RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469772.5

GTF2E1-202, Transcript of general transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene GTF2E1, Length 503 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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GTF2E1-202ENST00000469772 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP25.95■■□□□ 1.74
GTF2E1-202ENST00000469772 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa25.93■■□□□ 1.74
GTF2E1-202ENST00000469772 DCAF8L2P0C7V8 631 aa25.9■■□□□ 1.74
GTF2E1-202ENST00000469772 MYO15BQ96JP2 1530 aa25.89■■□□□ 1.74
GTF2E1-202ENST00000469772 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa25.83■■□□□ 1.73
GTF2E1-202ENST00000469772 UNC13AQ9UPW8 1703 aa25.18■■□□□ 1.62
GTF2E1-202ENST00000469772 SCRIBQ14160 1630 aa25.12■■□□□ 1.61
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GTF2E1-202ENST00000469772 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
GTF2E1-202ENST00000469772 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa24.21■■□□□ 1.47
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GTF2E1-202ENST00000469772 CECR2Q9BXF3 1484 aa24.1■■□□□ 1.45
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GTF2E1-202ENST00000469772 SMARCA2P51531 1590 aa23.98■■□□□ 1.43
GTF2E1-202ENST00000469772 NCAPD3P42695 1498 aa23.9■■□□□ 1.42
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GTF2E1-202ENST00000469772 MROH2BQ7Z745 1585 aa23.9■■□□□ 1.42
GTF2E1-202ENST00000469772 PEG3Q9GZU2 1588 aa23.89■■□□□ 1.41
GTF2E1-202ENST00000469772 HMGXB3Q12766 1538 aa23.82■■□□□ 1.4
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GTF2E1-202ENST00000469772 WIZO95785 1651 aa23.65■■□□□ 1.38
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GTF2E1-202ENST00000469772 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
GTF2E1-202ENST00000469772 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa23.27■■□□□ 1.32
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GTF2E1-202ENST00000469772 CCDC88BA6NC98 1476 aa23.18■■□□□ 1.3
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GTF2E1-202ENST00000469772 ERCC6Q03468 1493 aa23.13■■□□□ 1.29
GTF2E1-202ENST00000469772 NESP48681 1621 aa23.12■■□□□ 1.29
GTF2E1-202ENST00000469772 CFTRP13569 1480 aa23.11■■□□□ 1.29
GTF2E1-202ENST00000469772 PRDM2Q13029 1718 aa22.98■■□□□ 1.27
GTF2E1-202ENST00000469772 FANCD2Q9BXW9 1451 aa22.93■■□□□ 1.26
GTF2E1-202ENST00000469772 CEP164Q9UPV0 1460 aa22.92■■□□□ 1.26
GTF2E1-202ENST00000469772 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa22.91■■□□□ 1.26
GTF2E1-202ENST00000469772 CUX2O14529 1486 aa22.83■■□□□ 1.25
GTF2E1-202ENST00000469772 MRC2Q9UBG0 1479 aa22.83■■□□□ 1.25
GTF2E1-202ENST00000469772 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
GTF2E1-202ENST00000469772 CHIC1Q5VXU3 224 aa22.79■■□□□ 1.24
GTF2E1-202ENST00000469772 ABCC8Q09428 1581 aa22.73■■□□□ 1.23
GTF2E1-202ENST00000469772 WDR62O43379 1518 aa22.72■■□□□ 1.23
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GTF2E1-202ENST00000469772 TOPBP1Q92547 1522 aa22.57■■□□□ 1.2
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GTF2E1-202ENST00000469772 FGD5Q6ZNL6 1462 aa22.36■■□□□ 1.17
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GTF2E1-202ENST00000469772 SOGA1O94964 1423 aa22.33■■□□□ 1.17
GTF2E1-202ENST00000469772 WDR97A6NE52 1622 aa22.29■■□□□ 1.16
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GTF2E1-202ENST00000469772 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
GTF2E1-202ENST00000469772 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa22.22■■□□□ 1.15
GTF2E1-202ENST00000469772 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa22.2■■□□□ 1.14
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GTF2E1-202ENST00000469772 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
GTF2E1-202ENST00000469772 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
GTF2E1-202ENST00000469772 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP22.11■■□□□ 1.13
GTF2E1-202ENST00000469772 GAPVD1Q14C86 1478 aa22.09■■□□□ 1.13
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GTF2E1-202ENST00000469772 GRIN2BQ13224 1484 aa22.08■■□□□ 1.12
GTF2E1-202ENST00000469772 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa22.06■■□□□ 1.12
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GTF2E1-202ENST00000469772 KIF27Q86VH2 1401 aa22.01■■□□□ 1.11
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GTF2E1-202ENST00000469772 SYNJ2O15056 1496 aa21.9■■□□□ 1.1
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GTF2E1-202ENST00000469772 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa21.81■■□□□ 1.08
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GTF2E1-202ENST00000469772 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa21.64■■□□□ 1.05
GTF2E1-202ENST00000469772 CSRNP3Q8WYN3 585 aa21.63■■□□□ 1.05
GTF2E1-202ENST00000469772 CLASP1Q7Z460 1538 aa21.62■■□□□ 1.05
GTF2E1-202ENST00000469772 CEP170Q5SW79 1584 aa21.58■■□□□ 1.05
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GTF2E1-202ENST00000469772 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
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