RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486104.5

CFAP46-208, Transcript of cilia and flagella associated protein 46, humanhuman

TSL 2

Gene CFAP46, Length 1,675 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP46-208ENST00000486104 NISCHQ9Y2I1 1504 aa51.97■■■■■ 5.91
CFAP46-208ENST00000486104 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa45.89■■■■■ 4.94
CFAP46-208ENST00000486104 ABCC9O60706 1549 aa44.68■■■■■ 4.74
CFAP46-208ENST00000486104 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP43.39■■■■■ 4.54
CFAP46-208ENST00000486104 DCAF8L2P0C7V8 631 aa43.35■■■■■ 4.53
CFAP46-208ENST00000486104 NACADO15069 1562 aa43.05■■■■■ 4.48
CFAP46-208ENST00000486104 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa43.01■■■■■ 4.48
CFAP46-208ENST00000486104 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa42.91■■■■■ 4.46
CFAP46-208ENST00000486104 MYO15BQ96JP2 1530 aa42.9■■■■■ 4.46
CFAP46-208ENST00000486104 UNC13AQ9UPW8 1703 aa42.18■■■■■ 4.34
CFAP46-208ENST00000486104 SCRIBQ14160 1630 aa42.08■■■■■ 4.33
CFAP46-208ENST00000486104 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP41.89■■■■■ 4.3
CFAP46-208ENST00000486104 BICRAQ9NZM4 1560 aa41.84■■■■■ 4.29
CFAP46-208ENST00000486104 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa41.49■■■■■ 4.23
CFAP46-208ENST00000486104 DNAJC5BQ9UF47 199 aa40.73■■■■■ 4.11
CFAP46-208ENST00000486104 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP40.64■■■■■ 4.1
CFAP46-208ENST00000486104 CECR2Q9BXF3 1484 aa40.56■■■■■ 4.08
CFAP46-208ENST00000486104 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa40.39■■■■■ 4.06
CFAP46-208ENST00000486104 SMARCA4P51532 1647 aa40.23■■■■■ 4.03
CFAP46-208ENST00000486104 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP40.19■■■■■ 4.02
CFAP46-208ENST00000486104 MROH2BQ7Z745 1585 aa40.14■■■■■ 4.02
CFAP46-208ENST00000486104 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa39.91■■■■□ 3.98
CFAP46-208ENST00000486104 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP39.82■■■■□ 3.96
CFAP46-208ENST00000486104 SMARCA2P51531 1590 aa39.79■■■■□ 3.96
CFAP46-208ENST00000486104 PEG3Q9GZU2 1588 aa39.78■■■■□ 3.96
CFAP46-208ENST00000486104 NCAPD3P42695 1498 aa39.78■■■■□ 3.96
CFAP46-208ENST00000486104 WIZO95785 1651 aa39.73■■■■□ 3.95
CFAP46-208ENST00000486104 HMGXB3Q12766 1538 aa39.6■■■■□ 3.93
CFAP46-208ENST00000486104 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP39.58■■■■□ 3.93
CFAP46-208ENST00000486104 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP39.23■■■■□ 3.87
CFAP46-208ENST00000486104 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP39.21■■■■□ 3.87
CFAP46-208ENST00000486104 CCDC88BA6NC98 1476 aa38.85■■■■□ 3.81
CFAP46-208ENST00000486104 NESP48681 1621 aa38.84■■■■□ 3.81
CFAP46-208ENST00000486104 CADPSQ9ULU8 1353 aa38.67■■■■□ 3.78
CFAP46-208ENST00000486104 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa38.62■■■■□ 3.77
CFAP46-208ENST00000486104 CFTRP13569 1480 aa38.54■■■■□ 3.76
CFAP46-208ENST00000486104 ERCC6Q03468 1493 aa38.38■■■■□ 3.73
CFAP46-208ENST00000486104 PDS5BQ9NTI5 1447 aa38.34■■■■□ 3.73
CFAP46-208ENST00000486104 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa38.33■■■■□ 3.73
CFAP46-208ENST00000486104 FANCD2Q9BXW9 1451 aa38.24■■■■□ 3.71
CFAP46-208ENST00000486104 PRDM2Q13029 1718 aa38.21■■■■□ 3.71
CFAP46-208ENST00000486104 CEP164Q9UPV0 1460 aa38.11■■■■□ 3.69
CFAP46-208ENST00000486104 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP38.06■■■■□ 3.68
CFAP46-208ENST00000486104 MRC2Q9UBG0 1479 aa37.96■■■■□ 3.67
CFAP46-208ENST00000486104 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP37.88■■■■□ 3.65
CFAP46-208ENST00000486104 WDR62O43379 1518 aa37.83■■■■□ 3.65
CFAP46-208ENST00000486104 CUX2O14529 1486 aa37.74■■■■□ 3.63
CFAP46-208ENST00000486104 TOPBP1Q92547 1522 aa37.69■■■■□ 3.62
CFAP46-208ENST00000486104 ABCC8Q09428 1581 aa37.63■■■■□ 3.61
CFAP46-208ENST00000486104 DNMBPQ6XZF7 1577 aa37.63■■■■□ 3.61
CFAP46-208ENST00000486104 CUX1P39880 1505 aa37.61■■■■□ 3.61
CFAP46-208ENST00000486104 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP37.48■■■■□ 3.59
CFAP46-208ENST00000486104 SYNJ1O43426 1573 aa37.43■■■■□ 3.58
CFAP46-208ENST00000486104 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP37.42■■■■□ 3.58
CFAP46-208ENST00000486104 FGD5Q6ZNL6 1462 aa37.39■■■■□ 3.58
CFAP46-208ENST00000486104 TOP2BQ02880 1626 aa37.34■■■■□ 3.57
CFAP46-208ENST00000486104 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa37.32■■■■□ 3.56
CFAP46-208ENST00000486104 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa37.31■■■■□ 3.56
CFAP46-208ENST00000486104 IFT140Q96RY7 1462 aa37.27■■■■□ 3.56
CFAP46-208ENST00000486104 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP37.26■■■■□ 3.55
CFAP46-208ENST00000486104 SOGA1O94964 1423 aa37.23■■■■□ 3.55
CFAP46-208ENST00000486104 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP37.22■■■■□ 3.55
CFAP46-208ENST00000486104 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP37.06■■■■□ 3.52
CFAP46-208ENST00000486104 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP37.05■■■■□ 3.52
CFAP46-208ENST00000486104 WDR97A6NE52 1622 aa37.04■■■■□ 3.52
CFAP46-208ENST00000486104 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP37.02■■■■□ 3.52
CFAP46-208ENST00000486104 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa37■■■■□ 3.51
CFAP46-208ENST00000486104 TRIM41Q8WV44 630 aa36.92■■■■□ 3.5
CFAP46-208ENST00000486104 CHIC1Q5VXU3 224 aa36.83■■■■□ 3.49
CFAP46-208ENST00000486104 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa36.83■■■■□ 3.49
CFAP46-208ENST00000486104 GAPVD1Q14C86 1478 aa36.81■■■■□ 3.48
CFAP46-208ENST00000486104 GRIN2BQ13224 1484 aa36.71■■■■□ 3.47
CFAP46-208ENST00000486104 PBRM1Q86U86 1689 aa36.7■■■■□ 3.47
CFAP46-208ENST00000486104 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa36.66■■■■□ 3.46
CFAP46-208ENST00000486104 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa36.62■■■■□ 3.45
CFAP46-208ENST00000486104 KIF27Q86VH2 1401 aa36.61■■■■□ 3.45
CFAP46-208ENST00000486104 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP36.54■■■■□ 3.44
CFAP46-208ENST00000486104 ERICH3Q5RHP9 1530 aa36.53■■■■□ 3.44
CFAP46-208ENST00000486104 FBLN2P98095 1184 aa36.5■■■■□ 3.43
CFAP46-208ENST00000486104 IGF1RP08069 1367 aa36.5■■■■□ 3.43
CFAP46-208ENST00000486104 CHD1O14646 1710 aa36.47■■■■□ 3.43
CFAP46-208ENST00000486104 ADAMTS12P58397 1594 aa36.44■■■■□ 3.42
CFAP46-208ENST00000486104 SYNJ2O15056 1496 aa36.43■■■■□ 3.42
CFAP46-208ENST00000486104 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP36.4■■■■□ 3.42
CFAP46-208ENST00000486104 FHAD1B1AJZ9 1412 aa36.36■■■■□ 3.41
CFAP46-208ENST00000486104 OSCARQ8IYS5 282 aa36.32■■■■□ 3.41
CFAP46-208ENST00000486104 GRIN2AQ12879 1464 aa36.27■■■■□ 3.4
CFAP46-208ENST00000486104 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP36.27■■■■□ 3.4
CFAP46-208ENST00000486104 CUL7Q14999 1698 aa36.26■■■■□ 3.4
CFAP46-208ENST00000486104 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa36.25■■■■□ 3.39
CFAP46-208ENST00000486104 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa36.17■■■■□ 3.38
CFAP46-208ENST00000486104 CSRNP3Q8WYN3 585 aa36.15■■■■□ 3.38
CFAP46-208ENST00000486104 CEP170Q5SW79 1584 aa36.13■■■■□ 3.37
CFAP46-208ENST00000486104 EEA1Q15075 1411 aa36.12■■■■□ 3.37
CFAP46-208ENST00000486104 NUP160Q12769 1436 aa36.09■■■■□ 3.37
CFAP46-208ENST00000486104 PRXQ9BXM0 1461 aa36.08■■■■□ 3.37
CFAP46-208ENST00000486104 CLASP1Q7Z460 1538 aa36.06■■■■□ 3.36
CFAP46-208ENST00000486104 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa36.06■■■■□ 3.36
CFAP46-208ENST00000486104 EHMT2Q96KQ7 1210 aa35.85■■■■□ 3.33
CFAP46-208ENST00000486104 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa35.83■■■■□ 3.33
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