RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515316.5

SPOCK3-224, Transcript of SPARC (osteonectin), cwcv and kazal like domains proteoglycan 3, humanhuman

TSL 4

Gene SPOCK3, Length 524 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3-224ENST00000515316 NISCHQ9Y2I1 1504 aa60.56■■■■■ 7.28
SPOCK3-224ENST00000515316 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa53.64■■■■■ 6.18
SPOCK3-224ENST00000515316 ABCC9O60706 1549 aa52.22■■■■■ 5.95
SPOCK3-224ENST00000515316 DCAF8L2P0C7V8 631 aa50.61■■■■■ 5.69
SPOCK3-224ENST00000515316 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP50.47■■■■■ 5.67
SPOCK3-224ENST00000515316 NACADO15069 1562 aa50.43■■■■■ 5.66
SPOCK3-224ENST00000515316 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa50.4■■■■■ 5.66
SPOCK3-224ENST00000515316 MYO15BQ96JP2 1530 aa50.24■■■■■ 5.63
SPOCK3-224ENST00000515316 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa50.13■■■■■ 5.62
SPOCK3-224ENST00000515316 UNC13AQ9UPW8 1703 aa49.12■■■■■ 5.45
SPOCK3-224ENST00000515316 SCRIBQ14160 1630 aa48.97■■■■■ 5.43
SPOCK3-224ENST00000515316 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP48.91■■■■■ 5.42
SPOCK3-224ENST00000515316 BICRAQ9NZM4 1560 aa48.77■■■■■ 5.4
SPOCK3-224ENST00000515316 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa48.38■■■■■ 5.34
SPOCK3-224ENST00000515316 DNAJC5BQ9UF47 199 aa47.65■■■■■ 5.22
SPOCK3-224ENST00000515316 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP47.5■■■■■ 5.19
SPOCK3-224ENST00000515316 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa47.23■■■■■ 5.15
SPOCK3-224ENST00000515316 CECR2Q9BXF3 1484 aa47.12■■■■■ 5.13
SPOCK3-224ENST00000515316 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP46.93■■■■■ 5.1
SPOCK3-224ENST00000515316 SMARCA4P51532 1647 aa46.88■■■■■ 5.1
SPOCK3-224ENST00000515316 MROH2BQ7Z745 1585 aa46.64■■■■■ 5.06
SPOCK3-224ENST00000515316 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa46.59■■■■■ 5.05
SPOCK3-224ENST00000515316 SMARCA2P51531 1590 aa46.56■■■■■ 5.04
SPOCK3-224ENST00000515316 NCAPD3P42695 1498 aa46.55■■■■■ 5.04
SPOCK3-224ENST00000515316 PEG3Q9GZU2 1588 aa46.43■■■■■ 5.02
SPOCK3-224ENST00000515316 HMGXB3Q12766 1538 aa46.28■■■■■ 5
SPOCK3-224ENST00000515316 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP46.28■■■■■ 5
SPOCK3-224ENST00000515316 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP46.24■■■■■ 4.99
SPOCK3-224ENST00000515316 WIZO95785 1651 aa46.14■■■■■ 4.98
SPOCK3-224ENST00000515316 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP45.7■■■■■ 4.91
SPOCK3-224ENST00000515316 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP45.44■■■■■ 4.86
SPOCK3-224ENST00000515316 NESP48681 1621 aa45.25■■■■■ 4.83
SPOCK3-224ENST00000515316 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa45.24■■■■■ 4.83
SPOCK3-224ENST00000515316 CADPSQ9ULU8 1353 aa45.23■■■■■ 4.83
SPOCK3-224ENST00000515316 CCDC88BA6NC98 1476 aa45.2■■■■■ 4.83
SPOCK3-224ENST00000515316 ERCC6Q03468 1493 aa45.04■■■■■ 4.8
SPOCK3-224ENST00000515316 PDS5BQ9NTI5 1447 aa45■■■■■ 4.79
SPOCK3-224ENST00000515316 CFTRP13569 1480 aa44.98■■■■■ 4.79
SPOCK3-224ENST00000515316 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa44.67■■■■■ 4.74
SPOCK3-224ENST00000515316 FANCD2Q9BXW9 1451 aa44.66■■■■■ 4.74
SPOCK3-224ENST00000515316 CEP164Q9UPV0 1460 aa44.58■■■■■ 4.73
SPOCK3-224ENST00000515316 PRDM2Q13029 1718 aa44.57■■■■■ 4.73
SPOCK3-224ENST00000515316 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP44.45■■■■■ 4.71
SPOCK3-224ENST00000515316 MRC2Q9UBG0 1479 aa44.44■■■■■ 4.7
SPOCK3-224ENST00000515316 CUX2O14529 1486 aa44.42■■■■■ 4.7
SPOCK3-224ENST00000515316 WDR62O43379 1518 aa44.24■■■■■ 4.67
SPOCK3-224ENST00000515316 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP44.15■■■■■ 4.66
SPOCK3-224ENST00000515316 ABCC8Q09428 1581 aa44.09■■■■■ 4.65
SPOCK3-224ENST00000515316 TOPBP1Q92547 1522 aa43.98■■■■■ 4.63
SPOCK3-224ENST00000515316 DNMBPQ6XZF7 1577 aa43.94■■■■■ 4.62
SPOCK3-224ENST00000515316 CUX1P39880 1505 aa43.73■■■■■ 4.59
SPOCK3-224ENST00000515316 IFT140Q96RY7 1462 aa43.66■■■■■ 4.58
SPOCK3-224ENST00000515316 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP43.65■■■■■ 4.58
SPOCK3-224ENST00000515316 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP43.61■■■■■ 4.57
SPOCK3-224ENST00000515316 FGD5Q6ZNL6 1462 aa43.56■■■■■ 4.56
SPOCK3-224ENST00000515316 SOGA1O94964 1423 aa43.53■■■■■ 4.56
SPOCK3-224ENST00000515316 TOP2BQ02880 1626 aa43.46■■■■■ 4.55
SPOCK3-224ENST00000515316 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa43.43■■■■■ 4.54
SPOCK3-224ENST00000515316 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa43.43■■■■■ 4.54
SPOCK3-224ENST00000515316 SYNJ1O43426 1573 aa43.42■■■■■ 4.54
SPOCK3-224ENST00000515316 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP43.42■■■■■ 4.54
SPOCK3-224ENST00000515316 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP43.37■■■■■ 4.53
SPOCK3-224ENST00000515316 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP43.21■■■■■ 4.51
SPOCK3-224ENST00000515316 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP43.21■■■■■ 4.51
SPOCK3-224ENST00000515316 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP43.18■■■■■ 4.5
SPOCK3-224ENST00000515316 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa43.17■■■■■ 4.5
SPOCK3-224ENST00000515316 WDR97A6NE52 1622 aa43.16■■■■■ 4.5
SPOCK3-224ENST00000515316 GAPVD1Q14C86 1478 aa43■■■■■ 4.47
SPOCK3-224ENST00000515316 GRIN2BQ13224 1484 aa42.94■■■■■ 4.47
SPOCK3-224ENST00000515316 TRIM41Q8WV44 630 aa42.94■■■■■ 4.46
SPOCK3-224ENST00000515316 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa42.91■■■■■ 4.46
SPOCK3-224ENST00000515316 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa42.8■■■■■ 4.44
SPOCK3-224ENST00000515316 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP42.79■■■■■ 4.44
SPOCK3-224ENST00000515316 PBRM1Q86U86 1689 aa42.77■■■■■ 4.44
SPOCK3-224ENST00000515316 OSCARQ8IYS5 282 aa42.76■■■■■ 4.44
SPOCK3-224ENST00000515316 KIF27Q86VH2 1401 aa42.75■■■■■ 4.43
SPOCK3-224ENST00000515316 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa42.75■■■■■ 4.43
SPOCK3-224ENST00000515316 FBLN2P98095 1184 aa42.73■■■■■ 4.43
SPOCK3-224ENST00000515316 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP42.68■■■■■ 4.42
SPOCK3-224ENST00000515316 ERICH3Q5RHP9 1530 aa42.67■■■■■ 4.42
SPOCK3-224ENST00000515316 SYNJ2O15056 1496 aa42.62■■■■■ 4.41
SPOCK3-224ENST00000515316 CHIC1Q5VXU3 224 aa42.58■■■■■ 4.41
SPOCK3-224ENST00000515316 CHD1O14646 1710 aa42.56■■■■■ 4.4
SPOCK3-224ENST00000515316 FHAD1B1AJZ9 1412 aa42.53■■■■■ 4.4
SPOCK3-224ENST00000515316 IGF1RP08069 1367 aa42.52■■■■■ 4.4
SPOCK3-224ENST00000515316 ADAMTS12P58397 1594 aa42.48■■■■■ 4.39
SPOCK3-224ENST00000515316 GRIN2AQ12879 1464 aa42.36■■■■■ 4.37
SPOCK3-224ENST00000515316 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa42.36■■■■■ 4.37
SPOCK3-224ENST00000515316 CUL7Q14999 1698 aa42.32■■■■■ 4.37
SPOCK3-224ENST00000515316 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa42.29■■■■■ 4.36
SPOCK3-224ENST00000515316 NUP160Q12769 1436 aa42.16■■■■■ 4.34
SPOCK3-224ENST00000515316 EEA1Q15075 1411 aa42.16■■■■■ 4.34
SPOCK3-224ENST00000515316 CLASP1Q7Z460 1538 aa42.14■■■■■ 4.34
SPOCK3-224ENST00000515316 CSRNP3Q8WYN3 585 aa42.11■■■■■ 4.33
SPOCK3-224ENST00000515316 CEP170Q5SW79 1584 aa42.09■■■■■ 4.33
SPOCK3-224ENST00000515316 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa42.05■■■■■ 4.32
SPOCK3-224ENST00000515316 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP41.99■■■■■ 4.31
SPOCK3-224ENST00000515316 PRXQ9BXM0 1461 aa41.95■■■■■ 4.31
SPOCK3-224ENST00000515316 ARHGEF11O15085 1522 aa41.9■■■■■ 4.3
SPOCK3-224ENST00000515316 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa41.88■■■■■ 4.29
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