RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476057.1

STAG3-211, Transcript of stromal antigen 3, humanhuman

TSL 4

Gene STAG3, Length 583 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAG3-211ENST00000476057 NISCHQ9Y2I1 1504 aa32.69■■■□□ 2.82
STAG3-211ENST00000476057 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa28.86■■■□□ 2.21
STAG3-211ENST00000476057 ABCC9O60706 1549 aa28.1■■■□□ 2.09
STAG3-211ENST00000476057 DCAF8L2P0C7V8 631 aa27.46■■□□□ 1.99
STAG3-211ENST00000476057 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP27.28■■□□□ 1.96
STAG3-211ENST00000476057 NACADO15069 1562 aa27.14■■□□□ 1.93
STAG3-211ENST00000476057 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa27.11■■□□□ 1.93
STAG3-211ENST00000476057 MYO15BQ96JP2 1530 aa27.01■■□□□ 1.91
STAG3-211ENST00000476057 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa27.01■■□□□ 1.91
STAG3-211ENST00000476057 SCRIBQ14160 1630 aa26.46■■□□□ 1.83
STAG3-211ENST00000476057 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP26.37■■□□□ 1.81
STAG3-211ENST00000476057 UNC13AQ9UPW8 1703 aa26.34■■□□□ 1.81
STAG3-211ENST00000476057 BICRAQ9NZM4 1560 aa26.18■■□□□ 1.78
STAG3-211ENST00000476057 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa26.17■■□□□ 1.78
STAG3-211ENST00000476057 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP25.53■■□□□ 1.68
STAG3-211ENST00000476057 DNAJC5BQ9UF47 199 aa25.48■■□□□ 1.67
STAG3-211ENST00000476057 CECR2Q9BXF3 1484 aa25.45■■□□□ 1.66
STAG3-211ENST00000476057 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa25.36■■□□□ 1.65
STAG3-211ENST00000476057 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP25.34■■□□□ 1.65
STAG3-211ENST00000476057 SMARCA4P51532 1647 aa25.28■■□□□ 1.64
STAG3-211ENST00000476057 MROH2BQ7Z745 1585 aa25.2■■□□□ 1.62
STAG3-211ENST00000476057 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa25.11■■□□□ 1.61
STAG3-211ENST00000476057 SMARCA2P51531 1590 aa25.1■■□□□ 1.61
STAG3-211ENST00000476057 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
STAG3-211ENST00000476057 NCAPD3P42695 1498 aa25.04■■□□□ 1.6
STAG3-211ENST00000476057 PEG3Q9GZU2 1588 aa24.98■■□□□ 1.59
STAG3-211ENST00000476057 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
STAG3-211ENST00000476057 WIZO95785 1651 aa24.93■■□□□ 1.58
STAG3-211ENST00000476057 HMGXB3Q12766 1538 aa24.91■■□□□ 1.58
STAG3-211ENST00000476057 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
STAG3-211ENST00000476057 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
STAG3-211ENST00000476057 CCDC88BA6NC98 1476 aa24.44■■□□□ 1.5
STAG3-211ENST00000476057 CADPSQ9ULU8 1353 aa24.38■■□□□ 1.49
STAG3-211ENST00000476057 NESP48681 1621 aa24.35■■□□□ 1.49
STAG3-211ENST00000476057 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa24.33■■□□□ 1.48
STAG3-211ENST00000476057 CFTRP13569 1480 aa24.26■■□□□ 1.47
STAG3-211ENST00000476057 ERCC6Q03468 1493 aa24.26■■□□□ 1.47
STAG3-211ENST00000476057 PDS5BQ9NTI5 1447 aa24.24■■□□□ 1.47
STAG3-211ENST00000476057 FANCD2Q9BXW9 1451 aa24.1■■□□□ 1.45
STAG3-211ENST00000476057 CEP164Q9UPV0 1460 aa24.05■■□□□ 1.44
STAG3-211ENST00000476057 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa24.01■■□□□ 1.43
STAG3-211ENST00000476057 PRDM2Q13029 1718 aa23.97■■□□□ 1.43
STAG3-211ENST00000476057 MRC2Q9UBG0 1479 aa23.93■■□□□ 1.42
STAG3-211ENST00000476057 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP23.85■■□□□ 1.41
STAG3-211ENST00000476057 CUX2O14529 1486 aa23.8■■□□□ 1.4
STAG3-211ENST00000476057 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP23.79■■□□□ 1.4
STAG3-211ENST00000476057 WDR62O43379 1518 aa23.78■■□□□ 1.4
STAG3-211ENST00000476057 ABCC8Q09428 1581 aa23.76■■□□□ 1.39
STAG3-211ENST00000476057 TOPBP1Q92547 1522 aa23.71■■□□□ 1.39
STAG3-211ENST00000476057 DNMBPQ6XZF7 1577 aa23.69■■□□□ 1.38
STAG3-211ENST00000476057 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP23.66■■□□□ 1.38
STAG3-211ENST00000476057 CUX1P39880 1505 aa23.63■■□□□ 1.37
STAG3-211ENST00000476057 FGD5Q6ZNL6 1462 aa23.54■■□□□ 1.36
STAG3-211ENST00000476057 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
STAG3-211ENST00000476057 IFT140Q96RY7 1462 aa23.52■■□□□ 1.36
STAG3-211ENST00000476057 SOGA1O94964 1423 aa23.5■■□□□ 1.35
STAG3-211ENST00000476057 SYNJ1O43426 1573 aa23.49■■□□□ 1.35
STAG3-211ENST00000476057 TOP2BQ02880 1626 aa23.48■■□□□ 1.35
STAG3-211ENST00000476057 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa23.45■■□□□ 1.34
STAG3-211ENST00000476057 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa23.44■■□□□ 1.34
STAG3-211ENST00000476057 TRIM41Q8WV44 630 aa23.42■■□□□ 1.34
STAG3-211ENST00000476057 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
STAG3-211ENST00000476057 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
STAG3-211ENST00000476057 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
STAG3-211ENST00000476057 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP23.31■■□□□ 1.32
STAG3-211ENST00000476057 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa23.3■■□□□ 1.32
STAG3-211ENST00000476057 CHIC1Q5VXU3 224 aa23.25■■□□□ 1.31
STAG3-211ENST00000476057 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
STAG3-211ENST00000476057 GAPVD1Q14C86 1478 aa23.22■■□□□ 1.31
STAG3-211ENST00000476057 WDR97A6NE52 1622 aa23.21■■□□□ 1.31
STAG3-211ENST00000476057 GRIN2BQ13224 1484 aa23.17■■□□□ 1.3
STAG3-211ENST00000476057 KIF27Q86VH2 1401 aa23.16■■□□□ 1.3
STAG3-211ENST00000476057 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa23.12■■□□□ 1.29
STAG3-211ENST00000476057 FBLN2P98095 1184 aa23.12■■□□□ 1.29
STAG3-211ENST00000476057 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa23.09■■□□□ 1.29
STAG3-211ENST00000476057 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
STAG3-211ENST00000476057 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
STAG3-211ENST00000476057 PBRM1Q86U86 1689 aa23.04■■□□□ 1.28
STAG3-211ENST00000476057 ERICH3Q5RHP9 1530 aa23.03■■□□□ 1.28
STAG3-211ENST00000476057 IGF1RP08069 1367 aa23■■□□□ 1.27
STAG3-211ENST00000476057 OSCARQ8IYS5 282 aa22.98■■□□□ 1.27
STAG3-211ENST00000476057 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa22.98■■□□□ 1.27
STAG3-211ENST00000476057 SYNJ2O15056 1496 aa22.97■■□□□ 1.27
STAG3-211ENST00000476057 FHAD1B1AJZ9 1412 aa22.96■■□□□ 1.27
STAG3-211ENST00000476057 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
STAG3-211ENST00000476057 ADAMTS12P58397 1594 aa22.91■■□□□ 1.26
STAG3-211ENST00000476057 EEA1Q15075 1411 aa22.91■■□□□ 1.26
STAG3-211ENST00000476057 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa22.9■■□□□ 1.26
STAG3-211ENST00000476057 CSRNP3Q8WYN3 585 aa22.88■■□□□ 1.25
STAG3-211ENST00000476057 CHD1O14646 1710 aa22.86■■□□□ 1.25
STAG3-211ENST00000476057 CUL7Q14999 1698 aa22.86■■□□□ 1.25
STAG3-211ENST00000476057 GRIN2AQ12879 1464 aa22.85■■□□□ 1.25
STAG3-211ENST00000476057 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa22.78■■□□□ 1.24
STAG3-211ENST00000476057 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa22.76■■□□□ 1.23
STAG3-211ENST00000476057 PRXQ9BXM0 1461 aa22.72■■□□□ 1.23
STAG3-211ENST00000476057 NUP160Q12769 1436 aa22.71■■□□□ 1.23
STAG3-211ENST00000476057 EHMT2Q96KQ7 1210 aa22.68■■□□□ 1.22
STAG3-211ENST00000476057 CEP170Q5SW79 1584 aa22.67■■□□□ 1.22
STAG3-211ENST00000476057 CLASP1Q7Z460 1538 aa22.63■■□□□ 1.21
STAG3-211ENST00000476057 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa22.61■■□□□ 1.21
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