RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477901.5

GLIS3-212, Transcript of GLIS family zinc finger 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene GLIS3, Length 1,327 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLIS3-212ENST00000477901 NISCHQ9Y2I1 1504 aa50.07■■■■■ 5.61
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GLIS3-212ENST00000477901 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP41.79■■■■■ 4.28
GLIS3-212ENST00000477901 DCAF8L2P0C7V8 631 aa41.73■■■■■ 4.27
GLIS3-212ENST00000477901 NACADO15069 1562 aa41.57■■■■■ 4.24
GLIS3-212ENST00000477901 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa41.53■■■■■ 4.24
GLIS3-212ENST00000477901 MYO15BQ96JP2 1530 aa41.42■■■■■ 4.22
GLIS3-212ENST00000477901 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa41.4■■■■■ 4.22
GLIS3-212ENST00000477901 UNC13AQ9UPW8 1703 aa40.61■■■■■ 4.09
GLIS3-212ENST00000477901 SCRIBQ14160 1630 aa40.53■■■■■ 4.08
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GLIS3-212ENST00000477901 BICRAQ9NZM4 1560 aa40.28■■■■■ 4.04
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GLIS3-212ENST00000477901 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa38.94■■■■□ 3.82
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GLIS3-212ENST00000477901 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa38.46■■■■□ 3.75
GLIS3-212ENST00000477901 SMARCA2P51531 1590 aa38.41■■■■□ 3.74
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GLIS3-212ENST00000477901 PEG3Q9GZU2 1588 aa38.35■■■■□ 3.73
GLIS3-212ENST00000477901 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP38.3■■■■□ 3.72
GLIS3-212ENST00000477901 WIZO95785 1651 aa38.22■■■■□ 3.71
GLIS3-212ENST00000477901 HMGXB3Q12766 1538 aa38.21■■■■□ 3.71
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GLIS3-212ENST00000477901 NESP48681 1621 aa37.38■■■■□ 3.57
GLIS3-212ENST00000477901 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa37.28■■■■□ 3.56
GLIS3-212ENST00000477901 CADPSQ9ULU8 1353 aa37.28■■■■□ 3.56
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GLIS3-212ENST00000477901 ERCC6Q03468 1493 aa37.07■■■■□ 3.53
GLIS3-212ENST00000477901 PDS5BQ9NTI5 1447 aa37.03■■■■□ 3.52
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GLIS3-212ENST00000477901 CEP164Q9UPV0 1460 aa36.78■■■■□ 3.48
GLIS3-212ENST00000477901 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP36.7■■■■□ 3.47
GLIS3-212ENST00000477901 MRC2Q9UBG0 1479 aa36.64■■■■□ 3.46
GLIS3-212ENST00000477901 WDR62O43379 1518 aa36.5■■■■□ 3.43
GLIS3-212ENST00000477901 CUX2O14529 1486 aa36.5■■■■□ 3.43
GLIS3-212ENST00000477901 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP36.48■■■■□ 3.43
GLIS3-212ENST00000477901 TOPBP1Q92547 1522 aa36.32■■■■□ 3.4
GLIS3-212ENST00000477901 DNMBPQ6XZF7 1577 aa36.3■■■■□ 3.4
GLIS3-212ENST00000477901 ABCC8Q09428 1581 aa36.29■■■■□ 3.4
GLIS3-212ENST00000477901 CUX1P39880 1505 aa36.2■■■■□ 3.39
GLIS3-212ENST00000477901 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP36.11■■■■□ 3.37
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GLIS3-212ENST00000477901 SYNJ1O43426 1573 aa36.01■■■■□ 3.36
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GLIS3-212ENST00000477901 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP35.67■■■■□ 3.3
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GLIS3-212ENST00000477901 GAPVD1Q14C86 1478 aa35.49■■■■□ 3.27
GLIS3-212ENST00000477901 GRIN2BQ13224 1484 aa35.42■■■■□ 3.26
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GLIS3-212ENST00000477901 KIF27Q86VH2 1401 aa35.31■■■■□ 3.24
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GLIS3-212ENST00000477901 FBLN2P98095 1184 aa35.18■■■■□ 3.22
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GLIS3-212ENST00000477901 CHD1O14646 1710 aa35.16■■■■□ 3.22
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GLIS3-212ENST00000477901 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP34.84■■■■□ 3.17
GLIS3-212ENST00000477901 CSRNP3Q8WYN3 585 aa34.81■■■■□ 3.16
GLIS3-212ENST00000477901 CEP170Q5SW79 1584 aa34.8■■■■□ 3.16
GLIS3-212ENST00000477901 NUP160Q12769 1436 aa34.79■■■■□ 3.16
GLIS3-212ENST00000477901 CLASP1Q7Z460 1538 aa34.77■■■■□ 3.16
GLIS3-212ENST00000477901 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa34.76■■■■□ 3.16
GLIS3-212ENST00000477901 PRXQ9BXM0 1461 aa34.73■■■■□ 3.15
GLIS3-212ENST00000477901 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa34.55■■■■□ 3.12
GLIS3-212ENST00000477901 ARHGEF11O15085 1522 aa34.52■■■■□ 3.12
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