RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485921.5

ABCF3-216, Transcript of ATP binding cassette subfamily F member 3, humanhuman

TSL 2

Gene ABCF3, Length 813 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF3-216ENST00000485921 NISCHQ9Y2I1 1504 aa56.58■■■■■ 6.65
ABCF3-216ENST00000485921 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa50.04■■■■■ 5.6
ABCF3-216ENST00000485921 ABCC9O60706 1549 aa48.66■■■■■ 5.38
ABCF3-216ENST00000485921 DCAF8L2P0C7V8 631 aa47.21■■■■■ 5.15
ABCF3-216ENST00000485921 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP47.21■■■■■ 5.15
ABCF3-216ENST00000485921 NACADO15069 1562 aa47■■■■■ 5.11
ABCF3-216ENST00000485921 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa46.94■■■■■ 5.11
ABCF3-216ENST00000485921 MYO15BQ96JP2 1530 aa46.84■■■■■ 5.09
ABCF3-216ENST00000485921 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa46.8■■■■■ 5.08
ABCF3-216ENST00000485921 UNC13AQ9UPW8 1703 aa45.85■■■■■ 4.93
ABCF3-216ENST00000485921 SCRIBQ14160 1630 aa45.76■■■■■ 4.92
ABCF3-216ENST00000485921 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP45.59■■■■■ 4.89
ABCF3-216ENST00000485921 BICRAQ9NZM4 1560 aa45.51■■■■■ 4.88
ABCF3-216ENST00000485921 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa45.04■■■■■ 4.8
ABCF3-216ENST00000485921 DNAJC5BQ9UF47 199 aa44.32■■■■■ 4.69
ABCF3-216ENST00000485921 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP44.28■■■■■ 4.68
ABCF3-216ENST00000485921 CECR2Q9BXF3 1484 aa44.05■■■■■ 4.64
ABCF3-216ENST00000485921 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa44■■■■■ 4.63
ABCF3-216ENST00000485921 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP43.8■■■■■ 4.6
ABCF3-216ENST00000485921 SMARCA4P51532 1647 aa43.79■■■■■ 4.6
ABCF3-216ENST00000485921 MROH2BQ7Z745 1585 aa43.62■■■■■ 4.57
ABCF3-216ENST00000485921 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa43.48■■■■■ 4.55
ABCF3-216ENST00000485921 SMARCA2P51531 1590 aa43.42■■■■■ 4.54
ABCF3-216ENST00000485921 NCAPD3P42695 1498 aa43.38■■■■■ 4.54
ABCF3-216ENST00000485921 PEG3Q9GZU2 1588 aa43.33■■■■■ 4.53
ABCF3-216ENST00000485921 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP43.3■■■■■ 4.52
ABCF3-216ENST00000485921 HMGXB3Q12766 1538 aa43.17■■■■■ 4.5
ABCF3-216ENST00000485921 WIZO95785 1651 aa43.16■■■■■ 4.5
ABCF3-216ENST00000485921 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP43.14■■■■■ 4.5
ABCF3-216ENST00000485921 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP42.71■■■■■ 4.43
ABCF3-216ENST00000485921 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP42.59■■■■■ 4.41
ABCF3-216ENST00000485921 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.25■■■■■ 4.35
ABCF3-216ENST00000485921 NESP48681 1621 aa42.23■■■■■ 4.35
ABCF3-216ENST00000485921 CADPSQ9ULU8 1353 aa42.16■■■■■ 4.34
ABCF3-216ENST00000485921 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa42.14■■■■■ 4.34
ABCF3-216ENST00000485921 CFTRP13569 1480 aa41.98■■■■■ 4.31
ABCF3-216ENST00000485921 ERCC6Q03468 1493 aa41.91■■■■■ 4.3
ABCF3-216ENST00000485921 PDS5BQ9NTI5 1447 aa41.89■■■■■ 4.3
ABCF3-216ENST00000485921 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa41.68■■■■■ 4.26
ABCF3-216ENST00000485921 FANCD2Q9BXW9 1451 aa41.67■■■■■ 4.26
ABCF3-216ENST00000485921 PRDM2Q13029 1718 aa41.62■■■■■ 4.25
ABCF3-216ENST00000485921 CEP164Q9UPV0 1460 aa41.56■■■■■ 4.24
ABCF3-216ENST00000485921 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP41.44■■■■■ 4.22
ABCF3-216ENST00000485921 MRC2Q9UBG0 1479 aa41.42■■■■■ 4.22
ABCF3-216ENST00000485921 CUX2O14529 1486 aa41.28■■■■■ 4.2
ABCF3-216ENST00000485921 WDR62O43379 1518 aa41.24■■■■■ 4.19
ABCF3-216ENST00000485921 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP41.22■■■■■ 4.19
ABCF3-216ENST00000485921 ABCC8Q09428 1581 aa41.06■■■■■ 4.16
ABCF3-216ENST00000485921 TOPBP1Q92547 1522 aa41.04■■■■■ 4.16
ABCF3-216ENST00000485921 DNMBPQ6XZF7 1577 aa41.01■■■■■ 4.16
ABCF3-216ENST00000485921 CUX1P39880 1505 aa40.89■■■■■ 4.14
ABCF3-216ENST00000485921 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.81■■■■■ 4.12
ABCF3-216ENST00000485921 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP40.72■■■■■ 4.11
ABCF3-216ENST00000485921 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.69■■■■■ 4.1
ABCF3-216ENST00000485921 IFT140Q96RY7 1462 aa40.68■■■■■ 4.1
ABCF3-216ENST00000485921 SYNJ1O43426 1573 aa40.65■■■■■ 4.1
ABCF3-216ENST00000485921 TOP2BQ02880 1626 aa40.64■■■■■ 4.1
ABCF3-216ENST00000485921 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.6■■■■■ 4.09
ABCF3-216ENST00000485921 SOGA1O94964 1423 aa40.59■■■■■ 4.09
ABCF3-216ENST00000485921 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa40.57■■■■■ 4.08
ABCF3-216ENST00000485921 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP40.53■■■■■ 4.08
ABCF3-216ENST00000485921 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP40.47■■■■■ 4.07
ABCF3-216ENST00000485921 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP40.33■■■■■ 4.05
ABCF3-216ENST00000485921 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP40.32■■■■■ 4.055e-8■■■□□ 18.8
ABCF3-216ENST00000485921 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa40.31■■■■■ 4.04
ABCF3-216ENST00000485921 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP40.29■■■■■ 4.04
ABCF3-216ENST00000485921 WDR97A6NE52 1622 aa40.27■■■■■ 4.04
ABCF3-216ENST00000485921 TRIM41Q8WV44 630 aa40.19■■■■■ 4.02
ABCF3-216ENST00000485921 GAPVD1Q14C86 1478 aa40.12■■■■■ 4.01
ABCF3-216ENST00000485921 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.08■■■■■ 4.01
ABCF3-216ENST00000485921 GRIN2BQ13224 1484 aa40.04■■■■■ 4
ABCF3-216ENST00000485921 CHIC1Q5VXU3 224 aa39.98■■■■□ 3.99
ABCF3-216ENST00000485921 PBRM1Q86U86 1689 aa39.95■■■■□ 3.99
ABCF3-216ENST00000485921 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa39.94■■■■□ 3.98
ABCF3-216ENST00000485921 KIF27Q86VH2 1401 aa39.92■■■■□ 3.98
ABCF3-216ENST00000485921 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP39.88■■■■□ 3.98
ABCF3-216ENST00000485921 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.82■■■■□ 3.97
ABCF3-216ENST00000485921 FBLN2P98095 1184 aa39.8■■■■□ 3.96
ABCF3-216ENST00000485921 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP39.74■■■■□ 3.95
ABCF3-216ENST00000485921 IGF1RP08069 1367 aa39.73■■■■□ 3.95
ABCF3-216ENST00000485921 SYNJ2O15056 1496 aa39.73■■■■□ 3.95
ABCF3-216ENST00000485921 OSCARQ8IYS5 282 aa39.71■■■■□ 3.95
ABCF3-216ENST00000485921 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa39.7■■■■□ 3.95
ABCF3-216ENST00000485921 CHD1O14646 1710 aa39.69■■■■□ 3.94
ABCF3-216ENST00000485921 ADAMTS12P58397 1594 aa39.67■■■■□ 3.94
ABCF3-216ENST00000485921 FHAD1B1AJZ9 1412 aa39.66■■■■□ 3.94
ABCF3-216ENST00000485921 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa39.57■■■■□ 3.93
ABCF3-216ENST00000485921 GRIN2AQ12879 1464 aa39.53■■■■□ 3.92
ABCF3-216ENST00000485921 CUL7Q14999 1698 aa39.52■■■■□ 3.92
ABCF3-216ENST00000485921 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa39.5■■■■□ 3.91
ABCF3-216ENST00000485921 EEA1Q15075 1411 aa39.42■■■■□ 3.9
ABCF3-216ENST00000485921 CSRNP3Q8WYN3 585 aa39.38■■■■□ 3.89
ABCF3-216ENST00000485921 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP39.37■■■■□ 3.89
ABCF3-216ENST00000485921 NUP160Q12769 1436 aa39.33■■■■□ 3.89
ABCF3-216ENST00000485921 CEP170Q5SW79 1584 aa39.3■■■■□ 3.88
ABCF3-216ENST00000485921 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa39.3■■■■□ 3.88
ABCF3-216ENST00000485921 CLASP1Q7Z460 1538 aa39.29■■■■□ 3.88
ABCF3-216ENST00000485921 PRXQ9BXM0 1461 aa39.25■■■■□ 3.87
ABCF3-216ENST00000485921 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa39.07■■■■□ 3.84
ABCF3-216ENST00000485921 ARHGEF11O15085 1522 aa39.01■■■■□ 3.84
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