RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490088.2

HOXD10-202, Transcript of homeobox D10, humanhuman

TSL 2

Gene HOXD10, Length 1,010 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10-202ENST00000490088 NISCHQ9Y2I1 1504 aa51.5■■■■■ 5.84
HOXD10-202ENST00000490088 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa45.5■■■■■ 4.87
HOXD10-202ENST00000490088 ABCC9O60706 1549 aa44.11■■■■■ 4.65
HOXD10-202ENST00000490088 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP43.02■■■■■ 4.48
HOXD10-202ENST00000490088 DCAF8L2P0C7V8 631 aa42.89■■■■■ 4.46
HOXD10-202ENST00000490088 NACADO15069 1562 aa42.66■■■■■ 4.42
HOXD10-202ENST00000490088 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa42.6■■■■■ 4.41
HOXD10-202ENST00000490088 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa42.59■■■■■ 4.41
HOXD10-202ENST00000490088 MYO15BQ96JP2 1530 aa42.55■■■■■ 4.4
HOXD10-202ENST00000490088 SCRIBQ14160 1630 aa41.65■■■■■ 4.26
HOXD10-202ENST00000490088 UNC13AQ9UPW8 1703 aa41.64■■■■■ 4.26
HOXD10-202ENST00000490088 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP41.33■■■■■ 4.21
HOXD10-202ENST00000490088 BICRAQ9NZM4 1560 aa41.32■■■■■ 4.2
HOXD10-202ENST00000490088 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa41.11■■■■■ 4.17
HOXD10-202ENST00000490088 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP40.18■■■■■ 4.02
HOXD10-202ENST00000490088 CECR2Q9BXF3 1484 aa40.1■■■■■ 4.01
HOXD10-202ENST00000490088 DNAJC5BQ9UF47 199 aa40.01■■■■■ 4
HOXD10-202ENST00000490088 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa39.88■■■■□ 3.97
HOXD10-202ENST00000490088 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP39.86■■■■□ 3.97
HOXD10-202ENST00000490088 SMARCA4P51532 1647 aa39.85■■■■□ 3.97
HOXD10-202ENST00000490088 MROH2BQ7Z745 1585 aa39.73■■■■□ 3.95
HOXD10-202ENST00000490088 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa39.5■■■■□ 3.91
HOXD10-202ENST00000490088 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP39.46■■■■□ 3.91
HOXD10-202ENST00000490088 SMARCA2P51531 1590 aa39.46■■■■□ 3.91
HOXD10-202ENST00000490088 PEG3Q9GZU2 1588 aa39.42■■■■□ 3.9
HOXD10-202ENST00000490088 NCAPD3P42695 1498 aa39.37■■■■□ 3.89
HOXD10-202ENST00000490088 WIZO95785 1651 aa39.33■■■■□ 3.89
HOXD10-202ENST00000490088 HMGXB3Q12766 1538 aa39.23■■■■□ 3.87
HOXD10-202ENST00000490088 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP39.22■■■■□ 3.87
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HOXD10-202ENST00000490088 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP38.92■■■■□ 3.82
HOXD10-202ENST00000490088 CCDC88BA6NC98 1476 aa38.47■■■■□ 3.75
HOXD10-202ENST00000490088 NESP48681 1621 aa38.34■■■■□ 3.73
HOXD10-202ENST00000490088 CADPSQ9ULU8 1353 aa38.28■■■■□ 3.72
HOXD10-202ENST00000490088 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa38.24■■■■□ 3.71
HOXD10-202ENST00000490088 CFTRP13569 1480 aa38.15■■■■□ 3.7
HOXD10-202ENST00000490088 PDS5BQ9NTI5 1447 aa37.98■■■■□ 3.67
HOXD10-202ENST00000490088 ERCC6Q03468 1493 aa37.96■■■■□ 3.67
HOXD10-202ENST00000490088 PRDM2Q13029 1718 aa37.87■■■■□ 3.65
HOXD10-202ENST00000490088 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa37.85■■■■□ 3.65
HOXD10-202ENST00000490088 FANCD2Q9BXW9 1451 aa37.85■■■■□ 3.65
HOXD10-202ENST00000490088 CEP164Q9UPV0 1460 aa37.75■■■■□ 3.63
HOXD10-202ENST00000490088 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP37.59■■■■□ 3.61
HOXD10-202ENST00000490088 MRC2Q9UBG0 1479 aa37.58■■■■□ 3.61
HOXD10-202ENST00000490088 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP37.45■■■■□ 3.59
HOXD10-202ENST00000490088 WDR62O43379 1518 aa37.42■■■■□ 3.58
HOXD10-202ENST00000490088 CUX2O14529 1486 aa37.32■■■■□ 3.56
HOXD10-202ENST00000490088 TOPBP1Q92547 1522 aa37.31■■■■□ 3.56
HOXD10-202ENST00000490088 DNMBPQ6XZF7 1577 aa37.29■■■■□ 3.56
HOXD10-202ENST00000490088 ABCC8Q09428 1581 aa37.28■■■■□ 3.56
HOXD10-202ENST00000490088 CUX1P39880 1505 aa37.24■■■■□ 3.55
HOXD10-202ENST00000490088 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP37.19■■■■□ 3.54
HOXD10-202ENST00000490088 SYNJ1O43426 1573 aa37.08■■■■□ 3.53
HOXD10-202ENST00000490088 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP37.03■■■■□ 3.52
HOXD10-202ENST00000490088 TOP2BQ02880 1626 aa37.03■■■■□ 3.52
HOXD10-202ENST00000490088 FGD5Q6ZNL6 1462 aa37.02■■■■□ 3.52
HOXD10-202ENST00000490088 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa37.02■■■■□ 3.52
HOXD10-202ENST00000490088 IFT140Q96RY7 1462 aa36.92■■■■□ 3.5
HOXD10-202ENST00000490088 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa36.89■■■■□ 3.5
HOXD10-202ENST00000490088 SOGA1O94964 1423 aa36.89■■■■□ 3.5
HOXD10-202ENST00000490088 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP36.85■■■■□ 3.49
HOXD10-202ENST00000490088 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP36.75■■■■□ 3.47
HOXD10-202ENST00000490088 TRIM41Q8WV44 630 aa36.69■■■■□ 3.46
HOXD10-202ENST00000490088 WDR97A6NE52 1622 aa36.67■■■■□ 3.46
HOXD10-202ENST00000490088 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa36.66■■■■□ 3.46
HOXD10-202ENST00000490088 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP36.64■■■■□ 3.46
HOXD10-202ENST00000490088 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP36.62■■■■□ 3.45
HOXD10-202ENST00000490088 CHIC1Q5VXU3 224 aa36.61■■■■□ 3.45
HOXD10-202ENST00000490088 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP36.61■■■■□ 3.45
HOXD10-202ENST00000490088 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa36.48■■■■□ 3.43
HOXD10-202ENST00000490088 GAPVD1Q14C86 1478 aa36.47■■■■□ 3.43
HOXD10-202ENST00000490088 GRIN2BQ13224 1484 aa36.38■■■■□ 3.41
HOXD10-202ENST00000490088 KIF27Q86VH2 1401 aa36.35■■■■□ 3.41
HOXD10-202ENST00000490088 PBRM1Q86U86 1689 aa36.35■■■■□ 3.41
HOXD10-202ENST00000490088 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa36.29■■■■□ 3.4
HOXD10-202ENST00000490088 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa36.25■■■■□ 3.39
HOXD10-202ENST00000490088 ERICH3Q5RHP9 1530 aa36.23■■■■□ 3.39
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HOXD10-202ENST00000490088 IGF1RP08069 1367 aa36.15■■■■□ 3.38
HOXD10-202ENST00000490088 ADAMTS12P58397 1594 aa36.1■■■■□ 3.37
HOXD10-202ENST00000490088 FBLN2P98095 1184 aa36.09■■■■□ 3.37
HOXD10-202ENST00000490088 SYNJ2O15056 1496 aa36.07■■■■□ 3.37
HOXD10-202ENST00000490088 FHAD1B1AJZ9 1412 aa36.06■■■■□ 3.36
HOXD10-202ENST00000490088 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP36.04■■■■□ 3.36
HOXD10-202ENST00000490088 CHD1O14646 1710 aa36.03■■■■□ 3.36
HOXD10-202ENST00000490088 CUL7Q14999 1698 aa36■■■■□ 3.35
HOXD10-202ENST00000490088 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP35.99■■■■□ 3.35
HOXD10-202ENST00000490088 EEA1Q15075 1411 aa35.99■■■■□ 3.35
HOXD10-202ENST00000490088 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa35.96■■■■□ 3.35
HOXD10-202ENST00000490088 GRIN2AQ12879 1464 aa35.92■■■■□ 3.34
HOXD10-202ENST00000490088 CSRNP3Q8WYN3 585 aa35.9■■■■□ 3.34
HOXD10-202ENST00000490088 OSCARQ8IYS5 282 aa35.89■■■■□ 3.34
HOXD10-202ENST00000490088 PRXQ9BXM0 1461 aa35.8■■■■□ 3.32
HOXD10-202ENST00000490088 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa35.8■■■■□ 3.32
HOXD10-202ENST00000490088 CEP170Q5SW79 1584 aa35.73■■■■□ 3.31
HOXD10-202ENST00000490088 NUP160Q12769 1436 aa35.73■■■■□ 3.31
HOXD10-202ENST00000490088 CLASP1Q7Z460 1538 aa35.66■■■■□ 3.3
HOXD10-202ENST00000490088 KIF21BO75037 1637 aa35.6■■■■□ 3.29
HOXD10-202ENST00000490088 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa35.56■■■■□ 3.28
HOXD10-202ENST00000490088 EHMT2Q96KQ7 1210 aa35.52■■■■□ 3.28
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