RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000508338.1

SH3BP2-212, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP2, Length 491 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-212ENST00000508338 NISCHQ9Y2I1 1504 aa64.39■■■■■ 7.9
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SH3BP2-212ENST00000508338 ABCC9O60706 1549 aa55.41■■■■■ 6.46
SH3BP2-212ENST00000508338 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP53.71■■■■■ 6.19
SH3BP2-212ENST00000508338 NACADO15069 1562 aa53.69■■■■■ 6.19
SH3BP2-212ENST00000508338 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa53.64■■■■■ 6.18
SH3BP2-212ENST00000508338 DCAF8L2P0C7V8 631 aa53.55■■■■■ 6.16
SH3BP2-212ENST00000508338 MYO15BQ96JP2 1530 aa53.55■■■■■ 6.16
SH3BP2-212ENST00000508338 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa53.42■■■■■ 6.14
SH3BP2-212ENST00000508338 UNC13AQ9UPW8 1703 aa52.31■■■■■ 5.96
SH3BP2-212ENST00000508338 SCRIBQ14160 1630 aa52.04■■■■■ 5.92
SH3BP2-212ENST00000508338 BICRAQ9NZM4 1560 aa51.85■■■■■ 5.89
SH3BP2-212ENST00000508338 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP51.79■■■■■ 5.88
SH3BP2-212ENST00000508338 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa51.61■■■■■ 5.85
SH3BP2-212ENST00000508338 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP50.52■■■■■ 5.68
SH3BP2-212ENST00000508338 DNAJC5BQ9UF47 199 aa50.4■■■■■ 5.66
SH3BP2-212ENST00000508338 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa50.2■■■■■ 5.63
SH3BP2-212ENST00000508338 CECR2Q9BXF3 1484 aa50■■■■■ 5.59
SH3BP2-212ENST00000508338 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP49.96■■■■■ 5.59
SH3BP2-212ENST00000508338 SMARCA4P51532 1647 aa49.89■■■■■ 5.58
SH3BP2-212ENST00000508338 SMARCA2P51531 1590 aa49.58■■■■■ 5.53
SH3BP2-212ENST00000508338 MROH2BQ7Z745 1585 aa49.54■■■■■ 5.52
SH3BP2-212ENST00000508338 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa49.51■■■■■ 5.52
SH3BP2-212ENST00000508338 NCAPD3P42695 1498 aa49.49■■■■■ 5.51
SH3BP2-212ENST00000508338 PEG3Q9GZU2 1588 aa49.46■■■■■ 5.51
SH3BP2-212ENST00000508338 HMGXB3Q12766 1538 aa49.3■■■■■ 5.48
SH3BP2-212ENST00000508338 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP49.16■■■■■ 5.46
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SH3BP2-212ENST00000508338 WIZO95785 1651 aa49.04■■■■■ 5.44
SH3BP2-212ENST00000508338 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP48.63■■■■■ 5.38
SH3BP2-212ENST00000508338 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa48.16■■■■■ 5.3
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SH3BP2-212ENST00000508338 CADPSQ9ULU8 1353 aa48.05■■■■■ 5.28
SH3BP2-212ENST00000508338 NESP48681 1621 aa48.01■■■■■ 5.28
SH3BP2-212ENST00000508338 CCDC88BA6NC98 1476 aa48■■■■■ 5.27
SH3BP2-212ENST00000508338 CFTRP13569 1480 aa47.84■■■■■ 5.25
SH3BP2-212ENST00000508338 ERCC6Q03468 1493 aa47.84■■■■■ 5.25
SH3BP2-212ENST00000508338 PDS5BQ9NTI5 1447 aa47.83■■■■■ 5.25
SH3BP2-212ENST00000508338 PRDM2Q13029 1718 aa47.57■■■■■ 5.21
SH3BP2-212ENST00000508338 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa47.53■■■■■ 5.2
SH3BP2-212ENST00000508338 FANCD2Q9BXW9 1451 aa47.47■■■■■ 5.19
SH3BP2-212ENST00000508338 CEP164Q9UPV0 1460 aa47.41■■■■■ 5.18
SH3BP2-212ENST00000508338 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP47.31■■■■■ 5.16
SH3BP2-212ENST00000508338 CUX2O14529 1486 aa47.27■■■■■ 5.16
SH3BP2-212ENST00000508338 MRC2Q9UBG0 1479 aa47.26■■■■■ 5.16
SH3BP2-212ENST00000508338 WDR62O43379 1518 aa47.09■■■■■ 5.13
SH3BP2-212ENST00000508338 ABCC8Q09428 1581 aa46.93■■■■■ 5.1
SH3BP2-212ENST00000508338 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP46.91■■■■■ 5.1
SH3BP2-212ENST00000508338 DNMBPQ6XZF7 1577 aa46.77■■■■■ 5.08
SH3BP2-212ENST00000508338 TOPBP1Q92547 1522 aa46.74■■■■■ 5.07
SH3BP2-212ENST00000508338 CUX1P39880 1505 aa46.49■■■■■ 5.03
SH3BP2-212ENST00000508338 IFT140Q96RY7 1462 aa46.43■■■■■ 5.02
SH3BP2-212ENST00000508338 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP46.39■■■■■ 5.02
SH3BP2-212ENST00000508338 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP46.36■■■■■ 5.01
SH3BP2-212ENST00000508338 FGD5Q6ZNL6 1462 aa46.29■■■■■ 5
SH3BP2-212ENST00000508338 TOP2BQ02880 1626 aa46.27■■■■■ 5
SH3BP2-212ENST00000508338 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa46.25■■■■■ 4.99
SH3BP2-212ENST00000508338 SOGA1O94964 1423 aa46.2■■■■■ 4.99
SH3BP2-212ENST00000508338 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP46.2■■■■■ 4.99
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SH3BP2-212ENST00000508338 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa46.08■■■■■ 4.97
SH3BP2-212ENST00000508338 WDR97A6NE52 1622 aa46.05■■■■■ 4.96
SH3BP2-212ENST00000508338 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP46.03■■■■■ 4.96
SH3BP2-212ENST00000508338 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP45.94■■■■■ 4.94
SH3BP2-212ENST00000508338 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa45.93■■■■■ 4.94
SH3BP2-212ENST00000508338 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP45.84■■■■■ 4.93
SH3BP2-212ENST00000508338 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP45.82■■■■■ 4.93
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SH3BP2-212ENST00000508338 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa45.68■■■■■ 4.9
SH3BP2-212ENST00000508338 GRIN2BQ13224 1484 aa45.66■■■■■ 4.9
SH3BP2-212ENST00000508338 PBRM1Q86U86 1689 aa45.56■■■■■ 4.88
SH3BP2-212ENST00000508338 TRIM41Q8WV44 630 aa45.54■■■■■ 4.88
SH3BP2-212ENST00000508338 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP45.54■■■■■ 4.88
SH3BP2-212ENST00000508338 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa45.47■■■■■ 4.87
SH3BP2-212ENST00000508338 KIF27Q86VH2 1401 aa45.44■■■■■ 4.87
SH3BP2-212ENST00000508338 ERICH3Q5RHP9 1530 aa45.42■■■■■ 4.86
SH3BP2-212ENST00000508338 OSCARQ8IYS5 282 aa45.34■■■■■ 4.85
SH3BP2-212ENST00000508338 SYNJ2O15056 1496 aa45.32■■■■■ 4.85
SH3BP2-212ENST00000508338 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa45.29■■■■■ 4.84
SH3BP2-212ENST00000508338 CHD1O14646 1710 aa45.29■■■■■ 4.84
SH3BP2-212ENST00000508338 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP45.26■■■■■ 4.84
SH3BP2-212ENST00000508338 FBLN2P98095 1184 aa45.25■■■■■ 4.83
SH3BP2-212ENST00000508338 ADAMTS12P58397 1594 aa45.22■■■■■ 4.83
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SH3BP2-212ENST00000508338 CHIC1Q5VXU3 224 aa45.15■■■■■ 4.82
SH3BP2-212ENST00000508338 IGF1RP08069 1367 aa45.13■■■■■ 4.82
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SH3BP2-212ENST00000508338 GRIN2AQ12879 1464 aa45.04■■■■■ 4.8
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SH3BP2-212ENST00000508338 NUP160Q12769 1436 aa44.84■■■■■ 4.77
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SH3BP2-212ENST00000508338 CEP170Q5SW79 1584 aa44.74■■■■■ 4.75
SH3BP2-212ENST00000508338 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa44.71■■■■■ 4.75
SH3BP2-212ENST00000508338 CSRNP3Q8WYN3 585 aa44.67■■■■■ 4.74
SH3BP2-212ENST00000508338 PRXQ9BXM0 1461 aa44.6■■■■■ 4.73
SH3BP2-212ENST00000508338 ARHGEF11O15085 1522 aa44.54■■■■■ 4.72
SH3BP2-212ENST00000508338 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa44.53■■■■■ 4.72
SH3BP2-212ENST00000508338 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa44.49■■■■■ 4.71
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