RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485300.1

IL6-209, Transcript of interleukin 6, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene IL6, Length 985 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL6-209ENST00000485300 NISCHQ9Y2I1 1504 aa59.18■■■■■ 7.06
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IL6-209ENST00000485300 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa49.28■■■■■ 5.48
IL6-209ENST00000485300 NACADO15069 1562 aa49.26■■■■■ 5.48
IL6-209ENST00000485300 MYO15BQ96JP2 1530 aa49.03■■■■■ 5.44
IL6-209ENST00000485300 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa48.96■■■■■ 5.43
IL6-209ENST00000485300 UNC13AQ9UPW8 1703 aa48.14■■■■■ 5.3
IL6-209ENST00000485300 SCRIBQ14160 1630 aa47.98■■■■■ 5.27
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IL6-209ENST00000485300 BICRAQ9NZM4 1560 aa47.69■■■■■ 5.22
IL6-209ENST00000485300 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa47.26■■■■■ 5.16
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IL6-209ENST00000485300 DNAJC5BQ9UF47 199 aa46.43■■■■■ 5.02
IL6-209ENST00000485300 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa46.18■■■■■ 4.98
IL6-209ENST00000485300 CECR2Q9BXF3 1484 aa46.05■■■■■ 4.96
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IL6-209ENST00000485300 SMARCA4P51532 1647 aa45.88■■■■■ 4.93
IL6-209ENST00000485300 MROH2BQ7Z745 1585 aa45.62■■■■■ 4.89
IL6-209ENST00000485300 SMARCA2P51531 1590 aa45.52■■■■■ 4.88
IL6-209ENST00000485300 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa45.51■■■■■ 4.88
IL6-209ENST00000485300 NCAPD3P42695 1498 aa45.41■■■■■ 4.86
IL6-209ENST00000485300 PEG3Q9GZU2 1588 aa45.37■■■■■ 4.85
IL6-209ENST00000485300 HMGXB3Q12766 1538 aa45.26■■■■■ 4.84
IL6-209ENST00000485300 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP45.22■■■■■ 4.83
IL6-209ENST00000485300 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP45.2■■■■■ 4.83
IL6-209ENST00000485300 WIZO95785 1651 aa45.18■■■■■ 4.82
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IL6-209ENST00000485300 NESP48681 1621 aa44.25■■■■■ 4.67
IL6-209ENST00000485300 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa44.22■■■■■ 4.67
IL6-209ENST00000485300 CCDC88BA6NC98 1476 aa44.16■■■■■ 4.66
IL6-209ENST00000485300 CADPSQ9ULU8 1353 aa44.14■■■■■ 4.66
IL6-209ENST00000485300 ERCC6Q03468 1493 aa44.03■■■■■ 4.64
IL6-209ENST00000485300 CFTRP13569 1480 aa43.93■■■■■ 4.62
IL6-209ENST00000485300 PDS5BQ9NTI5 1447 aa43.92■■■■■ 4.62
IL6-209ENST00000485300 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa43.78■■■■■ 4.6
IL6-209ENST00000485300 PRDM2Q13029 1718 aa43.71■■■■■ 4.59
IL6-209ENST00000485300 FANCD2Q9BXW9 1451 aa43.66■■■■■ 4.58
IL6-209ENST00000485300 CEP164Q9UPV0 1460 aa43.6■■■■■ 4.57
IL6-209ENST00000485300 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP43.52■■■■■ 4.56
IL6-209ENST00000485300 MRC2Q9UBG0 1479 aa43.45■■■■■ 4.55
IL6-209ENST00000485300 CUX2O14529 1486 aa43.38■■■■■ 4.54
IL6-209ENST00000485300 WDR62O43379 1518 aa43.27■■■■■ 4.52
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IL6-209ENST00000485300 ABCC8Q09428 1581 aa43.02■■■■■ 4.48
IL6-209ENST00000485300 DNMBPQ6XZF7 1577 aa42.99■■■■■ 4.47
IL6-209ENST00000485300 TOPBP1Q92547 1522 aa42.99■■■■■ 4.47
IL6-209ENST00000485300 CUX1P39880 1505 aa42.78■■■■■ 4.44
IL6-209ENST00000485300 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP42.66■■■■■ 4.42
IL6-209ENST00000485300 IFT140Q96RY7 1462 aa42.65■■■■■ 4.42
IL6-209ENST00000485300 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP42.64■■■■■ 4.42
IL6-209ENST00000485300 FGD5Q6ZNL6 1462 aa42.62■■■■■ 4.41
IL6-209ENST00000485300 SYNJ1O43426 1573 aa42.53■■■■■ 4.4
IL6-209ENST00000485300 TOP2BQ02880 1626 aa42.53■■■■■ 4.4
IL6-209ENST00000485300 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa42.53■■■■■ 4.4
IL6-209ENST00000485300 SOGA1O94964 1423 aa42.49■■■■■ 4.39
IL6-209ENST00000485300 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP42.47■■■■■ 4.39
IL6-209ENST00000485300 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa42.46■■■■■ 4.39
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IL6-209ENST00000485300 WDR97A6NE52 1622 aa42.24■■■■■ 4.35
IL6-209ENST00000485300 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP42.22■■■■■ 4.35
IL6-209ENST00000485300 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa42.2■■■■■ 4.35
IL6-209ENST00000485300 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP42.19■■■■■ 4.34
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IL6-209ENST00000485300 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa42■■■■■ 4.31
IL6-209ENST00000485300 GRIN2BQ13224 1484 aa41.96■■■■■ 4.31
IL6-209ENST00000485300 PBRM1Q86U86 1689 aa41.94■■■■■ 4.3
IL6-209ENST00000485300 TRIM41Q8WV44 630 aa41.92■■■■■ 4.3
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IL6-209ENST00000485300 ERICH3Q5RHP9 1530 aa41.71■■■■■ 4.27
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IL6-209ENST00000485300 FHAD1B1AJZ9 1412 aa41.53■■■■■ 4.24
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IL6-209ENST00000485300 EEA1Q15075 1411 aa41.19■■■■■ 4.18
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IL6-209ENST00000485300 NUP160Q12769 1436 aa41.18■■■■■ 4.18
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IL6-209ENST00000485300 ARHGEF11O15085 1522 aa40.98■■■■■ 4.15
IL6-209ENST00000485300 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa40.96■■■■■ 4.15
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