RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469014.1

TCAM1P-203, Transcript of testicular cell adhesion molecule 1, pseudogene, humanhuman

TSL 2

Gene TCAM1P, Length 478 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCAM1P-203ENST00000469014 NISCHQ9Y2I1 1504 aa58.82■■■■■ 7.01
TCAM1P-203ENST00000469014 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa52.14■■■■■ 5.94
TCAM1P-203ENST00000469014 ABCC9O60706 1549 aa50.64■■■■■ 5.7
TCAM1P-203ENST00000469014 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP49.07■■■■■ 5.45
TCAM1P-203ENST00000469014 DCAF8L2P0C7V8 631 aa49.01■■■■■ 5.44
TCAM1P-203ENST00000469014 NACADO15069 1562 aa48.93■■■■■ 5.42
TCAM1P-203ENST00000469014 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa48.9■■■■■ 5.42
TCAM1P-203ENST00000469014 MYO15BQ96JP2 1530 aa48.75■■■■■ 5.39
TCAM1P-203ENST00000469014 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa48.68■■■■■ 5.38
TCAM1P-203ENST00000469014 UNC13AQ9UPW8 1703 aa47.76■■■■■ 5.24
TCAM1P-203ENST00000469014 SCRIBQ14160 1630 aa47.59■■■■■ 5.21
TCAM1P-203ENST00000469014 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP47.38■■■■■ 5.18
TCAM1P-203ENST00000469014 BICRAQ9NZM4 1560 aa47.37■■■■■ 5.17
TCAM1P-203ENST00000469014 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa46.95■■■■■ 5.11
TCAM1P-203ENST00000469014 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP46.1■■■■■ 4.97
TCAM1P-203ENST00000469014 DNAJC5BQ9UF47 199 aa46.1■■■■■ 4.97
TCAM1P-203ENST00000469014 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa45.82■■■■■ 4.93
TCAM1P-203ENST00000469014 CECR2Q9BXF3 1484 aa45.76■■■■■ 4.92
TCAM1P-203ENST00000469014 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP45.58■■■■■ 4.89
TCAM1P-203ENST00000469014 SMARCA4P51532 1647 aa45.56■■■■■ 4.88
TCAM1P-203ENST00000469014 MROH2BQ7Z745 1585 aa45.33■■■■■ 4.85
TCAM1P-203ENST00000469014 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa45.21■■■■■ 4.83
TCAM1P-203ENST00000469014 SMARCA2P51531 1590 aa45.2■■■■■ 4.83
TCAM1P-203ENST00000469014 NCAPD3P42695 1498 aa45.13■■■■■ 4.82
TCAM1P-203ENST00000469014 PEG3Q9GZU2 1588 aa45.11■■■■■ 4.81
TCAM1P-203ENST00000469014 HMGXB3Q12766 1538 aa44.96■■■■■ 4.79
TCAM1P-203ENST00000469014 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP44.95■■■■■ 4.79
TCAM1P-203ENST00000469014 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP44.88■■■■■ 4.78
TCAM1P-203ENST00000469014 WIZO95785 1651 aa44.86■■■■■ 4.77
TCAM1P-203ENST00000469014 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP44.43■■■■■ 4.7
TCAM1P-203ENST00000469014 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP44.12■■■■■ 4.65
TCAM1P-203ENST00000469014 NESP48681 1621 aa43.92■■■■■ 4.62
TCAM1P-203ENST00000469014 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa43.89■■■■■ 4.62
TCAM1P-203ENST00000469014 CCDC88BA6NC98 1476 aa43.89■■■■■ 4.62
TCAM1P-203ENST00000469014 CADPSQ9ULU8 1353 aa43.84■■■■■ 4.61
TCAM1P-203ENST00000469014 CFTRP13569 1480 aa43.66■■■■■ 4.58
TCAM1P-203ENST00000469014 ERCC6Q03468 1493 aa43.64■■■■■ 4.58
TCAM1P-203ENST00000469014 PDS5BQ9NTI5 1447 aa43.59■■■■■ 4.57
TCAM1P-203ENST00000469014 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa43.43■■■■■ 4.54
TCAM1P-203ENST00000469014 PRDM2Q13029 1718 aa43.37■■■■■ 4.53
TCAM1P-203ENST00000469014 FANCD2Q9BXW9 1451 aa43.34■■■■■ 4.53
TCAM1P-203ENST00000469014 CEP164Q9UPV0 1460 aa43.26■■■■■ 4.52
TCAM1P-203ENST00000469014 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP43.18■■■■■ 4.5
TCAM1P-203ENST00000469014 MRC2Q9UBG0 1479 aa43.13■■■■■ 4.49
TCAM1P-203ENST00000469014 CUX2O14529 1486 aa43.03■■■■■ 4.48
TCAM1P-203ENST00000469014 WDR62O43379 1518 aa42.95■■■■■ 4.47
TCAM1P-203ENST00000469014 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP42.87■■■■■ 4.45
TCAM1P-203ENST00000469014 ABCC8Q09428 1581 aa42.73■■■■■ 4.43
TCAM1P-203ENST00000469014 TOPBP1Q92547 1522 aa42.69■■■■■ 4.42
TCAM1P-203ENST00000469014 DNMBPQ6XZF7 1577 aa42.69■■■■■ 4.42
TCAM1P-203ENST00000469014 CUX1P39880 1505 aa42.51■■■■■ 4.39
TCAM1P-203ENST00000469014 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP42.39■■■■■ 4.38
TCAM1P-203ENST00000469014 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP42.36■■■■■ 4.37
TCAM1P-203ENST00000469014 IFT140Q96RY7 1462 aa42.35■■■■■ 4.37
TCAM1P-203ENST00000469014 FGD5Q6ZNL6 1462 aa42.31■■■■■ 4.36
TCAM1P-203ENST00000469014 TOP2BQ02880 1626 aa42.25■■■■■ 4.35
TCAM1P-203ENST00000469014 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa42.25■■■■■ 4.35
TCAM1P-203ENST00000469014 SYNJ1O43426 1573 aa42.25■■■■■ 4.35
TCAM1P-203ENST00000469014 SOGA1O94964 1423 aa42.2■■■■■ 4.35
TCAM1P-203ENST00000469014 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP42.19■■■■■ 4.34
TCAM1P-203ENST00000469014 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa42.16■■■■■ 4.34
TCAM1P-203ENST00000469014 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP42.1■■■■■ 4.33
TCAM1P-203ENST00000469014 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP41.97■■■■■ 4.31
TCAM1P-203ENST00000469014 WDR97A6NE52 1622 aa41.94■■■■■ 4.3
TCAM1P-203ENST00000469014 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa41.91■■■■■ 4.3
TCAM1P-203ENST00000469014 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP41.91■■■■■ 4.3
TCAM1P-203ENST00000469014 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP41.9■■■■■ 4.3
TCAM1P-203ENST00000469014 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa41.72■■■■■ 4.27
TCAM1P-203ENST00000469014 GAPVD1Q14C86 1478 aa41.72■■■■■ 4.27
TCAM1P-203ENST00000469014 TRIM41Q8WV44 630 aa41.67■■■■■ 4.26
TCAM1P-203ENST00000469014 GRIN2BQ13224 1484 aa41.66■■■■■ 4.26
TCAM1P-203ENST00000469014 PBRM1Q86U86 1689 aa41.61■■■■■ 4.25
TCAM1P-203ENST00000469014 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa41.54■■■■■ 4.24
TCAM1P-203ENST00000469014 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP41.51■■■■■ 4.24
TCAM1P-203ENST00000469014 KIF27Q86VH2 1401 aa41.48■■■■■ 4.23
TCAM1P-203ENST00000469014 ERICH3Q5RHP9 1530 aa41.44■■■■■ 4.22
TCAM1P-203ENST00000469014 CHIC1Q5VXU3 224 aa41.38■■■■■ 4.21
TCAM1P-203ENST00000469014 FBLN2P98095 1184 aa41.37■■■■■ 4.21
TCAM1P-203ENST00000469014 CHD1O14646 1710 aa41.36■■■■■ 4.21
TCAM1P-203ENST00000469014 SYNJ2O15056 1496 aa41.34■■■■■ 4.21
TCAM1P-203ENST00000469014 OSCARQ8IYS5 282 aa41.34■■■■■ 4.21
TCAM1P-203ENST00000469014 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP41.32■■■■■ 4.21
TCAM1P-203ENST00000469014 ADAMTS12P58397 1594 aa41.29■■■■■ 4.2
TCAM1P-203ENST00000469014 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa41.28■■■■■ 4.2
TCAM1P-203ENST00000469014 FHAD1B1AJZ9 1412 aa41.26■■■■■ 4.19
TCAM1P-203ENST00000469014 IGF1RP08069 1367 aa41.25■■■■■ 4.19
TCAM1P-203ENST00000469014 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa41.19■■■■■ 4.18
TCAM1P-203ENST00000469014 CUL7Q14999 1698 aa41.14■■■■■ 4.18
TCAM1P-203ENST00000469014 GRIN2AQ12879 1464 aa41.12■■■■■ 4.17
TCAM1P-203ENST00000469014 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa41.02■■■■■ 4.16
TCAM1P-203ENST00000469014 EEA1Q15075 1411 aa40.95■■■■■ 4.15
TCAM1P-203ENST00000469014 NUP160Q12769 1436 aa40.92■■■■■ 4.14
TCAM1P-203ENST00000469014 CLASP1Q7Z460 1538 aa40.91■■■■■ 4.14
TCAM1P-203ENST00000469014 CEP170Q5SW79 1584 aa40.89■■■■■ 4.14
TCAM1P-203ENST00000469014 CSRNP3Q8WYN3 585 aa40.84■■■■■ 4.13
TCAM1P-203ENST00000469014 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa40.83■■■■■ 4.13
TCAM1P-203ENST00000469014 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP40.78■■■■■ 4.12
TCAM1P-203ENST00000469014 PRXQ9BXM0 1461 aa40.76■■■■■ 4.12
TCAM1P-203ENST00000469014 ARHGEF11O15085 1522 aa40.64■■■■■ 4.1
TCAM1P-203ENST00000469014 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa40.63■■■■■ 4.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 83.4 ms