RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474580.1

VWA5B2-204, Transcript of von Willebrand factor A domain containing 5B2, humanhuman

TSL 4

Gene VWA5B2, Length 619 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA5B2-204ENST00000474580 NISCHQ9Y2I1 1504 aa48.53■■■■■ 5.36
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VWA5B2-204ENST00000474580 NACADO15069 1562 aa40.33■■■■■ 4.05
VWA5B2-204ENST00000474580 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa40.31■■■■■ 4.04
VWA5B2-204ENST00000474580 MYO15BQ96JP2 1530 aa40.15■■■■■ 4.02
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VWA5B2-204ENST00000474580 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa38.65■■■■□ 3.78
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VWA5B2-204ENST00000474580 CECR2Q9BXF3 1484 aa37.85■■■■□ 3.65
VWA5B2-204ENST00000474580 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa37.85■■■■□ 3.65
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VWA5B2-204ENST00000474580 SMARCA2P51531 1590 aa37.25■■■■□ 3.55
VWA5B2-204ENST00000474580 PEG3Q9GZU2 1588 aa37.16■■■■□ 3.54
VWA5B2-204ENST00000474580 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP37.12■■■■□ 3.53
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VWA5B2-204ENST00000474580 CCDC88BA6NC98 1476 aa36.25■■■■□ 3.39
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VWA5B2-204ENST00000474580 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa36.19■■■■□ 3.38
VWA5B2-204ENST00000474580 ERCC6Q03468 1493 aa36.06■■■■□ 3.36
VWA5B2-204ENST00000474580 CFTRP13569 1480 aa36.04■■■■□ 3.36
VWA5B2-204ENST00000474580 PDS5BQ9NTI5 1447 aa35.99■■■■□ 3.35
VWA5B2-204ENST00000474580 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa35.82■■■■□ 3.33
VWA5B2-204ENST00000474580 FANCD2Q9BXW9 1451 aa35.8■■■■□ 3.32
VWA5B2-204ENST00000474580 CEP164Q9UPV0 1460 aa35.71■■■■□ 3.31
VWA5B2-204ENST00000474580 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP35.64■■■■□ 3.3
VWA5B2-204ENST00000474580 PRDM2Q13029 1718 aa35.64■■■■□ 3.3
VWA5B2-204ENST00000474580 MRC2Q9UBG0 1479 aa35.6■■■■□ 3.29
VWA5B2-204ENST00000474580 CUX2O14529 1486 aa35.53■■■■□ 3.28
VWA5B2-204ENST00000474580 WDR62O43379 1518 aa35.44■■■■□ 3.26
VWA5B2-204ENST00000474580 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP35.43■■■■□ 3.26
VWA5B2-204ENST00000474580 TOPBP1Q92547 1522 aa35.25■■■■□ 3.23
VWA5B2-204ENST00000474580 ABCC8Q09428 1581 aa35.21■■■■□ 3.23
VWA5B2-204ENST00000474580 DNMBPQ6XZF7 1577 aa35.19■■■■□ 3.22
VWA5B2-204ENST00000474580 CUX1P39880 1505 aa35.11■■■■□ 3.21
VWA5B2-204ENST00000474580 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP34.98■■■■□ 3.19
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VWA5B2-204ENST00000474580 IFT140Q96RY7 1462 aa34.95■■■■□ 3.19
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VWA5B2-204ENST00000474580 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa34.88■■■■□ 3.17
VWA5B2-204ENST00000474580 SOGA1O94964 1423 aa34.87■■■■□ 3.17
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VWA5B2-204ENST00000474580 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP34.82■■■■□ 3.16
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VWA5B2-204ENST00000474580 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa34.78■■■■□ 3.16
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VWA5B2-204ENST00000474580 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP34.67■■■■□ 3.14
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VWA5B2-204ENST00000474580 GAPVD1Q14C86 1478 aa34.45■■■■□ 3.1
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VWA5B2-204ENST00000474580 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa34.39■■■■□ 3.1
VWA5B2-204ENST00000474580 GRIN2BQ13224 1484 aa34.39■■■■□ 3.1
VWA5B2-204ENST00000474580 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa34.33■■■■□ 3.09
VWA5B2-204ENST00000474580 PBRM1Q86U86 1689 aa34.27■■■■□ 3.08
VWA5B2-204ENST00000474580 FBLN2P98095 1184 aa34.26■■■■□ 3.08
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VWA5B2-204ENST00000474580 CHIC1Q5VXU3 224 aa34.2■■■■□ 3.07
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VWA5B2-204ENST00000474580 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP34.17■■■■□ 3.06
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VWA5B2-204ENST00000474580 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa34.07■■■■□ 3.04
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VWA5B2-204ENST00000474580 CEP170Q5SW79 1584 aa33.77■■■■□ 3
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VWA5B2-204ENST00000474580 EEA1Q15075 1411 aa33.7■■■□□ 2.99
VWA5B2-204ENST00000474580 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa33.69■■■□□ 2.98
VWA5B2-204ENST00000474580 PRXQ9BXM0 1461 aa33.63■■■□□ 2.97
VWA5B2-204ENST00000474580 ARHGEF11O15085 1522 aa33.58■■■□□ 2.97
VWA5B2-204ENST00000474580 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa33.55■■■□□ 2.96
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