RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495351.1

DGCR8-208, Transcript of DGCR8, microprocessor complex subunit, humanhuman

TSL 4

Gene DGCR8, Length 508 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DGCR8-208ENST00000495351 NISCHQ9Y2I1 1504 aa33.85■■■■□ 3.01
DGCR8-208ENST00000495351 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa30.05■■■□□ 2.4
DGCR8-208ENST00000495351 ABCC9O60706 1549 aa29.15■■■□□ 2.26
DGCR8-208ENST00000495351 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP28.23■■■□□ 2.11
DGCR8-208ENST00000495351 DCAF8L2P0C7V8 631 aa28.22■■■□□ 2.11
DGCR8-208ENST00000495351 NACADO15069 1562 aa28.2■■■□□ 2.11
DGCR8-208ENST00000495351 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa28.19■■■□□ 2.1
DGCR8-208ENST00000495351 MYO15BQ96JP2 1530 aa28.11■■■□□ 2.09
DGCR8-208ENST00000495351 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa28.05■■■□□ 2.08
DGCR8-208ENST00000495351 UNC13AQ9UPW8 1703 aa27.53■■■□□ 2
DGCR8-208ENST00000495351 SCRIBQ14160 1630 aa27.38■■□□□ 1.97
DGCR8-208ENST00000495351 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP27.26■■□□□ 1.95
DGCR8-208ENST00000495351 BICRAQ9NZM4 1560 aa27.26■■□□□ 1.95
DGCR8-208ENST00000495351 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa27.07■■□□□ 1.92
DGCR8-208ENST00000495351 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
DGCR8-208ENST00000495351 DNAJC5BQ9UF47 199 aa26.52■■□□□ 1.84
DGCR8-208ENST00000495351 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa26.39■■□□□ 1.82
DGCR8-208ENST00000495351 CECR2Q9BXF3 1484 aa26.3■■□□□ 1.8
DGCR8-208ENST00000495351 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP26.25■■□□□ 1.79
DGCR8-208ENST00000495351 SMARCA4P51532 1647 aa26.23■■□□□ 1.79
DGCR8-208ENST00000495351 MROH2BQ7Z745 1585 aa26.06■■□□□ 1.76
DGCR8-208ENST00000495351 SMARCA2P51531 1590 aa26.04■■□□□ 1.76
DGCR8-208ENST00000495351 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa26.03■■□□□ 1.76
DGCR8-208ENST00000495351 NCAPD3P42695 1498 aa25.99■■□□□ 1.75
DGCR8-208ENST00000495351 PEG3Q9GZU2 1588 aa25.98■■□□□ 1.75
DGCR8-208ENST00000495351 HMGXB3Q12766 1538 aa25.89■■□□□ 1.74
DGCR8-208ENST00000495351 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP25.85■■□□□ 1.73
DGCR8-208ENST00000495351 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP25.85■■□□□ 1.73
DGCR8-208ENST00000495351 WIZO95785 1651 aa25.81■■□□□ 1.72
DGCR8-208ENST00000495351 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP25.57■■□□□ 1.68
DGCR8-208ENST00000495351 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP25.36■■□□□ 1.65
DGCR8-208ENST00000495351 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa25.31■■□□□ 1.64
DGCR8-208ENST00000495351 CADPSQ9ULU8 1353 aa25.26■■□□□ 1.63
DGCR8-208ENST00000495351 NESP48681 1621 aa25.26■■□□□ 1.63
DGCR8-208ENST00000495351 CCDC88BA6NC98 1476 aa25.25■■□□□ 1.63
DGCR8-208ENST00000495351 ERCC6Q03468 1493 aa25.15■■□□□ 1.62
DGCR8-208ENST00000495351 CFTRP13569 1480 aa25.14■■□□□ 1.61
DGCR8-208ENST00000495351 PDS5BQ9NTI5 1447 aa25.13■■□□□ 1.61
DGCR8-208ENST00000495351 PRDM2Q13029 1718 aa25.03■■□□□ 1.6
DGCR8-208ENST00000495351 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa25.01■■□□□ 1.59
DGCR8-208ENST00000495351 FANCD2Q9BXW9 1451 aa24.96■■□□□ 1.59
DGCR8-208ENST00000495351 CEP164Q9UPV0 1460 aa24.92■■□□□ 1.58
DGCR8-208ENST00000495351 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
DGCR8-208ENST00000495351 MRC2Q9UBG0 1479 aa24.83■■□□□ 1.57
DGCR8-208ENST00000495351 CUX2O14529 1486 aa24.82■■□□□ 1.56
DGCR8-208ENST00000495351 WDR62O43379 1518 aa24.74■■□□□ 1.55
DGCR8-208ENST00000495351 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP24.66■■□□□ 1.54
DGCR8-208ENST00000495351 ABCC8Q09428 1581 aa24.65■■□□□ 1.54
DGCR8-208ENST00000495351 DNMBPQ6XZF7 1577 aa24.58■■□□□ 1.52
DGCR8-208ENST00000495351 TOPBP1Q92547 1522 aa24.57■■□□□ 1.52
DGCR8-208ENST00000495351 CUX1P39880 1505 aa24.44■■□□□ 1.5
DGCR8-208ENST00000495351 IFT140Q96RY7 1462 aa24.4■■□□□ 1.5
DGCR8-208ENST00000495351 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP24.4■■□□□ 1.5
DGCR8-208ENST00000495351 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
DGCR8-208ENST00000495351 FGD5Q6ZNL6 1462 aa24.34■■□□□ 1.49
DGCR8-208ENST00000495351 TOP2BQ02880 1626 aa24.32■■□□□ 1.48
DGCR8-208ENST00000495351 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa24.32■■□□□ 1.48
DGCR8-208ENST00000495351 SOGA1O94964 1423 aa24.3■■□□□ 1.48
DGCR8-208ENST00000495351 SYNJ1O43426 1573 aa24.29■■□□□ 1.48
DGCR8-208ENST00000495351 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
DGCR8-208ENST00000495351 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa24.25■■□□□ 1.47
DGCR8-208ENST00000495351 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.47
DGCR8-208ENST00000495351 WDR97A6NE52 1622 aa24.17■■□□□ 1.46
DGCR8-208ENST00000495351 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
DGCR8-208ENST00000495351 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa24.14■■□□□ 1.45
DGCR8-208ENST00000495351 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP24.12■■□□□ 1.453e-7■■■■■ 43.1
DGCR8-208ENST00000495351 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
DGCR8-208ENST00000495351 GAPVD1Q14C86 1478 aa24.02■■□□□ 1.44
DGCR8-208ENST00000495351 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa24.01■■□□□ 1.43
DGCR8-208ENST00000495351 GRIN2BQ13224 1484 aa24■■□□□ 1.43
DGCR8-208ENST00000495351 TRIM41Q8WV44 630 aa23.98■■□□□ 1.43
DGCR8-208ENST00000495351 PBRM1Q86U86 1689 aa23.97■■□□□ 1.43
DGCR8-208ENST00000495351 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP23.92■■□□□ 1.42
DGCR8-208ENST00000495351 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa23.91■■□□□ 1.42
DGCR8-208ENST00000495351 KIF27Q86VH2 1401 aa23.89■■□□□ 1.41
DGCR8-208ENST00000495351 ERICH3Q5RHP9 1530 aa23.87■■□□□ 1.41
DGCR8-208ENST00000495351 OSCARQ8IYS5 282 aa23.84■■□□□ 1.41
DGCR8-208ENST00000495351 CHD1O14646 1710 aa23.83■■□□□ 1.41
DGCR8-208ENST00000495351 FBLN2P98095 1184 aa23.82■■□□□ 1.4
DGCR8-208ENST00000495351 SYNJ2O15056 1496 aa23.81■■□□□ 1.4
DGCR8-208ENST00000495351 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP23.81■■□□□ 1.4
DGCR8-208ENST00000495351 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa23.8■■□□□ 1.4
DGCR8-208ENST00000495351 CHIC1Q5VXU3 224 aa23.78■■□□□ 1.4
DGCR8-208ENST00000495351 FHAD1B1AJZ9 1412 aa23.76■■□□□ 1.39
DGCR8-208ENST00000495351 ADAMTS12P58397 1594 aa23.76■■□□□ 1.39
DGCR8-208ENST00000495351 IGF1RP08069 1367 aa23.73■■□□□ 1.39
DGCR8-208ENST00000495351 CUL7Q14999 1698 aa23.7■■□□□ 1.39
DGCR8-208ENST00000495351 GRIN2AQ12879 1464 aa23.68■■□□□ 1.38
DGCR8-208ENST00000495351 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa23.65■■□□□ 1.38
DGCR8-208ENST00000495351 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa23.63■■□□□ 1.37
DGCR8-208ENST00000495351 EEA1Q15075 1411 aa23.59■■□□□ 1.37
DGCR8-208ENST00000495351 NUP160Q12769 1436 aa23.56■■□□□ 1.36
DGCR8-208ENST00000495351 CLASP1Q7Z460 1538 aa23.55■■□□□ 1.36
DGCR8-208ENST00000495351 CEP170Q5SW79 1584 aa23.52■■□□□ 1.36
DGCR8-208ENST00000495351 CSRNP3Q8WYN3 585 aa23.51■■□□□ 1.35
DGCR8-208ENST00000495351 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa23.5■■□□□ 1.35
DGCR8-208ENST00000495351 PRXQ9BXM0 1461 aa23.44■■□□□ 1.34
DGCR8-208ENST00000495351 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
DGCR8-208ENST00000495351 ARHGEF11O15085 1522 aa23.41■■□□□ 1.34
DGCR8-208ENST00000495351 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa23.4■■□□□ 1.34
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