RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496244.5

ALS2-212, Transcript of ALS2, alsin Rho guanine nucleotide exchange factor, humanhuman

TSL 3

Gene ALS2, Length 768 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2-212ENST00000496244 NISCHQ9Y2I1 1504 aa50.82■■■■■ 5.73
ALS2-212ENST00000496244 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa44.86■■■■■ 4.77
ALS2-212ENST00000496244 ABCC9O60706 1549 aa43.56■■■■■ 4.56
ALS2-212ENST00000496244 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP42.42■■■■■ 4.38
ALS2-212ENST00000496244 DCAF8L2P0C7V8 631 aa42.37■■■■■ 4.37
ALS2-212ENST00000496244 NACADO15069 1562 aa42.11■■■■■ 4.33
ALS2-212ENST00000496244 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa42.03■■■■■ 4.32
ALS2-212ENST00000496244 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa42.03■■■■■ 4.32
ALS2-212ENST00000496244 MYO15BQ96JP2 1530 aa42.01■■■■■ 4.32
ALS2-212ENST00000496244 UNC13AQ9UPW8 1703 aa41.1■■■■■ 4.17
ALS2-212ENST00000496244 SCRIBQ14160 1630 aa41.04■■■■■ 4.16
ALS2-212ENST00000496244 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP40.86■■■■■ 4.13
ALS2-212ENST00000496244 BICRAQ9NZM4 1560 aa40.8■■■■■ 4.12
ALS2-212ENST00000496244 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa40.52■■■■■ 4.08
ALS2-212ENST00000496244 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP39.66■■■■□ 3.94
ALS2-212ENST00000496244 DNAJC5BQ9UF47 199 aa39.65■■■■□ 3.94
ALS2-212ENST00000496244 CECR2Q9BXF3 1484 aa39.6■■■■□ 3.93
ALS2-212ENST00000496244 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa39.38■■■■□ 3.89
ALS2-212ENST00000496244 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP39.32■■■■□ 3.88
ALS2-212ENST00000496244 SMARCA4P51532 1647 aa39.29■■■■□ 3.88
ALS2-212ENST00000496244 MROH2BQ7Z745 1585 aa39.21■■■■□ 3.87
ALS2-212ENST00000496244 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa39.01■■■■□ 3.84
ALS2-212ENST00000496244 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP38.95■■■■□ 3.83
ALS2-212ENST00000496244 SMARCA2P51531 1590 aa38.92■■■■□ 3.82
ALS2-212ENST00000496244 NCAPD3P42695 1498 aa38.91■■■■□ 3.82
ALS2-212ENST00000496244 PEG3Q9GZU2 1588 aa38.9■■■■□ 3.82
ALS2-212ENST00000496244 WIZO95785 1651 aa38.78■■■■□ 3.8
ALS2-212ENST00000496244 HMGXB3Q12766 1538 aa38.69■■■■□ 3.78
ALS2-212ENST00000496244 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP38.67■■■■□ 3.78
ALS2-212ENST00000496244 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP38.4■■■■□ 3.74
ALS2-212ENST00000496244 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP38.37■■■■□ 3.73
ALS2-212ENST00000496244 CCDC88BA6NC98 1476 aa37.98■■■■□ 3.67
ALS2-212ENST00000496244 NESP48681 1621 aa37.86■■■■□ 3.65
ALS2-212ENST00000496244 CADPSQ9ULU8 1353 aa37.81■■■■□ 3.64
ALS2-212ENST00000496244 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa37.74■■■■□ 3.63
ALS2-212ENST00000496244 CFTRP13569 1480 aa37.67■■■■□ 3.62
ALS2-212ENST00000496244 PDS5BQ9NTI5 1447 aa37.51■■■■□ 3.59
ALS2-212ENST00000496244 ERCC6Q03468 1493 aa37.45■■■■□ 3.59
ALS2-212ENST00000496244 FANCD2Q9BXW9 1451 aa37.36■■■■□ 3.57
ALS2-212ENST00000496244 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa37.34■■■■□ 3.57
ALS2-212ENST00000496244 PRDM2Q13029 1718 aa37.32■■■■□ 3.56
ALS2-212ENST00000496244 CEP164Q9UPV0 1460 aa37.23■■■■□ 3.55
ALS2-212ENST00000496244 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP37.09■■■■□ 3.53
ALS2-212ENST00000496244 MRC2Q9UBG0 1479 aa37.08■■■■□ 3.53
ALS2-212ENST00000496244 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP36.97■■■■□ 3.51
ALS2-212ENST00000496244 WDR62O43379 1518 aa36.93■■■■□ 3.5
ALS2-212ENST00000496244 CUX2O14529 1486 aa36.86■■■■□ 3.49
ALS2-212ENST00000496244 TOPBP1Q92547 1522 aa36.82■■■■□ 3.48
ALS2-212ENST00000496244 ABCC8Q09428 1581 aa36.8■■■■□ 3.48
ALS2-212ENST00000496244 DNMBPQ6XZF7 1577 aa36.78■■■■□ 3.48
ALS2-212ENST00000496244 CUX1P39880 1505 aa36.74■■■■□ 3.47
ALS2-212ENST00000496244 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP36.68■■■■□ 3.46
ALS2-212ENST00000496244 SYNJ1O43426 1573 aa36.55■■■■□ 3.44
ALS2-212ENST00000496244 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP36.54■■■■□ 3.44
ALS2-212ENST00000496244 FGD5Q6ZNL6 1462 aa36.52■■■■□ 3.44
ALS2-212ENST00000496244 TOP2BQ02880 1626 aa36.51■■■■□ 3.43
ALS2-212ENST00000496244 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa36.48■■■■□ 3.43
ALS2-212ENST00000496244 IFT140Q96RY7 1462 aa36.44■■■■□ 3.42
ALS2-212ENST00000496244 SOGA1O94964 1423 aa36.43■■■■□ 3.42
ALS2-212ENST00000496244 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa36.43■■■■□ 3.42
ALS2-212ENST00000496244 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP36.36■■■■□ 3.41
ALS2-212ENST00000496244 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP36.29■■■■□ 3.4
ALS2-212ENST00000496244 TRIM41Q8WV44 630 aa36.21■■■■□ 3.39
ALS2-212ENST00000496244 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP36.19■■■■□ 3.38
ALS2-212ENST00000496244 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa36.18■■■■□ 3.38
ALS2-212ENST00000496244 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP36.17■■■■□ 3.38
ALS2-212ENST00000496244 CHIC1Q5VXU3 224 aa36.14■■■■□ 3.38
ALS2-212ENST00000496244 WDR97A6NE52 1622 aa36.13■■■■□ 3.37
ALS2-212ENST00000496244 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP36.09■■■■□ 3.37
ALS2-212ENST00000496244 GAPVD1Q14C86 1478 aa35.99■■■■□ 3.35
ALS2-212ENST00000496244 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa35.96■■■■□ 3.35
ALS2-212ENST00000496244 GRIN2BQ13224 1484 aa35.91■■■■□ 3.34
ALS2-212ENST00000496244 KIF27Q86VH2 1401 aa35.87■■■■□ 3.33
ALS2-212ENST00000496244 PBRM1Q86U86 1689 aa35.81■■■■□ 3.32
ALS2-212ENST00000496244 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa35.79■■■■□ 3.32
ALS2-212ENST00000496244 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa35.78■■■■□ 3.32
ALS2-212ENST00000496244 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP35.73■■■■□ 3.31
ALS2-212ENST00000496244 ERICH3Q5RHP9 1530 aa35.73■■■■□ 3.31
ALS2-212ENST00000496244 IGF1RP08069 1367 aa35.73■■■■□ 3.31
ALS2-212ENST00000496244 FBLN2P98095 1184 aa35.65■■■■□ 3.3
ALS2-212ENST00000496244 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP35.61■■■■□ 3.29
ALS2-212ENST00000496244 SYNJ2O15056 1496 aa35.6■■■■□ 3.29
ALS2-212ENST00000496244 FHAD1B1AJZ9 1412 aa35.58■■■■□ 3.29
ALS2-212ENST00000496244 ADAMTS12P58397 1594 aa35.58■■■■□ 3.29
ALS2-212ENST00000496244 CHD1O14646 1710 aa35.54■■■■□ 3.28
ALS2-212ENST00000496244 OSCARQ8IYS5 282 aa35.52■■■■□ 3.28
ALS2-212ENST00000496244 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa35.51■■■■□ 3.27
ALS2-212ENST00000496244 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP35.49■■■■□ 3.27
ALS2-212ENST00000496244 EEA1Q15075 1411 aa35.48■■■■□ 3.27
ALS2-212ENST00000496244 CSRNP3Q8WYN3 585 aa35.47■■■■□ 3.27
ALS2-212ENST00000496244 CUL7Q14999 1698 aa35.46■■■■□ 3.27
ALS2-212ENST00000496244 GRIN2AQ12879 1464 aa35.44■■■■□ 3.26
ALS2-212ENST00000496244 PRXQ9BXM0 1461 aa35.32■■■■□ 3.24
ALS2-212ENST00000496244 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa35.31■■■■□ 3.24
ALS2-212ENST00000496244 NUP160Q12769 1436 aa35.27■■■■□ 3.24
ALS2-212ENST00000496244 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa35.27■■■■□ 3.24
ALS2-212ENST00000496244 CEP170Q5SW79 1584 aa35.25■■■■□ 3.23
ALS2-212ENST00000496244 CLASP1Q7Z460 1538 aa35.19■■■■□ 3.22
ALS2-212ENST00000496244 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa35.06■■■■□ 3.2
ALS2-212ENST00000496244 KIF21BO75037 1637 aa35.06■■■■□ 3.2
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