RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472737.1

SYP-206, Transcript of synaptophysin, humanhuman

TSL 4

Gene SYP, Length 574 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYP-206ENST00000472737 NISCHQ9Y2I1 1504 aa30.42■■■□□ 2.46
SYP-206ENST00000472737 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa27.09■■□□□ 1.93
SYP-206ENST00000472737 ABCC9O60706 1549 aa26.16■■□□□ 1.78
SYP-206ENST00000472737 NACADO15069 1562 aa25.45■■□□□ 1.66
SYP-206ENST00000472737 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa25.42■■□□□ 1.66
SYP-206ENST00000472737 MYO15BQ96JP2 1530 aa25.4■■□□□ 1.66
SYP-206ENST00000472737 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP25.36■■□□□ 1.65
SYP-206ENST00000472737 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa25.31■■□□□ 1.64
SYP-206ENST00000472737 DCAF8L2P0C7V8 631 aa25.27■■□□□ 1.64
SYP-206ENST00000472737 UNC13AQ9UPW8 1703 aa24.71■■□□□ 1.55
SYP-206ENST00000472737 SCRIBQ14160 1630 aa24.53■■□□□ 1.52
SYP-206ENST00000472737 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa24.52■■□□□ 1.52
SYP-206ENST00000472737 BICRAQ9NZM4 1560 aa24.48■■□□□ 1.51
SYP-206ENST00000472737 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP24.42■■□□□ 1.5
SYP-206ENST00000472737 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP23.89■■□□□ 1.41
SYP-206ENST00000472737 DNAJC5BQ9UF47 199 aa23.77■■□□□ 1.4
SYP-206ENST00000472737 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa23.73■■□□□ 1.39
SYP-206ENST00000472737 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.37
SYP-206ENST00000472737 CECR2Q9BXF3 1484 aa23.56■■□□□ 1.36
SYP-206ENST00000472737 SMARCA4P51532 1647 aa23.56■■□□□ 1.36
SYP-206ENST00000472737 SMARCA2P51531 1590 aa23.48■■□□□ 1.35
SYP-206ENST00000472737 NCAPD3P42695 1498 aa23.43■■□□□ 1.34
SYP-206ENST00000472737 PEG3Q9GZU2 1588 aa23.41■■□□□ 1.34
SYP-206ENST00000472737 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa23.4■■□□□ 1.34
SYP-206ENST00000472737 MROH2BQ7Z745 1585 aa23.35■■□□□ 1.33
SYP-206ENST00000472737 HMGXB3Q12766 1538 aa23.34■■□□□ 1.33
SYP-206ENST00000472737 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
SYP-206ENST00000472737 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP23.18■■□□□ 1.3
SYP-206ENST00000472737 WIZO95785 1651 aa23.11■■□□□ 1.29
SYP-206ENST00000472737 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
SYP-206ENST00000472737 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa22.82■■□□□ 1.24
SYP-206ENST00000472737 CADPSQ9ULU8 1353 aa22.74■■□□□ 1.23
SYP-206ENST00000472737 PDS5BQ9NTI5 1447 aa22.68■■□□□ 1.22
SYP-206ENST00000472737 CCDC88BA6NC98 1476 aa22.65■■□□□ 1.22
SYP-206ENST00000472737 ERCC6Q03468 1493 aa22.65■■□□□ 1.22
SYP-206ENST00000472737 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
SYP-206ENST00000472737 NESP48681 1621 aa22.63■■□□□ 1.21
SYP-206ENST00000472737 CFTRP13569 1480 aa22.62■■□□□ 1.21
SYP-206ENST00000472737 PRDM2Q13029 1718 aa22.54■■□□□ 1.2
SYP-206ENST00000472737 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa22.45■■□□□ 1.18
SYP-206ENST00000472737 FANCD2Q9BXW9 1451 aa22.44■■□□□ 1.18
SYP-206ENST00000472737 CUX2O14529 1486 aa22.43■■□□□ 1.18
SYP-206ENST00000472737 CEP164Q9UPV0 1460 aa22.43■■□□□ 1.18
SYP-206ENST00000472737 MRC2Q9UBG0 1479 aa22.36■■□□□ 1.17
SYP-206ENST00000472737 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
SYP-206ENST00000472737 ABCC8Q09428 1581 aa22.29■■□□□ 1.16
SYP-206ENST00000472737 WDR62O43379 1518 aa22.27■■□□□ 1.16
SYP-206ENST00000472737 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
SYP-206ENST00000472737 DNMBPQ6XZF7 1577 aa22.12■■□□□ 1.13
SYP-206ENST00000472737 TOPBP1Q92547 1522 aa22.08■■□□□ 1.13
SYP-206ENST00000472737 IFT140Q96RY7 1462 aa21.99■■□□□ 1.11
SYP-206ENST00000472737 CUX1P39880 1505 aa21.92■■□□□ 1.1
SYP-206ENST00000472737 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP21.91■■□□□ 1.1
SYP-206ENST00000472737 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
SYP-206ENST00000472737 WDR97A6NE52 1622 aa21.87■■□□□ 1.09
SYP-206ENST00000472737 TOP2BQ02880 1626 aa21.86■■□□□ 1.09
SYP-206ENST00000472737 FGD5Q6ZNL6 1462 aa21.85■■□□□ 1.09
SYP-206ENST00000472737 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa21.85■■□□□ 1.09
SYP-206ENST00000472737 SOGA1O94964 1423 aa21.85■■□□□ 1.09
SYP-206ENST00000472737 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.08
SYP-206ENST00000472737 SYNJ1O43426 1573 aa21.74■■□□□ 1.07
SYP-206ENST00000472737 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa21.72■■□□□ 1.07
SYP-206ENST00000472737 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa21.71■■□□□ 1.07
SYP-206ENST00000472737 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP21.7■■□□□ 1.07
SYP-206ENST00000472737 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
SYP-206ENST00000472737 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP21.63■■□□□ 1.05
SYP-206ENST00000472737 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
SYP-206ENST00000472737 GRIN2BQ13224 1484 aa21.61■■□□□ 1.05
SYP-206ENST00000472737 GAPVD1Q14C86 1478 aa21.6■■□□□ 1.05
SYP-206ENST00000472737 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa21.58■■□□□ 1.04
SYP-206ENST00000472737 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
SYP-206ENST00000472737 PBRM1Q86U86 1689 aa21.53■■□□□ 1.04
SYP-206ENST00000472737 OSCARQ8IYS5 282 aa21.51■■□□□ 1.03
SYP-206ENST00000472737 ERICH3Q5RHP9 1530 aa21.5■■□□□ 1.03
SYP-206ENST00000472737 KIF27Q86VH2 1401 aa21.5■■□□□ 1.03
SYP-206ENST00000472737 TRIM41Q8WV44 630 aa21.5■■□□□ 1.03
SYP-206ENST00000472737 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa21.5■■□□□ 1.03
SYP-206ENST00000472737 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa21.46■■□□□ 1.03
SYP-206ENST00000472737 SYNJ2O15056 1496 aa21.45■■□□□ 1.02
SYP-206ENST00000472737 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
SYP-206ENST00000472737 CHD1O14646 1710 aa21.4■■□□□ 1.02
SYP-206ENST00000472737 FHAD1B1AJZ9 1412 aa21.39■■□□□ 1.02
SYP-206ENST00000472737 FBLN2P98095 1184 aa21.38■■□□□ 1.01
SYP-206ENST00000472737 CUL7Q14999 1698 aa21.35■■□□□ 1.01
SYP-206ENST00000472737 ADAMTS12P58397 1594 aa21.35■■□□□ 1.01
SYP-206ENST00000472737 IGF1RP08069 1367 aa21.31■■□□□ 1
SYP-206ENST00000472737 GRIN2AQ12879 1464 aa21.29■■□□□ 1
SYP-206ENST00000472737 EEA1Q15075 1411 aa21.27■■□□□ 1
SYP-206ENST00000472737 CHIC1Q5VXU3 224 aa21.24■□□□□ 0.99
SYP-206ENST00000472737 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa21.23■□□□□ 0.99
SYP-206ENST00000472737 NUP160Q12769 1436 aa21.21■□□□□ 0.99
SYP-206ENST00000472737 CLASP1Q7Z460 1538 aa21.19■□□□□ 0.98
SYP-206ENST00000472737 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa21.13■□□□□ 0.97
SYP-206ENST00000472737 CEP170Q5SW79 1584 aa21.11■□□□□ 0.97
SYP-206ENST00000472737 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa21.11■□□□□ 0.97
SYP-206ENST00000472737 CSRNP3Q8WYN3 585 aa21.1■□□□□ 0.97
SYP-206ENST00000472737 ARHGEF11O15085 1522 aa21.07■□□□□ 0.96
SYP-206ENST00000472737 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa21.07■□□□□ 0.96
SYP-206ENST00000472737 PRXQ9BXM0 1461 aa21.05■□□□□ 0.96
SYP-206ENST00000472737 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa21.04■□□□□ 0.96
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