RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483962.1

SNED1-210, Transcript of sushi, nidogen and EGF like domains 1, humanhuman

TSL 2

Gene SNED1, Length 938 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNED1-210ENST00000483962 NISCHQ9Y2I1 1504 aa46.82■■■■■ 5.09
SNED1-210ENST00000483962 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa41.47■■■■■ 4.23
SNED1-210ENST00000483962 ABCC9O60706 1549 aa40.28■■■■■ 4.04
SNED1-210ENST00000483962 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP39.06■■■■□ 3.84
SNED1-210ENST00000483962 DCAF8L2P0C7V8 631 aa38.97■■■■□ 3.83
SNED1-210ENST00000483962 NACADO15069 1562 aa38.89■■■■□ 3.82
SNED1-210ENST00000483962 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa38.86■■■■□ 3.81
SNED1-210ENST00000483962 MYO15BQ96JP2 1530 aa38.75■■■■□ 3.79
SNED1-210ENST00000483962 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa38.73■■■■□ 3.79
SNED1-210ENST00000483962 UNC13AQ9UPW8 1703 aa38.08■■■■□ 3.69
SNED1-210ENST00000483962 SCRIBQ14160 1630 aa37.89■■■■□ 3.66
SNED1-210ENST00000483962 BICRAQ9NZM4 1560 aa37.74■■■■□ 3.63
SNED1-210ENST00000483962 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP37.7■■■■□ 3.63
SNED1-210ENST00000483962 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa37.26■■■■□ 3.56
SNED1-210ENST00000483962 DNAJC5BQ9UF47 199 aa36.73■■■■□ 3.47
SNED1-210ENST00000483962 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP36.67■■■■□ 3.46
SNED1-210ENST00000483962 CECR2Q9BXF3 1484 aa36.47■■■■□ 3.43
SNED1-210ENST00000483962 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa36.46■■■■□ 3.43
SNED1-210ENST00000483962 SMARCA4P51532 1647 aa36.26■■■■□ 3.4
SNED1-210ENST00000483962 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP36.23■■■■□ 3.39
SNED1-210ENST00000483962 MROH2BQ7Z745 1585 aa36.12■■■■□ 3.37
SNED1-210ENST00000483962 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa35.98■■■■□ 3.35
SNED1-210ENST00000483962 SMARCA2P51531 1590 aa35.93■■■■□ 3.34
SNED1-210ENST00000483962 PEG3Q9GZU2 1588 aa35.89■■■■□ 3.34
SNED1-210ENST00000483962 NCAPD3P42695 1498 aa35.89■■■■□ 3.34
SNED1-210ENST00000483962 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP35.81■■■■□ 3.32
SNED1-210ENST00000483962 WIZO95785 1651 aa35.76■■■■□ 3.32
SNED1-210ENST00000483962 HMGXB3Q12766 1538 aa35.74■■■■□ 3.31
SNED1-210ENST00000483962 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP35.67■■■■□ 3.3
SNED1-210ENST00000483962 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP35.36■■■■□ 3.25
SNED1-210ENST00000483962 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP35.14■■■■□ 3.22
SNED1-210ENST00000483962 NESP48681 1621 aa34.98■■■■□ 3.19
SNED1-210ENST00000483962 CCDC88BA6NC98 1476 aa34.96■■■■□ 3.19
SNED1-210ENST00000483962 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa34.89■■■■□ 3.18
SNED1-210ENST00000483962 CADPSQ9ULU8 1353 aa34.86■■■■□ 3.17
SNED1-210ENST00000483962 CFTRP13569 1480 aa34.73■■■■□ 3.15
SNED1-210ENST00000483962 ERCC6Q03468 1493 aa34.65■■■■□ 3.14
SNED1-210ENST00000483962 PDS5BQ9NTI5 1447 aa34.62■■■■□ 3.13
SNED1-210ENST00000483962 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa34.59■■■■□ 3.13
SNED1-210ENST00000483962 PRDM2Q13029 1718 aa34.53■■■■□ 3.12
SNED1-210ENST00000483962 FANCD2Q9BXW9 1451 aa34.46■■■■□ 3.11
SNED1-210ENST00000483962 CEP164Q9UPV0 1460 aa34.39■■■■□ 3.1
SNED1-210ENST00000483962 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP34.36■■■■□ 3.09
SNED1-210ENST00000483962 MRC2Q9UBG0 1479 aa34.27■■■■□ 3.08
SNED1-210ENST00000483962 CUX2O14529 1486 aa34.16■■■■□ 3.06
SNED1-210ENST00000483962 WDR62O43379 1518 aa34.15■■■■□ 3.06
SNED1-210ENST00000483962 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP34.14■■■■□ 3.06
SNED1-210ENST00000483962 TOPBP1Q92547 1522 aa33.97■■■■□ 3.03
SNED1-210ENST00000483962 DNMBPQ6XZF7 1577 aa33.95■■■■□ 3.03
SNED1-210ENST00000483962 ABCC8Q09428 1581 aa33.94■■■■□ 3.02
SNED1-210ENST00000483962 CUX1P39880 1505 aa33.86■■■■□ 3.01
SNED1-210ENST00000483962 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP33.72■■■□□ 2.99
SNED1-210ENST00000483962 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP33.7■■■□□ 2.99
SNED1-210ENST00000483962 FGD5Q6ZNL6 1462 aa33.67■■■□□ 2.98
SNED1-210ENST00000483962 SYNJ1O43426 1573 aa33.67■■■□□ 2.98
SNED1-210ENST00000483962 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa33.64■■■□□ 2.98
SNED1-210ENST00000483962 IFT140Q96RY7 1462 aa33.64■■■□□ 2.98
SNED1-210ENST00000483962 TOP2BQ02880 1626 aa33.64■■■□□ 2.98
SNED1-210ENST00000483962 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP33.6■■■□□ 2.97
SNED1-210ENST00000483962 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa33.57■■■□□ 2.97
SNED1-210ENST00000483962 SOGA1O94964 1423 aa33.56■■■□□ 2.96
SNED1-210ENST00000483962 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP33.51■■■□□ 2.95
SNED1-210ENST00000483962 WDR97A6NE52 1622 aa33.41■■■□□ 2.94
SNED1-210ENST00000483962 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP33.38■■■□□ 2.93
SNED1-210ENST00000483962 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP33.36■■■□□ 2.93
SNED1-210ENST00000483962 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa33.35■■■□□ 2.93
SNED1-210ENST00000483962 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP33.34■■■□□ 2.93
SNED1-210ENST00000483962 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa33.21■■■□□ 2.91
SNED1-210ENST00000483962 GAPVD1Q14C86 1478 aa33.18■■■□□ 2.9
SNED1-210ENST00000483962 TRIM41Q8WV44 630 aa33.14■■■□□ 2.9
SNED1-210ENST00000483962 PBRM1Q86U86 1689 aa33.12■■■□□ 2.89
SNED1-210ENST00000483962 GRIN2BQ13224 1484 aa33.12■■■□□ 2.89
SNED1-210ENST00000483962 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa33.05■■■□□ 2.88
SNED1-210ENST00000483962 CHIC1Q5VXU3 224 aa33■■■□□ 2.87
SNED1-210ENST00000483962 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP32.99■■■□□ 2.87
SNED1-210ENST00000483962 KIF27Q86VH2 1401 aa32.98■■■□□ 2.87
SNED1-210ENST00000483962 ERICH3Q5RHP9 1530 aa32.94■■■□□ 2.86
SNED1-210ENST00000483962 CHD1O14646 1710 aa32.93■■■□□ 2.86
SNED1-210ENST00000483962 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa32.87■■■□□ 2.85
SNED1-210ENST00000483962 SYNJ2O15056 1496 aa32.86■■■□□ 2.85
SNED1-210ENST00000483962 FBLN2P98095 1184 aa32.86■■■□□ 2.85
SNED1-210ENST00000483962 ADAMTS12P58397 1594 aa32.86■■■□□ 2.85
SNED1-210ENST00000483962 IGF1RP08069 1367 aa32.83■■■□□ 2.85
SNED1-210ENST00000483962 OSCARQ8IYS5 282 aa32.81■■■□□ 2.84
SNED1-210ENST00000483962 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP32.81■■■□□ 2.84
SNED1-210ENST00000483962 FHAD1B1AJZ9 1412 aa32.79■■■□□ 2.84
SNED1-210ENST00000483962 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa32.76■■■□□ 2.83
SNED1-210ENST00000483962 CUL7Q14999 1698 aa32.72■■■□□ 2.83
SNED1-210ENST00000483962 GRIN2AQ12879 1464 aa32.7■■■□□ 2.83
SNED1-210ENST00000483962 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa32.63■■■□□ 2.81
SNED1-210ENST00000483962 CEP170Q5SW79 1584 aa32.56■■■□□ 2.8
SNED1-210ENST00000483962 CLASP1Q7Z460 1538 aa32.55■■■□□ 2.8
SNED1-210ENST00000483962 NUP160Q12769 1436 aa32.54■■■□□ 2.8
SNED1-210ENST00000483962 EEA1Q15075 1411 aa32.54■■■□□ 2.8
SNED1-210ENST00000483962 CSRNP3Q8WYN3 585 aa32.5■■■□□ 2.79
SNED1-210ENST00000483962 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP32.49■■■□□ 2.79
SNED1-210ENST00000483962 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa32.47■■■□□ 2.79
SNED1-210ENST00000483962 PRXQ9BXM0 1461 aa32.46■■■□□ 2.79
SNED1-210ENST00000483962 ARHGEF11O15085 1522 aa32.31■■■□□ 2.76
SNED1-210ENST00000483962 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa32.31■■■□□ 2.76
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