RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519426.5

NBN-208, Transcript of nibrin, humanhuman

TSL 4

Gene NBN, Length 535 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBN-208ENST00000519426 NISCHQ9Y2I1 1504 aa31.44■■■□□ 2.62
NBN-208ENST00000519426 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa27.74■■■□□ 2.03
NBN-208ENST00000519426 ABCC9O60706 1549 aa26.8■■□□□ 1.88
NBN-208ENST00000519426 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP26.28■■□□□ 1.8
NBN-208ENST00000519426 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa26.06■■□□□ 1.76
NBN-208ENST00000519426 MYO15BQ96JP2 1530 aa26.05■■□□□ 1.76
NBN-208ENST00000519426 NACADO15069 1562 aa26.03■■□□□ 1.76
NBN-208ENST00000519426 DCAF8L2P0C7V8 631 aa26.01■■□□□ 1.75
NBN-208ENST00000519426 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa25.94■■□□□ 1.74
NBN-208ENST00000519426 SCRIBQ14160 1630 aa25.32■■□□□ 1.64
NBN-208ENST00000519426 UNC13AQ9UPW8 1703 aa25.3■■□□□ 1.64
NBN-208ENST00000519426 BICRAQ9NZM4 1560 aa25.2■■□□□ 1.62
NBN-208ENST00000519426 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP25.12■■□□□ 1.61
NBN-208ENST00000519426 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa24.97■■□□□ 1.59
NBN-208ENST00000519426 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
NBN-208ENST00000519426 CECR2Q9BXF3 1484 aa24.46■■□□□ 1.51
NBN-208ENST00000519426 DNAJC5BQ9UF47 199 aa24.37■■□□□ 1.49
NBN-208ENST00000519426 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
NBN-208ENST00000519426 SMARCA4P51532 1647 aa24.28■■□□□ 1.48
NBN-208ENST00000519426 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa24.26■■□□□ 1.47
NBN-208ENST00000519426 MROH2BQ7Z745 1585 aa24.23■■□□□ 1.47
NBN-208ENST00000519426 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
NBN-208ENST00000519426 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa24.11■■□□□ 1.45
NBN-208ENST00000519426 PEG3Q9GZU2 1588 aa24.1■■□□□ 1.45
NBN-208ENST00000519426 NCAPD3P42695 1498 aa24.07■■□□□ 1.44
NBN-208ENST00000519426 SMARCA2P51531 1590 aa24.05■■□□□ 1.44
NBN-208ENST00000519426 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
NBN-208ENST00000519426 HMGXB3Q12766 1538 aa23.94■■□□□ 1.42
NBN-208ENST00000519426 WIZO95785 1651 aa23.93■■□□□ 1.42
NBN-208ENST00000519426 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP23.87■■□□□ 1.41
NBN-208ENST00000519426 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP23.74■■□□□ 1.39
NBN-208ENST00000519426 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP23.67■■□□□ 1.38
NBN-208ENST00000519426 CCDC88BA6NC98 1476 aa23.48■■□□□ 1.35
NBN-208ENST00000519426 CHIC1Q5VXU3 224 aa23.37■■□□□ 1.33
NBN-208ENST00000519426 CADPSQ9ULU8 1353 aa23.36■■□□□ 1.33
NBN-208ENST00000519426 NESP48681 1621 aa23.33■■□□□ 1.32
NBN-208ENST00000519426 CFTRP13569 1480 aa23.3■■□□□ 1.32
NBN-208ENST00000519426 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa23.3■■□□□ 1.32
NBN-208ENST00000519426 PDS5BQ9NTI5 1447 aa23.15■■□□□ 1.3
NBN-208ENST00000519426 FANCD2Q9BXW9 1451 aa23.06■■□□□ 1.28
NBN-208ENST00000519426 ERCC6Q03468 1493 aa23.04■■□□□ 1.28
NBN-208ENST00000519426 PRDM2Q13029 1718 aa23.02■■□□□ 1.28
NBN-208ENST00000519426 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa22.99■■□□□ 1.27
NBN-208ENST00000519426 CEP164Q9UPV0 1460 aa22.98■■□□□ 1.27
NBN-208ENST00000519426 MRC2Q9UBG0 1479 aa22.89■■□□□ 1.25
NBN-208ENST00000519426 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
NBN-208ENST00000519426 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
NBN-208ENST00000519426 WDR62O43379 1518 aa22.82■■□□□ 1.24
NBN-208ENST00000519426 TOPBP1Q92547 1522 aa22.74■■□□□ 1.23
NBN-208ENST00000519426 ABCC8Q09428 1581 aa22.74■■□□□ 1.23
NBN-208ENST00000519426 CUX2O14529 1486 aa22.73■■□□□ 1.23
NBN-208ENST00000519426 DNMBPQ6XZF7 1577 aa22.72■■□□□ 1.23
NBN-208ENST00000519426 CUX1P39880 1505 aa22.72■■□□□ 1.23
NBN-208ENST00000519426 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP22.68■■□□□ 1.22
NBN-208ENST00000519426 SYNJ1O43426 1573 aa22.6■■□□□ 1.21
NBN-208ENST00000519426 TOP2BQ02880 1626 aa22.59■■□□□ 1.21
NBN-208ENST00000519426 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.2
NBN-208ENST00000519426 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa22.57■■□□□ 1.2
NBN-208ENST00000519426 FGD5Q6ZNL6 1462 aa22.55■■□□□ 1.2
NBN-208ENST00000519426 IFT140Q96RY7 1462 aa22.5■■□□□ 1.19
NBN-208ENST00000519426 SOGA1O94964 1423 aa22.48■■□□□ 1.19
NBN-208ENST00000519426 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
NBN-208ENST00000519426 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa22.47■■□□□ 1.19
NBN-208ENST00000519426 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa22.38■■□□□ 1.17
NBN-208ENST00000519426 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
NBN-208ENST00000519426 TRIM41Q8WV44 630 aa22.35■■□□□ 1.17
NBN-208ENST00000519426 WDR97A6NE52 1622 aa22.33■■□□□ 1.17
NBN-208ENST00000519426 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
NBN-208ENST00000519426 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP22.29■■□□□ 1.163e-8■□□□□ 9.8
NBN-208ENST00000519426 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
NBN-208ENST00000519426 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa22.24■■□□□ 1.15
NBN-208ENST00000519426 GAPVD1Q14C86 1478 aa22.22■■□□□ 1.15
NBN-208ENST00000519426 GRIN2BQ13224 1484 aa22.17■■□□□ 1.14
NBN-208ENST00000519426 KIF27Q86VH2 1401 aa22.17■■□□□ 1.14
NBN-208ENST00000519426 ERICH3Q5RHP9 1530 aa22.11■■□□□ 1.13
NBN-208ENST00000519426 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa22.1■■□□□ 1.13
NBN-208ENST00000519426 IGF1RP08069 1367 aa22.1■■□□□ 1.13
NBN-208ENST00000519426 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa22.08■■□□□ 1.12
NBN-208ENST00000519426 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.12
NBN-208ENST00000519426 PBRM1Q86U86 1689 aa22.07■■□□□ 1.12
NBN-208ENST00000519426 EEA1Q15075 1411 aa21.99■■□□□ 1.11
NBN-208ENST00000519426 SYNJ2O15056 1496 aa21.99■■□□□ 1.11
NBN-208ENST00000519426 ADAMTS12P58397 1594 aa21.99■■□□□ 1.11
NBN-208ENST00000519426 FHAD1B1AJZ9 1412 aa21.98■■□□□ 1.11
NBN-208ENST00000519426 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa21.93■■□□□ 1.1
NBN-208ENST00000519426 CUL7Q14999 1698 aa21.92■■□□□ 1.1
NBN-208ENST00000519426 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP21.91■■□□□ 1.1
NBN-208ENST00000519426 CSRNP3Q8WYN3 585 aa21.91■■□□□ 1.1
NBN-208ENST00000519426 GRIN2AQ12879 1464 aa21.9■■□□□ 1.1
NBN-208ENST00000519426 PRXQ9BXM0 1461 aa21.89■■□□□ 1.09
NBN-208ENST00000519426 FBLN2P98095 1184 aa21.88■■□□□ 1.09
NBN-208ENST00000519426 CHD1O14646 1710 aa21.86■■□□□ 1.09
NBN-208ENST00000519426 OSCARQ8IYS5 282 aa21.84■■□□□ 1.09
NBN-208ENST00000519426 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
NBN-208ENST00000519426 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa21.83■■□□□ 1.08
NBN-208ENST00000519426 NUP160Q12769 1436 aa21.81■■□□□ 1.08
NBN-208ENST00000519426 CEP170Q5SW79 1584 aa21.76■■□□□ 1.07
NBN-208ENST00000519426 CLASP1Q7Z460 1538 aa21.74■■□□□ 1.07
NBN-208ENST00000519426 KIF21BO75037 1637 aa21.72■■□□□ 1.07
NBN-208ENST00000519426 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa21.67■■□□□ 1.06
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