RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489103.5

HIVEP3-205, Transcript of human immunodeficiency virus type I enhancer binding protein 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene HIVEP3, Length 1,705 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIVEP3-205ENST00000489103 NISCHQ9Y2I1 1504 aa33.83■■■■□ 3.01
HIVEP3-205ENST00000489103 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa29.7■■■□□ 2.35
HIVEP3-205ENST00000489103 ABCC9O60706 1549 aa28.93■■■□□ 2.22
HIVEP3-205ENST00000489103 DCAF8L2P0C7V8 631 aa28.38■■■□□ 2.13
HIVEP3-205ENST00000489103 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP28.24■■■□□ 2.11
HIVEP3-205ENST00000489103 NACADO15069 1562 aa27.91■■■□□ 2.06
HIVEP3-205ENST00000489103 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa27.91■■■□□ 2.06
HIVEP3-205ENST00000489103 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa27.84■■■□□ 2.05
HIVEP3-205ENST00000489103 MYO15BQ96JP2 1530 aa27.84■■■□□ 2.05
HIVEP3-205ENST00000489103 SCRIBQ14160 1630 aa27.32■■□□□ 1.96
HIVEP3-205ENST00000489103 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP27.23■■□□□ 1.95
HIVEP3-205ENST00000489103 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa27.22■■□□□ 1.95
HIVEP3-205ENST00000489103 UNC13AQ9UPW8 1703 aa27.2■■□□□ 1.94
HIVEP3-205ENST00000489103 BICRAQ9NZM4 1560 aa27.06■■□□□ 1.92
HIVEP3-205ENST00000489103 CECR2Q9BXF3 1484 aa26.42■■□□□ 1.82
HIVEP3-205ENST00000489103 DNAJC5BQ9UF47 199 aa26.31■■□□□ 1.8
HIVEP3-205ENST00000489103 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP26.29■■□□□ 1.8
HIVEP3-205ENST00000489103 MROH2BQ7Z745 1585 aa26.14■■□□□ 1.78
HIVEP3-205ENST00000489103 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP26.14■■□□□ 1.78
HIVEP3-205ENST00000489103 SMARCA4P51532 1647 aa26.11■■□□□ 1.77
HIVEP3-205ENST00000489103 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa26.09■■□□□ 1.77
HIVEP3-205ENST00000489103 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP26.02■■□□□ 1.76
HIVEP3-205ENST00000489103 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa25.93■■□□□ 1.74
HIVEP3-205ENST00000489103 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP25.86■■□□□ 1.73
HIVEP3-205ENST00000489103 WIZO95785 1651 aa25.85■■□□□ 1.73
HIVEP3-205ENST00000489103 NCAPD3P42695 1498 aa25.83■■□□□ 1.73
HIVEP3-205ENST00000489103 SMARCA2P51531 1590 aa25.82■■□□□ 1.72
HIVEP3-205ENST00000489103 PEG3Q9GZU2 1588 aa25.81■■□□□ 1.72
HIVEP3-205ENST00000489103 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP25.72■■□□□ 1.71
HIVEP3-205ENST00000489103 HMGXB3Q12766 1538 aa25.65■■□□□ 1.7
HIVEP3-205ENST00000489103 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP25.52■■□□□ 1.68
HIVEP3-205ENST00000489103 CCDC88BA6NC98 1476 aa25.34■■□□□ 1.65
HIVEP3-205ENST00000489103 NESP48681 1621 aa25.17■■□□□ 1.62
HIVEP3-205ENST00000489103 CADPSQ9ULU8 1353 aa25.15■■□□□ 1.62
HIVEP3-205ENST00000489103 CFTRP13569 1480 aa25.05■■□□□ 1.6
HIVEP3-205ENST00000489103 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa25■■□□□ 1.59
HIVEP3-205ENST00000489103 PDS5BQ9NTI5 1447 aa24.89■■□□□ 1.58
HIVEP3-205ENST00000489103 ERCC6Q03468 1493 aa24.83■■□□□ 1.57
HIVEP3-205ENST00000489103 FANCD2Q9BXW9 1451 aa24.83■■□□□ 1.57
HIVEP3-205ENST00000489103 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa24.74■■□□□ 1.55
HIVEP3-205ENST00000489103 CEP164Q9UPV0 1460 aa24.72■■□□□ 1.55
HIVEP3-205ENST00000489103 PRDM2Q13029 1718 aa24.68■■□□□ 1.54
HIVEP3-205ENST00000489103 MRC2Q9UBG0 1479 aa24.59■■□□□ 1.53
HIVEP3-205ENST00000489103 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
HIVEP3-205ENST00000489103 ABCC8Q09428 1581 aa24.56■■□□□ 1.52
HIVEP3-205ENST00000489103 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP24.53■■□□□ 1.52
HIVEP3-205ENST00000489103 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP24.49■■□□□ 1.51
HIVEP3-205ENST00000489103 CUX1P39880 1505 aa24.47■■□□□ 1.51
HIVEP3-205ENST00000489103 TOPBP1Q92547 1522 aa24.47■■□□□ 1.51
HIVEP3-205ENST00000489103 WDR62O43379 1518 aa24.46■■□□□ 1.51
HIVEP3-205ENST00000489103 DNMBPQ6XZF7 1577 aa24.41■■□□□ 1.5
HIVEP3-205ENST00000489103 SYNJ1O43426 1573 aa24.38■■□□□ 1.49
HIVEP3-205ENST00000489103 CHIC1Q5VXU3 224 aa24.34■■□□□ 1.49
HIVEP3-205ENST00000489103 TRIM41Q8WV44 630 aa24.33■■□□□ 1.49
HIVEP3-205ENST00000489103 CUX2O14529 1486 aa24.32■■□□□ 1.48
HIVEP3-205ENST00000489103 FGD5Q6ZNL6 1462 aa24.32■■□□□ 1.48
HIVEP3-205ENST00000489103 TOP2BQ02880 1626 aa24.31■■□□□ 1.48
HIVEP3-205ENST00000489103 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
HIVEP3-205ENST00000489103 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa24.27■■□□□ 1.48
HIVEP3-205ENST00000489103 SOGA1O94964 1423 aa24.27■■□□□ 1.48
HIVEP3-205ENST00000489103 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa24.26■■□□□ 1.47
HIVEP3-205ENST00000489103 IFT140Q96RY7 1462 aa24.18■■□□□ 1.46
HIVEP3-205ENST00000489103 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.45
HIVEP3-205ENST00000489103 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP24.14■■□□□ 1.45
HIVEP3-205ENST00000489103 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.45
HIVEP3-205ENST00000489103 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP24.09■■□□□ 1.45
HIVEP3-205ENST00000489103 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa24.06■■□□□ 1.44
HIVEP3-205ENST00000489103 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa23.97■■□□□ 1.43
HIVEP3-205ENST00000489103 WDR97A6NE52 1622 aa23.96■■□□□ 1.43
HIVEP3-205ENST00000489103 GAPVD1Q14C86 1478 aa23.95■■□□□ 1.42
HIVEP3-205ENST00000489103 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP23.93■■□□□ 1.42
HIVEP3-205ENST00000489103 KIF27Q86VH2 1401 aa23.92■■□□□ 1.42
HIVEP3-205ENST00000489103 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP23.92■■□□□ 1.42
HIVEP3-205ENST00000489103 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa23.88■■□□□ 1.41
HIVEP3-205ENST00000489103 IGF1RP08069 1367 aa23.86■■□□□ 1.41
HIVEP3-205ENST00000489103 GRIN2BQ13224 1484 aa23.86■■□□□ 1.41
HIVEP3-205ENST00000489103 FBLN2P98095 1184 aa23.79■■□□□ 1.4
HIVEP3-205ENST00000489103 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa23.79■■□□□ 1.4
HIVEP3-205ENST00000489103 CSRNP3Q8WYN3 585 aa23.78■■□□□ 1.4
HIVEP3-205ENST00000489103 ERICH3Q5RHP9 1530 aa23.75■■□□□ 1.39
HIVEP3-205ENST00000489103 PBRM1Q86U86 1689 aa23.74■■□□□ 1.39
HIVEP3-205ENST00000489103 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP23.73■■□□□ 1.39
HIVEP3-205ENST00000489103 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP23.7■■□□□ 1.39
HIVEP3-205ENST00000489103 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa23.7■■□□□ 1.38
HIVEP3-205ENST00000489103 EEA1Q15075 1411 aa23.68■■□□□ 1.38
HIVEP3-205ENST00000489103 FHAD1B1AJZ9 1412 aa23.67■■□□□ 1.38
HIVEP3-205ENST00000489103 EHMT2Q96KQ7 1210 aa23.65■■□□□ 1.38
HIVEP3-205ENST00000489103 SYNJ2O15056 1496 aa23.65■■□□□ 1.38
HIVEP3-205ENST00000489103 ADAMTS12P58397 1594 aa23.62■■□□□ 1.37
HIVEP3-205ENST00000489103 PRXQ9BXM0 1461 aa23.58■■□□□ 1.37
HIVEP3-205ENST00000489103 OSCARQ8IYS5 282 aa23.58■■□□□ 1.37
HIVEP3-205ENST00000489103 CUL7Q14999 1698 aa23.56■■□□□ 1.36
HIVEP3-205ENST00000489103 GRIN2AQ12879 1464 aa23.56■■□□□ 1.36
HIVEP3-205ENST00000489103 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa23.55■■□□□ 1.36
HIVEP3-205ENST00000489103 CHD1O14646 1710 aa23.54■■□□□ 1.36
HIVEP3-205ENST00000489103 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa23.46■■□□□ 1.35
HIVEP3-205ENST00000489103 NUP160Q12769 1436 aa23.42■■□□□ 1.34
HIVEP3-205ENST00000489103 UBTFP17480 764 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
HIVEP3-205ENST00000489103 CEP170Q5SW79 1584 aa23.42■■□□□ 1.34
HIVEP3-205ENST00000489103 KIF21BO75037 1637 aa23.39■■□□□ 1.33
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