RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470391.1

PRADC1-202, Transcript of protease associated domain containing 1, humanhuman

TSL 3

Gene PRADC1, Length 551 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRADC1-202ENST00000470391 NISCHQ9Y2I1 1504 aa55.92■■■■■ 6.54
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PRADC1-202ENST00000470391 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa46.86■■■■■ 5.09
PRADC1-202ENST00000470391 NACADO15069 1562 aa46.84■■■■■ 5.09
PRADC1-202ENST00000470391 MYO15BQ96JP2 1530 aa46.62■■■■■ 5.05
PRADC1-202ENST00000470391 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP46.52■■■■■ 5.04
PRADC1-202ENST00000470391 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa46.36■■■■■ 5.01
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PRADC1-202ENST00000470391 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP45.46■■■■■ 4.87
PRADC1-202ENST00000470391 BICRAQ9NZM4 1560 aa45.24■■■■■ 4.83
PRADC1-202ENST00000470391 SCRIBQ14160 1630 aa45.2■■■■■ 4.83
PRADC1-202ENST00000470391 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa45.09■■■■■ 4.81
PRADC1-202ENST00000470391 DNAJC5BQ9UF47 199 aa44.59■■■■■ 4.73
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PRADC1-202ENST00000470391 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa43.93■■■■■ 4.62
PRADC1-202ENST00000470391 CECR2Q9BXF3 1484 aa43.75■■■■■ 4.59
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PRADC1-202ENST00000470391 SMARCA4P51532 1647 aa43.3■■■■■ 4.52
PRADC1-202ENST00000470391 NCAPD3P42695 1498 aa43.24■■■■■ 4.51
PRADC1-202ENST00000470391 SMARCA2P51531 1590 aa43.19■■■■■ 4.5
PRADC1-202ENST00000470391 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa43.17■■■■■ 4.5
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PRADC1-202ENST00000470391 PEG3Q9GZU2 1588 aa42.97■■■■■ 4.47
PRADC1-202ENST00000470391 HMGXB3Q12766 1538 aa42.94■■■■■ 4.46
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PRADC1-202ENST00000470391 ERCC6Q03468 1493 aa42.01■■■■■ 4.32
PRADC1-202ENST00000470391 CADPSQ9ULU8 1353 aa42■■■■■ 4.31
PRADC1-202ENST00000470391 NESP48681 1621 aa41.96■■■■■ 4.31
PRADC1-202ENST00000470391 PDS5BQ9NTI5 1447 aa41.9■■■■■ 4.3
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PRADC1-202ENST00000470391 CCDC88BA6NC98 1476 aa41.66■■■■■ 4.26
PRADC1-202ENST00000470391 CUX2O14529 1486 aa41.6■■■■■ 4.25
PRADC1-202ENST00000470391 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP41.56■■■■■ 4.24
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PRADC1-202ENST00000470391 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa41.4■■■■■ 4.22
PRADC1-202ENST00000470391 CEP164Q9UPV0 1460 aa41.39■■■■■ 4.22
PRADC1-202ENST00000470391 MRC2Q9UBG0 1479 aa41.32■■■■■ 4.2
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PRADC1-202ENST00000470391 PRDM2Q13029 1718 aa41.16■■■■■ 4.18
PRADC1-202ENST00000470391 WDR62O43379 1518 aa41.13■■■■■ 4.17
PRADC1-202ENST00000470391 ABCC8Q09428 1581 aa40.95■■■■■ 4.15
PRADC1-202ENST00000470391 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP40.9■■■■■ 4.14
PRADC1-202ENST00000470391 TOPBP1Q92547 1522 aa40.72■■■■■ 4.11
PRADC1-202ENST00000470391 DNMBPQ6XZF7 1577 aa40.67■■■■■ 4.1
PRADC1-202ENST00000470391 IFT140Q96RY7 1462 aa40.57■■■■■ 4.08
PRADC1-202ENST00000470391 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa40.4■■■■■ 4.06
PRADC1-202ENST00000470391 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP40.36■■■■■ 4.05
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PRADC1-202ENST00000470391 SOGA1O94964 1423 aa40.33■■■■■ 4.05
PRADC1-202ENST00000470391 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.25■■■■■ 4.03
PRADC1-202ENST00000470391 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.22■■■■■ 4.03
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PRADC1-202ENST00000470391 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa40.13■■■■■ 4.02
PRADC1-202ENST00000470391 WDR97A6NE52 1622 aa40.08■■■■■ 4.01
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PRADC1-202ENST00000470391 TOP2BQ02880 1626 aa40.05■■■■■ 4
PRADC1-202ENST00000470391 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP40.02■■■■■ 4
PRADC1-202ENST00000470391 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP40.02■■■■■ 4
PRADC1-202ENST00000470391 OSCARQ8IYS5 282 aa40.02■■■■■ 4
PRADC1-202ENST00000470391 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa39.98■■■■□ 3.99
PRADC1-202ENST00000470391 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa39.94■■■■□ 3.98
PRADC1-202ENST00000470391 SYNJ1O43426 1573 aa39.91■■■■□ 3.98
PRADC1-202ENST00000470391 GRIN2BQ13224 1484 aa39.84■■■■□ 3.97
PRADC1-202ENST00000470391 GAPVD1Q14C86 1478 aa39.81■■■■□ 3.96
PRADC1-202ENST00000470391 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP39.74■■■■□ 3.95
PRADC1-202ENST00000470391 FBLN2P98095 1184 aa39.72■■■■□ 3.95
PRADC1-202ENST00000470391 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP39.68■■■■□ 3.94
PRADC1-202ENST00000470391 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa39.66■■■■□ 3.94
PRADC1-202ENST00000470391 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa39.65■■■■□ 3.94
PRADC1-202ENST00000470391 SYNJ2O15056 1496 aa39.56■■■■□ 3.92
PRADC1-202ENST00000470391 PBRM1Q86U86 1689 aa39.52■■■■□ 3.92
PRADC1-202ENST00000470391 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.49■■■■□ 3.91
PRADC1-202ENST00000470391 KIF27Q86VH2 1401 aa39.47■■■■□ 3.91
PRADC1-202ENST00000470391 CHD1O14646 1710 aa39.45■■■■□ 3.91
PRADC1-202ENST00000470391 FHAD1B1AJZ9 1412 aa39.4■■■■□ 3.9
PRADC1-202ENST00000470391 TRIM41Q8WV44 630 aa39.4■■■■□ 3.9
PRADC1-202ENST00000470391 ADAMTS12P58397 1594 aa39.27■■■■□ 3.88
PRADC1-202ENST00000470391 GRIN2AQ12879 1464 aa39.26■■■■□ 3.88
PRADC1-202ENST00000470391 IGF1RP08069 1367 aa39.25■■■■□ 3.87
PRADC1-202ENST00000470391 CLASP1Q7Z460 1538 aa39.14■■■■□ 3.86
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PRADC1-202ENST00000470391 NUP160Q12769 1436 aa39.1■■■■□ 3.85
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PRADC1-202ENST00000470391 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa39.05■■■■□ 3.84
PRADC1-202ENST00000470391 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa39.04■■■■□ 3.84
PRADC1-202ENST00000470391 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa39.04■■■■□ 3.84
PRADC1-202ENST00000470391 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa39.04■■■■□ 3.84
PRADC1-202ENST00000470391 CEP170Q5SW79 1584 aa38.94■■■■□ 3.82
PRADC1-202ENST00000470391 CYB5RLQ6IPT4 315 aa38.9■■■■□ 3.82
PRADC1-202ENST00000470391 JPH4Q96JJ6 628 aa38.84■■■■□ 3.81
PRADC1-202ENST00000470391 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa38.82■■■■□ 3.8
PRADC1-202ENST00000470391 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa38.79■■■■□ 3.8
PRADC1-202ENST00000470391 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa38.79■■■■□ 3.8
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