RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496792.3

NRXN1-219, Transcript of neurexin 1, humanhuman

TSL 2

Gene NRXN1, Length 464 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN1-219ENST00000496792 NISCHQ9Y2I1 1504 aa57.48■■■■■ 6.79
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NRXN1-219ENST00000496792 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa47.86■■■■■ 5.25
NRXN1-219ENST00000496792 MYO15BQ96JP2 1530 aa47.76■■■■■ 5.24
NRXN1-219ENST00000496792 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa47.65■■■■■ 5.22
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NRXN1-219ENST00000496792 SCRIBQ14160 1630 aa46.46■■■■■ 5.03
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NRXN1-219ENST00000496792 CECR2Q9BXF3 1484 aa44.67■■■■■ 4.74
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NRXN1-219ENST00000496792 MROH2BQ7Z745 1585 aa44.25■■■■■ 4.67
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NRXN1-219ENST00000496792 NCAPD3P42695 1498 aa44.19■■■■■ 4.66
NRXN1-219ENST00000496792 PEG3Q9GZU2 1588 aa44.11■■■■■ 4.65
NRXN1-219ENST00000496792 HMGXB3Q12766 1538 aa43.99■■■■■ 4.63
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NRXN1-219ENST00000496792 NESP48681 1621 aa42.9■■■■■ 4.46
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NRXN1-219ENST00000496792 MRC2Q9UBG0 1479 aa42.2■■■■■ 4.35
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NRXN1-219ENST00000496792 TOPBP1Q92547 1522 aa41.74■■■■■ 4.27
NRXN1-219ENST00000496792 DNMBPQ6XZF7 1577 aa41.73■■■■■ 4.27
NRXN1-219ENST00000496792 CUX1P39880 1505 aa41.5■■■■■ 4.23
NRXN1-219ENST00000496792 IFT140Q96RY7 1462 aa41.46■■■■■ 4.23
NRXN1-219ENST00000496792 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP41.44■■■■■ 4.22
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NRXN1-219ENST00000496792 FGD5Q6ZNL6 1462 aa41.34■■■■■ 4.21
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NRXN1-219ENST00000496792 TOP2BQ02880 1626 aa41.26■■■■■ 4.2
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NRXN1-219ENST00000496792 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa41■■■■■ 4.15
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NRXN1-219ENST00000496792 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP40.97■■■■■ 4.15
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NRXN1-219ENST00000496792 GRIN2BQ13224 1484 aa40.77■■■■■ 4.12
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NRXN1-219ENST00000496792 TRIM41Q8WV44 630 aa40.7■■■■■ 4.11
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NRXN1-219ENST00000496792 PBRM1Q86U86 1689 aa40.59■■■■■ 4.09
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NRXN1-219ENST00000496792 FBLN2P98095 1184 aa40.48■■■■■ 4.07
NRXN1-219ENST00000496792 SYNJ2O15056 1496 aa40.47■■■■■ 4.07
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NRXN1-219ENST00000496792 EEA1Q15075 1411 aa40.06■■■■■ 4
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NRXN1-219ENST00000496792 CEP170Q5SW79 1584 aa39.93■■■■□ 3.98
NRXN1-219ENST00000496792 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa39.92■■■■□ 3.98
NRXN1-219ENST00000496792 CSRNP3Q8WYN3 585 aa39.91■■■■□ 3.98
NRXN1-219ENST00000496792 PRXQ9BXM0 1461 aa39.83■■■■□ 3.97
NRXN1-219ENST00000496792 ARHGEF11O15085 1522 aa39.78■■■■□ 3.96
NRXN1-219ENST00000496792 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa39.76■■■■□ 3.96
NRXN1-219ENST00000496792 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP39.74■■■■□ 3.95
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