RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472718.5

DHX30-211, Transcript of DExH-box helicase 30, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene DHX30, Length 1,464 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX30-211ENST00000472718 NISCHQ9Y2I1 1504 aa56.45■■■■■ 6.63
DHX30-211ENST00000472718 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa49.86■■■■■ 5.57
DHX30-211ENST00000472718 ABCC9O60706 1549 aa48.52■■■■■ 5.36
DHX30-211ENST00000472718 DCAF8L2P0C7V8 631 aa47.17■■■■■ 5.14
DHX30-211ENST00000472718 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP47.09■■■■■ 5.13
DHX30-211ENST00000472718 NACADO15069 1562 aa46.84■■■■■ 5.09
DHX30-211ENST00000472718 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa46.78■■■■■ 5.08
DHX30-211ENST00000472718 MYO15BQ96JP2 1530 aa46.69■■■■■ 5.07
DHX30-211ENST00000472718 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa46.67■■■■■ 5.06
DHX30-211ENST00000472718 UNC13AQ9UPW8 1703 aa45.67■■■■■ 4.9
DHX30-211ENST00000472718 SCRIBQ14160 1630 aa45.63■■■■■ 4.9
DHX30-211ENST00000472718 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP45.51■■■■■ 4.88
DHX30-211ENST00000472718 BICRAQ9NZM4 1560 aa45.37■■■■■ 4.85
DHX30-211ENST00000472718 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa44.98■■■■■ 4.79
DHX30-211ENST00000472718 DNAJC5BQ9UF47 199 aa44.21■■■■■ 4.67
DHX30-211ENST00000472718 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP44.14■■■■■ 4.66
DHX30-211ENST00000472718 CECR2Q9BXF3 1484 aa43.98■■■■■ 4.63
DHX30-211ENST00000472718 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa43.85■■■■■ 4.61
DHX30-211ENST00000472718 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP43.69■■■■■ 4.59
DHX30-211ENST00000472718 SMARCA4P51532 1647 aa43.66■■■■■ 4.58
DHX30-211ENST00000472718 MROH2BQ7Z745 1585 aa43.54■■■■■ 4.56
DHX30-211ENST00000472718 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa43.37■■■■■ 4.53
DHX30-211ENST00000472718 SMARCA2P51531 1590 aa43.29■■■■■ 4.52
DHX30-211ENST00000472718 NCAPD3P42695 1498 aa43.28■■■■■ 4.52
DHX30-211ENST00000472718 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP43.23■■■■■ 4.51
DHX30-211ENST00000472718 PEG3Q9GZU2 1588 aa43.21■■■■■ 4.51
DHX30-211ENST00000472718 WIZO95785 1651 aa43.06■■■■■ 4.48
DHX30-211ENST00000472718 HMGXB3Q12766 1538 aa43.03■■■■■ 4.48
DHX30-211ENST00000472718 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP43.02■■■■■ 4.48
DHX30-211ENST00000472718 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP42.6■■■■■ 4.41
DHX30-211ENST00000472718 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP42.59■■■■■ 4.41
DHX30-211ENST00000472718 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.18■■■■■ 4.34
DHX30-211ENST00000472718 NESP48681 1621 aa42.12■■■■■ 4.33
DHX30-211ENST00000472718 CADPSQ9ULU8 1353 aa42.07■■■■■ 4.33
DHX30-211ENST00000472718 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa42■■■■■ 4.31
DHX30-211ENST00000472718 CFTRP13569 1480 aa41.88■■■■■ 4.29
DHX30-211ENST00000472718 PDS5BQ9NTI5 1447 aa41.77■■■■■ 4.28
DHX30-211ENST00000472718 ERCC6Q03468 1493 aa41.76■■■■■ 4.28
DHX30-211ENST00000472718 FANCD2Q9BXW9 1451 aa41.56■■■■■ 4.24
DHX30-211ENST00000472718 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa41.54■■■■■ 4.24
DHX30-211ENST00000472718 CEP164Q9UPV0 1460 aa41.44■■■■■ 4.22
DHX30-211ENST00000472718 PRDM2Q13029 1718 aa41.43■■■■■ 4.22
DHX30-211ENST00000472718 MRC2Q9UBG0 1479 aa41.28■■■■■ 4.2
DHX30-211ENST00000472718 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP41.28■■■■■ 4.2
DHX30-211ENST00000472718 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP41.11■■■■■ 4.17
DHX30-211ENST00000472718 CUX2O14529 1486 aa41.1■■■■■ 4.17
DHX30-211ENST00000472718 WDR62O43379 1518 aa41.1■■■■■ 4.17
DHX30-211ENST00000472718 ABCC8Q09428 1581 aa40.94■■■■■ 4.14
DHX30-211ENST00000472718 TOPBP1Q92547 1522 aa40.93■■■■■ 4.14
DHX30-211ENST00000472718 DNMBPQ6XZF7 1577 aa40.89■■■■■ 4.14
DHX30-211ENST00000472718 CUX1P39880 1505 aa40.79■■■■■ 4.12
DHX30-211ENST00000472718 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.74■■■■■ 4.11
DHX30-211ENST00000472718 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP40.62■■■■■ 4.09
DHX30-211ENST00000472718 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.6■■■■■ 4.09
DHX30-211ENST00000472718 IFT140Q96RY7 1462 aa40.57■■■■■ 4.08
DHX30-211ENST00000472718 SYNJ1O43426 1573 aa40.57■■■■■ 4.08
DHX30-211ENST00000472718 TOP2BQ02880 1626 aa40.53■■■■■ 4.08
DHX30-211ENST00000472718 SOGA1O94964 1423 aa40.52■■■■■ 4.08
DHX30-211ENST00000472718 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.49■■■■■ 4.07
DHX30-211ENST00000472718 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa40.48■■■■■ 4.07
DHX30-211ENST00000472718 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP40.42■■■■■ 4.06
DHX30-211ENST00000472718 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP40.37■■■■■ 4.05
DHX30-211ENST00000472718 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP40.26■■■■■ 4.04
DHX30-211ENST00000472718 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP40.24■■■■■ 4.037e-9■■■■■ 34.8
DHX30-211ENST00000472718 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa40.2■■■■■ 4.03
DHX30-211ENST00000472718 TRIM41Q8WV44 630 aa40.18■■■■■ 4.02
DHX30-211ENST00000472718 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP40.15■■■■■ 4.02
DHX30-211ENST00000472718 WDR97A6NE52 1622 aa40.12■■■■■ 4.01
DHX30-211ENST00000472718 GAPVD1Q14C86 1478 aa40.02■■■■■ 4
DHX30-211ENST00000472718 CHIC1Q5VXU3 224 aa40■■■■□ 3.99
DHX30-211ENST00000472718 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa39.95■■■■□ 3.99
DHX30-211ENST00000472718 GRIN2BQ13224 1484 aa39.94■■■■□ 3.98
DHX30-211ENST00000472718 KIF27Q86VH2 1401 aa39.85■■■■□ 3.97
DHX30-211ENST00000472718 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa39.83■■■■□ 3.97
DHX30-211ENST00000472718 PBRM1Q86U86 1689 aa39.79■■■■□ 3.96
DHX30-211ENST00000472718 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP39.76■■■■□ 3.96
DHX30-211ENST00000472718 FBLN2P98095 1184 aa39.73■■■■□ 3.95
DHX30-211ENST00000472718 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.71■■■■□ 3.95
DHX30-211ENST00000472718 IGF1RP08069 1367 aa39.68■■■■□ 3.94
DHX30-211ENST00000472718 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP39.68■■■■□ 3.94
DHX30-211ENST00000472718 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa39.67■■■■□ 3.94
DHX30-211ENST00000472718 OSCARQ8IYS5 282 aa39.62■■■■□ 3.93
DHX30-211ENST00000472718 SYNJ2O15056 1496 aa39.62■■■■□ 3.93
DHX30-211ENST00000472718 FHAD1B1AJZ9 1412 aa39.58■■■■□ 3.93
DHX30-211ENST00000472718 ADAMTS12P58397 1594 aa39.54■■■■□ 3.92
DHX30-211ENST00000472718 CHD1O14646 1710 aa39.54■■■■□ 3.92
DHX30-211ENST00000472718 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa39.44■■■■□ 3.9
DHX30-211ENST00000472718 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa39.43■■■■□ 3.9
DHX30-211ENST00000472718 GRIN2AQ12879 1464 aa39.41■■■■□ 3.9
DHX30-211ENST00000472718 CUL7Q14999 1698 aa39.4■■■■□ 3.9
DHX30-211ENST00000472718 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP39.38■■■■□ 3.9
DHX30-211ENST00000472718 CSRNP3Q8WYN3 585 aa39.36■■■■□ 3.89
DHX30-211ENST00000472718 EEA1Q15075 1411 aa39.35■■■■□ 3.89
DHX30-211ENST00000472718 NUP160Q12769 1436 aa39.23■■■■□ 3.87
DHX30-211ENST00000472718 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa39.21■■■■□ 3.87
DHX30-211ENST00000472718 CEP170Q5SW79 1584 aa39.19■■■■□ 3.86
DHX30-211ENST00000472718 PRXQ9BXM0 1461 aa39.18■■■■□ 3.86
DHX30-211ENST00000472718 CLASP1Q7Z460 1538 aa39.15■■■■□ 3.86
DHX30-211ENST00000472718 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa38.98■■■■□ 3.83
DHX30-211ENST00000472718 JPH4Q96JJ6 628 aa38.93■■■■□ 3.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.7 ms