RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480883.1

LAMC3-204, Transcript of laminin subunit gamma 3, humanhuman

TSL 5

Gene LAMC3, Length 1,903 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC3-204ENST00000480883 NISCHQ9Y2I1 1504 aa55.66■■■■■ 6.5
LAMC3-204ENST00000480883 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa48.57■■■■■ 5.37
LAMC3-204ENST00000480883 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP46.7■■■■■ 5.07
LAMC3-204ENST00000480883 ABCC9O60706 1549 aa46.24■■■■■ 4.99
LAMC3-204ENST00000480883 DCAF8L2P0C7V8 631 aa46.09■■■■■ 4.97
LAMC3-204ENST00000480883 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa46.02■■■■■ 4.96
LAMC3-204ENST00000480883 MYO15BQ96JP2 1530 aa45.6■■■■■ 4.89
LAMC3-204ENST00000480883 NACADO15069 1562 aa45.36■■■■■ 4.85
LAMC3-204ENST00000480883 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa45.21■■■■■ 4.83
LAMC3-204ENST00000480883 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa45.02■■■■■ 4.8
LAMC3-204ENST00000480883 SCRIBQ14160 1630 aa44.66■■■■■ 4.74
LAMC3-204ENST00000480883 UNC13AQ9UPW8 1703 aa44.01■■■■■ 4.64
LAMC3-204ENST00000480883 BICRAQ9NZM4 1560 aa43.68■■■■■ 4.58
LAMC3-204ENST00000480883 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP43.6■■■■■ 4.57
LAMC3-204ENST00000480883 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP43.4■■■■■ 4.54
LAMC3-204ENST00000480883 CECR2Q9BXF3 1484 aa43.28■■■■■ 4.52
LAMC3-204ENST00000480883 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP43.1■■■■■ 4.49
LAMC3-204ENST00000480883 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP42.99■■■■■ 4.47
LAMC3-204ENST00000480883 MROH2BQ7Z745 1585 aa42.98■■■■■ 4.47
LAMC3-204ENST00000480883 SMARCA4P51532 1647 aa42.8■■■■■ 4.44
LAMC3-204ENST00000480883 WIZO95785 1651 aa42.57■■■■■ 4.41
LAMC3-204ENST00000480883 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP42.4■■■■■ 4.38
LAMC3-204ENST00000480883 PEG3Q9GZU2 1588 aa42.33■■■■■ 4.37
LAMC3-204ENST00000480883 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa42.22■■■■■ 4.35
LAMC3-204ENST00000480883 SMARCA2P51531 1590 aa42.15■■■■■ 4.34
LAMC3-204ENST00000480883 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP42.15■■■■■ 4.34
LAMC3-204ENST00000480883 CHIC1Q5VXU3 224 aa42.05■■■■■ 4.32
LAMC3-204ENST00000480883 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP41.95■■■■■ 4.31
LAMC3-204ENST00000480883 NCAPD3P42695 1498 aa41.92■■■■■ 4.3
LAMC3-204ENST00000480883 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa41.81■■■■■ 4.28
LAMC3-204ENST00000480883 HMGXB3Q12766 1538 aa41.79■■■■■ 4.28
LAMC3-204ENST00000480883 CCDC88BA6NC98 1476 aa41.75■■■■■ 4.27
LAMC3-204ENST00000480883 DNAJC5BQ9UF47 199 aa41.09■■■■■ 4.17
LAMC3-204ENST00000480883 CFTRP13569 1480 aa40.91■■■■■ 4.14
LAMC3-204ENST00000480883 TRIM41Q8WV44 630 aa40.84■■■■■ 4.13
LAMC3-204ENST00000480883 CADPSQ9ULU8 1353 aa40.84■■■■■ 4.13
LAMC3-204ENST00000480883 ABCC8Q09428 1581 aa40.75■■■■■ 4.11
LAMC3-204ENST00000480883 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.57■■■■■ 4.09
LAMC3-204ENST00000480883 NESP48681 1621 aa40.52■■■■■ 4.08
LAMC3-204ENST00000480883 PRDM2Q13029 1718 aa40.51■■■■■ 4.08
LAMC3-204ENST00000480883 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa40.5■■■■■ 4.07
LAMC3-204ENST00000480883 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa40.48■■■■■ 4.07
LAMC3-204ENST00000480883 SYNJ1O43426 1573 aa40.36■■■■■ 4.05
LAMC3-204ENST00000480883 FANCD2Q9BXW9 1451 aa40.35■■■■■ 4.05
LAMC3-204ENST00000480883 TOP2BQ02880 1626 aa40.23■■■■■ 4.03
LAMC3-204ENST00000480883 PDS5BQ9NTI5 1447 aa40.23■■■■■ 4.03
LAMC3-204ENST00000480883 CUX1P39880 1505 aa40.2■■■■■ 4.03
LAMC3-204ENST00000480883 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.15■■■■■ 4.02
LAMC3-204ENST00000480883 CEP164Q9UPV0 1460 aa40.11■■■■■ 4.01
LAMC3-204ENST00000480883 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP40.06■■■■■ 4
LAMC3-204ENST00000480883 SOGA1O94964 1423 aa39.98■■■■□ 3.99
LAMC3-204ENST00000480883 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa39.94■■■■□ 3.98
LAMC3-204ENST00000480883 DNMBPQ6XZF7 1577 aa39.9■■■■□ 3.98
LAMC3-204ENST00000480883 TOPBP1Q92547 1522 aa39.88■■■■□ 3.97
LAMC3-204ENST00000480883 PCGF6Q9BYE7 350 aa39.87■■■■□ 3.97
LAMC3-204ENST00000480883 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP39.85■■■■□ 3.97
LAMC3-204ENST00000480883 EEA1Q15075 1411 aa39.84■■■■□ 3.97
LAMC3-204ENST00000480883 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa39.83■■■■□ 3.97
LAMC3-204ENST00000480883 FGD5Q6ZNL6 1462 aa39.81■■■■□ 3.96
LAMC3-204ENST00000480883 HRCP23327 699 aa39.71■■■■□ 3.95
LAMC3-204ENST00000480883 MRC2Q9UBG0 1479 aa39.69■■■■□ 3.94
LAMC3-204ENST00000480883 CSRNP3Q8WYN3 585 aa39.69■■■■□ 3.94
LAMC3-204ENST00000480883 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP39.68■■■■□ 3.94
LAMC3-204ENST00000480883 ERCC6Q03468 1493 aa39.68■■■■□ 3.94
LAMC3-204ENST00000480883 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP39.57■■■■□ 3.93
LAMC3-204ENST00000480883 KIF27Q86VH2 1401 aa39.57■■■■□ 3.92
LAMC3-204ENST00000480883 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa39.54■■■■□ 3.92
LAMC3-204ENST00000480883 CUX2O14529 1486 aa39.51■■■■□ 3.92
LAMC3-204ENST00000480883 EHMT2Q96KQ7 1210 aa39.49■■■■□ 3.91
LAMC3-204ENST00000480883 WDR62O43379 1518 aa39.49■■■■□ 3.91
LAMC3-204ENST00000480883 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa39.47■■■■□ 3.91
LAMC3-204ENST00000480883 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP39.4■■■■□ 3.9
LAMC3-204ENST00000480883 KIF21BO75037 1637 aa39.28■■■■□ 3.88
LAMC3-204ENST00000480883 IGF1RP08069 1367 aa39.28■■■■□ 3.88
LAMC3-204ENST00000480883 WDR97A6NE52 1622 aa39.27■■■■□ 3.88
LAMC3-204ENST00000480883 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP39.27■■■■□ 3.88
LAMC3-204ENST00000480883 GOLGA3Q08378 1498 aa39.26■■■■□ 3.88
LAMC3-204ENST00000480883 PRXQ9BXM0 1461 aa39.25■■■■□ 3.87
LAMC3-204ENST00000480883 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP39.21■■■■□ 3.87
LAMC3-204ENST00000480883 IFT140Q96RY7 1462 aa39.18■■■■□ 3.86
LAMC3-204ENST00000480883 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa39.17■■■■□ 3.86
LAMC3-204ENST00000480883 UBTFP17480 764 aaKnown RBP39.14■■■■□ 3.86
LAMC3-204ENST00000480883 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa39.12■■■■□ 3.85
LAMC3-204ENST00000480883 TNIKQ9UKE5 1360 aa39.12■■■■□ 3.85
LAMC3-204ENST00000480883 GAPVD1Q14C86 1478 aa39.1■■■■□ 3.85
LAMC3-204ENST00000480883 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.1■■■■□ 3.85
LAMC3-204ENST00000480883 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa39.05■■■■□ 3.84
LAMC3-204ENST00000480883 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP39■■■■□ 3.83
LAMC3-204ENST00000480883 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP38.98■■■■□ 3.83
LAMC3-204ENST00000480883 CUL7Q14999 1698 aa38.89■■■■□ 3.82
LAMC3-204ENST00000480883 CEP162Q5TB80 1403 aa38.88■■■■□ 3.81
LAMC3-204ENST00000480883 GRIN2BQ13224 1484 aa38.83■■■■□ 3.81
LAMC3-204ENST00000480883 PBRM1Q86U86 1689 aa38.79■■■■□ 3.8
LAMC3-204ENST00000480883 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP38.79■■■■□ 3.8
LAMC3-204ENST00000480883 FHAD1B1AJZ9 1412 aa38.69■■■■□ 3.78
LAMC3-204ENST00000480883 CLIP1P30622 1438 aa38.64■■■■□ 3.78
LAMC3-204ENST00000480883 ADAMTS12P58397 1594 aa38.63■■■■□ 3.77
LAMC3-204ENST00000480883 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP38.6■■■■□ 3.77
LAMC3-204ENST00000480883 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP38.59■■■■□ 3.77
LAMC3-204ENST00000480883 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa38.59■■■■□ 3.77
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