RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472427.5

RALGPS1-212, Transcript of Ral GEF with PH domain and SH3 binding motif 1, humanhuman

TSL 2

Gene RALGPS1, Length 764 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGPS1-212ENST00000472427 NISCHQ9Y2I1 1504 aa51.99■■■■■ 5.91
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RALGPS1-212ENST00000472427 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP43.4■■■■■ 4.54
RALGPS1-212ENST00000472427 DCAF8L2P0C7V8 631 aa43.32■■■■■ 4.53
RALGPS1-212ENST00000472427 NACADO15069 1562 aa43.29■■■■■ 4.52
RALGPS1-212ENST00000472427 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa43.27■■■■■ 4.52
RALGPS1-212ENST00000472427 MYO15BQ96JP2 1530 aa43.13■■■■■ 4.5
RALGPS1-212ENST00000472427 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa43.08■■■■■ 4.49
RALGPS1-212ENST00000472427 UNC13AQ9UPW8 1703 aa42.19■■■■■ 4.34
RALGPS1-212ENST00000472427 SCRIBQ14160 1630 aa42.1■■■■■ 4.33
RALGPS1-212ENST00000472427 BICRAQ9NZM4 1560 aa41.8■■■■■ 4.28
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RALGPS1-212ENST00000472427 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa41.58■■■■■ 4.25
RALGPS1-212ENST00000472427 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP40.74■■■■■ 4.11
RALGPS1-212ENST00000472427 DNAJC5BQ9UF47 199 aa40.52■■■■■ 4.08
RALGPS1-212ENST00000472427 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa40.48■■■■■ 4.07
RALGPS1-212ENST00000472427 CECR2Q9BXF3 1484 aa40.39■■■■■ 4.06
RALGPS1-212ENST00000472427 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP40.35■■■■■ 4.05
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RALGPS1-212ENST00000472427 SMARCA2P51531 1590 aa40.01■■■■□ 3.99
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RALGPS1-212ENST00000472427 PEG3Q9GZU2 1588 aa39.89■■■■□ 3.98
RALGPS1-212ENST00000472427 NCAPD3P42695 1498 aa39.87■■■■□ 3.97
RALGPS1-212ENST00000472427 HMGXB3Q12766 1538 aa39.77■■■■□ 3.96
RALGPS1-212ENST00000472427 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP39.72■■■■□ 3.95
RALGPS1-212ENST00000472427 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP39.71■■■■□ 3.95
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RALGPS1-212ENST00000472427 CCDC88BA6NC98 1476 aa38.78■■■■□ 3.8
RALGPS1-212ENST00000472427 NESP48681 1621 aa38.75■■■■□ 3.79
RALGPS1-212ENST00000472427 CADPSQ9ULU8 1353 aa38.74■■■■□ 3.79
RALGPS1-212ENST00000472427 ERCC6Q03468 1493 aa38.62■■■■□ 3.77
RALGPS1-212ENST00000472427 CFTRP13569 1480 aa38.59■■■■□ 3.77
RALGPS1-212ENST00000472427 PDS5BQ9NTI5 1447 aa38.57■■■■□ 3.77
RALGPS1-212ENST00000472427 PRDM2Q13029 1718 aa38.42■■■■□ 3.74
RALGPS1-212ENST00000472427 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa38.38■■■■□ 3.73
RALGPS1-212ENST00000472427 FANCD2Q9BXW9 1451 aa38.33■■■■□ 3.73
RALGPS1-212ENST00000472427 CEP164Q9UPV0 1460 aa38.29■■■■□ 3.72
RALGPS1-212ENST00000472427 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP38.15■■■■□ 3.7
RALGPS1-212ENST00000472427 MRC2Q9UBG0 1479 aa38.14■■■■□ 3.7
RALGPS1-212ENST00000472427 CUX2O14529 1486 aa38.04■■■■□ 3.68
RALGPS1-212ENST00000472427 WDR62O43379 1518 aa37.97■■■■□ 3.67
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RALGPS1-212ENST00000472427 ABCC8Q09428 1581 aa37.85■■■■□ 3.65
RALGPS1-212ENST00000472427 DNMBPQ6XZF7 1577 aa37.77■■■■□ 3.64
RALGPS1-212ENST00000472427 TOPBP1Q92547 1522 aa37.73■■■■□ 3.63
RALGPS1-212ENST00000472427 CUX1P39880 1505 aa37.56■■■■□ 3.6
RALGPS1-212ENST00000472427 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP37.52■■■■□ 3.6
RALGPS1-212ENST00000472427 IFT140Q96RY7 1462 aa37.45■■■■□ 3.59
RALGPS1-212ENST00000472427 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP37.43■■■■□ 3.58
RALGPS1-212ENST00000472427 FGD5Q6ZNL6 1462 aa37.41■■■■□ 3.58
RALGPS1-212ENST00000472427 TOP2BQ02880 1626 aa37.39■■■■□ 3.58
RALGPS1-212ENST00000472427 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa37.39■■■■□ 3.58
RALGPS1-212ENST00000472427 SYNJ1O43426 1573 aa37.36■■■■□ 3.57
RALGPS1-212ENST00000472427 SOGA1O94964 1423 aa37.3■■■■□ 3.56
RALGPS1-212ENST00000472427 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP37.28■■■■□ 3.56
RALGPS1-212ENST00000472427 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa37.22■■■■□ 3.55
RALGPS1-212ENST00000472427 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP37.15■■■■□ 3.54
RALGPS1-212ENST00000472427 WDR97A6NE52 1622 aa37.13■■■■□ 3.53
RALGPS1-212ENST00000472427 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP37.12■■■■□ 3.53
RALGPS1-212ENST00000472427 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa37.07■■■■□ 3.53
RALGPS1-212ENST00000472427 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP37.01■■■■□ 3.51
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RALGPS1-212ENST00000472427 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa36.9■■■■□ 3.5
RALGPS1-212ENST00000472427 TRIM41Q8WV44 630 aa36.9■■■■□ 3.5
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RALGPS1-212ENST00000472427 GRIN2BQ13224 1484 aa36.86■■■■□ 3.49
RALGPS1-212ENST00000472427 PBRM1Q86U86 1689 aa36.83■■■■□ 3.49
RALGPS1-212ENST00000472427 KIF27Q86VH2 1401 aa36.74■■■■□ 3.47
RALGPS1-212ENST00000472427 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa36.74■■■■□ 3.47
RALGPS1-212ENST00000472427 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP36.74■■■■□ 3.47
RALGPS1-212ENST00000472427 ERICH3Q5RHP9 1530 aa36.67■■■■□ 3.46
RALGPS1-212ENST00000472427 CHIC1Q5VXU3 224 aa36.58■■■■□ 3.45
RALGPS1-212ENST00000472427 SYNJ2O15056 1496 aa36.57■■■■□ 3.45
RALGPS1-212ENST00000472427 FBLN2P98095 1184 aa36.57■■■■□ 3.44
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RALGPS1-212ENST00000472427 ADAMTS12P58397 1594 aa36.54■■■■□ 3.44
RALGPS1-212ENST00000472427 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP36.54■■■■□ 3.44
RALGPS1-212ENST00000472427 OSCARQ8IYS5 282 aa36.5■■■■□ 3.43
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RALGPS1-212ENST00000472427 EEA1Q15075 1411 aa36.32■■■■□ 3.4
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RALGPS1-212ENST00000472427 CLASP1Q7Z460 1538 aa36.15■■■■□ 3.38
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RALGPS1-212ENST00000472427 CEP170Q5SW79 1584 aa36.14■■■■□ 3.38
RALGPS1-212ENST00000472427 CSRNP3Q8WYN3 585 aa36.12■■■■□ 3.37
RALGPS1-212ENST00000472427 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP36.07■■■■□ 3.36
RALGPS1-212ENST00000472427 PRXQ9BXM0 1461 aa36.05■■■■□ 3.36
RALGPS1-212ENST00000472427 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa35.93■■■■□ 3.34
RALGPS1-212ENST00000472427 ARHGEF11O15085 1522 aa35.9■■■■□ 3.34
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