa25.99■■□□□ 1.75
TBC1D9B-211ENST00000520912 TRIM41Q8WV44 630 aa25.97■■□□□ 1.75
TBC1D9B-211ENST00000520912 NESP48681 1621 aa25.89■■□□□ 1.73
TBC1D9B-211ENST00000520912 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa25.87■■□□□ 1.73
TBC1D9B-211ENST00000520912 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP25.86■■□□□ 1.739e-6■■■■■ 50.1
TBC1D9B-211ENST00000520912 PCGF6Q9BYE7 350 aa25.79■■□□□ 1.72
TBC1D9B-211ENST00000520912 SYNJ1O43426 1573 aa25.78■■□□□ 1.72
TBC1D9B-211ENST00000520912 FANCD2Q9BXW9 1451 aa25.75■■□□□ 1.71
TBC1D9B-211ENST00000520912 TOP2BQ02880 1626 aa25.69■■□□□ 1.7
TBC1D9B-211ENST00000520912 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa25.67■■□□□ 1.7
TBC1D9B-211ENST00000520912 CUX1P39880 1505 aa25.67■■□□□ 1.7
TBC1D9B-211ENST00000520912 PDS5BQ9NTI5 1447 aa25.64■■□□□ 1.7
TBC1D9B-211ENST00000520912 CEP164Q9UPV0 1460 aa25.6■■□□□ 1.69
TBC1D9B-211ENST00000520912 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa25.6■■□□□ 1.69
TBC1D9B-211ENST00000520912 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa25.53■■□□□ 1.68
TBC1D9B-211ENST00000520912 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP25.49■■□□□ 1.67
TBC1D9B-211ENST00000520912 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP25.49■■□□□ 1.67
TBC1D9B-211ENST00000520912 DNMBPQ6XZF7 1577 aa25.49■■□□□ 1.67
TBC1D9B-211ENST00000520912 SOGA1O94964 1423 aa25.48■■□□□ 1.67
TBC1D9B-211ENST00000520912 TOPBP1Q92547 1522 aa25.46■■□□□ 1.67
TBC1D9B-211ENST00000520912 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP25.45■■□□□ 1.66
TBC1D9B-211ENST00000520912 FGD5Q6ZNL6 1462 aa25.41■■□□□ 1.66
TBC1D9B-211ENST00000520912 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa25.41■■□□□ 1.66
TBC1D9B-211ENST00000520912 EEA1Q15075 1411 aa25.36■■□□□ 1.65
TBC1D9B-211ENST00000520912 MRC2Q9UBG0 1479 aa25.35■■□□□ 1.65
TBC1D9B-211ENST00000520912 ERCC6Q03468 1493 aa25.33■■□□□ 1.65
TBC1D9B-211ENST00000520912 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP25.32■■□□□ 1.64
TBC1D9B-211ENST00000520912 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
TBC1D9B-211ENST00000520912 CSRNP3Q8WYN3 585 aa25.24■■□□□ 1.63
TBC1D9B-211ENST00000520912 WDR62O43379 1518 aa25.23■■□□□ 1.63
TBC1D9B-211ENST00000520912 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa25.23■■□□□ 1.63
TBC1D9B-211ENST00000520912 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
TBC1D9B-211ENST00000520912 KIF27Q86VH2 1401 aa25.21■■□□□ 1.63
TBC1D9B-211ENST00000520912 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
TBC1D9B-211ENST00000520912 CUX2O14529 1486 aa25.2■■□□□ 1.62
TBC1D9B-211ENST00000520912 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa25.17■■□□□ 1.62
TBC1D9B-211ENST00000520912 WDR97A6NE52 1622 aa25.15■■□□□ 1.62
TBC1D9B-211ENST00000520912 EHMT2Q96KQ7 1210 aa25.14■■□□□ 1.62
TBC1D9B-211ENST00000520912 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
TBC1D9B-211ENST00000520912 KIF21BO75037 1637 aa25.08■■□□□ 1.61
TBC1D9B-211ENST00000520912 GOLGA3Q08378 1498 aa25.01■■□□□ 1.59
TBC1D9B-211ENST00000520912 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa25.01■■□□□ 1.59
TBC1D9B-211ENST00000520912 IGF1RP08069 1367 aa25.01■■□□□ 1.59
TBC1D9B-211ENST00000520912 PRXQ9BXM0 1461 aa25.01■■□□□ 1.59
TBC1D9B-211ENST00000520912 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
TBC1D9B-211ENST00000520912 IFT140Q96RY7 1462 aa25■■□□□ 1.59
TBC1D9B-211ENST00000520912 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa24.97■■□□□ 1.59
TBC1D9B-211ENST00000520912 GAPVD1Q14C86 1478 aa24.95■■□□□ 1.58
TBC1D9B-211ENST00000520912 ERICH3Q5RHP9 1530 aa24.94■■□□□ 1.58
TBC1D9B-211ENST00000520912 TNIKQ9UKE5 1360 aa24.89■■□□□ 1.58
TBC1D9B-211ENST00000520912 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP24.89■■□□□ 1.58
TBC1D9B-211ENST00000520912 UBTFP17480 764 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.58
TBC1D9B-211ENST00000520912 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP24.88■■□□□ 1.577e-7■■■■□ 25.2
TBC1D9B-211ENST00000520912 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa24.87■■□□□ 1.57
TBC1D9B-211ENST00000520912 CUL7Q14999 1698 aa24.86■■□□□ 1.57
TBC1D9B-211ENST00000520912 PBRM1Q86U86 1689 aa24.85■■□□□ 1.57
TBC1D9B-211ENST00000520912 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
TBC1D9B-211ENST00000520912 GRIN2BQ13224 1484 aa24.77■■□□□ 1.56
TBC1D9B-211ENST00000520912 CEP162Q5TB80 1403 aa24.76■■□□□ 1.55
TBC1D9B-211ENST00000520912 ADAMTS12P58397 1594 aa24.7■■□□□ 1.54
TBC1D9B-211ENST00000520912 FHAD1B1AJZ9 1412 aa24.66■■□□□ 1.54
TBC1D9B-211ENST00000520912 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa24.64■■□□□ 1.54
TBC1D9B-211ENST00000520912 CLIP1P30622 1438 aa24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7.2 ms