RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468272.1

RBCK1-212, Transcript of RANBP2-type and C3HC4-type zinc finger containing 1, humanhuman

TSL 5

Gene RBCK1, Length 1,486 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBCK1-212ENST00000468272 NISCHQ9Y2I1 1504 aa51.16■■■■■ 5.78
RBCK1-212ENST00000468272 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa45.17■■■■■ 4.82
RBCK1-212ENST00000468272 ABCC9O60706 1549 aa44.26■■■■■ 4.68
RBCK1-212ENST00000468272 DCAF8L2P0C7V8 631 aa42.98■■■■■ 4.47
RBCK1-212ENST00000468272 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP42.64■■■■■ 4.42
RBCK1-212ENST00000468272 NACADO15069 1562 aa42.48■■■■■ 4.39
RBCK1-212ENST00000468272 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa42.48■■■■■ 4.39
RBCK1-212ENST00000468272 MYO15BQ96JP2 1530 aa42.22■■■■■ 4.35
RBCK1-212ENST00000468272 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa42.19■■■■■ 4.34
RBCK1-212ENST00000468272 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP41.54■■■■■ 4.247e-8■□□□□ 8.8
RBCK1-212ENST00000468272 UNC13AQ9UPW8 1703 aa41.54■■■■■ 4.24
RBCK1-212ENST00000468272 SCRIBQ14160 1630 aa41.49■■■■■ 4.23
RBCK1-212ENST00000468272 BICRAQ9NZM4 1560 aa41.26■■■■■ 4.2
RBCK1-212ENST00000468272 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa40.9■■■■■ 4.14
RBCK1-212ENST00000468272 DNAJC5BQ9UF47 199 aa40.5■■■■■ 4.07
RBCK1-212ENST00000468272 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP40.13■■■■■ 4.01
RBCK1-212ENST00000468272 CECR2Q9BXF3 1484 aa39.96■■■■□ 3.99
RBCK1-212ENST00000468272 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa39.93■■■■□ 3.98
RBCK1-212ENST00000468272 SMARCA4P51532 1647 aa39.61■■■■□ 3.93
RBCK1-212ENST00000468272 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP39.57■■■■□ 3.93
RBCK1-212ENST00000468272 MROH2BQ7Z745 1585 aa39.52■■■■□ 3.92
RBCK1-212ENST00000468272 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa39.38■■■■□ 3.89
RBCK1-212ENST00000468272 NCAPD3P42695 1498 aa39.26■■■■□ 3.88
RBCK1-212ENST00000468272 SMARCA2P51531 1590 aa39.25■■■■□ 3.87
RBCK1-212ENST00000468272 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP39.17■■■■□ 3.86
RBCK1-212ENST00000468272 PEG3Q9GZU2 1588 aa39.12■■■■□ 3.85
RBCK1-212ENST00000468272 WIZO95785 1651 aa39.09■■■■□ 3.85
RBCK1-212ENST00000468272 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP39.06■■■■□ 3.84
RBCK1-212ENST00000468272 HMGXB3Q12766 1538 aa39.02■■■■□ 3.84
RBCK1-212ENST00000468272 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP38.63■■■■□ 3.77
RBCK1-212ENST00000468272 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP38.59■■■■□ 3.77
RBCK1-212ENST00000468272 NESP48681 1621 aa38.39■■■■□ 3.74
RBCK1-212ENST00000468272 CCDC88BA6NC98 1476 aa38.26■■■■□ 3.71
RBCK1-212ENST00000468272 CADPSQ9ULU8 1353 aa38.2■■■■□ 3.71
RBCK1-212ENST00000468272 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa38.12■■■■□ 3.69
RBCK1-212ENST00000468272 ERCC6Q03468 1493 aa38.07■■■■□ 3.68
RBCK1-212ENST00000468272 CFTRP13569 1480 aa37.99■■■■□ 3.67
RBCK1-212ENST00000468272 PDS5BQ9NTI5 1447 aa37.94■■■■□ 3.66
RBCK1-212ENST00000468272 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa37.81■■■■□ 3.64
RBCK1-212ENST00000468272 FANCD2Q9BXW9 1451 aa37.76■■■■□ 3.64
RBCK1-212ENST00000468272 CEP164Q9UPV0 1460 aa37.65■■■■□ 3.62
RBCK1-212ENST00000468272 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP37.56■■■■□ 3.6
RBCK1-212ENST00000468272 PRDM2Q13029 1718 aa37.55■■■■□ 3.6
RBCK1-212ENST00000468272 MRC2Q9UBG0 1479 aa37.52■■■■□ 3.6
RBCK1-212ENST00000468272 CUX2O14529 1486 aa37.42■■■■□ 3.58
RBCK1-212ENST00000468272 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP37.39■■■■□ 3.58
RBCK1-212ENST00000468272 WDR62O43379 1518 aa37.34■■■■□ 3.57
RBCK1-212ENST00000468272 TOPBP1Q92547 1522 aa37.18■■■■□ 3.54
RBCK1-212ENST00000468272 DNMBPQ6XZF7 1577 aa37.09■■■■□ 3.53
RBCK1-212ENST00000468272 ABCC8Q09428 1581 aa37.07■■■■□ 3.52
RBCK1-212ENST00000468272 CUX1P39880 1505 aa37.03■■■■□ 3.52
RBCK1-212ENST00000468272 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP36.89■■■■□ 3.5
RBCK1-212ENST00000468272 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP36.89■■■■□ 3.5
RBCK1-212ENST00000468272 FGD5Q6ZNL6 1462 aa36.85■■■■□ 3.49
RBCK1-212ENST00000468272 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa36.83■■■■□ 3.49
RBCK1-212ENST00000468272 IFT140Q96RY7 1462 aa36.82■■■■□ 3.49
RBCK1-212ENST00000468272 SOGA1O94964 1423 aa36.8■■■■□ 3.48
RBCK1-212ENST00000468272 SYNJ1O43426 1573 aa36.79■■■■□ 3.48
RBCK1-212ENST00000468272 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP36.76■■■■□ 3.48
RBCK1-212ENST00000468272 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP36.71■■■■□ 3.47
RBCK1-212ENST00000468272 TOP2BQ02880 1626 aa36.7■■■■□ 3.47
RBCK1-212ENST00000468272 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa36.65■■■■□ 3.46
RBCK1-212ENST00000468272 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP36.64■■■■□ 3.46
RBCK1-212ENST00000468272 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP36.63■■■■□ 3.456e-7■■■□□ 17
RBCK1-212ENST00000468272 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP36.51■■■■□ 3.43
RBCK1-212ENST00000468272 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa36.45■■■■□ 3.42
RBCK1-212ENST00000468272 WDR97A6NE52 1622 aa36.39■■■■□ 3.42
RBCK1-212ENST00000468272 TRIM41Q8WV44 630 aa36.36■■■■□ 3.41
RBCK1-212ENST00000468272 GAPVD1Q14C86 1478 aa36.34■■■■□ 3.41
RBCK1-212ENST00000468272 GRIN2BQ13224 1484 aa36.25■■■■□ 3.39
RBCK1-212ENST00000468272 FBLN2P98095 1184 aa36.24■■■■□ 3.39
RBCK1-212ENST00000468272 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa36.24■■■■□ 3.39
RBCK1-212ENST00000468272 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa36.22■■■■□ 3.39
RBCK1-212ENST00000468272 PBRM1Q86U86 1689 aa36.14■■■■□ 3.38
RBCK1-212ENST00000468272 CHIC1Q5VXU3 224 aa36.13■■■■□ 3.37
RBCK1-212ENST00000468272 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa36.11■■■■□ 3.37
RBCK1-212ENST00000468272 OSCARQ8IYS5 282 aa36.1■■■■□ 3.37
RBCK1-212ENST00000468272 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP36.08■■■■□ 3.37
RBCK1-212ENST00000468272 KIF27Q86VH2 1401 aa36.08■■■■□ 3.37
RBCK1-212ENST00000468272 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP36.07■■■■□ 3.37
RBCK1-212ENST00000468272 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa36■■■■□ 3.35
RBCK1-212ENST00000468272 CHD1O14646 1710 aa36■■■■□ 3.35
RBCK1-212ENST00000468272 IGF1RP08069 1367 aa35.98■■■■□ 3.35
RBCK1-212ENST00000468272 ERICH3Q5RHP9 1530 aa35.98■■■■□ 3.35
RBCK1-212ENST00000468272 SYNJ2O15056 1496 aa35.97■■■■□ 3.35
RBCK1-212ENST00000468272 FHAD1B1AJZ9 1412 aa35.89■■■■□ 3.34
RBCK1-212ENST00000468272 ADAMTS12P58397 1594 aa35.88■■■■□ 3.33
RBCK1-212ENST00000468272 GRIN2AQ12879 1464 aa35.79■■■■□ 3.32
RBCK1-212ENST00000468272 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP35.76■■■■□ 3.32
RBCK1-212ENST00000468272 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa35.76■■■■□ 3.31
RBCK1-212ENST00000468272 CUL7Q14999 1698 aa35.66■■■■□ 3.3
RBCK1-212ENST00000468272 CEP170Q5SW79 1584 aa35.62■■■■□ 3.29
RBCK1-212ENST00000468272 CSRNP3Q8WYN3 585 aa35.6■■■■□ 3.29
RBCK1-212ENST00000468272 NUP160Q12769 1436 aa35.59■■■■□ 3.29
RBCK1-212ENST00000468272 CLASP1Q7Z460 1538 aa35.59■■■■□ 3.29
RBCK1-212ENST00000468272 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa35.51■■■■□ 3.28
RBCK1-212ENST00000468272 EEA1Q15075 1411 aa35.48■■■■□ 3.27
RBCK1-212ENST00000468272 PRXQ9BXM0 1461 aa35.45■■■■□ 3.27
RBCK1-212ENST00000468272 ARHGEF11O15085 1522 aa35.44■■■■□ 3.26
RBCK1-212ENST00000468272 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa35.4■■■■□ 3.26
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