RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481414.5

KCNS3-205, Transcript of potassium voltage-gated channel modifier subfamily S member 3, human

TSL 4

Gene KCNS3, Length 560 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KCNS3-205	ENST00000481414	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		58.2	■■■■■ 6.91
KCNS3-205	ENST00000481414	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		51.44	■■■■■ 5.83
KCNS3-205	ENST00000481414	ABCC9	O60706	1549 aa		49.82	■■■■■ 5.57
KCNS3-205	ENST00000481414	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	48.59	■■■■■ 5.37
KCNS3-205	ENST00000481414	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		48.39	■■■■■ 5.34
KCNS3-205	ENST00000481414	NACAD	O15069	1562 aa		48.29	■■■■■ 5.32
KCNS3-205	ENST00000481414	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		48.22	■■■■■ 5.31
KCNS3-205	ENST00000481414	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		48.22	■■■■■ 5.31
KCNS3-205	ENST00000481414	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		48.18	■■■■■ 5.3
KCNS3-205	ENST00000481414	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		47	■■■■■ 5.11
KCNS3-205	ENST00000481414	SCRIB	Q14160	1630 aa		46.96	■■■■■ 5.11
KCNS3-205	ENST00000481414	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		46.69	■■■■■ 5.07
KCNS3-205	ENST00000481414	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	46.68	■■■■■ 5.06
KCNS3-205	ENST00000481414	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		46.31	■■■■■ 5
KCNS3-205	ENST00000481414	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	45.42	■■■■■ 4.86
KCNS3-205	ENST00000481414	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		45.28	■■■■■ 4.84
KCNS3-205	ENST00000481414	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		45.26	■■■■■ 4.84
KCNS3-205	ENST00000481414	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		45.08	■■■■■ 4.81
KCNS3-205	ENST00000481414	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	45.06	■■■■■ 4.8
KCNS3-205	ENST00000481414	SMARCA4	P51532	1647 aa		45	■■■■■ 4.79
KCNS3-205	ENST00000481414	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		44.84	■■■■■ 4.77
KCNS3-205	ENST00000481414	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		44.67	■■■■■ 4.74
KCNS3-205	ENST00000481414	SMARCA2	P51531	1590 aa		44.62	■■■■■ 4.73
KCNS3-205	ENST00000481414	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		44.6	■■■■■ 4.73
KCNS3-205	ENST00000481414	NCAPD3	P42695	1498 aa		44.59	■■■■■ 4.73
KCNS3-205	ENST00000481414	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	44.57	■■■■■ 4.72
KCNS3-205	ENST00000481414	HMGXB3	Q12766	1538 aa		44.37	■■■■■ 4.69
KCNS3-205	ENST00000481414	WIZ	O95785	1651 aa		44.34	■■■■■ 4.69
KCNS3-205	ENST00000481414	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	44.31	■■■■■ 4.68
KCNS3-205	ENST00000481414	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	43.94	■■■■■ 4.63
KCNS3-205	ENST00000481414	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	43.83	■■■■■ 4.61
KCNS3-205	ENST00000481414	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		43.45	■■■■■ 4.55
KCNS3-205	ENST00000481414	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		43.31	■■■■■ 4.52
KCNS3-205	ENST00000481414	NES	P48681	1621 aa		43.27	■■■■■ 4.52
KCNS3-205	ENST00000481414	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		43.27	■■■■■ 4.52
KCNS3-205	ENST00000481414	CFTR	P13569	1480 aa		43.16	■■■■■ 4.5
KCNS3-205	ENST00000481414	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		43	■■■■■ 4.47
KCNS3-205	ENST00000481414	ERCC6	Q03468	1493 aa		42.9	■■■■■ 4.46
KCNS3-205	ENST00000481414	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		42.78	■■■■■ 4.44
KCNS3-205	ENST00000481414	PRDM2	Q13029	1718 aa		42.75	■■■■■ 4.43
KCNS3-205	ENST00000481414	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		42.72	■■■■■ 4.43
KCNS3-205	ENST00000481414	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		42.66	■■■■■ 4.42
KCNS3-205	ENST00000481414	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		42.49	■■■■■ 4.39
KCNS3-205	ENST00000481414	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	42.48	■■■■■ 4.39
KCNS3-205	ENST00000481414	WDR62	O43379	1518 aa		42.32	■■■■■ 4.37
KCNS3-205	ENST00000481414	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	42.3	■■■■■ 4.36
KCNS3-205	ENST00000481414	CUX2	O14529	1486 aa		42.29	■■■■■ 4.36
KCNS3-205	ENST00000481414	ABCC8	Q09428	1581 aa		42.22	■■■■■ 4.35
KCNS3-205	ENST00000481414	TOPBP1	Q92547	1522 aa		42.15	■■■■■ 4.34
KCNS3-205	ENST00000481414	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		42.14	■■■■■ 4.34
KCNS3-205	ENST00000481414	CUX1	P39880	1505 aa		42.03	■■■■■ 4.32
KCNS3-205	ENST00000481414	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	41.99	■■■■■ 4.31
KCNS3-205	ENST00000481414	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	41.84	■■■■■ 4.29
KCNS3-205	ENST00000481414	TOP2B	Q02880	1626 aa		41.81	■■■■■ 4.28
KCNS3-205	ENST00000481414	SYNJ1	O43426	1573 aa		41.81	■■■■■ 4.28
KCNS3-205	ENST00000481414	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		41.8	■■■■■ 4.28
KCNS3-205	ENST00000481414	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		41.78	■■■■■ 4.28
KCNS3-205	ENST00000481414	IFT140	Q96RY7	1462 aa		41.77	■■■■■ 4.28
KCNS3-205	ENST00000481414	SOGA1	O94964	1423 aa		41.7	■■■■■ 4.27
KCNS3-205	ENST00000481414	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		41.64	■■■■■ 4.26
KCNS3-205	ENST00000481414	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	41.63	■■■■■ 4.26
KCNS3-205	ENST00000481414	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	41.5	■■■■■ 4.23
KCNS3-205	ENST00000481414	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		41.45	■■■■■ 4.23
KCNS3-205	ENST00000481414	TRIM41	Q8WV44	630 aa		41.41	■■■■■ 4.22
KCNS3-205	ENST00000481414	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	41.38	■■■■■ 4.22
KCNS3-205	ENST00000481414	WDR97	A6NE52	1622 aa		41.37	■■■■■ 4.21
KCNS3-205	ENST00000481414	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	41.36	■■■■■ 4.21
KCNS3-205	ENST00000481414	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	41.33	■■■■■ 4.21
KCNS3-205	ENST00000481414	CHIC1	Q5VXU3	224 aa		41.27	■■■■■ 4.2
KCNS3-205	ENST00000481414	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		41.21	■■■■■ 4.19
KCNS3-205	ENST00000481414	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		41.19	■■■■■ 4.18
KCNS3-205	ENST00000481414	GRIN2B	Q13224	1484 aa		41.14	■■■■■ 4.18
KCNS3-205	ENST00000481414	KIF27	Q86VH2	1401 aa		41.09	■■■■■ 4.17
KCNS3-205	ENST00000481414	PBRM1	Q86U86	1689 aa		40.99	■■■■■ 4.15
KCNS3-205	ENST00000481414	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		40.97	■■■■■ 4.15
KCNS3-205	ENST00000481414	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		40.96	■■■■■ 4.15
KCNS3-205	ENST00000481414	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	40.96	■■■■■ 4.15
KCNS3-205	ENST00000481414	IGF1R	P08069	1367 aa		40.88	■■■■■ 4.14
KCNS3-205	ENST00000481414	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		40.84	■■■■■ 4.13
KCNS3-205	ENST00000481414	SYNJ2	O15056	1496 aa		40.8	■■■■■ 4.12
KCNS3-205	ENST00000481414	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		40.77	■■■■■ 4.12
KCNS3-205	ENST00000481414	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	40.76	■■■■■ 4.12
KCNS3-205	ENST00000481414	ADAMTS12	P58397	1594 aa		40.75	■■■■■ 4.11
KCNS3-205	ENST00000481414	FBLN2	P98095	1184 aa		40.75	■■■■■ 4.11
KCNS3-205	ENST00000481414	EEA1	Q15075	1411 aa		40.69	■■■■■ 4.1
KCNS3-205	ENST00000481414	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		40.68	■■■■■ 4.1
KCNS3-205	ENST00000481414	CHD1	O14646	1710 aa		40.67	■■■■■ 4.1
KCNS3-205	ENST00000481414	CUL7	Q14999	1698 aa		40.66	■■■■■ 4.1
KCNS3-205	ENST00000481414	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		40.64	■■■■■ 4.1
KCNS3-205	ENST00000481414	GRIN2A	Q12879	1464 aa		40.59	■■■■■ 4.09
KCNS3-205	ENST00000481414	CSRNP3	Q8WYN3	585 aa		40.57	■■■■■ 4.09
KCNS3-205	ENST00000481414	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	40.48	■■■■■ 4.07
KCNS3-205	ENST00000481414	PRX	Q9BXM0	1461 aa		40.45	■■■■■ 4.07
KCNS3-205	ENST00000481414	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		40.44	■■■■■ 4.06
KCNS3-205	ENST00000481414	NUP160	Q12769	1436 aa		40.42	■■■■■ 4.06
KCNS3-205	ENST00000481414	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		40.38	■■■■■ 4.05
KCNS3-205	ENST00000481414	CEP170	Q5SW79	1584 aa		40.33	■■■■■ 4.05
KCNS3-205	ENST00000481414	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		40.31	■■■■■ 4.04
KCNS3-205	ENST00000481414	KIAA0586	Q9BVV6	1533 aa		40.17	■■■■■ 4.02
KCNS3-205	ENST00000481414	KIF21B	O75037	1637 aa		40.16	■■■■■ 4.02

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