RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496248.5

MEIS1-213, Transcript of Meis homeobox 1, humanhuman

TSL 4

Gene MEIS1, Length 468 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS1-213ENST00000496248 NISCHQ9Y2I1 1504 aa46.38■■■■■ 5.01
MEIS1-213ENST00000496248 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa41.12■■■■■ 4.17
MEIS1-213ENST00000496248 ABCC9O60706 1549 aa39.86■■■■□ 3.97
MEIS1-213ENST00000496248 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP38.71■■■■□ 3.79
MEIS1-213ENST00000496248 DCAF8L2P0C7V8 631 aa38.7■■■■□ 3.79
MEIS1-213ENST00000496248 NACADO15069 1562 aa38.56■■■■□ 3.76
MEIS1-213ENST00000496248 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa38.53■■■■□ 3.76
MEIS1-213ENST00000496248 MYO15BQ96JP2 1530 aa38.39■■■■□ 3.74
MEIS1-213ENST00000496248 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa38.38■■■■□ 3.74
MEIS1-213ENST00000496248 UNC13AQ9UPW8 1703 aa37.61■■■■□ 3.61
MEIS1-213ENST00000496248 SCRIBQ14160 1630 aa37.57■■■■□ 3.6
MEIS1-213ENST00000496248 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP37.29■■■■□ 3.56
MEIS1-213ENST00000496248 BICRAQ9NZM4 1560 aa37.25■■■■□ 3.55
MEIS1-213ENST00000496248 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa36.96■■■■□ 3.51
MEIS1-213ENST00000496248 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP36.3■■■■□ 3.4
MEIS1-213ENST00000496248 DNAJC5BQ9UF47 199 aa36.1■■■■□ 3.37
MEIS1-213ENST00000496248 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa36.06■■■■□ 3.36
MEIS1-213ENST00000496248 CECR2Q9BXF3 1484 aa36.05■■■■□ 3.36
MEIS1-213ENST00000496248 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP35.97■■■■□ 3.35
MEIS1-213ENST00000496248 SMARCA4P51532 1647 aa35.94■■■■□ 3.34
MEIS1-213ENST00000496248 MROH2BQ7Z745 1585 aa35.73■■■■□ 3.31
MEIS1-213ENST00000496248 SMARCA2P51531 1590 aa35.64■■■■□ 3.3
MEIS1-213ENST00000496248 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa35.6■■■■□ 3.29
MEIS1-213ENST00000496248 PEG3Q9GZU2 1588 aa35.53■■■■□ 3.28
MEIS1-213ENST00000496248 NCAPD3P42695 1498 aa35.52■■■■□ 3.28
MEIS1-213ENST00000496248 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP35.46■■■■□ 3.27
MEIS1-213ENST00000496248 HMGXB3Q12766 1538 aa35.42■■■■□ 3.26
MEIS1-213ENST00000496248 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP35.41■■■■□ 3.26
MEIS1-213ENST00000496248 WIZO95785 1651 aa35.4■■■■□ 3.26
MEIS1-213ENST00000496248 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP35.06■■■■□ 3.2
MEIS1-213ENST00000496248 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP34.94■■■■□ 3.18
MEIS1-213ENST00000496248 CCDC88BA6NC98 1476 aa34.62■■■■□ 3.13
MEIS1-213ENST00000496248 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa34.58■■■■□ 3.13
MEIS1-213ENST00000496248 NESP48681 1621 aa34.56■■■■□ 3.12
MEIS1-213ENST00000496248 CADPSQ9ULU8 1353 aa34.53■■■■□ 3.12
MEIS1-213ENST00000496248 ERCC6Q03468 1493 aa34.39■■■■□ 3.1
MEIS1-213ENST00000496248 CFTRP13569 1480 aa34.39■■■■□ 3.1
MEIS1-213ENST00000496248 PDS5BQ9NTI5 1447 aa34.35■■■■□ 3.09
MEIS1-213ENST00000496248 PRDM2Q13029 1718 aa34.24■■■■□ 3.07
MEIS1-213ENST00000496248 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa34.22■■■■□ 3.07
MEIS1-213ENST00000496248 FANCD2Q9BXW9 1451 aa34.16■■■■□ 3.06
MEIS1-213ENST00000496248 CEP164Q9UPV0 1460 aa34.11■■■■□ 3.05
MEIS1-213ENST00000496248 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP33.98■■■■□ 3.03
MEIS1-213ENST00000496248 MRC2Q9UBG0 1479 aa33.96■■■■□ 3.03
MEIS1-213ENST00000496248 CUX2O14529 1486 aa33.82■■■■□ 3.01
MEIS1-213ENST00000496248 WDR62O43379 1518 aa33.82■■■■□ 3
MEIS1-213ENST00000496248 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP33.76■■■■□ 3
MEIS1-213ENST00000496248 ABCC8Q09428 1581 aa33.71■■■□□ 2.99
MEIS1-213ENST00000496248 DNMBPQ6XZF7 1577 aa33.67■■■□□ 2.98
MEIS1-213ENST00000496248 TOPBP1Q92547 1522 aa33.64■■■□□ 2.98
MEIS1-213ENST00000496248 CUX1P39880 1505 aa33.52■■■□□ 2.96
MEIS1-213ENST00000496248 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP33.47■■■□□ 2.95
MEIS1-213ENST00000496248 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP33.37■■■□□ 2.93
MEIS1-213ENST00000496248 FGD5Q6ZNL6 1462 aa33.37■■■□□ 2.93
MEIS1-213ENST00000496248 SYNJ1O43426 1573 aa33.36■■■□□ 2.93
MEIS1-213ENST00000496248 IFT140Q96RY7 1462 aa33.36■■■□□ 2.93
MEIS1-213ENST00000496248 TOP2BQ02880 1626 aa33.35■■■□□ 2.93
MEIS1-213ENST00000496248 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa33.35■■■□□ 2.93
MEIS1-213ENST00000496248 SOGA1O94964 1423 aa33.27■■■□□ 2.92
MEIS1-213ENST00000496248 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP33.23■■■□□ 2.91
MEIS1-213ENST00000496248 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa33.23■■■□□ 2.91
MEIS1-213ENST00000496248 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP33.12■■■□□ 2.89
MEIS1-213ENST00000496248 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP33.08■■■□□ 2.89
MEIS1-213ENST00000496248 WDR97A6NE52 1622 aa33.07■■■□□ 2.88
MEIS1-213ENST00000496248 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa33.05■■■□□ 2.88
MEIS1-213ENST00000496248 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP33.01■■■□□ 2.88
MEIS1-213ENST00000496248 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP33.01■■■□□ 2.88
MEIS1-213ENST00000496248 TRIM41Q8WV44 630 aa33■■■□□ 2.87
MEIS1-213ENST00000496248 GAPVD1Q14C86 1478 aa32.9■■■□□ 2.86
MEIS1-213ENST00000496248 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa32.9■■■□□ 2.86
MEIS1-213ENST00000496248 GRIN2BQ13224 1484 aa32.85■■■□□ 2.85
MEIS1-213ENST00000496248 PBRM1Q86U86 1689 aa32.84■■■□□ 2.85
MEIS1-213ENST00000496248 KIF27Q86VH2 1401 aa32.77■■■□□ 2.84
MEIS1-213ENST00000496248 CHIC1Q5VXU3 224 aa32.76■■■□□ 2.83
MEIS1-213ENST00000496248 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa32.74■■■□□ 2.83
MEIS1-213ENST00000496248 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP32.72■■■□□ 2.83
MEIS1-213ENST00000496248 ERICH3Q5RHP9 1530 aa32.68■■■□□ 2.82
MEIS1-213ENST00000496248 FBLN2P98095 1184 aa32.63■■■□□ 2.81
MEIS1-213ENST00000496248 CHD1O14646 1710 aa32.6■■■□□ 2.81
MEIS1-213ENST00000496248 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP32.58■■■□□ 2.81
MEIS1-213ENST00000496248 SYNJ2O15056 1496 aa32.58■■■□□ 2.81
MEIS1-213ENST00000496248 ADAMTS12P58397 1594 aa32.58■■■□□ 2.81
MEIS1-213ENST00000496248 FHAD1B1AJZ9 1412 aa32.52■■■□□ 2.8
MEIS1-213ENST00000496248 IGF1RP08069 1367 aa32.51■■■□□ 2.79
MEIS1-213ENST00000496248 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa32.51■■■□□ 2.79
MEIS1-213ENST00000496248 CUL7Q14999 1698 aa32.5■■■□□ 2.79
MEIS1-213ENST00000496248 OSCARQ8IYS5 282 aa32.5■■■□□ 2.79
MEIS1-213ENST00000496248 GRIN2AQ12879 1464 aa32.42■■■□□ 2.78
MEIS1-213ENST00000496248 EEA1Q15075 1411 aa32.41■■■□□ 2.78
MEIS1-213ENST00000496248 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa32.38■■■□□ 2.77
MEIS1-213ENST00000496248 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP32.31■■■□□ 2.76
MEIS1-213ENST00000496248 CSRNP3Q8WYN3 585 aa32.28■■■□□ 2.76
MEIS1-213ENST00000496248 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa32.28■■■□□ 2.76
MEIS1-213ENST00000496248 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa32.25■■■□□ 2.75
MEIS1-213ENST00000496248 NUP160Q12769 1436 aa32.22■■■□□ 2.75
MEIS1-213ENST00000496248 CEP170Q5SW79 1584 aa32.22■■■□□ 2.75
MEIS1-213ENST00000496248 CLASP1Q7Z460 1538 aa32.2■■■□□ 2.74
MEIS1-213ENST00000496248 PRXQ9BXM0 1461 aa32.16■■■□□ 2.74
MEIS1-213ENST00000496248 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa32.03■■■□□ 2.72
MEIS1-213ENST00000496248 KIF21BO75037 1637 aa32.03■■■□□ 2.72
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